Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
10478538 |
96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
4,258,919 |
C→G |
intergenic (+132/+99) |
prpE → / ← RPPX_18965 |
propionyl‑CoA synthetase/ATPase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
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reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 4,258,919 | 0 | C | G | 100.0%
| 851.1
/ NA
| 239 | intergenic (+132/+99) | prpE/RPPX_18965 | propionyl‑CoA synthetase/ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base G (118/121); total (118/121) |
Only 100 of 246 total aligned reads displayed.
TGCCCAGGGCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTGGTGCAGTTGCCCCAACCGGCTGCGGGTACGCATC > CP009974/4258771‑4259066
|
tGCCCAGGGCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTgcggc < 1:2552908/151‑1 (MQ=255)
gCCCAGGGCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTgcggcc < 1:1563524/151‑1 (MQ=255)
ccAGGGCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCggccgc > 1:1222389/1‑151 (MQ=255)
cAGGGCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCt > 1:1552682/1‑151 (MQ=255)
aGGGCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTa > 1:3529302/1‑151 (MQ=255)
gggCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTAc < 1:3953516/151‑1 (MQ=255)
ggCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTAcc > 1:2777101/1‑151 (MQ=255)
ggggTGGATGGTTTGACCTGGATGGCCCCTGCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGt < 1:856688/150‑1 (MQ=255)
gggTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTa < 2:3928586/151‑1 (MQ=255)
gTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACt < 1:1014071/151‑1 (MQ=255)
ttGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTAATc > 1:1641880/1‑151 (MQ=255)
gATGGTTGGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTcgc < 2:1907988/151‑1 (MQ=255)
aTGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTcgcg > 2:4671127/1‑151 (MQ=255)
tGGTTTGGCGTGGATGGCGCCTTGGCGGGGGGGGCGGGCATCGGTGGGTGGGCAGGGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCgg < 2:3304808/151‑1 (MQ=18)
tttGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTa > 2:1142229/1‑151 (MQ=255)
gACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTCCTCGCGGGTAAAc > 2:581087/1‑151 (MQ=255)
gACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAAc > 1:4268717/1‑151 (MQ=255)
aCCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAAcc < 2:563976/151‑1 (MQ=255)
ccTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAAccc < 1:1476330/151‑1 (MQ=255)
cTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAAcccc > 1:2204766/1‑150 (MQ=255)
cTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCg < 1:4719650/151‑1 (MQ=255)
cTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCg < 1:914763/151‑1 (MQ=255)
gATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTc < 2:1742943/151‑1 (MQ=255)
gggCCCCTGCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCt < 2:768905/150‑1 (MQ=255)
ggCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa < 2:4257937/151‑1 (MQ=255)
gCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc < 1:2160768/151‑1 (MQ=255)
ccTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGa > 1:1400900/1‑151 (MQ=255)
ccTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGa > 1:1584195/1‑151 (MQ=255)
cgtCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGAc < 1:2049101/149‑1 (MQ=255)
cTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGAc < 1:2992804/151‑1 (MQ=255)
cTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGAc < 1:3195477/151‑1 (MQ=255)
cgggcgggACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATc < 1:4133510/151‑1 (MQ=255)
gggcgggACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCg > 1:1507643/1‑151 (MQ=255)
ggcgggACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCgg < 1:1258826/151‑1 (MQ=255)
ggcgggACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCgg < 1:522060/151‑1 (MQ=255)
gcgggACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCggt < 1:1143509/151‑1 (MQ=255)
cgggACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCggtg < 2:4002401/151‑1 (MQ=255)
cgggACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCggtg > 2:816986/1‑151 (MQ=255)
gggACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCggtgg < 1:1958872/151‑1 (MQ=255)
gTGCATCGGTGGCTCGGGCGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCGCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTa < 2:4797906/151‑1 (MQ=255)
gTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCTTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTa > 2:843166/1‑151 (MQ=255)
gTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTa < 2:663641/151‑1 (MQ=255)
