Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F2 I0 R1
|
233 |
6461.8 |
9239822 |
98.3% |
9082745 |
135.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
5,044,137 |
G→T |
17.7% |
V1256V (GTG→GTT) |
CIW80_RS25525 → |
EntS/YbdA MFS transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 5,044,137 | 0 | G | T | 17.7%
| 251.9
/ 11.2
| 165 | V1256V (GTG→GTT) | CIW80_RS25525 | EntS/YbdA MFS transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (61/55); new base T (4/25); total (77/88) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.35e-04 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
AAGGCGGTATGACCGTTACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGGATTGATATCACCGGCGA > NZ_CP022686/5043998‑5044271
|
aaGGCGGTATGACCGTTACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTg < 3:789707/140‑1 (MQ=255)
aaGGCGGTATGACCGTAACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTg < 8:688751/140‑1 (MQ=255)
aGGCGGTATGACCGTTACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGa > 1:298882/1‑140 (MQ=255)
gCGGTATGCCCGTTACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCCTCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAAc > 7:337395/1‑140 (MQ=255)
gCGGTATGACCGTTACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGCCAGTGCCATCAGCAACGGCGGCCCCGGCACGCAGATTAACGGTGATGAAGCCACCGTTAAc > 2:884815/1‑140 (MQ=255)
ggTATGACCGTTACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGCCGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAAc > 6:238340/1‑138 (MQ=255)
ggTATGACCGTTACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAAc > 6:372567/1‑138 (MQ=255)
gcaTGACTGTCACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGaa < 1:780981/134‑1 (MQ=2)
gcaTGACCGTTACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAAt < 2:72311/138‑1 (MQ=255)
gTATGACTGTAACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAAt < 7:383654/140‑1 (MQ=255)
gTATGACCGTTACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAAt < 3:971347/140‑1 (MQ=255)
gTATGACCGTTACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAAt > 2:1117041/1‑140 (MQ=255)
aTGACCGTTACCGAACCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACTAGGCGGCCGTGAACAACGACGGTGCCAGAGCCATCCGCACCGGCGGCCCCGGCACGCAGGTTAACGGTCATGACGCCACCGTGAACAAt > 5:72659/1‑138 (MQ=14)
tGAGCGTTACCGATCCGGATTCCCTCGGTATTCTGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATa < 5:28440/138‑1 (MQ=255)
ttACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGCCGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGCTTAACGGTGATGAAGCCACCGTAAACAATAACggcata > 8:132606/1‑136 (MQ=255)
ttACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGAAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTCAACAATAACggcaga > 2:763491/1‑136 (MQ=255)
aCCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTg < 5:156445/123‑1 (MQ=35)
gATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGGCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAacc < 6:70839/138‑1 (MQ=37)
ccGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACTCAGCTTAACGGTGATGAAGCCACCGTCAACAATAACGGGACAaccaccct > 2:1161082/1‑138 (MQ=11)
ccGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGt < 4:575869/140‑1 (MQ=37)
ccGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGAAACGGCGGCACCGGCACGCAGCTTAACGGTGATGAAGCCACCGTAAACAATAACGGAAACACCACCGt > 7:799061/1‑140 (MQ=11)
ggATTCCATAGGTTTTCAGATACACGGCGACAAGGCCGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGt < 5:1042961/138‑1 (MQ=11)
cATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGAAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTTAACAATAACGGGATCACCACCGTTGAAggaa > 8:1029895/1‑138 (MQ=11)
tCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTg > 7:571602/1‑107 (MQ=38)
tCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTg < 8:571602/107‑1 (MQ=38)
tCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTg < 2:325812/132‑1 (MQ=37)
gTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCCCGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTTAACAATAACGGAAACACCACCGTTGAAGGtaaagtt > 1:1109968/1‑134 (MQ=11)
gTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCAATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGc < 1:398267/140‑1 (MQ=37)
atacAGATCCACGGCGACAAGGCGTTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTACCGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTc < 8:419039/137‑1 (MQ=255)
ttCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCg > 4:740354/1‑140 (MQ=37)
cataTCGACGGCGACAAGGCTTTCGTCAACAACGACGGTGACAGTGCCAGCAGTAACGGCGGCACCGGCACGCTGTTTAACGGTGATGAAGCCATCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGAt < 3:238530/137‑1 (MQ=11)
gACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGa < 2:665048/119‑1 (MQ=39)
gACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGa > 1:665048/1‑119 (MQ=39)
cGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGAAGGTCATGGGTCGATCGGTAc > 5:62466/1‑138 (MQ=255)
cGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGAAAGGTACCGaaa > 3:363554/1‑140 (MQ=255)
cAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATcg < 1:155457/140‑1 (MQ=255)
cAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATcg < 7:25322/140‑1 (MQ=255)
aGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATcgcg < 3:1042190/140‑1 (MQ=255)
gCGGTCGTTAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCTGGTTAACGGTGATGATGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCggg < 3:192454/140‑1 (MQ=255)
gTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGtaa > 7:771108/1‑140 (MQ=255)
gTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACAGGCCCGCAGGTAAACGGCGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTTCCGAAATCGCGGGtaa > 1:872270/1‑140 (MQ=14)
gAACAACGACGGGGACAGAGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTAAACGGTGATTAAGCCACAGTGAACAAAAACTGTAAAACCACCTTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGtaataa < 5:682988/138‑1 (MQ=14)
caataacGACGGTGACAGTGCCATCAGTAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGGAAAACCACCGGTGATGGTCAGGGCTCGAGCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAAcg < 3:890449/136‑1 (MQ=14)
acgacgGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAAAAACGGTAAAACCACCGTTGATGGAAAAGGCTCGAACGGTACCGAAATCTCGGGTAACAAAGCggtg > 8:733509/1‑140 (MQ=14)
cgacgGTGACAGTGCCATCAGTAACGGCGGCCCCGGCACGCAGCTTAACGGTGATGAAGCCACCGTAAACAATAACGGAAAAACCACCGTTGAGGGTCAGGGCTCGAGCGGGACCGAAATCGCGGGTATTAACGCggtgg > 4:890449/1‑140 (MQ=11)
cgacgGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCTCTCAGTGTAACGTAGAAGACGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCggtgg < 1:971706/140‑1 (MQ=14)
cgacgGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTTAACAATAACGGTAAAACCAGCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCggtgg < 7:314515/140‑1 (MQ=255)
cgacgGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCggt < 6:626086/138‑1 (MQ=255)
cgacgGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGAGATGAAGCCACCGTCAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGAt > 1:318716/1‑108 (MQ=16)
cgacgGTGACAGTGCCATCAGAAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTCAACAATAACGGTATAACCACCGTTGAAGGAAAAGGATCCAGAGGTACCGATATATCGGGTGATAACGCgttgg > 2:145665/1‑140 (MQ=14)
ttGACAGTGAGATCATCTACGGCGGCACCGGCACGCAGTTTACGGGTGATGATGCCACGGAGAACAATATCGTCAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGAACAGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAAt < 7:121660/139‑1 (MQ=11)
gtgccagtgccaTCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAAAAACGGTAAAACCAACTTTGAAGGTCAGCGATCGAGCGGTACCGAATTCTCGGGTAATAACTCGGTGGTGAAt > 7:445891/1‑140 (MQ=14)
gTGACTGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCTCGAAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCTTTAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAAt < 3:210734/140‑1 (MQ=14)
gACAGTGCCATCAGCCACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTTAACAATAACGGTAAAACCAACTTTGATTGTCAGGTCTCGCTCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCTGTGGTGAAt < 6:973572/138‑1 (MQ=14)
gACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTTAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCa < 2:292455/140‑1 (MQ=255)
gACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTTAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCa < 8:680802/140‑1 (MQ=255)
gACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGatt > 6:592715/1‑136 (MQ=255)
gACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAAt < 6:729672/138‑1 (MQ=255)
gACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCa < 4:730754/140‑1 (MQ=255)
aGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTTAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGGCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGa < 3:497824/140‑1 (MQ=255)
aGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAAGGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAg < 6:345815/138‑1 (MQ=255)
aGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAACTCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGa < 1:340604/140‑1 (MQ=255)
aGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGa < 2:677422/140‑1 (MQ=255)
aGTGCCAGACGCAACGTCGGCACCGGAACGCAGGTTACCTGTGATGACGCCACAGAGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGAGTGTCAGGGATCGATCGGTACCTAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGa < 7:19830/140‑1 (MQ=14)
tGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCTGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTTAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACg < 4:19291/140‑1 (MQ=255)
tGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATcg < 2:1044771/110‑1 (MQ=255)
tGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTAAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCa < 8:587892/87‑1 (MQ=18)
tGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGGGAAGAAGCCACCGTTAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACAGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACg < 4:75359/140‑1 (MQ=255)
gCCATCAGGAACGGCGGCACCGGCACGGATGTTAACTCTCATATAGCCACCGTTAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACgg < 3:554540/140‑1 (MQ=14)
gCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTTACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACgg < 1:1038335/140‑1 (MQ=255)
gCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACGGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACgg < 8:337395/140‑1 (MQ=255)
ccATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAACACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGAGCGGTACCGACATCGCGGGTAAAAACGCGTTGGTGAATCAGGACGGt > 8:170939/1‑140 (MQ=14)
aTCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGAACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTac > 4:391871/1‑140 (MQ=255)
tCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTTAACAATAACGGTAAAACCAGCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTaca < 1:1109915/140‑1 (MQ=255)
tCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTaca < 3:740354/140‑1 (MQ=255)
aaCGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAAt > 4:216933/1‑51 (MQ=255)
aaCGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGAGGGTCATGGGTCGATCGGGACCGAAATCGCGGGTTAGAACGCGGTGGTGAAACAGGACGGTaccatcga > 4:146625/1‑134 (MQ=14)
cggcggCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGAt > 1:1019894/1‑84 (MQ=255)
cggcggCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGATg > 1:1121932/1‑140 (MQ=255)
cggcaccggcacGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGACATCGCGGGTAAGAACGCGGTGGTGAAGCAGGACGGTCACCTGGATGTcc > 1:102459/1‑139 (MQ=14)
gcaccggcacGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGTTCAGGGCTCGATCGGATCAGAAATAGAGGGTAATAACGAGGAGGTGAATAAGTACGGTAACCTGGATGTCAgc > 7:263211/1‑140 (MQ=14)
gcaccggcacGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAAGCAGGACGGTCCACTGGAGGTCAgc > 7:661654/1‑140 (MQ=255)
cggcacGCAGGTTAACGGCGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGATGTCAgcgg < 5:732404/138‑1 (MQ=255)
cgatctgtAACGGTGATGACGCGACCGACAACAATATAGGAAAAACCACCGTTGACGGGCAGGGCTCGATCGGTACTGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGATGTCAGCGGCGGCGGt < 1:524228/133‑1 (MQ=17)
gCAGGTTAACGGAGATGAAGCCACCGTTAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTc < 2:902458/140‑1 (MQ=255)
gtggTTAATGTTGATGAAGCCAGCGTGATCAATACCTGTACATCCACCGTTGATGGTCTGGGCTCGTTCTGTAGAGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGTATCAGGAGGGTACACTGGATGTCTGCGGCGGCGGTCa < 8:445891/138‑1 (MQ=18)
aaaCGGAGAAGAAGCCACCCTCAACAATAACGGTAAAACCACCGTAGACGGCCAGGTCTCTCTCGGTACCTAAATCGCGGGTAATCACGCGGAGCTGACTCATGACGGCACACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGGa < 2:1005926/139‑1 (MQ=17)
cGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGAGGGTCAGGGCTCGATCGGGACCGAAATCGAGGGTAAGAACGCCGTGGTGAAACAGGACGGTACCCGGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGGAt > 6:233698/1‑138 (MQ=17)
tgatgaAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGGATTGata > 8:245959/1‑140 (MQ=255)
ggatgaAGCCACCGTTAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGAGCGGTACCGAAATCGCGTGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGGATTGa < 5:264113/137‑1 (MQ=255)
atgaAGCCACCGTGAACAATAACGGTAACACCACCGTTGAGGGTCAGGGCTCGAGCGGGACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTGCACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGGATTGATATc > 2:182810/1‑140 (MQ=17)
atgaAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACCCTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGGAGTGataga > 3:262842/1‑138 (MQ=255)
atgaAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGGATTGATATc > 3:116955/1‑140 (MQ=255)
atgaAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGGATTGATATc > 7:969817/1‑140 (MQ=255)
atgaAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGGATTGATATc > 1:704785/1‑140 (MQ=255)
gaAGCCACCTTTAACAATACGGGAACACCCAGCGCTGATGTTCATGGCTCGATCGGTCCCGCACTCGCGGCTAATACCCCGGTGGTGAAGCAGGACGGCACACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGGATTGATATCAc < 4:944240/140‑1 (MQ=12)
gaAGCCACCGTGAACAATAACGGGAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGGACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTCCACTGGATGTCAGCTGCGGCGGTCTCGGGATGGAGATc > 6:1057642/1‑138 (MQ=17)
gCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGATCTCAGCGGCGGCGGTCACGGGATTGATATCACCgg > 1:296138/1‑140 (MQ=255)
aCCGTGAACAATAACTGTAAACCAACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGACTCAGGACGTGAAGATGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACTGAATTGATATCACGGgaga > 8:911077/1‑140 (MQ=14)
aCCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAAACAGGACGGGTCACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGCATTGATATCACgggg > 6:1101598/1‑137 (MQ=17)
|
AAGGCGGTATGACCGTTACCGATCCGGATTCCATCGGTATTCAGATCGACGGCGACAAGGCGGTCGTGAACAACGACGGTGACAGTGCCATCAGCAACGGCGGCACCGGCACGCAGGTTAACGGTGATGAAGCCACCGTGAACAATAACGGTAAAACCACCGTTGATGGTCAGGGCTCGATCGGTACCGAAATCGCGGGTAATAACGCGGTGGTGAATCAGGACGGTACACTGGATGTCAGCGGCGGCGGTCACGGGATTGATATCACCGGCGA > NZ_CP022686/5043998‑5044271
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
