Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
336 |
367.5 |
14491858 |
96.8% |
14028118 |
150.7 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 1269 total aligned reads displayed.
TACGGTCAACGGACGGTCCAGCGCCTGGCTCACTTTCACAGTAAAGGAAGGTTGCTGGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTGA > CP009974/1898869‑1899146
|
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cgaaggtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctgtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCA < SRR10918235.38367/37‑1 (MQ=0)
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gtgacggcagttagacgtggtcgcttacgatctcggtgtaagtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTG < SRR10918235.5051175/41‑1 (MQ=0)
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gtctgagcagggttgcttagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAAT > SRR10918235.5085170/103‑151 (MQ=9)
tctgagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATT < SRR10918235.3501258/50‑1 (MQ=8)
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tgcgaaggtgtgtggagttcagccgtgtgcgcttccgatctgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTAC < SRR10918235.3748882/52‑1 (MQ=14)
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gagcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACC > SRR10918235.1137821/99‑151 (MQ=18)
caagcaggatgcggtatacgagggtcacgatgctgactggggctcagacgcgtgcccgtccgatcgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACC < SRR10918235.3166629/53‑1 (MQ=18)
agcagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCG < SRR10918235.6111468/54‑1 (MQ=21)
cagggttgctcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCC > SRR10918235.3000819/96‑151 (MQ=30)
CGGCTGGCTCACTTTCACAGTAAAGGAAGGTTGCTGGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGGTGTCGTTGAT‑‑‑GGCCGTCGAGG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCA < SRR10918235.867866/151‑1 (MQ=17)
gacgcgagggcagacgtttgctgttccgacgtcgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTG < SRR10918235.4181692/60‑1 (MQ=42)
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tcagggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTT < SRR10918235.2276438/65‑1 (MQ=56)
atagccgaaggtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCT < SRR10918235.4355390/67‑1 (MQ=43)
agggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCT < SRR10918235.3777472/67‑1 (MQ=60)
ggtcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCG < SRR10918235.4554473/69‑1 (MQ=60)
gtcacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGA > SRR10918235.7066554/82‑151 (MQ=60)
ttttattgagcataagacggcatacgaggtaaccgaaggtggctggagtccaggcgtgggctcttgcgatctccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGAT < SRR10918235.3536340/71‑1 (MQ=60)
tcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGGCAGCTGCTCGAAATTGCCGCCCGTGGCGTTCGCGAT > SRR10918235.2229706/81‑151 (MQ=18)
tcacggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGGTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGAT > SRR10918235.200901/81‑151 (MQ=60)
gtgtgtgctggcgatctcgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATA < SRR10918235.4737594/72‑1 (MQ=60)
cacggtgtaagtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATG > SRR10918235.6837412/80‑151 (MQ=60)
acggtgtaggtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAG > SRR10918235.5962093/79‑151 (MQ=60)
acggtgtaggtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAG > SRR10918235.3314052/79‑151 (MQ=60)
acggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGG > SRR10918235.1490974/79‑151 (MQ=58)
cggtgtaggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGT > SRR10918235.5235196/78‑151 (MQ=60)
ttggtttgtttttttcaagcagaagacggcatacgagataaccgaaggtgactggagttcagacgtgtgctcttccgatcT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTG < SRR10918235.4890123/71‑1 (MQ=60)
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ggtgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTG < SRR10918235.4409524/81‑1 (MQ=60)
agtgatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGAGAGTGACGCTG > SRR10918235.542026/71‑151 (MQ=60)
tgatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGCTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACagatcg > SRR10918235.4022203/69‑145 (MQ=60)
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gatcacgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACG < SRR10918235.253283/84‑1 (MQ=48)
gatcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACG > SRR10918235.2673827/68‑151 (MQ=60)
gaagcagaagccttcggtcgcgttagcccaaggtgtctggagtgcagtcgtgggctcttccgagctgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACG < SRR10918235.6412711/84‑1 (MQ=60)
tcacgccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGT > SRR10918235.1943396/66‑151 (MQ=60)
tcacgccgccttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACagatcggaa > SRR10918235.2335643/66‑142 (MQ=60)
cagacgtgtgctcttccgatctgcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCG < SRR10918235.2057960/88‑1 (MQ=60)
acgccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCG < SRR10918235.5540117/88‑1 (MQ=60)
gccgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAG > SRR10918235.5705340/62‑151 (MQ=60)
gccgccttcggtgactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTGGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACCGTCGAG > SRR10918235.7030711/62‑151 (MQ=60)
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cgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGGG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCGGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACC > SRR10918235.3551845/60‑151 (MQ=60)
cgccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACC > SRR10918235.2975872/60‑151 (MQ=60)
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gccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCG > SRR10918235.2304019/59‑151 (MQ=60)
gccttcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACagatcggaagagcaca > SRR10918235.4688828/59‑135 (MQ=60)
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ttcggtgaccgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTG > SRR10918235.237888/56‑151 (MQ=60)
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tcggttacgcttggcgaggcggtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGT > SRR10918235.6518019/55‑151 (MQ=60)
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gttctcgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGT < SRR10918235.718723/100‑1 (MQ=60)
cgtgtgctcttccgatcttcagggtcgcggtggtggtgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTA < SRR10918235.2768258/101‑1 (MQ=60)
gactgacgggctcgccgtcagggtcgcggtggtggcgtcgaccgagtcgTTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAG < SRR10918235.5325570/102‑1 (MQ=60)
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TGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTGCCGGC > SRR10918235.664030/1‑151 (MQ=60)
GAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGGACTTCCTGCCAGCGGCGCTCACGTTGGTGGCGCTCACGGGCGAGCCGTTGCTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCT < SRR10918235.7153531/151‑1 (MQ=60)
GAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTGCCGGCT < SRR10918235.1025870/151‑1 (MQ=60)
GAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCACTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCT < SRR10918235.5475402/151‑1 (MQ=60)
AT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTGCCGGCTT > SRR10918235.2592768/1‑151 (MQ=60)
AT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTT > SRR10918235.4980163/1‑151 (MQ=60)
AT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTT > SRR10918235.6011817/1‑151 (MQ=60)
T‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTC > SRR10918235.3663924/1‑151 (MQ=60)
T‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTC < SRR10918235.6927170/151‑1 (MQ=60)
T‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTA > SRR10918235.6591845/1‑47 (MQ=21)
T‑‑‑CATGGTCTTGG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGCCCGGGGTCTGGAATTCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTC < SRR10918235.1215451/151‑1 (MQ=60)
CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTagatcgggagggcacacgtctggactccagtgaccttcggttaggtcgtatgctggcttttgcttctgcactaggatttacccgcttca > SRR10918235.2580725/1‑62 (MQ=60)
CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATGGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTGCCGGCTTCA > SRR10918235.4288573/1‑151 (MQ=60)
CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCA < SRR10918235.5593991/151‑1 (MQ=60)
GTGGTGTGTG‑CCGG‑CGCGGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAA < SRR10918235.7105188/151‑1 (MQ=60)
GTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGCGAGTGCCGCTGCCGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAA < SRR10918235.5922727/151‑1 (MQ=60)
TGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAAC < SRR10918235.4089010/151‑1 (MQ=60)
GGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATagatcggaagagcacacgtctgaactccagtcaccttcggttatctcgtatgccgtcttctgcttgaaaaaaaaaaagaaattaaagatgaaaacacttgtaaatttaca > SRR10918235.3132648/1‑41 (MQ=9)
GGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTCGAAATTACCGCCCGCGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACG < SRR10918235.1515258/151‑1 (MQ=60)
TCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTGGGTTTTACCCagatcggaagg > SRR10918235.5673/1‑140 (MQ=60)
CTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAACCGTTGTTGTAGACGTCATTGCCCGGGGTCTGGAATTCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTG > SRR10918235.3826622/1‑151 (MQ=60)
TGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATAGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTGTAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAGTTGACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTGA < SRR10918235.2950947/151‑1 (MQ=60)
TGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGCTGCTCGAAGTTGCCGCCCGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTGA > SRR10918235.3677788/1‑151 (MQ=60)
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TACGGTCAACGGACGGTCCAGCGCCTGGCTCACTTTCACAGTAAAGGAAGGTTGCTGGTCTTCGGTCACATTGCCATTGCTGACAATGCTTACGGTGACGGCATCGATGCTGTCATTGAT‑‑‑CGTGGTCTGAG‑CCGG‑CGTCGGGTTCGGGGTCAGTTGCTCGAAATTACCGCCAGTGGCGTTCTCGATGGTGACGCTGACGGTCGAGCCGTTGTTATAGACGTCATTGGCCGGGGTCTGGAAATCAACGCTGCCCTGGGTTTTACCCGCTTCAACGGTGA > CP009974/1898869‑1899146
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
