Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F1 I1 R1
|
343 |
268.7 |
10873516 |
97.0% |
10547310 |
150.6 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AATAGCGTTCTAGCTCAGGTTTGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGGCATCTCGCCCTTGGCCAGGCGCCGGTTGATGTCGGCAATGACTTCGGGGAGAT > CP009974/4132080‑4132380
|
AATAGCGTTCTAGCTCAGGTTTGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACA > SRR10918230.4769017/1‑151 (MQ=60)
TAGCGTTCTAGCTCAGGTTTGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACA < SRR10918230.1465588/151‑1 (MQ=60)
GCGTTCTAGCTCAGGTTTGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGG < SRR10918230.4653462/151‑1 (MQ=60)
GCGTTCTAGCTCAGGTTTGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGG > SRR10918230.5000419/1‑151 (MQ=60)
gctgcttgttcctttggttttttttttcaagcagacgacggcagacgagcttgatgtccgtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGT < SRR10918230.4184265/58‑1 (MQ=0)
GTTCTAGCTCAGGTTTGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTC < SRR10918230.3033267/151‑1 (MQ=60)
ctcgcgacatagcccgtcgtgaaggaccaggccttcccgcgaagaggcgcgcccgacggtaccattttcacccgcagatccctgttgccgctgattgcggatgcacaggtgAACCCGCTCGTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGG < SRR10918230.1419210/40‑1 (MQ=0)
TAGCTCAGGTTTGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTG > SRR10918230.789241/1‑151 (MQ=60)
TCAGGTTTGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGGGATTG > SRR10918230.3172653/1‑151 (MQ=60)
GGTTTGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGC < SRR10918230.606657/151‑1 (MQ=60)
TTTGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGC < SRR10918230.3217594/151‑1 (MQ=60)
TTTGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGCCGGTGATTGGGCGC > SRR10918230.347404/1‑151 (MQ=60)
TTTGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCCCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATCGGGCGC > SRR10918230.3508776/1‑151 (MQ=60)
TTGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACCGGTCGGTGATTGGGCGCA > SRR10918230.1838206/1‑151 (MQ=60)
TTGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCA < SRR10918230.1110207/151‑1 (MQ=60)
TTGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGGGATTGGGCGCA > SRR10918230.798639/1‑151 (MQ=60)
TGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAG < SRR10918230.3250470/151‑1 (MQ=60)
GTCGGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACCGGTCGGTGATTGGGCGCAGG > SRR10918230.1485002/1‑151 (MQ=60)
CGGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGGCACAGGTCGGTGGTTGGGCGCCGGCC > SRR10918230.3557101/1‑151 (MQ=60)
GCGGTAGGAGCGGGTTCACCCGGGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTCCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑T < SRR10918230.1877507/151‑1 (MQ=57)
GCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑G > SRR10918230.3442409/1‑151 (MQ=60)
CGTAGGAGCGGGTTCGCCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGtcg < SRR10918230.2835616/151‑4 (MQ=60)
CGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGtcg < SRR10918230.1697808/151‑4 (MQ=60)
CGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGCGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGGCACAGGTCGGGGATTGGGCGCAGcccctcg > SRR10918230.3231467/1‑144 (MQ=60)
GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGtcgt < SRR10918230.2261264/151‑5 (MQ=60)
GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGtcgt < SRR10918230.4045368/151‑5 (MQ=60)
GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGtcgt > SRR10918230.1053537/1‑147 (MQ=60)
GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGTCGG > SRR10918230.1053807/1‑151 (MQ=60)
GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATAGGGCGCAGGCCGtcgt > SRR10918230.5421497/1‑147 (MQ=60)
GTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGCCGGTGATTGGGCGCAGGCCGgcgt > SRR10918230.3854053/1‑147 (MQ=60)
GGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGtcgtgta < SRR10918230.4702796/151‑8 (MQ=59)
GGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGtcgtgta < SRR10918230.5006780/151‑8 (MQ=59)
AGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCcggccctcgtgtagg > SRR10918230.2974755/1‑136 (MQ=60)
GCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGtcgtgtagga < SRR10918230.839413/151‑11 (MQ=53)
GGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGGCACAGGTCGGGGGTTGGGGGCAGGCCGtcgtgtagggac > SRR10918230.3556718/1‑139 (MQ=47)
TTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGtcgtgtaggagcggg < SRR10918230.3714194/151‑16 (MQ=34)
CACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATC‑GGGGTGGCAACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGtcgtgtcggagcgggtt > SRR10918230.3229394/1‑134 (MQ=34)
GCCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGtcgtgtaggagcgggttt < SRR10918230.5446394/151‑19 (MQ=19)
ACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCtgtcgtgtaggagcgggttt < SRR10918230.2236228/151‑21 (MQ=28)
CCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCagatcggaagagcacacgtc > SRR10918230.2670039/1‑131 (MQ=48)
CCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGtcgtgtaggagcgggttta > SRR10918230.3092838/1‑132 (MQ=17)
CCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGtcgtgtaggagcgggtttac > SRR10918230.3309569/1‑131 (MQ=10)
CGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGtcgtgtaggagcgggtttacc < SRR10918230.4238084/151‑22 (MQ=6)
GCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGtcgtgtaggagcgggtttaccc > SRR10918230.718853/1‑129 (MQ=1)
gaagaggccggccctgcTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGC > SRR10918230.3068318/18‑151 (MQ=7)
gaagaggccggccctgcTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGC > SRR10918230.3778655/18‑151 (MQ=7)
GAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGtcgtgtaggagcgggtttaccccc > SRR10918230.2517012/1‑127 (MQ=0)
ccggccctgcTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGG > SRR10918230.613236/11‑151 (MQ=39)
ccggccctgcTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGG > SRR10918230.613036/11‑151 (MQ=39)
cggccctgcTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGC > SRR10918230.1855832/10‑151 (MQ=43)
cggccctgcTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGC < SRR10918230.4292242/142‑1 (MQ=43)
gccctgcTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCAGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCG < SRR10918230.3554726/144‑1 (MQ=39)
CGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGGCACAGGTCGGCGATTTGGCGCAGGCCGtcgtctaggcccgggtctacccgcgcagcggccggcc > SRR10918230.785580/1‑114 (MQ=5)
tgcTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTC > SRR10918230.4937181/4‑151 (MQ=60)
GCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCC < SRR10918230.1556877/151‑1 (MQ=60)
TTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGG‑GGGCACAGGTCGGTGgatgggcgccggccgtcggtagggggggggtttacccgcgaagaggccggtcccg > SRR10918230.56697/1‑96 (MQ=0)
CTGGCCAATTACCCCCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCA < SRR10918230.767879/151‑1 (MQ=60)
CTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCA < SRR10918230.1679755/151‑1 (MQ=60)
GGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACA < SRR10918230.2969394/151‑1 (MQ=60)
GCCACTTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAG < SRR10918230.886960/151‑1 (MQ=60)
GCCAATTTCCACCCGGCGTTCCCCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAACCCCGCTTCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGGTTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAG < SRR10918230.4611792/151‑1 (MQ=60)
CAATTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCG > SRR10918230.2887754/1‑151 (MQ=60)
TTTCCCCCCGCCGTTCACCTCTGCCGCAGCTACCGTCTTCTCGGGGAAACCCGCTCCTACGCGGGATCGGGCGTGGACCCAGGGCGGTTATTGGGCGCAGGCCG‑CAGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAA < SRR10918230.3924030/151‑1 (MQ=60)
TTACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGATGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGAACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAA < SRR10918230.82573/151‑1 (MQ=60)
ACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACC < SRR10918230.2422576/151‑1 (MQ=60)
ACCACCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACC < SRR10918230.2089758/151‑1 (MQ=60)
CCCCGCTGTTCACCGCGGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCA < SRR10918230.5099426/151‑1 (MQ=60)
CCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAG < SRR10918230.1415482/151‑1 (MQ=60)
CCCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAG > SRR10918230.4735044/1‑151 (MQ=60)
CCGCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGG > SRR10918230.2655210/1‑151 (MQ=60)
GCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGCGCGGCTTTGTGTGGCACAACGGCCGCTTCCACCGCGAAACCGCAGGGG > SRR10918230.1817943/1‑151 (MQ=60)
GCCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCCGGGG > SRR10918230.520615/1‑151 (MQ=60)
CCGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTATGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGT < SRR10918230.790251/151‑1 (MQ=60)
CGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTGGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTC < SRR10918230.3709511/151‑1 (MQ=60)
CGTTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTC > SRR10918230.2212253/1‑151 (MQ=60)
TTCACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAG > SRR10918230.3523481/1‑151 (MQ=60)
CACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAA > SRR10918230.2681176/1‑151 (MQ=60)
ACCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAG > SRR10918230.4417800/1‑151 (MQ=60)
CCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGG < SRR10918230.1566111/151‑1 (MQ=60)
CCGCTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTAGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGG > SRR10918230.5196078/1‑151 (MQ=60)
TGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTG < SRR10918230.508365/151‑1 (MQ=60)
TGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTG > SRR10918230.5115809/1‑151 (MQ=60)
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CGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGG < SRR10918230.2387951/151‑1 (MQ=60)
CTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGGCA > SRR10918230.2583063/1‑151 (MQ=60)
TGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGGCAT < SRR10918230.2156411/151‑1 (MQ=60)
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GCTACCGGATTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGGCATC < SRR10918230.930332/151‑1 (MQ=60)
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CTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGGCATCT > SRR10918230.2404733/1‑151 (MQ=60)
TACCGTATTCGCGGGTAAACCAGCTTCTTCGCCGGATCGGGGGTGGACCCCGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGACACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGGCATCTC < SRR10918230.3948960/151‑1 (MQ=60)
TACCGGATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGGCATCTC < SRR10918230.3762619/151‑1 (MQ=60)
ACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGGCATCTCG < SRR10918230.1600106/151‑1 (MQ=60)
ACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGGCATCTCG < SRR10918230.1713611/151‑1 (MQ=60)
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CGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTGGGTGCTTGGGCGaggggggtcgtgcaggcgtgtgttttcccgctacggagatcgccctggtgggcaatctcctgctttagataagcatagcggtggccg > SRR10918230.1886737/1‑64 (MQ=0)
gtgtgCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGGCATCTCGCCC < SRR10918230.4416105/146‑1 (MQ=60)
GTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGGCATCTCGCCC < SRR10918230.2266819/151‑1 (MQ=60)
TATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATTGGTGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCGtcgtggagcggcagagcacccggctgaactgcagtcccggccagccaactcgtatcccgcgttcaccttggaagacaccacc > SRR10918230.2784258/1‑69 (MQ=0)
TATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGGCATCTCGCCCT > SRR10918230.454658/1‑151 (MQ=60)
TATTAGCGGGTACACCCGCTCCTGCGCCGGAGCGGGGGTGGACGCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGGCATCTCGCCCT < SRR10918230.3892929/151‑1 (MQ=60)
ATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGGCATCTCGCCCTT < SRR10918230.1431943/151‑1 (MQ=60)
ATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGGCAGAAGGCTTTCGGCATCTGGCCCCT > SRR10918230.4616188/1‑151 (MQ=60)
TTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGGCATCTCGCCCTTG > SRR10918230.5002125/1‑151 (MQ=60)
GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGCTTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGGCAGAAGGGTTGCGGCATCTCGCCCTGGGCCAG > SRR10918230.1701940/1‑151 (MQ=60)
GGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGGCATCTCGCCCTTGGCCAG > SRR10918230.1717474/1‑151 (MQ=60)
GTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGGCATCTCGCCCTTGGCCAGGC > SRR10918230.4897297/1‑151 (MQ=60)
AAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGGCATCTCGCCCTTGGCCAGGCGC > SRR10918230.5366617/1‑151 (MQ=60)
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CGGATCGGGGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCTCAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGGCATCTCGCCCTTGGCCAGGCGCCGGTTGATGTCGGCAA > SRR10918230.154761/1‑151 (MQ=60)
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GGGTGGACCCAGGTCGGTGATTGGGCGCCGGCCG‑AGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGGCATCTCGCCCTTGGCCAGGCGCCGGTTGATGTCGGCAATGACTTCG < SRR10918230.742148/151‑1 (MQ=60)
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CCCAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGGCATCTCGCCCTTGGCCAGGCGCCGGTTGATGTCGGCAATGACTTCGGGGAGAT > SRR10918230.1330533/1‑151 (MQ=60)
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AATAGCGTTCTAGCTCAGGTTTGTCGGCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCGGTTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATCGGGGGTGGACACAGGTCGGTGATTGGGCGCAGGCCG‑CGGTAGGAGCGGCCTTGTGTGGCACAAGGGCCGCTTCCACAGCGAAACCGCAGGGGTCAGAAGGCTTGCGGCATCTCGCCCTTGGCCAGGCGCCGGTTGATGTCGGCAATGACTTCGGGGAGAT > CP009974/4132080‑4132380
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
