Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
343 |
268.7 |
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97.0% |
10547310 |
150.6 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 1568 total aligned reads displayed.
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|
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gtcattggccggggtctggaagttgacgctgccctgggtttagatcggaagagcacacgtctgaactccagtcacggacatcaatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaaaaaaaaCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACG > SRR10918230.1758783/118‑151 (MQ=60)
GTCATTGGCCGGGGTCTGGAATTTGACGCTGCCCTGGGTTTTTCCCGCTTCAACGGTGATGGTCGGGCCGGTGGACAGGGTCTCGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACG < SRR10918230.4300293/151‑1 (MQ=60)
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TCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTGATGACTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTTAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTgactg > SRR10918230.2268322/1‑146 (MQ=60)
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agttcaggcgtgtgcgcttccgatctTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTT < SRR10918230.2314632/125‑1 (MQ=60)
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ttgaaatcaacgctgttttttttttcaagcagaagacggcatacgatcttgatgtccgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatcTTGCTTAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTgactgacgggctcgccgtca < SRR10918230.2055421/61‑21 (MQ=59)
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ttccacgctgtcctctttttagctCGCTTCAACGGTGATGGTTTGGCCGTTGGACAGTGTCACGGTGACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTC < SRR10918230.64242/127‑1 (MQ=60)
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GACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGAGTAACGGTTAACGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGACGCGGTGTACGTGATCACGCCGCATTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTAGCG > SRR10918230.1208115/1‑151 (MQ=60)
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CGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTGATGACTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTTAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTgaccgacgggctcgccgtcaggggcgcgga > SRR10918230.3448412/1‑121 (MQ=60)
CGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTGATGACTTGGCCGTTGGACAGGGTAACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggt < SRR10918230.2612628/151‑31 (MQ=60)
TGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggt > SRR10918230.905188/1‑118 (MQ=60)
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GCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtg > SRR10918230.5219566/1‑117 (MQ=60)
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tttttttcaagcagaagacggcatacgagattgatgtccgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctGTTGCTTAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggc < SRR10918230.671830/78‑37 (MQ=60)
CCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTTAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggt < SRR10918230.149918/151‑37 (MQ=60)
CCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGC < SRR10918230.2872043/151‑1 (MQ=60)
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GGTTTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTgaccgacgggctcgcggtcagggtcgcggtggtggcgtcg > SRR10918230.4373366/1‑111 (MQ=60)
GTTTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcga > SRR10918230.3027740/1‑110 (MQ=60)
TTTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAC < SRR10918230.516252/151‑1 (MQ=60)
TTTACCCTGTTCGACGGTGATGTTCTGGCCGTTGGACAGAGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAcc < SRR10918230.574195/151‑3 (MQ=60)
TTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccg < SRR10918230.2826234/151‑4 (MQ=60)
TACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGAGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTAgatcggaagagcacacgtctgaactccagtcacggacatcaaa > SRR10918230.404212/1‑108 (MQ=60)
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ACCCGCTGCCACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgag < SRR10918230.5124459/151‑6 (MQ=60)
CCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGGTCACGCCCCCTTCGGTactcctttgacggacagccaggttcgctgccgtcgcctcgaccgagac > SRR10918230.3715470/1‑103 (MQ=60)
CGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGAGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcg < SRR10918230.2414689/151‑9 (MQ=60)
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gtgatgactTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTTAGGGTCACGGCGTAGGTGCTCACGCCGCCTTCGGTgacctacgggctcgccgcgagtgccgcggtggtggtgtcgaacgaggcgttgatcgtgg > SRR10918230.3413372/10‑92 (MQ=60)
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AATGGTTTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTA > SRR10918230.3164245/1‑151 (MQ=60)
atgactTGGCCGTTGGACAGGGTCACGGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTTAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgttgatcgtggtct > SRR10918230.4943743/7‑89 (MQ=60)
ATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtct < SRR10918230.4724152/151‑22 (MQ=60)
TGGTCTGGCCGTTGGACAGAGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctg > SRR10918230.1387711/1‑129 (MQ=60)
gctTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgttgatcgtggtctgag < SRR10918230.619343/148‑66 (MQ=60)
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gacgGTTACGGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTGAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtagttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtc < SRR10918230.5146171/147‑86 (MQ=39)
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ACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtca > SRR10918230.478341/1‑106 (MQ=60)
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CGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagt > SRR10918230.794546/1‑63 (MQ=60)
