Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F5 I175 R1
|
328 |
64.7 |
2582366 |
96.2% |
2484236 |
120.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP009273 |
783,406 |
T→C |
G296G (GGA→GGG) |
galM ← |
galactose‑1‑epimerase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP009273 | 783,406 | 0 | T | C | 100.0%
| 187.0
/ NA
| 54 | G296G (GGA→GGG) | galM | galactose‑1‑epimerase |
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|
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gAATACTTTTCGCCAGGACGCAGGAATCAGTCCGGTTGCGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCTGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTgccg < 2:1244230/138‑1 (MQ=255)
aTACTCTTCGCCAGGACGCAGGAAGCAGTCCGGTTGCGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGccgccg < 1:857249/139‑1 (MQ=255)
ctTCGCCAGGACGCAGGAAGCAGTCCGGTTGCGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAgg > 2:1113026/1‑137 (MQ=255)
cGCCAGGACGCAGGAAGCAGTCCGGTTGCGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGtt > 2:110813/1‑139 (MQ=255)
gCCAGGACGCAGGAAGCAGTCCGGTTGCGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTg > 1:787228/1‑139 (MQ=255)
gACGCAGGAAGCAGTCCGGTTGCGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCg > 1:1037033/1‑137 (MQ=255)
gACGCAGGAAGCAGTCCGGTTGCGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCg > 2:1226105/1‑137 (MQ=255)
aCGCAGGAAGCAGTCCGGTTGCGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAg < 2:542588/139‑1 (MQ=255)
aGCAGTCCGGTTGCGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGa > 1:10294/1‑135 (MQ=255)
aGCAGTCCGGTTGCGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGa < 2:10294/135‑1 (MQ=255)
aGTCCGGTTGCGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCag < 1:627189/139‑1 (MQ=255)
cGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCg < 2:1059951/139‑1 (MQ=255)
cGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCg < 2:787228/139‑1 (MQ=255)
ggCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCgg < 1:269821/139‑1 (MQ=255)
gCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCggt > 1:457852/1‑139 (MQ=255)
gCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCggt > 1:953815/1‑139 (MQ=255)
gCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCggt > 2:1288319/1‑139 (MQ=255)
gCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCggt > 2:735076/1‑139 (MQ=255)
ggtggtTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGAc > 1:524497/1‑139 (MQ=255)
tggtTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCt > 1:1017476/1‑139 (MQ=255)
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ttCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCg < 2:87042/123‑1 (MQ=255)
ttCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCg > 1:87042/1‑123 (MQ=255)
ttCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCtt > 1:633972/1‑137 (MQ=255)
ttCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCtt > 1:619717/1‑137 (MQ=255)
ctCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCgg > 2:905533/2‑124 (MQ=255)
ctCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCgg < 1:905533/123‑1 (MQ=255)
ggCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTg < 1:1288319/139‑1 (MQ=255)
tCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAAtt > 1:134873/1‑139 (MQ=255)
tCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGCGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAAtt > 2:463646/1‑139 (MQ=255)
gAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCAt < 1:1113026/138‑1 (MQ=255)
aaaCTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATct < 1:735076/139‑1 (MQ=255)
aCTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGa > 2:609112/1‑55 (MQ=255)
aCTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGa > 1:34731/1‑55 (MQ=255)
aCTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGa < 2:34731/55‑1 (MQ=255)
aCTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGa < 1:609112/55‑1 (MQ=255)
aCTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTg < 2:878252/91‑1 (MQ=255)
aCTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTg > 1:878252/1‑91 (MQ=255)
aCTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATctgc > 1:992245/1‑139 (MQ=255)
aCTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATctgc > 1:1188600/1‑139 (MQ=255)
aCTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATctgc > 2:150486/1‑139 (MQ=255)
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cTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGAc > 2:1193918/1‑138 (MQ=255)
cTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGAc > 1:49002/1‑138 (MQ=255)
ccagccCTTGCCCGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAGACATgcgc > 1:875081/1‑139 (MQ=255)
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gccCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAGACATGcgccgc > 2:480690/1‑139 (MQ=255)
ccAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGCCCAGACATGCGCCGCCACTTTc < 2:909412/139‑1 (MQ=255)
gCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAGACATGCGCCGCCACTTTCTTGCCAt < 1:791616/139‑1 (MQ=255)
cggtccCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAGACATGCGCCGCCACTTTCTTGCCATCGCCTTTGGc > 1:1020267/1‑139 (MQ=255)
ggtccCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGTCCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAGACATGCGCCGCCACTTTCTTGCCATCGCCTTTGGcc < 2:875081/139‑1 (MQ=255)
ggtccCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAGACATGCGCCGCCACTTTCTTGCCATCGCCTTTGGcc < 2:353053/139‑1 (MQ=255)
ggtccCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAGACATGCGCCGCCACTTTCTTGCCATCGCCTTTGGcc > 2:1041091/1‑139 (MQ=255)
ggtccCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAGACATGCGCCGCCACTTTCTTGCCATCGCCTTTGGcc < 1:1272534/139‑1 (MQ=255)
ggtccCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAGACATGCGCCGCCACTTTCTTGCCATCGCCTTTGGcc < 2:99106/139‑1 (MQ=255)
ggtccCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAGACATGCGCCGCCACTTTCTTGCCATCGCCTTTGGc < 1:343240/138‑1 (MQ=255)
|
TCAGGCTGGAATACTCTTCGCCAGGACGCAGGAAGCAGTCCGGTTGCGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTTCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAGACATGCGCCGCCACTTTCTTGCCATCGCCTTTGGCC > NZ_CP009273/783279‑783541
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ACTGATATTCCGTCAGGCTGGAATACTCTTCGCCAGGACGCAGGAAGCAGTCCGGTTGCGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTTCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAGACATGCGCCGCCACTTTCTTGCCATCGCCTTTGGCCTGTAACAAGAATGCG > NZ_CP009273/783267‑783556
|
gcagaagacggcatacgagattcgccttagtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGG < SRR3722129.2136/88‑1 (MQ=60)
tttttttcaagcagaagacggcatacgatattcgccttagtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGC < SRR3722129.618181/77‑1 (MQ=60)
GAATACTCTTCGCCAGGACGCAGGAAGCAGTCCGGTTGCGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGC > SRR3722129.798638/1‑151 (MQ=60)
AATACTCTTCGCCAGGACGCAGGAAGCAGTCCGGTTGCGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCC < SRR3722129.869481/151‑1 (MQ=60)
CTCTTCGCCAGGACGCAGGAAGCAGTCCGGTTGCGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGG > SRR3722129.1051618/1‑149 (MQ=60)
GCCAGGACGAAGGAAGCAGTCCGGTTGCGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAAT < SRR3722129.371368/151‑1 (MQ=60)
AGGACGCAGGAAGCAGTCCGGTTGCGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGC > SRR3722129.10412/1‑151 (MQ=60)
CAGTCCGGTTGCGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGG < SRR3722129.636515/151‑1 (MQ=60)
GTCCGGTTGCGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTG > SRR3722129.967291/1‑151 (MQ=60)
GTCCGGTTGCGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTG > SRR3722129.464467/1‑151 (MQ=60)
tggtcaagcagaagacggcatacgaagttcgccttagtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacaGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAG < SRR3722129.165559/81‑1 (MQ=60)
cgtgggctcggagatgtgtataagagacaGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGAC < SRR3722129.1038685/122‑1 (MQ=60)
gcggcaatcaaggggggttcgggcgtccggttagaacccggctttccgtggccagccttggccggccggcgtagggtccggTCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGAC < SRR3722129.154061/69‑1 (MQ=60)
gacagATTCAGGGTGGCTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACC < SRR3722129.918361/146‑1 (MQ=60)
CGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACC < SRR3722129.1118152/151‑1 (MQ=60)
CGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACC > SRR3722129.532159/1‑151 (MQ=60)
CGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACC < SRR3722129.273640/151‑1 (MQ=60)
cgccttagtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACC < SRR3722129.467157/109‑1 (MQ=60)
GCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTT > SRR3722129.1031840/1‑151 (MQ=60)
ATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCctgtc > SRR3722129.318236/1‑146 (MQ=60)
ATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTgtct > SRR3722129.88176/1‑147 (MQ=60)
ATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTC > SRR3722129.628928/1‑149 (MQ=60)
ATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTC > SRR3722129.643398/1‑149 (MQ=60)
GGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTT > SRR3722129.136694/1‑151 (MQ=60)
GGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCAT < SRR3722129.1306162/151‑1 (MQ=60)
GTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCtgtctcttatacacatctccgagcccacgagactaaggcgaagctcgtatgccgtcttctgcttggaaaaaa > SRR3722129.35165/1‑78 (MQ=60)
GTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCtgtctcttatacacatctccgagcccacgagacta > SRR3722129.890776/1‑114 (MQ=60)
GTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCT > SRR3722129.1006247/1‑151 (MQ=60)
GTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCT > SRR3722129.1205141/1‑151 (MQ=60)
GTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACC > SRR3722129.49661/1‑150 (MQ=60)
AGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAG < SRR3722129.1128559/150‑1 (MQ=60)
GAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAGAC < SRR3722129.745847/151‑1 (MQ=60)
CGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAGACATGCGC < SRR3722129.1243161/151‑1 (MQ=60)
GCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCCGTCGGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAGACATGCGCC > SRR3722129.887560/1‑151 (MQ=60)
GGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAGACATGCGCCGCCACTTTCTTGCCATCGCCTTTGGCC < SRR3722129.803087/151‑1 (MQ=60)
GGCGTAAGGTTCGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAGACATGCGCCGCCACTTTCTTGCCATCGCCTTTGGCC > SRR3722129.1034659/1‑151 (MQ=60)
gacaTCCCCGCGCCGGTTTGCCGCCGAGGAAGTTGCAGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGCCCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAGCCATGCGCCGCCACTTTCTTGCCATCGCCTTTGGCCTGTAACAAGAA < SRR3722129.1000462/147‑1 (MQ=60)
CGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAGACATGCGCCGCCACTTTCTTGCCATCGCCTTTGGCCTGTAACAAGAA < SRR3722129.1290203/151‑1 (MQ=60)
CGGTCCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAGACATGCGCCGCCACTTTCTTGCCATCGCCTTTGGCCTGTAACAAGA < SRR3722129.348192/150‑1 (MQ=60)
CCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAGACATGCGCCGCCACTTTCTTGCCATCGCCTTTGGCCTGTAACAAGAATGCG < SRR3722129.1055721/151‑1 (MQ=60)
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ACTGATATTCCGTCAGGCTGGAATACTCTTCGCCAGGACGCAGGAAGCAGTCCGGTTGCGGCCATTCAGGGTGGTTCGGGCTGTCCGGTAGAAACTCGCTTTCCAGAGCCAGCCCTTGCCAGTCGGCGTAAGGTTCGGTTCCCCGCGACGGTGTGCCGCCGAGGAAGTTGCCGGAGTAGAATTGCAGAGCCGGAGCGGTGGTGTAGACCTTCAGCTGCAATTTTTCATCTGCTGACCAGACATGCGCCGCCACTTTCTTGCCATCGCCTTTGGCCTGTAACAAGAATGCG > NZ_CP009273/783267‑783556
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
