Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
343 |
268.7 |
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97.0% |
10547310 |
150.6 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 253 total aligned reads displayed.
TGCGCCGGGAAGATGACTGCGCGCGGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCAA > CP009974/3847408‑3847706
|
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CGCCGGGAAGATGACTGCGCGCGGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCAC > SRR10918230.2021372/1‑151 (MQ=60)
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ccgctcttcaccgttaccgcagttcccgcatgcgcggttccgctcgcccccacagtcaatggtcatgctcaaccatcggtggtccgacacagcccaCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCA < SRR10918230.2240614/55‑1 (MQ=0)
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CCGGGAAGATGACTGCGCGCGGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCC < SRR10918230.4955618/151‑1 (MQ=60)
GGAAGATGACTGCGCGCGGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCC < SRR10918230.4289710/151‑1 (MQ=60)
GAAGATGACTGCGCGCGGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCG > SRR10918230.3025653/1‑151 (MQ=60)
taatgtatactcttttaccgttttttttttttttttcaagcagaagacggcatacgagattgatgtccgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTT < SRR10918230.3844692/49‑1 (MQ=0)
AGATGACTGCGCGCGGATCCTTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTT < SRR10918230.4378817/151‑1 (MQ=60)
AGATGACTGCGCGCGGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAATGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCCCCGTT > SRR10918230.5360743/1‑151 (MQ=60)
GATGACTGCGCGCGGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTC > SRR10918230.5197432/1‑151 (MQ=60)
ATGACTGCGCGCGGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCA > SRR10918230.1955913/1‑151 (MQ=60)
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gctgttagtcgtttcgcaagtagacccagtcatacgccatagatgggcgggactcaggtccggaattgtgctctggcggtcgTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTCCCACCCGCCGTTCACCGTTGC < SRR10918230.3616828/69‑1 (MQ=0)
gccgccgccaccatattcgcggggagagccgctcctacagagattggtgatggacacacatcggtggttaagcacagcacacaGTAGGAGCGGGTTTCCCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCAGCCATTCACTGTTGC < SRR10918230.348296/68‑1 (MQ=0)
CGCGCGGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGC < SRR10918230.5263179/151‑1 (MQ=60)
ccgctaccgtctttgcgggtaaccccgctccttctcagattggggggggacacaccgcggtggttggccacaagcggagttgaaagatctgcTTTACCCGCCAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCG < SRR10918230.1364673/59‑1 (MQ=0)
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ttatgttttctgtgggtaatgccttttttcttttagacaagcggtggacggcatacggtgtttatgtgcatgcctcgagttcagacgtgttctactccggacAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCT < SRR10918230.3823195/49‑1 (MQ=0)
GGGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCC < SRR10918230.3085278/151‑1 (MQ=60)
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GATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTagaacgggacagtacacgtctcaactgc > SRR10918230.1542236/1‑123 (MQ=60)
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gtgacgcgtctggcgtattcgcgggtaagcccggtcctacagagattggtgggggacacacagcggtggttgaacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTA < SRR10918230.383189/66‑1 (MQ=10)
catattcgcggggaaccccgcggcttcgccggaccggtagttgacacaggtcggtggttggtcacgggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTA < SRR10918230.1793294/77‑1 (MQ=0)
CACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTAC > SRR10918230.2833619/1‑151 (MQ=60)
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gccactaccgtagtcgcgggtaaacccgctcctacccagatcgctggtgcacacacatcggtgattgaacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTA < SRR10918230.5356168/71‑1 (MQ=30)
cgtgtgctcttccgatctCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTGCCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTAT < SRR10918230.434164/133‑1 (MQ=57)
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atacgagattgatgtccgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctggtcacaggccgtcgTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTC < SRR10918230.1994505/85‑1 (MQ=5)
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TGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGC‑GG > SRR10918230.3323545/1‑151 (MQ=60)
GGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGC‑GGG > SRR10918230.757148/1‑151 (MQ=60)
GTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGGGTGAACAGGCGTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAA < SRR10918230.2939078/151‑1 (MQ=39)
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agacgcattggtgggagacacacttgtgggggtgtacacaggccggcggGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGC‑GGGTAAACCCGCTCCT < SRR10918230.2025690/102‑1 (MQ=0)
aaccccgctcctacacagattgctggtggacacacatcggtgtttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCT < SRR10918230.1253113/92‑1 (MQ=26)
agacgacatacgagattgatgtccgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTA < SRR10918230.1620261/93‑1 (MQ=6)
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AGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCCCCTGCTGGCCAATCTCAACCCGCCGTTCACCGATGCCCCCGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAAACCGCTACTAC > SRR10918230.5412827/1‑151 (MQ=60)
cctgctcgcacgccgattggttggggccgctcatccgtccgtggtcgcacgccggcgtttcCCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA < SRR10918230.2666933/90‑1 (MQ=24)
GCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACA < SRR10918230.298109/151‑1 (MQ=60)
ccgctcgtacacagattgggggtggacacacatcggtggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACAC < SRR10918230.2298843/96‑1 (MQ=26)
CCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGATACCGTCTTCTC‑GGGTATACCGGCTCCTACAC > SRR10918230.2117028/1‑151 (MQ=60)
tacgagattgatgtccgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctcgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACACC < SRR10918230.416680/97‑1 (MQ=25)
CTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCC > SRR10918230.4085920/1‑151 (MQ=60)
CTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaca < SRR10918230.919739/151‑4 (MQ=60)
ctcctacacagattggtggtggacacacatcggtggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaccag > SRR10918230.160773/53‑146 (MQ=2)
GGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGG > SRR10918230.866939/1‑151 (MQ=60)
ggtggtggacacaggtcggtggttggtcacaggccgtggTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGAT < SRR10918230.3376398/112‑1 (MQ=9)
ctacacagattggtggtggacacacatcggtggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaccagatt > SRR10918230.2748827/50‑143 (MQ=10)
AGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaccgaatt > SRR10918230.4793740/1‑143 (MQ=59)
AGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATCCGC‑GGGTAACCCCGCTCCTACacagaatg > SRR10918230.4793699/1‑143 (MQ=54)
tacacatagtggtggtggacacacatcggtggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaccagattg < SRR10918230.3098548/103‑10 (MQ=24)
tacacagattggtggtggacacacatcggtggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaccagattg > SRR10918230.1940407/49‑142 (MQ=13)
tacacagattggtgggggacacacatcggtggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaccagattg < SRR10918230.108057/103‑10 (MQ=24)
GGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaccgaatgg > SRR10918230.256829/1‑142 (MQ=57)
caccgattggtgcgggacacacagcggtggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaccagattggt < SRR10918230.4963507/105‑12 (MQ=15)
tggacacaggtcggtgatggggcgcaggccgccgtgcAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGG < SRR10918230.3554722/114‑1 (MQ=0)
acagattggtggtggacacacatcgggggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaccagattggtg < SRR10918230.2639110/106‑13 (MQ=13)
gattggtggtggacacacatcggtggttggacacaggccgccGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACaccagattggtggtg > SRR10918230.5212984/43‑136 (MQ=5)
CGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATCCCCACCCGCCGTTCACCGATGCCGCCGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACacagattggtggtgg > SRR10918230.3753137/1‑136 (MQ=34)
tacgagattgatgtccgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACACCGGATtggtggtggacc < SRR10918230.1195967/101‑13 (MQ=0)
ggtcggtgatcggccgcaggccgccgTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACAC < SRR10918230.1627431/125‑1 (MQ=24)
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GCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAG > SRR10918230.3411131/1‑151 (MQ=44)
GCCGGCCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGA > SRR10918230.1310585/1‑151 (MQ=60)
CCGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGTTGCCGTATTCGC‑GGGTAACCCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAG < SRR10918230.4383720/151‑1 (MQ=57)
CGGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGG > SRR10918230.963049/1‑151 (MQ=60)
GGCCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGatgggcagaggccaccgcggaagtccgggcatggacgccaagcgcg > SRR10918230.3478164/1‑105 (MQ=24)
cgCCTGCTGGCCAATTTCCCCCCGCCGTTCACTGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCGCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCA < SRR10918230.5274489/149‑1 (MQ=60)
CCCTGCTGGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGGTTACCCagatcggaagagc > SRR10918230.106615/1‑138 (MQ=26)
CCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCCACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGGAGAGGCCAT > SRR10918230.4366019/1‑151 (MQ=26)
CCCTGCTGGCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGG‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCG < SRR10918230.1371646/151‑1 (MQ=60)
CCTGCTGGCCAATTCCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATC < SRR10918230.430691/151‑1 (MQ=55)
CCTGCTGGCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCgg > SRR10918230.3395729/1‑149 (MQ=60)
CTGCTGGCCAGTTTTCACCCGCCGTTCACGGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑AGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggc < SRR10918230.324710/151‑4 (MQ=51)
GCTGGCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggctc > SRR10918230.4754100/1‑146 (MQ=60)
GCTGCCCAATTTCCCCCCCCCGTGCAGTGTTGACGCCGCTGCCGTATTGGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGACCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggccc < SRR10918230.2016906/151‑6 (MQ=60)
TGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACC > SRR10918230.2573615/1‑151 (MQ=60)
TGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACC < SRR10918230.134804/151‑1 (MQ=60)
TGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCACTCCTACGCCGGATagctgggggacccaggacggggagagggcgcgtgccatcgtgaaggagcgggatcaccctcgtatagcccgtccctc > SRR10918230.2794403/1‑74 (MQ=0)
GGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTagatcggaagagcacacgtctgaact > SRR10918230.2593519/1‑125 (MQ=27)
GGCCAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggccctac > SRR10918230.3518126/1‑143 (MQ=55)
GCCAATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggctctgct > SRR10918230.2232355/1‑142 (MQ=60)
CCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTCCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCG < SRR10918230.4777692/151‑1 (MQ=60)
CAATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAagccgacccgactgg > SRR10918230.4803941/1‑136 (MQ=52)
CAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACACCGT > SRR10918230.1424486/1‑151 (MQ=60)
AATCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggctctgctggg > SRR10918230.81834/1‑139 (MQ=60)
ATTTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCCCAGGCCGCCGGGTAGGAGCGGGTTTACCGCCGAAGAGGCCggcaccaccggcc > SRR10918230.4918242/1‑138 (MQ=37)
ATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGC > SRR10918230.3533898/1‑151 (MQ=60)
ATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGC > SRR10918230.2250803/1‑151 (MQ=60)
TTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGC‑GGGCGCAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCA > SRR10918230.1777112/1‑151 (MQ=60)
TCTCCACCCGTCGTTCAACGTTGCCGCCACCACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGGCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCggctctgctggcca > SRR10918230.2720998/1‑137 (MQ=60)
TTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTTGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGTAGAGGgcggccctactggccaa > SRR10918230.62895/1‑134 (MQ=60)
TTTCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTGCCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGACGAGGCCggccccaccggccca > SRR10918230.5145969/1‑136 (MQ=60)
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TGCGCCGGGAAGATGACTGCGCGCGGATCACTCGGTTGCTGGGGGTAGAGGCTCAAGCCTTGGAGGCTTGCGTCGCCTGAACAGGCCTCTGGTACTGCACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGC‑GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGAGGATGGACACAGGTCGGTGGCGGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCATCAAACCCCGTGCAA > CP009974/3847408‑3847706
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |