Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
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343 |
268.7 |
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97.0% |
10547310 |
150.6 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 225 total aligned reads displayed.
CCGGCCCTGCTGGCCAATTT‑CACCAGCCGTTCAGCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCGCAGGAACTGGGCAATACGCGGTTGCTTGAAGTGACGCAC > CP009974/981274‑981573
|
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CGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGACCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGG > SRR10918230.3006336/1‑151 (MQ=55)
CGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGACCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGG > SRR10918230.2996845/1‑151 (MQ=55)
GGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGACCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCTGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCCCCGGC > SRR10918230.1819222/1‑151 (MQ=49)
GGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGACCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGC > SRR10918230.1765154/1‑151 (MQ=59)
GGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGACCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGC > SRR10918230.1819026/1‑151 (MQ=59)
ggcctgctggccaatttccaccgtccgttcgccgcgGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCC < SRR10918230.4808770/115‑1 (MQ=60)
gccccccgcagctctttccgccaacgctacgcccctctatccgccactggatgagcgtgtgcacccgcgccccccatggactcgcacgggccgtgGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCC < SRR10918230.1088087/56‑1 (MQ=17)
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CTGCTGGCCAATTTCCACCGACCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTT > SRR10918230.218604/1‑151 (MQ=60)
CTGCTGGCCAATTTCCACCGACCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTT > SRR10918230.4408268/1‑151 (MQ=60)
TGCTGGCCAATTT‑CACCCGCCGTTCAGCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGACCGTTCG < SRR10918230.3545137/151‑1 (MQ=60)
GCTGGCCAATTTCCACCGACCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCG < SRR10918230.3298058/151‑1 (MQ=60)
CTGGCCAATTTCCACCGACCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGC < SRR10918230.834/151‑1 (MQ=60)
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tggccaatttccaccgcccgttcgccgcTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCC < SRR10918230.3444304/123‑1 (MQ=60)
TGGCCAATTT‑CACCAGCCGTTCAGCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGACCGTTCGCCG < SRR10918230.4401928/151‑1 (MQ=60)
gcaaaagatttagatgtccttgactggtgctccgacgtgcgtacttgcgatctctctgccgtccctgaagggcgggcacgccctcccGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCG < SRR10918230.1725289/64‑1 (MQ=41)
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gccaatttccaccgaccgttcgccgcTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGC > SRR10918230.1956412/27‑151 (MQ=60)
GCCAATTT‑CACCAGCCGTTCAGCGTTGCTGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGACCGTTCGCCGCT < SRR10918230.3330465/151‑1 (MQ=60)
GCCAATTT‑CACCAGCCGTTCAGCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGaccgg > SRR10918230.4733266/1‑146 (MQ=60)
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ccattttccacctaccgttccccgcgGCCGCCGCTACCATATTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACAATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCT < SRR10918230.1180373/125‑1 (MQ=60)
ccaatttccaccgaccgttcgccgcTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCT < SRR10918230.1499271/126‑1 (MQ=60)
ccaatttccaccgaccgttcgccgcTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCT < SRR10918230.1499368/126‑1 (MQ=60)
AATTT‑CACCAGCCGTTCAGCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGACCGTTCGCCGCTGCC < SRR10918230.145261/151‑1 (MQ=60)
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atttccaccgaccgttcgccgcTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGCTCGCCGtcgac > SRR10918230.2534188/23‑146 (MQ=60)
TT‑CACCAGCCGTTCAGCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGACCGTTCGCCGCTGCCGCC < SRR10918230.4382982/151‑1 (MQ=60)
ccacccgcggttccgcgtttccgcccgggccgtggtgtcgggtcgtgtcgcctccccgccggggcgggccaggctccccgaggaggcGGTTCCCCCG‑CCAATAGGCCGGGCCCGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCG < SRR10918230.5368180/64‑1 (MQ=51)
caccgaccgttcgccgcTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGC > SRR10918230.5418631/18‑151 (MQ=60)
accgaccgttcgccgcTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCT > SRR10918230.3501946/17‑151 (MQ=60)
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CCAGCCGTTCAGCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGACCGTTCTCCGCTGCCGCCGCTA > SRR10918230.3798418/1‑151 (MQ=60)
CCAGCCGTTCAGCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGACCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTA < SRR10918230.4929234/151‑1 (MQ=60)
cagccattcacgccgccagcaactaccggagtcgcgagtgctcccgcgcccacataggactggcacgGGCTGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGACCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTAC < SRR10918230.1414518/84‑1 (MQ=55)
gaccgttcgccgcTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACC > SRR10918230.562309/14‑151 (MQ=60)
gaccgttcgccgcTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACC > SRR10918230.4680949/14‑151 (MQ=60)
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gccgcTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGC < SRR10918230.2847031/146‑1 (MQ=60)
GCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGACCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCG < SRR10918230.3626855/151‑1 (MQ=60)
CGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGG > SRR10918230.565756/1‑151 (MQ=60)
GCTGCCGCCGCTACCTTACACGCGGGAAAACCCGTTCCTACGTGGGGCGCGCACATGCTGTTGAAGGGGCGGGTCCACCGG‑TGAATGGGCCGGGCCTGCTTGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGG < SRR10918230.1667863/151‑1 (MQ=42)
GCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGTTGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGG < SRR10918230.660428/151‑1 (MQ=60)
GCTGCCGACGCGACCGAATTCGCGGGTAAGCCCGCTCCTACGTTGGACGCGCACAGGCTGCTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGG < SRR10918230.3158985/151‑1 (MQ=60)
CTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCGGCTCTTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCAACCG‑GGAATGGGTCGGGCCTGCTGTCAAATTTCCACCCGGCGTTCGGCGCTGCCGacgatacccacttagggggg > SRR10918230.4691602/1‑131 (MQ=56)
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GCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACC > SRR10918230.2994525/1‑151 (MQ=60)
CCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGACCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCC < SRR10918230.3511577/151‑1 (MQ=60)
CGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCG > SRR10918230.3450825/1‑151 (MQ=60)
CGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTAGCGGGTAAACCCG > SRR10918230.5255071/1‑151 (MQ=60)
GCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGACCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGC < SRR10918230.4994569/151‑1 (MQ=60)
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TACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGATGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGCTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGCATTCGCCGGTAAACCCGCTC > SRR10918230.416431/1‑151 (MQ=60)
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GAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCCGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGAT > SRR10918230.2303362/1‑151 (MQ=60)
GAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGCT > SRR10918230.2303286/1‑151 (MQ=60)
TTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTTGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGGAAACCCCCTCCTACACGTCTGTTCAACGCATCCAGCCGTGCTGGGTTCATTTCCGGCGTACCGAAGGTAATT > SRR10918230.1062619/1‑151 (MQ=60)
TTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGACCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACgctggacgcgcacacgctgttctaggaccgggttcacccccgccggcgccgggcctgc > SRR10918230.2994879/1‑93 (MQ=60)
TCCCCCG‑CGAATGGGCCCGGCCTGCTGGCCAATTTCCCCCGACCGTACGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAC < SRR10918230.4602128/92‑1 (MQ=60)
TCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCC < SRR10918230.8339/151‑1 (MQ=60)
CACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCG < SRR10918230.4072503/151‑1 (MQ=60)
CACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGACCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAatgcacgccaacgcacccttgagtgagcgggtcatctcgcgactacggatggcctgctg > SRR10918230.3984186/1‑92 (MQ=60)
CCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCGCA < SRR10918230.1693824/151‑1 (MQ=60)
CCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCGCA > SRR10918230.2433363/1‑151 (MQ=60)
CCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCGCA < SRR10918230.1692837/151‑1 (MQ=60)
CCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCGCA > SRR10918230.2889707/1‑151 (MQ=60)
CG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCGCAGG > SRR10918230.2691813/1‑151 (MQ=60)
GAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCGCAGGAAC < SRR10918230.1224732/151‑1 (MQ=60)
AATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTCATCCGCAGGAACT > SRR10918230.2904214/1‑151 (MQ=60)
CCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCGCAGGAACTGGGCAA > SRR10918230.5207616/1‑151 (MQ=60)
CGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCGCAGGAACTGGGCAAT > SRR10918230.3396777/1‑151 (MQ=60)
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GGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCGCAGGAACTGGGCAATA < SRR10918230.1086386/151‑1 (MQ=60)
GGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCGCAGGAACTGGGCAATAC > SRR10918230.4731563/1‑151 (MQ=60)
GCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCGCAGGAACTGGGCAATACG > SRR10918230.3754116/1‑151 (MQ=60)
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TGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCGCAGGAACTGGGCAATACGCGGTTG > SRR10918230.5351229/1‑151 (MQ=60)
aaatttgcatCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACTGGCGTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCATCAGTGGCTGGTTCATTTCCGGCTTACCGATGGTAATCCGCAGGAACTGGGCAATACGCGGTTGCTTG < SRR10918230.4095264/141‑1 (MQ=60)
CAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCGCAGGAACTGGGCAATACGCGGTTGCTTG > SRR10918230.2974028/1‑151 (MQ=60)
CAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCGCAGGAACTGGGCAATACGCGGTTGCTTG < SRR10918230.391636/151‑1 (MQ=60)
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TCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCGCAGGAACTGGGCAATACGCGGTTGCTTGAAGTG > SRR10918230.1118188/1‑151 (MQ=60)
TCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCGCAGGAACTGGGCAATACGCGGTTGCTTGAAGTG > SRR10918230.902932/1‑151 (MQ=60)
CACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCGCAGGAACTGGGCAATACGCGGTTGCTTGAAGTGAC < SRR10918230.1261748/151‑1 (MQ=60)
CGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCGCAGGAACTGGGCAATACGCGGTTGCTTGAAGTGACGCA < SRR10918230.2555755/151‑1 (MQ=60)
GGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCGCAGGAACTGGGCAATACGCGGTTGCTTGACGTTACGCAC > SRR10918230.3250284/1‑151 (MQ=60)
GGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCGCAGGAACTGGGCAATACGCGGTTGCTTGAAGTGACGCAC < SRR10918230.236972/151‑1 (MQ=60)
|
CCGGCCCTGCTGGCCAATTT‑CACCAGCCGTTCAGCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACATTGGACGCGCACAGGCTGTTGTAGGAGCGGGTTCACCCG‑CGAATGGGCCGGGCCTGCTGGCCAATTTCCACCGGCCGTTCGCCGCTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGTCAGTTCAACGCATCCAGCAGTGCCTGGTTCATTTCCGGCGTACCGATGGTAATCCGCAGGAACTGGGCAATACGCGGTTGCTTGAAGTGACGCAC > CP009974/981274‑981573
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