gTGCATCGGTGGCTCGGAAGAGGCCGTCGTAGACGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCAGACGTTCACCGTTACGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATAGGTGGTCGTa < 2:892385/151‑1 (MQ=21)
tGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAg < 1:2249614/151‑1 (MQ=255)
gCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAgg > 2:3405301/1‑151 (MQ=255)
gCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAgg < 2:3702511/151‑1 (MQ=255)
cATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGa < 1:3393578/151‑1 (MQ=255)
cATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCGACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGa > 1:1775888/1‑151 (MQ=255)
aTCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGCGGTCGTAGGAg > 2:1410984/1‑151 (MQ=255)
ggTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCgg > 1:1517442/1‑151 (MQ=255)
ggTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGCGGTCGTAGGAGCgg > 2:3623560/1‑151 (MQ=255)
tGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGt > 2:1703684/1‑151 (MQ=255)
ggCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGtt > 2:1824972/1‑151 (MQ=255)
ctggggagagGCCGCCGTAGGCGCGGGTTCCCCCGGGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCa < 2:2376086/145‑1 (MQ=18)
cGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCAcc < 2:1232088/151‑1 (MQ=255)
ggCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCAccc < 1:1878664/151‑1 (MQ=255)
cAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCCCCcgc > 2:3791495/1‑151 (MQ=255)
gagGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGa > 2:4528088/1‑151 (MQ=255)
gagGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGa > 1:4364790/1‑151 (MQ=255)
cgtcgtAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATggg < 1:1414296/151‑1 (MQ=255)
cgtcgtAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGCGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCCCGCATgcg > 2:2721364/1‑149 (MQ=255)
gtggtAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGc < 2:4848738/148‑1 (MQ=255)
gtcgtAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGc > 1:4966502/1‑151 (MQ=255)
cgtAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCg < 1:893337/151‑1 (MQ=255)
cgtAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCg < 2:1877971/151‑1 (MQ=255)
aGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCt > 2:4942718/1‑151 (MQ=255)
ggCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGCCCACCCGCGCCTGGCCCGGccc > 1:2019682/1‑149 (MQ=18)
gcgcGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCa > 1:2903710/1‑151 (MQ=255)
cgcgGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAg < 1:1142229/151‑1 (MQ=255)
cgcgGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAg > 1:671556/1‑151 (MQ=255)
gggTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGACTGGGCCGGCTCAGGCa > 1:2379827/1‑151 (MQ=255)
ttCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCCCTg > 2:1528652/1‑151 (MQ=255)
tCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACttc > 2:2999101/1‑149 (MQ=255)
aCCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAg < 1:2669678/151‑1 (MQ=255)
cccGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAgg > 1:173035/1‑151 (MQ=255)
cgcgAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCt < 1:502329/151‑1 (MQ=255)
gAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAg > 1:456089/1‑151 (MQ=255)
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TCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTGGTGCAGTTGCCCCAACCGGCTGCGGGG > SRR10918231.630572/1‑151 (MQ=60)
TCACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTGGCGCAGTTGCCCCCACCGGCAGCGGGG > SRR10918231.1149968/1‑151 (MQ=60)
ACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTGGTGCAGTTGCCCCAACCGGCTGCGGGTAC > SRR10918231.4213019/1‑151 (MQ=60)
ACCGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTGGTGCAGTTGCCCCAACCGGCTGCGGGTAC > SRR10918231.1781439/1‑151 (MQ=60)
CGTTGCGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTGGTGCAGTTGCCCCAACCGGCTGCGGGTACGC > SRR10918231.4772661/1‑151 (MQ=60)
CGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTGGTGCAGTTGCCCCAACCGGCTGCGGGTACGCATCAG < SRR10918231.1464405/151‑1 (MQ=60)
CGGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTGGTGCAGTTGCCCCAACCGGCTGCGGGTACGCATCAG < SRR10918231.3004953/151‑1 (MQ=60)
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TGCCCAGGGCGGGTTGATGGTTTGACCTCGATGGCCCCTTCGCGGGCGGGACGTGCATCGGTGGCTCGGCAGAGGCCGTCGTAGGCGCGGGTTCACCCGCGAAGAGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTACTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGACGCATCGGTGGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCTCAGGCACTGCAGGCTCAGGGGGCAATCTGGTGCAGTTGCCCCAACCGGCTGCGGGTACGCATCAG > CP009974/4258771‑4259068
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
