Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
343 |
268.7 |
10873516 |
97.0% |
10547310 |
150.6 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 1629 total aligned reads displayed.
GGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCG > CP009974/1898932‑1899232
|
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gtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTAT > SRR10918230.5105644/52‑151 (MQ=60)
tttgttttttttttttcaagcagaagacggcatacgagattgatgtccgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTA < SRR10918230.3266614/69‑1 (MQ=60)
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gaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAG > SRR10918230.3501522/50‑151 (MQ=60)
gacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGT > SRR10918230.2144274/46‑151 (MQ=60)
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ggctcgccgtcagggtcgcggttgtggtgtcgaccgagtcgttgaaCGTGGTCTGAGCCTGCGTCGGGTTCGGGGTCATTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATT < SRR10918230.1562871/105‑1 (MQ=60)
ggctcgccggcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATT < SRR10918230.2559084/110‑1 (MQ=60)
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gccggcagggtccatgtgggggtgttgtccgtgacgggggttgaggcgtgtgctgtcgccgtcTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCG < SRR10918230.4113737/88‑1 (MQ=60)
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gtcagggtcgctgtggtgttgtcgaccgagtcgttgtTCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCCGCTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGG < SRR10918230.2711787/114‑1 (MQ=60)
gtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGCCCGGGG > SRR10918230.187752/34‑151 (MQ=60)
tcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGT > SRR10918230.2953514/33‑151 (MQ=60)
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agggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCT > SRR10918230.4829852/31‑151 (MQ=60)
gggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTG > SRR10918230.4678265/30‑151 (MQ=60)
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gtgctcttccgatctgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGG < SRR10918230.884416/123‑1 (MQ=60)
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tcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAA < SRR10918230.2388890/125‑1 (MQ=60)
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ggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAgttgacg < SRR10918230.2072828/132‑8 (MQ=60)
ggtggtgtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTCAACG < SRR10918230.4645222/132‑1 (MQ=60)
gggtgtgtcgaccgaggacttgtgcgcggtcgatctCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTCAACG < SRR10918230.1283385/115‑1 (MQ=60)
GGCATCGATGCTGTCATTGATGACCGTCGAGGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGCGTCTGGAAATCGACGCTG > SRR10918230.680392/1‑151 (MQ=60)
atctcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTCAACGCTGC < SRR10918230.3437648/136‑1 (MQ=60)
catggatgctgtcattgatgaccgtcgaggcaGGCGTCGAGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTGCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGCGTCTGGAAATCGACGCTGCC < SRR10918230.2327888/119‑1 (MQ=60)
gtcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCC < SRR10918230.415137/138‑1 (MQ=60)
atcgatgctgtcattgatgaccgtcgagGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGCGTCTGGAAATCGACGCTGCCC > SRR10918230.1179587/29‑151 (MQ=60)
tcgaccgagtcgtttatccTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTCAAAGTTGCCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCT < SRR10918230.2792522/132‑1 (MQ=60)
tcgaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCT < SRR10918230.1717690/139‑1 (MQ=60)
gaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTG‑G > SRR10918230.3804257/11‑151 (MQ=60)
gaccgagtcgTTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑G > SRR10918230.3546360/11‑151 (MQ=60)
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gagtcgTTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TT > SRR10918230.3423510/7‑151 (MQ=60)
gagtcgTTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TT > SRR10918230.4305482/7‑151 (MQ=60)
ttcaagcagaagacggcatacgagattgatgtgcgtgactggagttcagacgtgtgctctgccgagctTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTT < SRR10918230.109920/83‑1 (MQ=60)
agtcgTTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTT < SRR10918230.3453474/146‑1 (MQ=60)
GTCGTTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTA < SRR10918230.389423/151‑1 (MQ=60)
tcattgatgaccgtcgagGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGCGTCTGGAAATCGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTAC > SRR10918230.4274612/19‑151 (MQ=60)
tgttcttccgggttTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGGCGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGCCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACC < SRR10918230.4767969/137‑1 (MQ=60)
cattgatgaccgtcgagGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGCGTCTGGAAATCGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACC > SRR10918230.615285/18‑151 (MQ=60)
gttgacggcatacggggttggtgtccgtgactggagttcaggcgtgtgctcttccgctgcGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCC < SRR10918230.3915987/91‑1 (MQ=60)
attgatgaccgtcgagGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGCGTCTGGAAATCGACGCTGagctcggtagagcac > SRR10918230.1166404/17‑136 (MQ=60)
GTTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCC < SRR10918230.2528817/151‑1 (MQ=60)
TTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCG > SRR10918230.3035634/1‑151 (MQ=60)
ggtgctcttccgatctGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTT < SRR10918230.1024609/135‑1 (MQ=60)
atcgtggtctgagccggcgtcgggttcgggttggatgggcagacgttagcactcctgtcgcggacgtcagtgacgtttgcggtcgtgcgcTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTT > SRR10918230.1198370/91‑151 (MQ=54)
ATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTT < SRR10918230.2670823/151‑1 (MQ=60)
TCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTGCCGGCTTC < SRR10918230.1833080/151‑1 (MQ=60)
gaccgtcgagGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGCGTCTGGAAATCGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCagat > SRR10918230.2905001/11‑147 (MQ=60)
agacgtgtgctcttccgatctGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCA < SRR10918230.5447750/130‑1 (MQ=60)
GTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAA < SRR10918230.4515519/151‑1 (MQ=60)
GTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAA > SRR10918230.819754/1‑151 (MQ=60)
GTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAA > SRR10918230.788923/1‑151 (MQ=60)
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GTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTG < SRR10918230.79960/151‑1 (MQ=60)
TTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGCGTCTGGAAATCGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGAGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGC < SRR10918230.3845796/151‑1 (MQ=60)
TTCTCGATAGTGACGGTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGCCGTCATTGGGCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGACTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGC < SRR10918230.1925827/151‑1 (MQ=60)
TCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCT > SRR10918230.3821240/1‑151 (MQ=60)
CTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTGCCGGCTTCAACGGTAATGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTC < SRR10918230.2995924/151‑1 (MQ=60)
TCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGACTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTTA > SRR10918230.929250/1‑151 (MQ=60)
CGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGATGTCGTTGGCCGGGGTCTGGAAATCAGCGGTGCGCTG‑GGT‑‑TTTTCCCGCTTCAAGGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAG < SRR10918230.4098348/151‑1 (MQ=60)
CGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGACTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTTAG < SRR10918230.2346744/151‑1 (MQ=60)
CGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGACTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTTAG < SRR10918230.515967/151‑1 (MQ=60)
GATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGG < SRR10918230.404767/151‑1 (MQ=60)
ATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGG < SRR10918230.1420590/151‑1 (MQ=60)
GGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTGCCGGCTTCAACGGTAATGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTC > SRR10918230.4953223/1‑151 (MQ=60)
AGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGACTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTTAGGGTC > SRR10918230.1473776/1‑151 (MQ=60)
cgatctCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGCGTCTGGAAATCGACGCTGCCCTG‑GAT‑‑TTTACCCGATTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCA < SRR10918230.1655786/145‑1 (MQ=60)
GACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGACTTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGtcggcagagcgcacgg > SRR10918230.2512166/1‑135 (MQ=60)
GACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACG > SRR10918230.2364298/1‑151 (MQ=60)
ACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGG < SRR10918230.4326637/151‑1 (MQ=60)
ACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGACTTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGG > SRR10918230.3774499/1‑151 (MQ=60)
ACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTGCCGGCTTCAACGGTAATGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGG < SRR10918230.4788374/151‑1 (MQ=60)
CGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTATGGAAGGCAACGCTGC‑‑‑GAGGTTGTTTACCCGGTCCAGCGTTGAGGGTTGGGCCGTTGGGCTGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGT < SRR10918230.1086061/151‑1 (MQ=43)
CTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGACTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTTAGGGTCACGGTGT < SRR10918230.5228638/151‑1 (MQ=60)
gctcttccgatctGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTA < SRR10918230.168043/138‑1 (MQ=60)
GACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAG > SRR10918230.1439352/1‑151 (MQ=60)
GACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAA > SRR10918230.3297085/1‑151 (MQ=60)
GACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAA > SRR10918230.92203/1‑151 (MQ=60)
GTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGggaggcgcagaaatcggtacccgcgtctgggccgggatgctcgggttcccggtgttagtgg > SRR10918230.5039741/1‑90 (MQ=60)
GTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGCGTCTGGAAATCGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCagatcgggagagcacacgtctgaactccagtcacggacat > SRR10918230.1548996/1‑111 (MQ=60)
TCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGACTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTTAGGGTCACGGTGTAGGTGAT > SRR10918230.4494996/1‑151 (MQ=60)
TCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGAT > SRR10918230.5267467/1‑151 (MQ=60)
CGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATC > SRR10918230.5298311/1‑151 (MQ=60)
CGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATC > SRR10918230.572489/1‑151 (MQ=60)
CGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAgttgaggtcggaagagcacacgtctgaactccagtcacggacatcaatatcgtatgccgtcttctgtttgaaaaaaaaaacaacctaaccaacagttacatagccactaaca > SRR10918230.2740708/1‑39 (MQ=55)
GAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCA < SRR10918230.841128/151‑1 (MQ=60)
AGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGTGTTGCTCAGGCTCACGGTGTAAGTGATCAC > SRR10918230.5068465/1‑151 (MQ=60)
AGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCAC < SRR10918230.558675/151‑1 (MQ=60)
AGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGACTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTTAGGGTCACGGTGTAGGTGATCAC < SRR10918230.4006749/151‑1 (MQ=60)
AGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCAC < SRR10918230.1264639/151‑1 (MQ=60)
GCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGACTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTTAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACG > SRR10918230.5372352/1‑151 (MQ=60)
CGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGACTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTTAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCC < SRR10918230.3338876/151‑1 (MQ=60)
TTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGagatcggaagagcacacgtctgaactccagtcac > SRR10918230.1212341/1‑117 (MQ=60)
TGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCC > SRR10918230.1630486/1‑151 (MQ=60)
TTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGagatcggaagagcacacgtctgaactccagtcacgcacacca > SRR10918230.723219/1‑109 (MQ=60)
TTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTT < SRR10918230.597206/151‑1 (MQ=60)
ATAGACGTCATTGGCCGGCGTCTGGAAATCGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGAGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCG < SRR10918230.4295208/151‑1 (MQ=60)
ATAGACGTCATTGGCCGGCGTCTGGAAATCGACGCTGCCCTG‑GGT‑‑CATACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGAGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCCTCG > SRR10918230.4035987/1‑151 (MQ=60)
|
GGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGATCGTGGTCTGAGCCGGCGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTG‑GGT‑‑TTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCG > CP009974/1898932‑1899232
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