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CGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcg > SRR10918230.3106848/1‑98 (MQ=60)
CGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcggcgggttcggggtcgattggtcg > SRR10918230.3360987/1‑98 (MQ=60)
GGCGTCTGAGCAGGGTTGCTTAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgttgatcgtggtctgaagatcggaagagcacacgtctgaactccagt > SRR10918230.2803503/1‑56 (MQ=40)
GGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcga < SRR10918230.739460/151‑55 (MQ=60)
GCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaa < SRR10918230.1141458/151‑56 (MQ=60)
GCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCTCGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCCC < SRR10918230.44036/151‑1 (MQ=60)
GTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaat > SRR10918230.5295932/1‑94 (MQ=60)
GTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGT > SRR10918230.5096313/1‑53 (MQ=9)
GTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcggggccggggtcagttagagcggaa > SRR10918230.2329550/1‑94 (MQ=60)
TCTGAGCAGGGTTGCTTAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGT < SRR10918230.5023129/52‑1 (MQ=8)
TCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCCCACC < SRR10918230.979181/151‑1 (MQ=60)
CTGAGCAGGGTTGCTTAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGT > SRR10918230.31308/1‑51 (MQ=11)
AGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGT > SRR10918230.2549349/1‑48 (MQ=21)
AGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCCCACCACCT < SRR10918230.1535720/151‑1 (MQ=60)
GCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGT > SRR10918230.4126380/1‑47 (MQ=27)
GCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagctgctcgaagttaccgc > SRR10918230.3314583/1‑88 (MQ=60)
CAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCGACGGTTCCGCTTGGCGCGGCTGTCAGGGACGCGGTGGTGGCGTCGA > SRR10918230.3765432/1‑87 (MQ=30)
CAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgcc > SRR10918230.1322096/1‑87 (MQ=60)
AGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgcca < SRR10918230.4100109/151‑66 (MQ=60)
GGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGT < SRR10918230.197395/44‑1 (MQ=35)
GGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGT < SRR10918230.4525420/44‑1 (MQ=36)
GGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatagatgggaagggcacacgcctgaacgccagtcgctgccatcaatctcctatac > SRR10918230.158072/1‑85 (MQ=60)
GGTTGCTTAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttagatcggaagagcacgcgtctgaacgccag > SRR10918230.966648/1‑43 (MQ=0)
GGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggagcgcggtagggcacacgtctgtactccaggt > SRR10918230.1907433/1‑84 (MQ=60)
GGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGT > SRR10918230.1596675/1‑43 (MQ=30)
GTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagctgctcgaagttgccgcccgtg < SRR10918230.2906322/151‑69 (MQ=60)
TTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTgactgacgggctcgccgtagatcggaagagcacacgtctgaactccagtcacggacatcaatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaaaaaaaaaagatacaacgagtag > SRR10918230.1954169/1‑41 (MQ=60)
TTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagcgg < SRR10918230.1932340/151‑70 (MQ=60)
TGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGT < SRR10918230.532039/40‑1 (MQ=48)
TGCTCAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGT < SRR10918230.870091/40‑1 (MQ=11)
TGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggc < SRR10918230.2968617/151‑71 (MQ=60)
TGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggc < SRR10918230.4310293/151‑71 (MQ=60)
GCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcg > SRR10918230.2501294/1‑80 (MQ=60)
CTTAGGGTCACGGTGTAGGTGATCACGCCGCCTTCGGTGACGGATGGGTTCGCCGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGA < SRR10918230.4255253/79‑1 (MQ=20)
CAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagctgctcgaagttgccgcccgtggcgttc < SRR10918230.4451588/151‑75 (MQ=60)
CAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttc > SRR10918230.2152007/1‑77 (MQ=60)
AGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCCCACCACCTCCGGTACTACCTG > SRR10918230.3571728/1‑151 (MQ=60)
GGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCCCACCACCTCCGGTACTACCTGTC > SRR10918230.2294824/1‑151 (MQ=60)
GTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagcctgcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcga > SRR10918230.1183654/1‑73 (MQ=60)
TCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagttgctcgaaattaccgccagtggcgttctcgat > SRR10918230.1004963/1‑72 (MQ=60)
TCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGA > SRR10918230.2569249/1‑72 (MQ=60)
CACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTCACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCAGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCCCACCACCTCCGGTACTACCTGTCACG > SRR10918230.4894788/1‑151 (MQ=60)
CGGTGTAAGTGATCTCGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGA < SRR10918230.4667649/69‑1 (MQ=60)
GTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagctgctcgaagttgccgcccgtggcgttctcgatggtga < SRR10918230.1994359/151‑85 (MQ=60)
GTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGCGTCGA > SRR10918230.553079/1‑67 (MQ=60)
TAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGAccgagtcgttgatcgtggtctgagccggcgtcgggttcggggtcagctgctcgaagttgccgcccgtggcgttctcgatggtgacgc > SRR10918230.3947284/1‑64 (MQ=60)
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GACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTGATGGTCTGGCCGTTGGACAGGGTAACCGTTACCGGCGTCTGAGCAGGGTTGCTCAGGGTCACGGTGTAAGTGATCACGCCGCCTTCGGTTACGCTTGGCGAGGCGGTCAGGGTCGCGGTGGTGGTGTCGATTGTATCGGTCACCTGGGTAACCGCTGGCGTTTGCGGCAATGTCACCGTCAGCCCACCACCTCCGGTACTACCTGTCACGGTGGCCGA > CP009974/1899064‑1899363
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
