Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I2 R1
|
593 |
264.2 |
13311096 |
97.8% |
13018251 |
93.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,013,772 |
+C |
intergenic (‑53/‑246) |
ysgA ← / → udp |
hypothetical protein/uridine phosphorylase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,013,770 | 1 | . | C | 99.1%
| 802.0
/ ‑1.8
| 218 | intergenic (‑51/‑248) | ysgA/udp | hypothetical protein/uridine phosphorylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/2); new base C (119/97); total (119/99) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.05e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
GCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGC‑ATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑C‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCT > NC_000913/4013679‑4013856
|
gtcgtcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑c‑c > 1:3598774/1‑93 (MQ=255)
tcgtcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑c‑cc > 2:6386576/1‑92 (MQ=255)
gcgtcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑c‑cc < 2:1179349/92‑2 (MQ=255)
cgtcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑c‑cct < 1:2578078/93‑3 (MQ=255)
tcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑c‑cctta > 2:2153041/1‑89 (MQ=255)
tcCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑c‑cctta < 1:571709/93‑5 (MQ=255)
cGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTtata > 1:4889864/1‑93 (MQ=255)
cGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑CTCTtata > 2:3863470/1‑93 (MQ=255)
ggggTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATaa > 2:1622161/1‑93 (MQ=255)
ggTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATaaaa < 1:2694260/93‑1 (MQ=255)
ggTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATaaaa < 1:4991811/93‑1 (MQ=255)
cTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATg > 1:17262/1‑93 (MQ=255)
tGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGt < 1:6277513/93‑1 (MQ=255)
gAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGtt < 1:2114441/93‑1 (MQ=255)
gAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGtt < 1:3900781/93‑1 (MQ=255)
gAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGtt > 2:2881877/1‑93 (MQ=255)
aCGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTgc < 1:4222315/93‑1 (MQ=255)
aCGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTgc < 2:3283029/93‑1 (MQ=255)
aCGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTgc > 2:6043477/1‑93 (MQ=255)
aCGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTgc < 1:3058134/93‑1 (MQ=255)
cGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTgcg > 2:6148647/1‑93 (MQ=255)
cGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTgcg < 1:1152995/93‑1 (MQ=255)
gATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTgcgc > 2:2552105/1‑93 (MQ=255)
aTGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCa > 1:1458985/1‑93 (MQ=255)
tGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCaa > 1:942328/1‑93 (MQ=255)
gTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATg > 2:1849939/1‑93 (MQ=255)
tCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGt < 2:2932177/93‑1 (MQ=255)
gAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTa > 1:3728558/1‑93 (MQ=255)
aaGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTaa < 2:5946445/93‑1 (MQ=255)
aaGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTaa > 1:3527759/1‑93 (MQ=255)
aaGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTaa > 2:3538248/1‑93 (MQ=255)
aGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAAc > 2:3822629/1‑93 (MQ=255)
gCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACt < 2:1273658/93‑1 (MQ=255)
gCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACt > 1:2864677/1‑93 (MQ=255)
gCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACt < 1:5434150/93‑1 (MQ=255)
cGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACta < 2:145812/93‑1 (MQ=255)
gagaGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACtat > 1:2920202/1‑93 (MQ=255)
gagaGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACtat > 1:1817645/1‑93 (MQ=255)
ggcgaTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTc < 1:3227148/89‑1 (MQ=255)
gaTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGc > 1:5243936/2‑93 (MQ=255)
aTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCa > 2:238793/1‑93 (MQ=255)
tGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCAt < 2:141558/93‑1 (MQ=255)
tGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCAt > 2:2840033/1‑93 (MQ=255)
gcagcaAGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATg < 2:1147703/93‑1 (MQ=255)
cagcagGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGc > 2:5855159/1‑93 (MQ=255)
gcagGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGcaa < 1:937215/93‑1 (MQ=255)
ggTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGcaacaa > 1:1141218/1‑93 (MQ=255)
gTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACaaa < 2:5591813/93‑1 (MQ=255)
gTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACaaa < 2:82178/93‑1 (MQ=255)
gTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACaaa > 2:1015216/1‑93 (MQ=255)
tGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAAt < 1:3426971/93‑1 (MQ=255)
tGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAAt > 1:1776032/1‑93 (MQ=255)
cAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATca > 2:3957519/1‑93 (MQ=255)
aaaTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATcac > 1:3196736/1‑93 (MQ=255)
aaaTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATcac > 1:609385/1‑93 (MQ=255)
aaaTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATcac < 2:5470134/93‑1 (MQ=255)
aTCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACAt < 1:669710/93‑1 (MQ=255)
tCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACAtt < 2:4014620/93‑1 (MQ=255)
ccAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTg < 2:4741019/93‑1 (MQ=255)
cAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGc > 2:4325428/1‑93 (MQ=255)
cAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGc > 1:1657537/1‑93 (MQ=255)
aGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGcc > 1:3048856/1‑93 (MQ=255)
gATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCt > 1:5386303/1‑93 (MQ=255)
gATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCt < 2:1608429/93‑1 (MQ=255)
aTTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTg > 1:5584109/1‑93 (MQ=255)
aTTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTg > 2:4633709/1‑93 (MQ=255)
ttgttgTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGa > 2:6318386/1‑93 (MQ=255)
gttgtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAAt < 1:2514892/93‑1 (MQ=255)
gttgtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAAt < 2:3339937/93‑1 (MQ=255)
gttgtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAAt < 1:5979699/93‑1 (MQ=255)
ttgtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATc < 1:6486528/93‑1 (MQ=255)
ttgtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATc < 1:1909169/93‑1 (MQ=255)
ttgtgttgtTGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATc < 1:1650396/93‑1 (MQ=255)
gttgttGCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCt > 2:5771382/1‑93 (MQ=255)
ttgttgCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTc < 1:2440450/93‑1 (MQ=255)
ttgttgCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTc > 1:5134598/1‑93 (MQ=255)
gttgCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCAt > 2:2350821/1‑93 (MQ=255)
ttgCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATc < 2:6598139/93‑1 (MQ=255)
ttgCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATc < 1:2326971/93‑1 (MQ=255)
ttgCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATc < 2:4227959/93‑1 (MQ=255)
tgCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCt < 1:5741816/93‑1 (MQ=255)
tgCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCt < 2:1310619/93‑1 (MQ=255)
tgCCATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCt < 2:3442044/93‑1 (MQ=255)
ccATGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTCAATCGGCTCATCttt > 1:1874105/1‑93 (MQ=255)
aTGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTTCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTa > 2:2684480/1‑93 (MQ=255)
aTGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTa < 2:4155229/93‑1 (MQ=255)
aTGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTa > 1:1360181/1‑93 (MQ=255)
aTGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTa > 1:5618016/1‑93 (MQ=255)
tGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTAt < 2:1997175/93‑1 (MQ=255)
tGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTAt > 1:3310227/1‑93 (MQ=255)
tGGTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTAt > 1:4714795/1‑93 (MQ=255)
ggTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATg > 1:2843523/1‑93 (MQ=255)
gTATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGc > 2:4302242/1‑93 (MQ=255)
tATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCa > 1:3985440/1‑93 (MQ=255)
tATTCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCa > 1:1071035/1‑93 (MQ=255)
ttCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGt > 2:5323159/1‑93 (MQ=255)
ttCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGt > 1:2071275/1‑93 (MQ=255)
ttCTCCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGt > 2:2256612/1‑93 (MQ=255)
tctcCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTc < 1:1585193/93‑1 (MQ=255)
tcCGTACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCt > 1:6149877/1‑93 (MQ=255)
|
GCGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGC‑ATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTA‑C‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCT > NC_000913/4013679‑4013856
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGC‑ATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑C‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGA > NC_000913/4013680‑4013865
|
CGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑C‑C < SRR4302547.2368568/94‑1 (MQ=60)
CGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑C‑C > SRR4302547.3672158/1‑94 (MQ=60)
CGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑C‑C > SRR4302547.1747667/1‑94 (MQ=60)
CGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑C‑Cctt < SRR4302547.2630102/94‑4 (MQ=60)
CGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑C‑Cctt < SRR4302547.6278012/94‑4 (MQ=60)
GTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTA < SRR4302547.5290263/94‑1 (MQ=60)
GTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTA > SRR4302547.3940507/1‑94 (MQ=60)
TCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTAT < SRR4302547.581986/94‑1 (MQ=60)
CCGGGGTCTGAGCGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATA < SRR4302547.881553/94‑1 (MQ=60)
CCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATA > SRR4302547.4991141/1‑94 (MQ=60)
CCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATA < SRR4302547.4421724/94‑1 (MQ=60)
CCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATA < SRR4302547.4018276/94‑1 (MQ=60)
CGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAA > SRR4302547.6283058/1‑94 (MQ=60)
GGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAA < SRR4302547.5094988/94‑1 (MQ=60)
GGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAA < SRR4302547.2748351/94‑1 (MQ=60)
GTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAAT < SRR4302547.5515723/94‑1 (MQ=60)
TCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATG > SRR4302547.17586/1‑94 (MQ=60)
CTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGT < SRR4302547.957525/94‑1 (MQ=60)
TGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTT < SRR4302547.6407931/94‑1 (MQ=60)
GAACGATGGTCGAAGCGAGATGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTG < SRR4302547.1487239/94‑1 (MQ=60)
GAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTG < SRR4302547.2156571/94‑1 (MQ=60)
GAACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTG < SRR4302547.3980106/94‑1 (MQ=60)
AACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGC < SRR4302547.1693545/94‑1 (MQ=60)
ACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCG < SRR4302547.4308552/94‑1 (MQ=60)
ACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCG < SRR4302547.3337933/94‑1 (MQ=60)
ACGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCG < SRR4302547.3118981/94‑1 (MQ=60)
CGATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGC < SRR4302547.1176334/94‑1 (MQ=60)
GATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCA > SRR4302547.1488139/1‑94 (MQ=60)
GATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCA > SRR4302547.3752108/1‑94 (MQ=60)
ATGGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAA > SRR4302547.960590/1‑94 (MQ=60)
GGTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATG < SRR4302547.1910774/94‑1 (MQ=60)
GTCGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCGCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGT < SRR4302547.6173771/94‑1 (MQ=60)
CGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTA > SRR4302547.2557186/1‑94 (MQ=60)
CGAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTA > SRR4302547.3804677/1‑94 (MQ=60)
GAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAA > SRR4302547.2914927/1‑94 (MQ=60)
GAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAA > SRR4302547.2959338/1‑94 (MQ=60)
GAAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAA > SRR4302547.3599790/1‑94 (MQ=60)
AAGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAAC < SRR4302547.2318992/94‑1 (MQ=60)
AGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACT > SRR4302547.2921896/1‑94 (MQ=60)
AGCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACT < SRR4302547.1113733/94‑1 (MQ=60)
GCGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTA < SRR4302547.5546480/94‑1 (MQ=60)
CGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTAT > SRR4302547.5370311/1‑94 (MQ=60)
CGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTAT < SRR4302547.3612131/94‑1 (MQ=60)
CGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTAT > SRR4302547.2978430/1‑94 (MQ=60)
CGAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTAT > SRR4302547.1853565/1‑94 (MQ=60)
GAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATA > SRR4302547.5720384/1‑94 (MQ=60)
GAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATA > SRR4302547.5844648/1‑94 (MQ=60)
GAGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATA > SRR4302547.361326/1‑94 (MQ=60)
AGAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATCG > SRR4302547.6001175/1‑94 (MQ=60)
GAGGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGT < SRR4302547.3396181/94‑1 (MQ=60)
atgtcaagatcggaagagcgtcgtgtagggaaagagTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTC > SRR4302547.5518578/37‑94 (MQ=60)
GGCGATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCA < SRR4302547.3291558/94‑1 (MQ=60)
gcgATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAG < SRR4302547.1562380/91‑1 (MQ=60)
gcgATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAG < SRR4302547.1173535/91‑1 (MQ=60)
gcgATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑CGCTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAG < SRR4302547.1837121/91‑1 (MQ=60)
cgATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGC > SRR4302547.5351868/3‑94 (MQ=60)
G‑ATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCA > SRR4302547.1002105/1‑94 (MQ=60)
TTGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATGCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCAT < SRR4302547.6298559/94‑1 (MQ=60)
TGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATG < SRR4302547.1767551/94‑1 (MQ=60)
CTGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCA > SRR4302547.1960370/1‑94 (MQ=60)
AGCAGGTGCAACTCGAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAA < SRR4302547.3350413/94‑1 (MQ=60)
GCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATTTTGCGCAATGTTAACTTAAATCAGCATGCAAA > SRR4302547.611842/1‑94 (MQ=60)
GCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAAC < SRR4302547.955357/94‑1 (MQ=60)
CAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACA > SRR4302547.4859318/1‑94 (MQ=60)
AGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAA > SRR4302547.1164263/1‑94 (MQ=60)
GTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAAT > SRR4302547.1811257/1‑94 (MQ=60)
GTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAAT > SRR4302547.316189/1‑94 (MQ=60)
TGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAGCTATAGTCAGCATGCAACAAATC > SRR4302547.4760583/1‑94 (MQ=60)
TGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATC < SRR4302547.3496775/94‑1 (MQ=60)
GCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCA > SRR4302547.3280994/1‑94 (MQ=60)
CAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCAC > SRR4302547.3260453/1‑94 (MQ=60)
CAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCAC > SRR4302547.620711/1‑94 (MQ=60)
CAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCAC > SRR4302547.2599144/1‑94 (MQ=60)
AAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACA > SRR4302547.5691312/1‑94 (MQ=60)
AAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACA > SRR4302547.545122/1‑94 (MQ=60)
ATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATT < SRR4302547.682035/94‑1 (MQ=60)
TCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTG > SRR4302547.3181214/1‑94 (MQ=60)
TCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTG < SRR4302547.310736/94‑1 (MQ=60)
TCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTG < SRR4302547.1685597/94‑1 (MQ=60)
CCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGC > SRR4302547.1690230/1‑94 (MQ=60)
CAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCC > SRR4302547.3109509/1‑94 (MQ=60)
CAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCC > SRR4302547.4248777/1‑94 (MQ=60)
CAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCC > SRR4302547.2016198/1‑94 (MQ=60)
CAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCC > SRR4302547.3041673/1‑94 (MQ=60)
CAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGAC > SRR4302547.4060827/1‑94 (MQ=60)
CAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTACC > SRR4302547.3508822/1‑94 (MQ=60)
AGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCT > SRR4302547.5497523/1‑94 (MQ=60)
AGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCT < SRR4302547.2928978/94‑1 (MQ=60)
GATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTG > SRR4302547.5699284/1‑94 (MQ=60)
ATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGA < SRR4302547.745853/94‑1 (MQ=60)
TGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGTCC‑C‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAAT < SRR4302547.4556370/94‑1 (MQ=60)
GTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATC > SRR4302547.5070362/1‑94 (MQ=60)
GTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATC < SRR4302547.6103736/94‑1 (MQ=60)
GTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATC < SRR4302547.2565736/94‑1 (MQ=60)
TTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCG < SRR4302547.6621572/94‑1 (MQ=60)
TTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCG < SRR4302547.256468/94‑1 (MQ=60)
TTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCG < SRR4302547.1682969/94‑1 (MQ=60)
TTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCG < SRR4302547.1946952/94‑1 (MQ=60)
TGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGG < SRR4302547.5765076/94‑1 (MQ=60)
TGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGG < SRR4302547.1921774/94‑1 (MQ=60)
GTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTC > SRR4302547.5240387/1‑94 (MQ=60)
GTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTC > SRR4302547.3921964/1‑94 (MQ=60)
TTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCA < SRR4302547.2489814/94‑1 (MQ=60)
TTGTTGCCATGGTATGCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCA < SRR4302547.1852942/94‑1 (MQ=60)
TTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCT < SRR4302547.2374135/94‑1 (MQ=60)
TTGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCT < SRR4302547.5011234/94‑1 (MQ=60)
TGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTT < SRR4302547.83144/94‑1 (MQ=60)
TGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTT < SRR4302547.5860469/94‑1 (MQ=60)
TGCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTT > SRR4302547.2685907/1‑94 (MQ=60)
GCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTT < SRR4302547.5875999/94‑1 (MQ=60)
GCCATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTCAATCGGCTCATCTTT > SRR4302547.1911129/1‑94 (MQ=60)
GCCATAGTATACTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTT < SRR4302547.1592927/94‑1 (MQ=60)
CATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTA > SRR4302547.6517855/1‑94 (MQ=60)
CATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTA < SRR4302547.5626624/94‑1 (MQ=60)
CATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTA > SRR4302547.1355343/1‑94 (MQ=60)
CATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTA > SRR4302547.5733957/1‑94 (MQ=60)
CATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTA > SRR4302547.1387477/1‑94 (MQ=60)
ATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTAT > SRR4302547.974738/1‑94 (MQ=60)
ATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTAT > SRR4302547.4812403/1‑94 (MQ=60)
ATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTAT > SRR4302547.3376977/1‑94 (MQ=60)
ATGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTAT < SRR4302547.1654432/94‑1 (MQ=60)
TGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATG > SRR4302547.2900343/1‑94 (MQ=60)
TGGTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATG > SRR4302547.2147673/1‑94 (MQ=60)
GTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCA > SRR4302547.2771116/1‑94 (MQ=60)
GTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCA > SRR4302547.4066478/1‑94 (MQ=60)
GTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCA > SRR4302547.1092374/1‑94 (MQ=60)
GTATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATCCA < SRR4302547.6686426/94‑1 (MQ=60)
ATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGT > SRR4302547.2112618/1‑94 (MQ=60)
ATTCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGT > SRR4302547.6250252/1‑94 (MQ=60)
TCTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCC < SRR4302547.1616714/94‑1 (MQ=60)
CTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCT < SRR4302547.5744772/94‑1 (MQ=60)
CTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCT > SRR4302547.3470514/1‑94 (MQ=60)
CTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCT > SRR4302547.2456778/1‑94 (MQ=60)
CTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCT < SRR4302547.2812802/94‑1 (MQ=60)
CTCCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCT > SRR4302547.6277470/1‑94 (MQ=60)
CCGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGC > SRR4302547.1071166/1‑94 (MQ=60)
CGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCA > SRR4302547.5208244/1‑94 (MQ=60)
CGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCA < SRR4302547.1154062/94‑1 (MQ=60)
CGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCA < SRR4302547.298747/94‑1 (MQ=60)
CGT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGGTAACTATAGTCAGCATGCATCAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCA > SRR4302547.6785316/1‑94 (MQ=60)
GT‑ACC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAG > SRR4302547.838433/1‑94 (MQ=60)
tacC‑CTTATCAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGA > SRR4302547.6639947/4‑94 (MQ=60)
tacC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGA > SRR4302547.5076532/4‑94 (MQ=60)
tacC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGA < SRR4302547.2721371/91‑1 (MQ=60)
tacC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGA > SRR4302547.5770009/4‑94 (MQ=60)
tacC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGA > SRR4302547.6208926/4‑94 (MQ=60)
tacC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGA < SRR4302547.2049221/91‑1 (MQ=60)
tacC‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGA > SRR4302547.1993837/4‑94 (MQ=60)
C‑C‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAAT > SRR4302547.2511851/1‑94 (MQ=60)
C‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATG < SRR4302547.4159429/94‑1 (MQ=60)
C‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATG > SRR4302547.1457648/1‑94 (MQ=60)
C‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATG < SRR4302547.4489303/94‑1 (MQ=60)
C‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATG > SRR4302547.6153039/1‑94 (MQ=60)
C‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATG < SRR4302547.2778746/94‑1 (MQ=60)
CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGA > SRR4302547.4534013/1‑94 (MQ=60)
CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGA < SRR4302547.3748314/94‑1 (MQ=60)
CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGA < SRR4302547.2618756/94‑1 (MQ=60)
|
CGTCGTCCGGGGTCTGAACGATGGTCGAAGCGAGAGGC‑ATGCAGCAGGTGCAAATCCAGATTGTTGTGTTGTTGCCATGGTATTCTCCGT‑A‑C‑CTTATAAAAATGTTGCGCAATGTTAACTATAGTCAGCATGCAACAAATCACATTGCCTGAATCGGCTCATCTTTTATGCAGTCCTGCAGAATGA > NC_000913/4013680‑4013865
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
