Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
593 |
264.2 |
13311096 |
97.8% |
13018251 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC |
NC_000913 |
3,156,257 |
(CCA)2→1 |
coding (594‑596/930 nt) |
yqhG → |
hypothetical protein |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
= 3156256 | 1 (0.000) | 258 (1.030) |
127/178 |
0.2 |
99.6% |
coding (593/930 nt) |
yqhG |
hypothetical protein |
| ? | NC_000913 |
3156260 = |
1 (0.000) | coding (597/930 nt) |
yqhG |
hypothetical protein |
Only 100 of 286 total aligned reads displayed.
AAAGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3156162‑3156256
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATC > NC_000913/3156260‑3156351
AAAGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGC > 2:3835075/1‑93
AAAGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGC < 2:6076421/93‑1
AAAGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGC > 1:3238602/1‑93
AAGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCC > 2:5114707/1‑93
AGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCA > 2:4232694/1‑93
AGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCA < 1:2397536/93‑1
AACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGG < 1:6367919/93‑1
ACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGC > 1:4590929/1‑93
ACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGC < 1:4649689/93‑1
CAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCG > 2:6186784/1‑93
CAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCG > 1:3745025/1‑93
AGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGG < 1:4088514/93‑1
GCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGT > 1:2903380/1‑93
CGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTA > 2:1714890/1‑93
GGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAA < 1:2668505/93‑1
GGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAA > 1:1433573/1‑93
GAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAAT > 2:4863158/1‑93
GAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAAT > 1:2855188/1‑93
GAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAAT > 2:2845455/1‑93
GAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAAT < 2:3255079/93‑1
AAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATG > 1:5955842/1‑93
GCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCC < 1:537016/93‑1
GCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCC > 1:1766223/1‑93
TTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGGTTATAGCTGGCCGTGGACGTGGCTGGTTTCCGACTCTTACAGCCAGGCGGGTAATGACTTC > 1:330857/1‑93
TTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTC > 2:4783352/1‑93
TTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTC > 1:2058669/1‑93
TTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCT < 2:3913547/93‑1
GTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGGCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTAT < 2:1764839/93‑1
GTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTAT < 1:5169507/93‑1
CCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAA < 2:4137840/93‑1
CGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAAC > 2:2896079/1‑93
CGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAAC > 1:5068959/1‑93
GAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACC < 2:498098/93‑1
AACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCA < 1:849552/93‑1
ACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCAC > 2:3237930/1‑93
ACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCAC < 1:1205238/93‑1
CTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACC > 1:4733555/1‑93
CTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACC < 2:1659192/93‑1
TCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCT > 2:5562751/1‑93
TCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCT > 2:2257273/1‑93
CTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTGTAAAACCACCTT > 1:4016706/1‑93
TTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTC > 2:2160000/1‑93
TGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAA < 1:698178/93‑1
TGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAA > 2:2755504/1‑93
TGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAA < 1:25503/93‑1
GAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAG > 2:2644368/1‑93
GAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAG > 1:4858057/1‑93
AACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGA < 1:3356685/93‑1
ACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGAC < 1:307268/93‑1
ATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGG > 2:4047428/1‑93
ATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGG > 1:2027998/1‑93
ATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGG < 1:4978617/93‑1
ATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGGTAATGCCTTCTATAAAGCCACCTTCAAGACGG > 2:589320/1‑93
TATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGC > 1:1147230/1‑93
TATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGC > 1:5836895/1‑93
ATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATACAACCACCTTCGAGACTGCC > 1:2474802/1‑93
ATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCC < 1:5452098/93‑1
TGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAA < 2:3046904/93‑1
TGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAA > 2:5397078/1‑93
TGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAA > 1:1522147/1‑93
GATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAAT > 1:3035916/1‑93
TATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCC < 2:744443/93‑1
TATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCC > 1:3610421/1‑93
TATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCC > 1:3006711/1‑93
ATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCG < 2:4638027/93‑1
AGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGAT < 1:1846862/93‑1
GCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATG < 1:1055309/93‑1
CTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCTAATAATCCCGATGA < 2:2994755/93‑1
CTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGA < 2:3509709/93‑1
GGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAG > 2:4325554/1‑93
GGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAG < 2:6539066/93‑1
GGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAG > 1:312558/1‑93
GCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGA < 2:1487728/93‑1
CGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATA < 1:645132/93‑1
CGTGGACGTGGGTGGATTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATA > 1:904413/1‑93
GGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAANCCACCTTCAAGACGGCNAATAATCCCGATGNGNATANGC > 2:2032061/1‑93
GGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGC < 2:6623172/93‑1
CGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAA < 2:861611/93‑1
CGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAA < 1:4266223/93‑1
TGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATA < 1:5534156/93‑1
TGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATA > 2:1152055/1‑93
GGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAG > 2:5751223/1‑93
GGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATTCCGATGAAGATATGCAAATAGA > 1:6616508/1‑93
GGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGA < 1:1124986/93‑1
TGGTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAAC < 2:4398900/93‑1
GTTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGG > 2:3299380/1‑93
TTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGC < 2:5054904/93‑1
TTTCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGC > 1:2227093/1‑93
TCCGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAA < 1:992902/93‑1
CGACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATT < 2:6287913/93‑1
GACTCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTT > 1:1644280/1‑93
TCTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATT > 1:4419258/1‑93
CTTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTT < 2:3175877/93‑1
TTACCGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTA > 2:1212937/1‑93
CGCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGAC < 2:2932116/93‑1
CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAA > 2:6426335/1‑93
CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAA < 1:1314096/93‑1
CAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAT > 1:3973861/1‑93
AGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATC > 1:3846945/1‑93
AGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATC < 2:679674/93‑1
AAAGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3156162‑3156256
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccaGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAATC > NC_000913/3156260‑3156351
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCACCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAT > NC_000913/3156164‑3156350
|
AGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAG < SRR4302547.2446105/94‑1 (MQ=60)
AGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGT > SRR4302547.4101188/1‑94 (MQ=60)
AGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGT > SRR4302547.2961276/1‑94 (MQ=60)
AGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGT > SRR4302547.6111402/1‑94 (MQ=60)
GCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTT > SRR4302547.3358763/1‑94 (MQ=60)
GCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTT > SRR4302547.1487515/1‑94 (MQ=60)
GCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTT > SRR4302547.2568627/1‑94 (MQ=60)
CCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTA < SRR4302547.4164453/94‑1 (MQ=60)
CCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTA > SRR4302547.1551300/1‑94 (MQ=60)
CGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAA < SRR4302547.5970145/94‑1 (MQ=60)
CGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAA > SRR4302547.1462235/1‑94 (MQ=60)
CGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAA > SRR4302547.5019370/1‑94 (MQ=60)
CGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAA > SRR4302547.1250130/1‑94 (MQ=60)
GGAAGCCTTTGTTGGCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAAT > SRR4302547.6671552/1‑94 (MQ=60)
GGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAAT > SRR4302547.4058325/1‑94 (MQ=60)
GGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAAT > SRR4302547.2912238/1‑94 (MQ=60)
GGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAAT < SRR4302547.2722121/94‑1 (MQ=60)
GAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATG > SRR4302547.6079343/1‑94 (MQ=60)
AAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGC > SRR4302547.5491635/1‑94 (MQ=60)
AAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGC > SRR4302547.326429/1‑94 (MQ=60)
AGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCC > SRR4302547.1801258/1‑94 (MQ=60)
AGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCC > SRR4302547.3074747/1‑94 (MQ=60)
GCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCT > SRR4302547.1590114/1‑94 (MQ=60)
GCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCT > SRR4302547.3191074/1‑94 (MQ=60)
GCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCT < SRR4302547.546715/94‑1 (MQ=60)
CCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTT < SRR4302547.2478556/94‑1 (MQ=60)
CTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGGTTATAGCTGGCCGTGGACGTGGCTGGTTTCCGACTCTTACAG‑‑‑CCAGGCGGGTAATGACTTC > SRR4302547.337019/1‑94 (MQ=60)
CTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTC < SRR4302547.2059010/94‑1 (MQ=60)
CTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTC > SRR4302547.2099749/1‑94 (MQ=60)
TTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCT < SRR4302547.6528223/94‑1 (MQ=60)
TTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTA < SRR4302547.2067582/94‑1 (MQ=60)
TTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTA < SRR4302547.4694075/94‑1 (MQ=60)
TGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTAT < SRR4302547.4710475/94‑1 (MQ=60)
GTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATA < SRR4302547.5275947/94‑1 (MQ=60)
TTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAA < SRR4302547.6549010/94‑1 (MQ=60)
TGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAA > SRR4302547.890523/1‑94 (MQ=60)
CCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAAC > SRR4302547.5173554/1‑94 (MQ=60)
CCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAAC < SRR4302547.1219006/94‑1 (MQ=60)
CGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACC > SRR4302547.243397/1‑94 (MQ=60)
AACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCAC < SRR4302547.865779/94‑1 (MQ=60)
ACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACC < SRR4302547.1229556/94‑1 (MQ=60)
ACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACC > SRR4302547.4831662/1‑94 (MQ=60)
TCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTGTAAAACCACCTT > SRR4302547.4098327/1‑94 (MQ=60)
TCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTT < SRR4302547.1455395/94‑1 (MQ=60)
cttgtAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTC < SRR4302547.2644011/89‑1 (MQ=60)
CTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTC < SRR4302547.3864721/94‑1 (MQ=60)
CTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTC > SRR4302547.3357219/1‑94 (MQ=60)
TTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCA < SRR4302547.4660490/94‑1 (MQ=60)
TTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAA > SRR4302547.2808330/1‑94 (MQ=60)
TTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAA > SRR4302547.3941751/1‑94 (MQ=60)
TGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAG < SRR4302547.706636/94‑1 (MQ=60)
TGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAG > SRR4302547.4958704/1‑94 (MQ=60)
TGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAG < SRR4302547.25972/94‑1 (MQ=60)
TGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAG < SRR4302547.585812/94‑1 (MQ=60)
TGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAG < SRR4302547.3380093/94‑1 (MQ=60)
TGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAG < SRR4302547.711089/94‑1 (MQ=60)
AACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGAC < SRR4302547.110643/94‑1 (MQ=60)
AACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGAC < SRR4302547.3424771/94‑1 (MQ=60)
AACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGAC > SRR4302547.3824616/1‑94 (MQ=60)
ACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACG < SRR4302547.312992/94‑1 (MQ=60)
ACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACG > SRR4302547.1826241/1‑94 (MQ=60)
CATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGG > SRR4302547.2068382/1‑94 (MQ=60)
CATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGG > SRR4302547.4055151/1‑94 (MQ=60)
ATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGC < SRR4302547.5081589/94‑1 (MQ=60)
ATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGC > SRR4302547.1170428/1‑94 (MQ=60)
ATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGC > SRR4302547.5957670/1‑94 (MQ=60)
TATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATACAACCACCTTCGAGACTGCC > SRR4302547.2524840/1‑94 (MQ=60)
TATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCC > SRR4302547.2085913/1‑94 (MQ=60)
TATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCC > SRR4302547.1307191/1‑94 (MQ=60)
TATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCC < SRR4302547.4509597/94‑1 (MQ=60)
ATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCA < SRR4302547.5564765/94‑1 (MQ=60)
ATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCA < SRR4302547.789934/94‑1 (MQ=60)
ATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCA > SRR4302547.4239623/1‑94 (MQ=60)
TTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAA < SRR4302547.2092985/94‑1 (MQ=60)
GCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATA > SRR4302547.1435310/1‑94 (MQ=60)
GCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATA < SRR4302547.5551506/94‑1 (MQ=60)
GCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATA < SRR4302547.2657286/94‑1 (MQ=60)
CTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAA > SRR4302547.1552453/1‑94 (MQ=60)
TGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAAT > SRR4302547.3096313/1‑94 (MQ=60)
TGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAAT < SRR4302547.853391/94‑1 (MQ=60)
TTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCC > SRR4302547.3684060/1‑94 (MQ=60)
TTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCC < SRR4302547.3584421/94‑1 (MQ=60)
TTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCC > SRR4302547.3066506/1‑94 (MQ=60)
TATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCG < SRR4302547.5092905/94‑1 (MQ=60)
AGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATG < SRR4302547.1883374/94‑1 (MQ=60)
AGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATG < SRR4302547.3185339/94‑1 (MQ=60)
GCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGA < SRR4302547.1076293/94‑1 (MQ=60)
CTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAA < SRR4302547.2986211/94‑1 (MQ=60)
CTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAA < SRR4302547.3711211/94‑1 (MQ=60)
TGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAG > SRR4302547.318380/1‑94 (MQ=60)
TGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAG > SRR4302547.2457182/1‑94 (MQ=60)
TGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAG > SRR4302547.2959423/1‑94 (MQ=60)
GGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGA > SRR4302547.2922719/1‑94 (MQ=60)
CCGTGGACGTGGGTGGATTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATA > SRR4302547.921834/1‑94 (MQ=60)
CCGGGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTGACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTCCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATA < SRR4302547.5461279/94‑1 (MQ=60)
CGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATAT < SRR4302547.4454544/94‑1 (MQ=60)
CGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATAT < SRR4302547.3422945/94‑1 (MQ=60)
CGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATAT < SRR4302547.657028/94‑1 (MQ=60)
TGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGC < SRR4302547.2724475/94‑1 (MQ=60)
TGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGC > SRR4302547.5258435/1‑94 (MQ=60)
TGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGC < SRR4302547.3077265/94‑1 (MQ=60)
GGACGTGGGTGGTGTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCA < SRR4302547.5019615/94‑1 (MQ=60)
GGACGTGGGAGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTTTAAAAACACATTAAAGACAGCCAATAATAACGATGAAGATATACA > SRR4302547.4158235/1‑94 (MQ=37)
CGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAAT < SRR4302547.4353657/94‑1 (MQ=60)
TGGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAG < SRR4302547.5648372/94‑1 (MQ=60)
GGGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATTCCGATGAAGATATGCAAATAGA > SRR4302547.6754224/1‑94 (MQ=60)
GGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAA < SRR4302547.1147683/94‑1 (MQ=60)
GGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAA < SRR4302547.3488182/94‑1 (MQ=60)
GGTGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAA < SRR4302547.2412923/94‑1 (MQ=60)
TGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACG > SRR4302547.115688/1‑94 (MQ=60)
TGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACG > SRR4302547.4629686/1‑94 (MQ=60)
TGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACG > SRR4302547.3111563/1‑94 (MQ=60)
TGGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACG < SRR4302547.4912679/94‑1 (MQ=60)
GGTTTCCGCCTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGAAAAAAGAACGG > SRR4302547.5992967/1‑94 (MQ=60)
GGTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGG < SRR4302547.6793478/94‑1 (MQ=60)
GTTTCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGC > SRR4302547.2271977/1‑94 (MQ=60)
TCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAAT < SRR4302547.1165382/94‑1 (MQ=60)
TCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAAT < SRR4302547.1012244/94‑1 (MQ=60)
TCCGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAAT < SRR4302547.666757/94‑1 (MQ=60)
CGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTT > SRR4302547.2105661/1‑94 (MQ=60)
CGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTT > SRR4302547.1676767/1‑94 (MQ=60)
CGACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTT < SRR4302547.3043421/94‑1 (MQ=60)
GACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTA > SRR4302547.4760933/1‑94 (MQ=60)
GACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTA < SRR4302547.4927395/94‑1 (MQ=60)
GACTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTA > SRR4302547.5348760/1‑94 (MQ=60)
CTCTTACCG‑‑‑CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATT > SRR4302547.4510485/1‑94 (MQ=60)
cttaccgCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTA > SRR4302547.1219377/8‑94 (MQ=60)
taccgCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACG > SRR4302547.935886/6‑94 (MQ=60)
taccgCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACG > SRR4302547.3816307/6‑94 (MQ=60)
taccgCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACG > SRR4302547.6000292/6‑94 (MQ=60)
GCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAA > SRR4302547.1744620/1‑94 (MQ=60)
GCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAA > SRR4302547.5082951/1‑94 (MQ=60)
GCCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAA > SRR4302547.5918570/1‑94 (MQ=60)
CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAT > SRR4302547.2151815/1‑94 (MQ=60)
CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAT < SRR4302547.1340515/94‑1 (MQ=60)
CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAT > SRR4302547.1855551/1‑94 (MQ=60)
CCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAT > SRR4302547.4054673/1‑94 (MQ=60)
CCAGGCGGTTAATGCCTTCTAGAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAT < SRR4302547.5228210/94‑1 (MQ=60)
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AGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCACCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACAAT > NC_000913/3156164‑3156350
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
