Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
336 |
367.5 |
14491858 |
96.8% |
14028118 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
4,258,919 |
C→G |
intergenic (+132/+99) |
prpE → / ← RPPX_18965 |
propionyl‑CoA synthetase/ATPase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 4,258,919 | 0 | C | G | 99.4%
| 1186.1
/ NA
| 337 | intergenic (+132/+99) | prpE/RPPX_18965 | propionyl‑CoA synthetase/ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); major base G (169/165); minor base T (2/0); total (172/165) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 343 total aligned reads displayed.
TTTGCCCAGGGCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTGGTGCAGTTGCCCCAACCGGCTGCGGGTACGCATC > CP009974/4258769‑4259066
|
tttGCCCAGGGCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCCCCGTTgcc > 2:5229387/1‑151 (MQ=255)
gCCCAGGGCGGGTTGATGGTTTGACCTCGAGGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTgcggcc < 2:5326570/151‑1 (MQ=255)
ccAGGGCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCggccgc > 1:2794467/1‑151 (MQ=255)
cAGGGCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCt < 1:3226853/151‑1 (MQ=255)
aGGGCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTa > 1:1232427/1‑151 (MQ=255)
aGGGCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTa < 1:5597839/151‑1 (MQ=255)
gggCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCtcc > 1:3581993/1‑149 (MQ=255)
ggCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTAcc > 1:1599857/1‑151 (MQ=255)
ggCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTAcc < 2:1917883/151‑1 (MQ=255)
ggCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTAcc < 1:5175670/151‑1 (MQ=255)
ggTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTAc > 1:2285729/1‑151 (MQ=255)
tGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTcg < 1:5117502/151‑1 (MQ=255)
gagggTTTGGCCGCGATGGCCGCTTCGCGGGCGGGACGGGCATCGGTGGCTCGGGAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTcgc < 2:6994797/148‑1 (MQ=21)
gATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTcgc > 2:4178803/1‑151 (MQ=255)
ggTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCggg > 1:2160016/1‑151 (MQ=255)
gTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGGTCACCGTCGCGGCCCCCACCGCACTcccgccc > 2:5814356/1‑148 (MQ=25)
tttGTCCTCGATGGCCGCTGCGCGGGCGGGACGTGCAGCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGGCGTAGGCGCGGGTTCCCCCGCGAAGAGGACGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTa < 1:3145525/151‑1 (MQ=21)
ttGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTaa > 1:3628079/1‑151 (MQ=255)
gACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAAc > 2:3832946/1‑151 (MQ=255)
ccTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAAccc > 1:3904338/1‑151 (MQ=255)
cTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCg > 1:1916298/1‑151 (MQ=255)
gATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTc < 1:1626623/151‑1 (MQ=255)
gATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTc < 1:5252823/151‑1 (MQ=255)
tGGCCCCTTCGCGGGCGGGGCGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCt < 2:6658384/151‑1 (MQ=255)
gCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc < 1:2705773/151‑1 (MQ=255)
cccTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg > 1:6603452/1‑151 (MQ=255)
cccTGCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg < 1:7050121/151‑1 (MQ=255)
ccTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGa < 1:1448408/151‑1 (MQ=255)
cTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGAc > 1:1308081/1‑151 (MQ=255)
cTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGAc > 1:6803135/1‑151 (MQ=255)
tCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTACACCCGCTCCTACAGACGc > 2:1768582/1‑151 (MQ=255)
gcgggcggGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCAt < 2:2547583/151‑1 (MQ=255)
gggcgggACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCTACCGTACTCACGGGTAAACCCGCTCCTACTGACGCATCg > 2:317419/1‑151 (MQ=255)
gggcgggACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCg < 1:3936288/151‑1 (MQ=255)
gggcgggACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCg > 1:253442/1‑151 (MQ=255)
gggcgggACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGCGTAAACCCCCTCCTACAGAAGccgcg > 2:4346973/1‑147 (MQ=18)
ggcgggACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCCCCTACAGACGCAACgg > 2:6917332/1‑151 (MQ=255)
gACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTc < 1:2865539/151‑1 (MQ=255)
aCGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCg > 1:2458065/1‑151 (MQ=255)
cGTGCAGCGGTGGCGCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGt < 1:3005261/151‑1 (MQ=255)
ggCAGCGGTGGCTCGGCAGGGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAg < 2:7146734/150‑1 (MQ=255)
gCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAgg < 2:2377971/151‑1 (MQ=255)
cGGTGGGTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCg < 2:3392512/151‑1 (MQ=255)
gTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCggg > 1:2219914/1‑151 (MQ=255)
tGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCTGCCGCTACCGTACACGCGGGGAAACCAACACCTACAGTCGCCTCGGTGCGCGGAGGAGCGGGt > 1:6335990/1‑151 (MQ=18)
ggCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGtt < 1:4599931/151‑1 (MQ=255)
ggCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGtt < 2:5149671/151‑1 (MQ=255)
ggCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGtt < 1:6475861/151‑1 (MQ=255)
gCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTc < 1:3732538/151‑1 (MQ=255)
cTCGGCAGAGGCCGTAGTAGGCGCGGGTTCACGCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCa < 2:3537108/151‑1 (MQ=255)
tCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCAc > 1:6064661/1‑151 (MQ=255)
tCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCAc > 2:1006813/1‑151 (MQ=255)
ggCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCAccc < 1:500140/151‑1 (MQ=255)
cAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCACCGGTGGTCGTAGCAGCGGGTTCACCcgc > 2:5397199/1‑151 (MQ=255)
agagGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCcgcg < 1:6904311/151‑1 (MQ=255)
gagGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGa > 2:5601519/1‑151 (MQ=255)
gagGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGa < 1:4489826/151‑1 (MQ=255)
gagGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGa > 1:1783831/1‑151 (MQ=255)
gggCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGaa < 2:2971832/150‑1 (MQ=255)
gCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATg < 1:5566617/151‑1 (MQ=255)
gtAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCgg > 2:4853919/1‑151 (MQ=255)
gtAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCgg > 2:2169289/1‑151 (MQ=255)
aGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCt < 1:6766086/151‑1 (MQ=255)
cgGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGc < 2:1249212/151‑1 (MQ=255)
gTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGCACGGGCCGGCTCAGGCACt > 2:6746392/1‑151 (MQ=255)
gtCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTg < 2:5767345/150‑1 (MQ=255)
tCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGc > 1:832730/1‑151 (MQ=255)
cACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCa < 2:1378626/151‑1 (MQ=255)
cccGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAgg < 2:4435077/151‑1 (MQ=255)
ccGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGc < 2:749510/151‑1 (MQ=255)
cgcgAAGATGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCACTGGTAAACCCCCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTATGAGCGGGTTCACCCGCGATTGGGCCGCCTCAGTCACCGCACGcc > 2:2749619/1‑150 (MQ=18)
cgcgAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCt < 2:6219602/151‑1 (MQ=255)
gAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAg < 1:3595055/151‑1 (MQ=255)
agGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAggggg < 1:6198226/151‑1 (MQ=255)
cGGGCGTGCTCGCGAATTACCGCCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGTGACCGTCCTCGCGGGTAACCCCGCCCCAGAAGCCGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAAt < 2:5912299/151‑1 (MQ=37)
cGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAAt < 2:603069/151‑1 (MQ=255)
ggCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCt > 1:3509482/1‑151 (MQ=255)
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gctgGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTGGTGc < 1:7220156/151‑1 (MQ=255)
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tatAGGCCGGTCCTTCTGTCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGTCCGCTACCGTCCTCGCTGGTAAACCCGCTCCTACAGACACATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGG < SRR10918235.32874/148‑1 (MQ=60)
AAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGG < SRR10918235.345359/151‑1 (MQ=60)
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GCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCCCTGCAGGCTCAGGGGGCA > SRR10918235.4848069/1‑151 (MQ=60)
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CAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTGGTGCAGTTGC < SRR10918235.2882374/151‑1 (MQ=60)
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ATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTGGTGCAGTTGCCC < SRR10918235.1491956/151‑1 (MQ=60)
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TTTGCCCAGGGCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTGGTGCAGTTGCCCCAACCGGCTGCGGGTACGCATCAGG > CP009974/4258769‑4259069
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
