Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
343 |
268.7 |
10873516 |
97.0% |
10547310 |
150.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
4,258,919 |
C→G |
intergenic (+132/+99) |
prpE → / ← RPPX_18965 |
propionyl‑CoA synthetase/ATPase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 4,258,919 | 0 | C | G | 100.0%
| 828.4
/ NA
| 241 | intergenic (+132/+99) | prpE/RPPX_18965 | propionyl‑CoA synthetase/ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (118/123); total (118/123) |
Only 100 of 250 total aligned reads displayed.
GCCCAGGGCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTGGTGCAGTTGCCCCAACCGGCTGCGGGTACGCA > CP009974/4258772‑4259064
|
gCCCAGGGCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTgcggcc > 2:2192317/1‑151 (MQ=255)
ccgaGGGCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGcggccg < 1:3971545/148‑1 (MQ=255)
cccAGGGCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGcggccg > 1:2918590/1‑151 (MQ=255)
cAGGGCGGGGTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCGTCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCt < 2:3149572/151‑1 (MQ=255)
aGGGCGGGTTGATGGTTTGACCTCGCTGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGGCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTa < 2:3864993/151‑1 (MQ=255)
gggTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTa < 2:1513102/151‑1 (MQ=255)
gggTTGATGGTTGGCCCTCGTTGGGCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTa < 2:5403396/151‑1 (MQ=25)
gggATGATGGTTTGCCCTCGTTGGCCCCTACGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTa < 2:2120537/151‑1 (MQ=255)
ggTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTACACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCCTAc > 2:3214209/1‑151 (MQ=255)
ggTTGATGGTGTGACCTCGAGGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATGGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTAc < 2:4411682/151‑1 (MQ=255)
ttGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTc < 1:5104630/151‑1 (MQ=255)
tGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGGAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTcg > 2:3515191/1‑151 (MQ=255)
tGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCGGCCGCTACCGTTCTCGCgg > 2:3341518/1‑151 (MQ=255)
tGGTGTGCCCTCGGTGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCgg < 2:4361535/151‑1 (MQ=255)
gTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCgggg > 1:1650106/1‑150 (MQ=255)
ttGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTCCCGTACTCGCGGGCaa > 2:338654/1‑151 (MQ=255)
tGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTaaa < 1:1206673/151‑1 (MQ=255)
cTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCg < 1:4301799/151‑1 (MQ=255)
ctGGCCCCTTCGCGGGCGGGGCGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTcc < 2:4865885/150‑1 (MQ=255)
ggCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGGTCCTa > 2:3458475/1‑151 (MQ=255)
ggCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa > 2:4644589/1‑151 (MQ=255)
gCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc > 1:2628441/1‑151 (MQ=255)
ccgcctggcggggggAACGTGCTGCGGTGGCACGGCAGAGGCCGTGGTAGGCGCGGGTTAAACCGAGAAGAGGCCGGGCCTGATGGCCAATTACCACCCGACGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACa < 2:1316039/144‑1 (MQ=17)
ccccTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACa > 2:663050/1‑151 (MQ=255)
ccccTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACa > 1:4065661/1‑151 (MQ=255)
ccTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGa > 2:1242513/1‑151 (MQ=255)
ttCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCAGACg > 2:2777608/1‑151 (MQ=255)
gggcgggACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGCTCACCGTTGCGCCCGCTACCGTGCTCGCGGGTATACCCGCCCCCACACACGCATcc > 2:1874309/1‑150 (MQ=21)
ggcgggACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCgg < 2:2885613/151‑1 (MQ=255)
cgggACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCggtg < 1:1520014/151‑1 (MQ=255)
cgggACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCggtg < 1:911577/151‑1 (MQ=255)
gggACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCggtgg > 1:2100577/1‑151 (MQ=255)
ggACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCggtggt < 1:2789121/151‑1 (MQ=255)
gACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCCCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTc < 1:5298381/151‑1 (MQ=255)
gACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTc > 2:4591946/1‑151 (MQ=255)
gACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTc < 2:2694692/151‑1 (MQ=255)
cGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGt < 1:3743108/151‑1 (MQ=255)
tGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAg < 2:2234700/151‑1 (MQ=255)
gggagcGGTGGCGCGGCGGAGGCCGGCGTGGGCGCGGGTTCGCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAg < 2:2513218/146‑1 (MQ=18)
ggaTCGGTGGCTCGGGAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAgg < 2:3103752/149‑1 (MQ=255)
gCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAgg < 1:1890015/151‑1 (MQ=255)
tCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGc > 2:263033/1‑151 (MQ=255)
cGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGGCGTAGGAGCg > 1:785711/1‑151 (MQ=255)
ggTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCgg > 1:702700/1‑151 (MQ=255)
gCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTc > 1:731667/1‑151 (MQ=255)
tCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTAGCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGCCGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGGTCAc > 2:5165454/1‑151 (MQ=255)
ggCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCAccc < 1:4644589/151‑1 (MQ=255)
cAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGACGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTTCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTCCACACGCTCCTACAGACGCACCGTTGGTCGCAGGACCTGGTTCACCcgc > 2:2274625/1‑151 (MQ=18)
agagGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCCCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGACCGGGGTCACCcgcg > 2:4267262/1‑151 (MQ=255)
gagGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGa < 1:5228930/151‑1 (MQ=255)
cgtcgtAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATggg > 1:318144/1‑151 (MQ=255)
gtcgtAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGc > 2:1556290/1‑151 (MQ=255)
tcgtAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGcc < 1:1196005/151‑1 (MQ=255)
ggtAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCg < 2:2191871/150‑1 (MQ=255)
cgtAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCg > 1:2431013/1‑151 (MQ=255)
aGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTGCACCCGCGAATGGGCCGGcc > 2:706619/1‑150 (MQ=255)
gcgcGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCa < 1:663050/151‑1 (MQ=255)
cgcgGGTTCCCCCGCGATGAGGCCGGGCTGGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCAGCGTTGCGGCCGCTACCGTTCTCGCGGGTTAACCCGCGCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAg < 2:4118086/151‑1 (MQ=21)
gcgGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAgg > 2:1679130/1‑151 (MQ=255)
gcgGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAgg > 1:4406625/1‑151 (MQ=255)
gggTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCa > 1:4748057/1‑151 (MQ=255)
gggTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCCATCGTACTCGCGGGCAAACCCGCTCCTACAGCCGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGCGCTCACTCGCGAATGCGCCTGCTCAGGCa > 2:1046876/1‑151 (MQ=18)
ggTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTAGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAg < 1:3406256/147‑1 (MQ=255)
gTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACt < 1:453001/151‑1 (MQ=255)
cACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATAGGAGGTCGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAATTGTCCGGCTCAGGCCCTGCa > 1:2323418/1‑151 (MQ=18)
cccGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAgg < 1:3493649/151‑1 (MQ=255)
gcgAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTc > 1:998299/1‑151 (MQ=255)
cgAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCa < 1:5199028/151‑1 (MQ=255)
cgAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCa > 1:2230847/1‑151 (MQ=255)
gAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCAAATTCCCACCCGCCGGTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTGCAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAg < 2:2065487/151‑1 (MQ=37)
ggCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGCATGGGCCCGCCCCGGCACCGGACGCACAGGGGGc > 2:4449442/1‑151 (MQ=18)
ggCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGc > 1:2861451/1‑151 (MQ=255)
cggggCCTACTGGCCAATTACCGCCCTCCGTTCGCCGTTTCGGCCGCTTCCGTTCTCGTGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCaa < 1:5362293/149‑1 (MQ=37)
ccGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGCGCGGGCTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCaa > 2:3266560/1‑151 (MQ=255)
cGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAAt > 1:3041701/1‑151 (MQ=255)
gggCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATc > 1:4235255/1‑151 (MQ=255)
ggCCTGGGGGCCAATTGCCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCGACCGTACTCGCGGGTACACCCGCTCCTACGGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTGCACCCGCGAAGGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCt < 2:3579868/151‑1 (MQ=255)
ggCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCt < 2:602260/151‑1 (MQ=255)
gCCGGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTg < 2:3740339/151‑1 (MQ=255)
ccTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTgg > 1:1341347/1‑151 (MQ=255)
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CAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGC > SRR10918230.1522736/1‑151 (MQ=60)
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GGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCA < SRR10918230.2409333/151‑1 (MQ=60)
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CACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCA > SRR10918230.431651/1‑151 (MQ=60)
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CACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATAGGAGGTCGTAGGAGCGGGTTTAGCCGCGAATTGTCCGGCTCAGGCCCTGCA > SRR10918230.2333324/1‑151 (MQ=48)
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CGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCA > SRR10918230.2240304/1‑151 (MQ=60)
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aaggcGCCGGTCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTGCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGG < SRR10918230.4346652/146‑1 (MQ=60)
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AATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTGGTGCAGTTGCC < SRR10918230.4186565/151‑1 (MQ=60)
AATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTGGTGCAGTTGCC < SRR10918230.542911/151‑1 (MQ=60)
AATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGCCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTGGTGCAGTTGCC > SRR10918230.4721604/1‑151 (MQ=60)
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ACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTGGTGCAGTTGCCCCAA < SRR10918230.1822924/151‑1 (MQ=60)
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GGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTGGTGCAGTTGCCCCAACCGGCTGCGGGTACGCATCAGG < SRR10918230.5346056/151‑1 (MQ=60)
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TTTGCCCAGGGCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTGGTGCAGTTGCCCCAACCGGCTGCGGGTACGCATCAGG > CP009974/4258769‑4259069
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
