Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
336 |
367.5 |
14491858 |
96.8% |
14028118 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
3,585,070 |
C→G |
intergenic (+210/+13) |
RPPX_16020 → / ← RPPX_16025 |
hypothetical protein/diguanylate phosphodiesterase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 3,585,070 | 0 | C | G | 96.6%
| 911.1
/ 13.7
| 292 | intergenic (+210/+13) | RPPX_16020/RPPX_16025 | hypothetical protein/diguanylate phosphodiesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (4/6); new base G (189/93); total (193/99) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.36e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 312 total aligned reads displayed.
CCTGCTGGCCAATCTCCACCCGTCGGTCACCGTTGTCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGGTTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCT > CP009974/3584919‑3585220
|
gctgGCCAATCTCCACCCGTCGGTCACCGTTGTCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAgggccgggcc > 1:3494967/1‑151 (MQ=255)
ctgGCCAAGGTCGACCCGTCGGTCACCGTTGTCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCTGCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCct < 2:6879530/151‑1 (MQ=255)
tgGCCAATCTCCACCCGTCGGTCACCGTTGTCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGGGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCctg > 2:4639317/1‑151 (MQ=255)
aaTGTCGACCCGGCGGTCGCCGTTGTGGCCGCTGCTGTATTCGTGGGTGAACTCTCTCATGCGACTGATCGAAGGTGGGCCTATGGCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGGGGGTCTTCCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGc < 2:2757772/151‑1 (MQ=16)
aTCTCCACCCGTCGGTCACCGTTGTCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGcc > 1:1029200/1‑151 (MQ=255)
tcCACCCGTCGGTCACCGTTGTCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGAGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAACGGCCGGGCCTGCTGGcccct > 2:5580711/1‑148 (MQ=255)
cgacgcGTCGGTGGCCGTTGTCGCCGCTGCCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCATACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCCCGGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTCACGCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCAttt < 1:3460974/146‑1 (MQ=17)
aCCCGTCGGTCACCGTTGTCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTac > 2:3772951/1‑151 (MQ=255)
cccGTCGGTCACCGTTGTCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTTCCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTacc < 1:4811821/151‑1 (MQ=255)
gcGTGGGTCACCGGTGTCGCCGCTTCCGTATTCGCGGGTAAGCCCGCTGCTACGCCTTATCGAAGGTGGACATGTGTCGGTGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTacca < 1:4332030/150‑1 (MQ=14)
ccGTCGGTCACCGTTGTCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGGAGGTTGGCACATGGCTGCCGTTGGGCCCGGGCCGCCGGGGAAGAGCGGGGCTACCCGCGCGCGTGCCGGGCCTGCTGGCCACTTcccc > 2:4712856/1‑150 (MQ=12)
ggTCACCGTTGTCGCCGCTCCCGTTTTCGTGGGTAAGCCGGCTCCGACGCCTGATCGCAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACGGGTCGCCGTGTGGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACccgc < 2:3201599/151‑1 (MQ=17)
ggTCACCGTTGTCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACccgc > 1:5708636/1‑151 (MQ=255)
gtggccGGTGTCGCCGCTGCCGTATTCGCGGGGCAGCGCTCTCCGACCCCTGATCGAAAATGGACACATGTCGGTGGTTGTGCACAGGCAGCCGTGTAAGAGGGGGTTTTCCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACccgcc < 2:3530340/147‑1 (MQ=16)
tCACCGTTGTCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGTAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACccgccc > 1:134837/1‑150 (MQ=255)
gTCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAgtgt > 1:6005883/1‑151 (MQ=255)
tCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGCGGAGGAGCGGGCTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATCTTCCACGCGCCGTTCAGCGtt > 2:2193324/1‑151 (MQ=17)
ccgcTGCCGCAGTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTgcc < 1:5128507/151‑1 (MQ=255)
ccgcTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTgcc > 1:6963192/1‑151 (MQ=255)
cgcTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTgccg < 1:1650824/151‑1 (MQ=255)
tgccGTTTTCGCGGGTAATGCCTCTCCTACGCCCGATCGAGGGTCGACACATGTCTGTGGTTAGGCATAGGCCGCCGTGTAGGCGCGTGTTGTCCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGccgccg < 2:6643079/149‑1 (MQ=21)
tACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGTAGGTGGACACATGTCTGTGGTAGGGCACAGGCCGCCGTCTAGCTGCGGGTTTACCCGCGACAGGGCCGGGCTCCCTGGCCCTTTACTCCCCGCCGTTCGGTGCTgccgccc > 2:6936191/1‑150 (MQ=17)
tATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTAcc > 1:1087251/1‑151 (MQ=255)
tATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCCGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTAGGCACAGGCCGTCGTGTAGGATCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTAcc < 1:6732804/151‑1 (MQ=17)
ttCGCGGGTCAACCCGCTGCTACGCCTTATCGAAGGTGGACACATGGCTGTGGTTGGGCACGGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTCTTCGCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGt < 2:5655581/151‑1 (MQ=18)
cgGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTc > 2:6031960/1‑151 (MQ=255)
ggttAAGCCCGCTCCTCCGCCCGATCGAAGGTGGTCCTGTGGCTGTGGTCGGGCACGTGCGGTCGTGTAGGGGCGTGTTTATCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTcg < 1:1457639/148‑1 (MQ=17)
gggTCAGCCCTCTGCTACGCCTGATCGAAGGTGGACATATGGCTGTGGTTGGGCACGGGCAGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACGCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTcg < 1:4403576/151‑1 (MQ=17)
gggTCAGCCCGCTGCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGGCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTcg < 1:5062945/151‑1 (MQ=17)
ggTCAACCCTCCCCTACCACCGATCGCAGGTGGACACATGGCGGTGGTTGGGCCAGGGCCTCCGTGTGGGAGCGGGTCCACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGCTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTcgc < 1:6325433/151‑1 (MQ=14)
gTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGCATTcgcg > 2:390795/1‑151 (MQ=255)
cccGCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTaa > 1:3091343/1‑151 (MQ=255)
ccGCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTaaa > 2:2551058/1‑151 (MQ=255)
ccGCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGCCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGCaaa > 2:4162321/1‑151 (MQ=255)
gCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTCTTCGCGGGTAAccc > 2:1799357/1‑151 (MQ=255)
tCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAACCCCg > 2:6409030/1‑151 (MQ=255)
ccatccacTGATCGTAAGTCGACAAAAGGCTGTGCCTGGGCACAGGCAGTCGTGTAGGGGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGc < 1:1014721/144‑1 (MQ=14)
tACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTc > 1:359189/1‑151 (MQ=255)
tACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTc > 1:5207356/1‑151 (MQ=255)
ccTGATCGGAGATGGACATGAGTCTGTGCTGGGGCACGGGCCGTCGTGTAGGGGCGGGTTTTCCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc < 1:5090527/151‑1 (MQ=14)
ccTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc > 2:1701763/1‑151 (MQ=255)
cTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGGTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACg > 1:7085094/1‑151 (MQ=255)
tGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGc > 2:4415994/1‑151 (MQ=255)
tGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGAGTAAACCCGCTCCTActc > 1:2153922/1‑149 (MQ=255)
tGATCGAAGGGGGGCCCGGGTCTGTGGTTGGGCACGGGCCGTCGTGTAGGGGGGGGTTTGCGCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGc < 2:3314335/151‑1 (MQ=17)
tCGAGGGTGAACACAGGTCGGTGATTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTg < 1:4706400/151‑1 (MQ=11)
tCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTg > 1:2213035/1‑151 (MQ=255)
tCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTg > 2:4956326/1‑151 (MQ=255)
cGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGa > 1:3298275/1‑151 (MQ=255)
gAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCCACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGAt > 2:1343204/1‑151 (MQ=255)
gggTGGACACATGGCTGTGGTCGGGCCAGGGTCTTCGTGTAAGGGCGGGTTCTCGCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATtg < 2:3102180/150‑1 (MQ=17)
ggTGGACACAGGTCGGTGGTTGGTCACAGGCCGTCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTACCACCCGCCGTTCACCGTTGCCGCTGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCGGATtgg > 1:4577342/1‑151 (MQ=11)
ggggACACACCTCTGGGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCAATTTCCACCCGCCGTTCACTGTTGCCGCCGCTACCGTATTTGCGGGTAAACCCGCTCCTACG‑CAGATtggtg < 1:3030192/149‑1 (MQ=14)
cacaTGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGGTTg > 1:1381259/1‑151 (MQ=255)
aTGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGTGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGGTTGGGc > 2:1277796/1‑151 (MQ=255)
gTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGGTTGTGcac > 1:3605941/1‑151 (MQ=255)
gTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGGTTGGGcac > 1:205580/1‑151 (MQ=255)
cTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGGTTGGGCACAg > 1:6181286/1‑151 (MQ=255)
cTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGGTTGGGCACAg > 1:2093557/1‑151 (MQ=255)
gtgGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGGTTGGGCACAGGc > 2:3239062/1‑151 (MQ=255)
tgGTTGGGCCAGGGCCGTCGTGTGGGGCGGGGTTGAGCCGCGAAGGGGCCGAGCCTGCTGGCCATTGACCGCCCGCCGGTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATGGGTGGTTGGGCACAGGcc < 2:2822106/151‑1 (MQ=17)
tGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGGTTGGGCACAGGCCCCCg < 1:1729094/151‑1 (MQ=255)
ggCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTCAACCCGCTCCTACGCCTGATCGGTGGTTGGCCACAGGCCCCCGtc > 2:2395448/1‑150 (MQ=255)
cacaGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGGTTGGGCACAGGCCCCCGTAgg > 1:5414683/1‑151 (MQ=255)
aGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGGTTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGc > 1:2698696/1‑151 (MQ=255)
aGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCGACGCCTGATTGGTGGTTGGGCACAGGCCCCCGTAGGGGc > 1:409039/1‑151 (MQ=255)
gggctccgTGTAGGGGCGGGTTCTCGAGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGGTTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCg < 1:3843432/146‑1 (MQ=21)
ccgccgTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGGTTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCggg > 1:6552945/1‑151 (MQ=255)
cgccgTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCGCCTGATTGGTGGTTGGGCACAGGCCCCCGCAGCAGCCGGt > 2:5939777/1‑151 (MQ=255)
cgccgTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGGTTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGt > 1:3908633/1‑151 (MQ=255)
gccgTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGGTTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGtt > 2:6149242/1‑151 (MQ=255)
gccgTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGGTTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGtt > 1:341511/1‑151 (MQ=255)
ccgTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCt < 1:2547304/106‑1 (MQ=255)
ccgTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTTGTGGTTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTc > 1:6345316/1‑151 (MQ=255)
ccgTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGGTTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTc > 1:2197770/1‑151 (MQ=255)
cgTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGCGGTTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGGTcc > 2:548280/1‑150 (MQ=255)
tgtAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGGTTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCAcc > 1:4845599/1‑151 (MQ=255)
taagAGCGGGACTACGCGCCAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGGTTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCcg < 1:1855890/148‑1 (MQ=25)
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ggAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGGCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGGTTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCcgcg > 1:5797248/1‑151 (MQ=255)
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CTGCTGGCCAATCTCCACCCGTCGGTCACCGTTGTCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATCGAAGGTGGACACATGTCTGTGGTTGGGCACAGGCCGCCGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCCCTGCTGGCCATTTACCACCCGCCGTTCAGTGTTGCCGCCGCTACCGTATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACGCCTGATTGGTGGTTGGGCACAGGCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAGCGCATCCCT > CP009974/3584920‑3585220
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
