Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F35 I0 R1
|
304 |
9232.4 |
10623078 |
98.3% |
10442485 |
135.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
5,044,137 |
G→T |
12.9% |
V1256V (GTG→GTT) |
CIW80_RS25525 → |
EntS/YbdA MFS transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 5,044,137 | 0 | G | T | 12.9%
| 309.3
/ 4.6
| 186 | V1256V (GTG→GTT) | CIW80_RS25525 | EntS/YbdA MFS transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (82/60); new base T (11/18); total (100/86) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.55e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
AAGGCGGTATGACCGTTACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGGATTGATATCACCGGCGA > NZ_CP022686/5043998‑5044271
|
aaGGCTGCATGACCGTAACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGCCGGCTACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTg < 8:1193347/140‑1 (MQ=11)
aaGGCGGTATGACTGTTACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTg < 8:336013/140‑1 (MQ=38)
aaGGCGGAAGGACCGTAACCGATACGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCATCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTg < 6:1069312/140‑1 (MQ=11)
aGGCGGTATGCCCGTTACCGATCCGTATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGTGCGTGAACAACGCCGGTGACAGTTCCATCAGCAACGTCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGTAGCCACCGTGa > 2:837041/1‑140 (MQ=14)
gCGGTATGACCGTTACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGa > 3:225598/1‑138 (MQ=255)
gCGGTATGACCGTTACCGATCCGGATTACATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTAGTGAACAACGACGTTGCCAGTGCCATCAGCCACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGCAGCCACCGTTAAc > 7:1132529/1‑140 (MQ=14)
gcctGACCGTTACCGATCCGGATTCAATCGGTATTCAGATCGACGTCGACACTGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGTCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACa < 3:992701/135‑1 (MQ=14)
gTATGACCGTTACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCCCCGTTAACAAt > 5:919481/1‑140 (MQ=255)
gTATGACCGTTACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTCAACAAt > 5:1295912/1‑140 (MQ=255)
caTGACTGTTACCGAGCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATa < 8:527070/139‑1 (MQ=255)
aTGACCGTTACCGATCCGGATTCCATCGGGATTCACATCGACGGCGACAAGGCGGTCGAGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGCTTAAAGGAGATGAAGCCACCGAGAACAaaaa > 6:895191/1‑140 (MQ=14)
tGACCGTTACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCTACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGAGCCAGTGGCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGTTTAACGGTGATGAAGCCACCGGGAACAATacc > 7:615888/1‑138 (MQ=14)
cGTTACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACggaa > 1:654504/1‑138 (MQ=255)
agTTACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAAAAACGACGGTGACAGTGCCATCAGAAACGGAGGCACCGGCCCGCAGTTTAACGGTGATGCAGCCACCGTAAACAATAActcta > 6:920547/2‑136 (MQ=11)
ttACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTCAACAACGCCGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCCGCACCGGCACGCAGGTTAACAGTGATGAAGCCACCGTTCACAATAACggcaga > 6:733145/1‑136 (MQ=11)
aCCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTaaa > 4:990173/1‑138 (MQ=37)
ccGGATTCCATCGGTATTCAGATCGCCGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGAAACGGCGGCACCGGCACGCAGCATAACGGTGATGAAGCCACCGTTAACAATAACTGAATCACCACCGt > 5:785546/1‑140 (MQ=11)
ccGGATTCCATAGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACCGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAAAAACGGTAAAACCACCGt > 2:482864/1‑140 (MQ=255)
ggATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTg < 1:574411/140‑1 (MQ=37)
gATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTTAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGa < 6:242179/140‑1 (MQ=21)
gATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTTAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGa > 1:371473/1‑140 (MQ=21)
cgaTCGGAATTCAGATCTACGGCGACAAGGCGGTCGTTAACAACGCCGGTGACTGGGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGt < 8:23548/138‑1 (MQ=11)
ccATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTTAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGt < 2:463753/140‑1 (MQ=37)
ccATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTTAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGt < 8:100860/140‑1 (MQ=21)
aTCGGTTTTCAGATCGACGGCGACAAGGGGGTCGTGAACAAAGTCGGTGACATTGCCATCACCAAAGGCGGCAACGGCACGCATGTTAACGGTGATTAATCCACCGTTAACAATAAAGGTAAAACCACCGTTGATGGt < 4:552400/138‑1 (MQ=11)
gTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAAAAATAACGGTAAAACCACCGTTGAGGGtaaaggg > 7:1263589/1‑134 (MQ=255)
gTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGAGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAaccac < 2:996773/124‑1 (MQ=25)
tATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAACCCACCGTTGATGGTCAGGGCt > 7:908137/1‑140 (MQ=37)
cAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCCCCGTTGATGGTCTGGGCTCGAt < 7:627804/140‑1 (MQ=255)
aTCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGAGGGTCAGGGCTCGAGCgg > 8:908656/1‑140 (MQ=255)
aTCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGAAGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGACCgg > 6:255072/1‑140 (MQ=17)
aTCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGAGAAGAAGCCACCGTTAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCgg > 1:1291436/1‑140 (MQ=12)
cGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGCTGGTCAGGGCTCGAGCGGTAc > 4:95682/1‑138 (MQ=255)
cGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTAc > 4:212128/1‑138 (MQ=255)
cGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGGACAACCACCGTTGATGGTCAGGGATCGAACGGTCCCg > 2:150402/1‑140 (MQ=14)
ccagccGGTCGTTAACTACGAAGTTGCCAGGGCGAGCATCATCTGATTCACCGTCACGCTGCTTAAGGGTGATGAAGCCACGGTCAACAATAACGGAAATACCACCGTTGACGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATcg < 6:937059/135‑1 (MQ=255)
aGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATcgcg < 1:1363782/140‑1 (MQ=255)
gCGTTCGTGAACAACGACGGTGACAGGTCCATCAGCTATGGCGGCACCGGAACGCTGTTTAACGGTGATGATGCGACGGTCAACAAAAATGGTAATACCACCGTAGATGGTCAGGGATCGATCGGAACCGAAATCGCggg < 8:630744/140‑1 (MQ=2)
gCGGTCGTGAACATCGAAGTTGACAGTGCCTTCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTTAACAATATCGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGAACCGAAATcgcg < 3:662675/138‑1 (MQ=11)
gTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCCTCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGTTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGAAGGTCAGGGATCGATCGGTACAGAAATCTCGGGtaa > 8:972348/1‑140 (MQ=14)
tCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGAAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTTAACAATAAAGGGAAAACCACCGTTGATGGTCATGGCTCGAGCGGTACCGAAGTCGCGGGtaat > 8:838678/1‑140 (MQ=14)
tGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGTTAATAAc > 5:554947/1‑140 (MQ=255)
aacaacGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTTAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGc < 6:491860/108‑1 (MQ=25)
acgactGTGACATTGCCATCAGCTACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCtgtg < 6:551412/140‑1 (MQ=255)
cgacgGTGACAGTTCCATCATCAAGGGCGGCACCGGCACGCCGGTTAAGGGTGATGAAGCGACCGTGAACAATAACGGAAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCggtgg < 7:43262/140‑1 (MQ=14)
cgacgGTGACAGTGCCATCAGCTACGGCGGCACCGGAACGCAGGTTCACGGGGATGAAGCCACCGTGAACAATAAAGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCggt < 4:414369/138‑1 (MQ=14)
cgacgGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCggtgg < 8:870028/140‑1 (MQ=255)
cgaagGTGACAGTGCCATCATCAACGGCGGCACCGGCACGCATGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACTGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCTGTTAATAACGCggtgg < 5:1224045/140‑1 (MQ=14)
gTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTTAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGa < 4:644046/138‑1 (MQ=255)
gTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGAAAAACCACCGTTGAAGGTCAGGGTTCGAGCGGAACAGAAATAGCCGGTTATAACGCGGTGGTGaag > 8:687783/1‑139 (MQ=11)
gACAGTGCCATCAGAAACGGCGGCACCGGAACGCAGGATAACGGTGAGTAAGCCACCGTCAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGAGCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCa < 8:366109/140‑1 (MQ=14)
aCAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAg < 2:540675/140‑1 (MQ=255)
aCAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGAAAAACCACCGTTGAGGGTCAGGGCTCGATCGGAACTGAAATCGAGGGTTAGAACGCGGTGGTGAACCAg > 2:1071811/1‑140 (MQ=11)
agcccgaTCAGCTACGGCGGCACCGGAACCCAGTTTAAGGGTGATGAAGCGACCGACAACAATAAAGGTAAAACCACCGTAGATGGTCAGGGCTCGATCGGAACAGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGa < 8:405433/134‑1 (MQ=11)
aGTTCCATCATGTACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCATGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAg < 3:402682/138‑1 (MQ=14)
aGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAACAACGCGGTGGTGAACCAg > 4:301350/1‑138 (MQ=255)
aGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGAAAAACCACCGTTGAGGGAAAGGTCTCGACCGGAACGGAAATCGCCGGTAATAACGCGCTCGTCAATCAGGa > 6:159116/1‑140 (MQ=11)
gtcccATCCTCAACGGCGGCACCGGCACCCAGGTTAAGGGTGATGAAGCCACCGACAACAATACCGGCAAAACCACCGTAGAAGGTCAGGGATCGATCGGAACAGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGAc < 5:223717/137‑1 (MQ=11)
tGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCCCGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGAAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGAACGGAACCGAAATCGCGGGTAAAAACGCGGTGGTGAATCAGGACg > 5:1190544/1‑140 (MQ=14)
tGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTACAACCACCGTTGAAGGTCACGCGTCGAGCGGGACGGAGATATCGGGTAATAAAGCCGTGGTGAAGCAGGACg > 1:582287/1‑140 (MQ=11)
tGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACAGTTGAGGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGATATCGCGGGTAAAAACGCGGTGGTGAATCAGGACg > 1:1067907/1‑140 (MQ=255)
tGCCATCAGCAACGGCGGCACCGCCACGCAGGTTAACGGTGATGACGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGAcc > 5:160008/1‑139 (MQ=255)
tccATCAGCTACGGCGGCACCGGAACGCTGTTTACCGGTGATGAAGCCACCGGTAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGAACAGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGAc < 3:74320/137‑1 (MQ=11)
gCCATGAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGTTGAAGCCTCCGTTAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGTTACCGAAATCGCTGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACgg < 5:608436/140‑1 (MQ=14)
cATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACgg < 3:123702/138‑1 (MQ=255)
aTCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGCAGCCACCGTGAACAATAACGGAACAACCACCGTTGAAGGAAATGGCTCGAGCGGAACCGACATAGCCGGTGAAAACGCGGTCGTGAATCACGACggg > 3:325905/1‑137 (MQ=14)
aTCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTac > 6:21613/1‑140 (MQ=255)
tCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTa < 4:1141284/138‑1 (MQ=255)
tCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGAAAAACCACCGATGAAGCTCAGAGCTATATCGGTACCGAAAACGCGGGAAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTaaa > 7:795643/1‑138 (MQ=17)
cAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTacac > 7:65748/1‑140 (MQ=255)
gCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTTAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTg < 5:462612/140‑1 (MQ=255)
aaCGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGAGCGGTACAGAAATCGCGGGTAAGAACGCGGTGGTCAAGCAGGACGGAAACCTGGa > 2:1093706/1‑140 (MQ=14)
aCGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGAt < 1:515492/140‑1 (MQ=255)
cggcggCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGGGAATCAGGACGGTTCACTggctt > 8:763717/1‑137 (MQ=255)
cggcacGCAGGTCAACGGCGATGCAGCCACCGTGAACAATAACGGTAACACCCCCGTTGAAGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGTTAATACCGCGGGGGAGAATCAGGACGGTACACTGGATGTCAgcgg < 4:1040359/138‑1 (MQ=25)
ggcacGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGATGTCAgcggc < 4:1170972/138‑1 (MQ=255)
gcacGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGATGTCAgcggcggc > 6:1263018/1‑140 (MQ=255)
cAGGTTAACGGCGAAGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCa < 6:796692/140‑1 (MQ=255)
gTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAAACAGGACGGTACACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACgg > 7:486844/1‑140 (MQ=255)
aaCGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAAGAACGCGGTGGTGAAGCAGGACGGAGCACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGCAt > 2:1225366/1‑140 (MQ=17)
cGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTAACCTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCGCGGGAt > 3:621527/1‑138 (MQ=255)
tgatgaAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGAt < 2:1341233/57‑1 (MQ=255)
tgatgaAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGAt > 1:1341233/1‑57 (MQ=255)
tgatgaAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGGATTGata > 5:717736/1‑140 (MQ=255)
tgatgaAGCCACCGTCAACAATAACGGTAAAACCCCCTTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGAACCGAAATCTCGGGTAAAAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACTCTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGGATTGata > 5:903380/1‑140 (MQ=18)
cgatgaAGCCACCGTGAACAAAAACTGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAAGCAGTACGGTACACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGGATTGata < 5:1125954/139‑1 (MQ=255)
atgatgCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATTGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAAt < 7:238019/92‑1 (MQ=255)
atgaAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGATTCAGGACGGTAAGCTGGATGTGAGCGGCGGCGGTCACGGAATTGATATc > 5:506607/1‑140 (MQ=17)
atgaAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTTCACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGCATTGATATc > 5:16828/1‑140 (MQ=255)
atgaAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTGCACTGGATGTCAGAGGCGGCGGTCACGGGATTGATATc > 1:808371/1‑140 (MQ=255)
atgaAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGCATTGatagt > 2:682997/1‑138 (MQ=255)
atgaAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTCGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGGATTGATATc > 5:1005073/1‑140 (MQ=255)
atgaAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGGACGCTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGCATTGatata > 1:1022262/1‑139 (MQ=255)
atgaAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATAGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTCGTGAAGCAGCACGGTAGACTGCATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGGATTGATATc > 1:1137451/1‑140 (MQ=17)
atgaAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGAGGGTAAGGGCTCGAGCGGTACAGAAATAGCGGGTAATAACGCCGTGGTGAAACAGGTCGGTACAATCGAGGTCAGCGGCCGCGGTAACGGGATTGATATc > 7:386886/1‑140 (MQ=17)
gaAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAg > 4:1030473/1‑93 (MQ=255)
gaAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAg < 3:1030473/93‑1 (MQ=255)
gaAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGGATTGATATc > 3:291807/1‑138 (MQ=255)
gaAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGCATTGATATc > 3:1088468/1‑138 (MQ=255)
aCCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGCTCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGATGTCCGCGGCGGCGGTCACGGGATTGATATCACCGGCGa > 1:232393/1‑140 (MQ=255)
|
AAGGCGGTATGACCGTTACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGGATTGATATCACCGGCGA > NZ_CP022686/5043998‑5044271
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
