Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F1 I1 R1
|
368 |
332.2 |
13092066 |
97.0% |
12699304 |
150.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
5,157,352 |
C→T |
intergenic (+178/+65) |
RPPX_22875 → / ← dnaE2 |
integrase/DNA polymerase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 5,157,352 | 0 | C | T | 100.0%
| 1083.6
/ NA
| 290 | intergenic (+178/+65) | RPPX_22875/dnaE2 | integrase/DNA polymerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (156/134); total (156/134) |
Only 100 of 294 total aligned reads displayed.
GGGGGGCTCAGGCCTAGTGGCAAACGTGGCTGTCGACCAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAACGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTGCAGCAGCGGACTCACATCCTCCAACCGCCGCGCAATCAGGTGCCGCA > CP009974/5157204‑5157499
|
gggggCTCAGGCCTAGTGGCAAACGTGGCTGTCGACCAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAAtgcg < 2:1364144/151‑1 (MQ=255)
ggCTCAGGGCTAGTGGCAAACGTGGCTGTCGACCAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTg < 2:6438428/151‑1 (MQ=255)
gCTCAGGCCTAGTGGCAAACGTGGCTGTCGACCAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTgg > 1:5745279/1‑151 (MQ=255)
tCAGGCCTAGTGGCAAACGTGGCTGTCGACCAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGgct < 1:4984842/151‑1 (MQ=255)
aGGCCTAGTGGCAAACGTGGCTGTCGACCAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGGGgctgc > 1:6032224/1‑151 (MQ=255)
gCCTAGTGGCAAACGTGGCTGTCGACCAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCtt > 2:3358349/1‑151 (MQ=255)
ccTAGTGGCAAACGTGGCTGTCGACCAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTc > 1:1435353/1‑151 (MQ=255)
cTAGTGGCAAACGTGGCTGTCGACCAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTcg > 2:3017543/1‑151 (MQ=255)
tGGCAAACGTGGCTGTCGACCAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCggg > 2:5323892/1‑151 (MQ=255)
cAAACGTGGCTGTCGACCAAGGTATAACGCACGGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGAATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGATGGCTGCTTCGCGGGCTc < 2:1870942/151‑1 (MQ=255)
aaaCGTGGCTGTCGACCAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCg > 2:6467565/1‑151 (MQ=255)
aaCGTGGCTGTCGACCAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGc < 2:5960060/151‑1 (MQ=255)
aaCGGGGCTATGGACCAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGc < 2:5136807/151‑1 (MQ=255)
aCGTGGCTGTAGAACAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTACAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGcc < 2:6254615/151‑1 (MQ=255)
cGTGGCTGTCGACCAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGccc < 1:751774/151‑1 (MQ=255)
tGGCTGTCGACCAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGc > 2:67399/1‑151 (MQ=255)
ggCTGTCGACCAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGcc > 2:782775/1‑150 (MQ=255)
cTGTCGACCAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTcc > 2:3218459/1‑151 (MQ=255)
cGACCAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCcaca < 1:987811/151‑1 (MQ=255)
cGACCAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCcaca > 2:4015126/1‑151 (MQ=255)
gACCAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAg > 1:1073122/1‑151 (MQ=255)
aCCAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAgg > 1:4068606/1‑151 (MQ=255)
ccAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAggg < 1:4406829/151‑1 (MQ=255)
cAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGa > 1:3023267/1‑151 (MQ=255)
cAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCCCGGGCCCGCCCGCcccccccgcgc > 1:1225134/1‑144 (MQ=25)
aaGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGaa > 1:2076265/1‑151 (MQ=255)
aaGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCCCGCCCGCTCCCACAGGGaa > 1:4199301/1‑151 (MQ=255)
ggTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAAcc < 1:5321507/151‑1 (MQ=255)
tataACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACcgc < 2:2478066/151‑1 (MQ=255)
ataACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACCGGGGACcgcg > 2:3608486/1‑151 (MQ=255)
ataACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACcgcg < 1:2928558/151‑1 (MQ=255)
aaCGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCa < 2:5779798/151‑1 (MQ=255)
ccGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTcc < 1:2344776/151‑1 (MQ=255)
cGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCACTGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGCAACCGCGCACGTTCCg > 1:1975067/1‑151 (MQ=255)
gTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGa < 1:5617185/151‑1 (MQ=255)
gTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGa > 2:4325436/1‑151 (MQ=255)
gCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCg > 1:6499345/1‑151 (MQ=255)
gTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGt < 2:3384066/151‑1 (MQ=255)
ggggCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGa < 2:409654/151‑1 (MQ=255)
ggggCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGa < 1:3642566/151‑1 (MQ=255)
gggCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGaa < 1:2823845/151‑1 (MQ=255)
cAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATc > 1:5723874/1‑151 (MQ=255)
aGGCGCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATcc < 2:739840/151‑1 (MQ=255)
cgcAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCgg < 2:1289733/149‑1 (MQ=255)
tCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGc > 1:3383881/1‑151 (MQ=255)
tCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGc < 1:4783847/151‑1 (MQ=255)
cAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCt < 1:4471866/151‑1 (MQ=255)
aaGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTg < 1:2571999/151‑1 (MQ=255)
tcTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGt > 1:5790541/2‑151 (MQ=255)
ggCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTAc < 2:4439405/150‑1 (MQ=255)
cAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACAt > 2:269581/1‑151 (MQ=255)
aGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATc > 2:5681275/1‑151 (MQ=255)
ggCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATcc > 1:1802328/1‑151 (MQ=255)
cGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGCAATCCCGGCTGCGTACATCCAg > 2:4512534/1‑151 (MQ=255)
ggTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGCACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAACCCCGGCTGCGTACATCCAGc > 2:385944/1‑151 (MQ=255)
ggTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGc > 1:460338/1‑151 (MQ=255)
ggTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGc < 2:1481694/151‑1 (MQ=255)
tCAGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACAGCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAGTGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGccc < 2:1693370/151‑1 (MQ=255)
aTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGAGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCCTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTg < 1:652517/151‑1 (MQ=255)
ggtgGGGGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCGCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTgc < 2:2233447/150‑1 (MQ=255)
gtgGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTgca < 1:2151015/151‑1 (MQ=255)
tgGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGCTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTgccg > 2:4770985/1‑149 (MQ=255)
gggAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTgcagc < 1:2197957/151‑1 (MQ=255)
ggAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTgcagca < 2:2028526/151‑1 (MQ=255)
ggAGCGGGCAGGCCCGCGAACAGCGGCAAGGCCGGTGCCGTGCAGTGGGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTgcagca < 2:4381874/151‑1 (MQ=25)
gCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTTGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTGCAGCAGCg > 2:2129791/1‑151 (MQ=255)
cGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTGCAGCCGCgg > 2:4881855/1‑151 (MQ=255)
cGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAATGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTGCACCAGCgg > 1:1665275/1‑151 (MQ=255)
gggCTTGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACCGGGAACCGCGCAAGGTCCGCGCGTTGGGGACAGTGGAAAGCCCGGCCGCGTGCATCCAGCCCGTGCAGCAGCGGa > 2:5380334/1‑151 (MQ=21)
cATGCCCGCGAACACCGGGAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGGCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTGCAGCAGCGGACTc < 2:3732028/151‑1 (MQ=255)
ccGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTTAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTGCAGCAGCGGACTCACAtc > 1:856484/1‑151 (MQ=255)
ccGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTGCAGCAGCGGACTCACAtc < 1:3978048/151‑1 (MQ=255)
ccGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTGCAGCAGCGGACTCACAtc > 1:828972/1‑151 (MQ=255)
cgAGCACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTGCAGCAGCGGACTCACAtcctc < 2:1456922/151‑1 (MQ=255)
cgAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTGCAGCAGCGGACTCACAtcctc < 1:342477/151‑1 (MQ=255)
cgAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCCGCTGCGTACATCCAGCCCTTGCAGCAGCGGACTCACAtcctc > 2:5095866/1‑151 (MQ=255)
gAACACCGGCAAGGCCGGTGCGCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTGCAGCAGCGGACTCACAtcctcc < 2:4126948/151‑1 (MQ=255)
gacacCGGCAAGGGCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCGGCTTCGCGGCCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTGCAGCAGCGGACTCACATCCTCCa < 2:5714903/150‑1 (MQ=255)
aaCACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTGCAGCAGCGGACTCACATCCTCCa < 2:280340/151‑1 (MQ=255)
aaCACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTGCAGCAGCGGACTCACATCCTCCa < 1:3380828/151‑1 (MQ=255)
acacCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTGCAGCAGCGGACTCACATCCTCCaa < 2:2994192/151‑1 (MQ=255)
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TTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTG > SRR10918232.2657193/1‑151 (MQ=60)
TGGGGCCGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCAGGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGG < SRR10918232.4516723/151‑1 (MQ=60)
TGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGG > SRR10918232.1138773/1‑151 (MQ=60)
GGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGA < SRR10918232.3658479/151‑1 (MQ=60)
GGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGA < SRR10918232.5050848/151‑1 (MQ=60)
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GGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAA > SRR10918232.6491098/1‑151 (MQ=60)
CAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATC > SRR10918232.5750019/1‑151 (MQ=60)
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GGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTAC < SRR10918232.1796882/151‑1 (MQ=60)
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AGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTGCAGCAGC > SRR10918232.3007129/1‑151 (MQ=60)
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atctTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTGCAGCAGCGGACTCACATCCTCCAACCGCCGCGCAAT < SRR10918232.6366437/147‑1 (MQ=60)
CGGTGCCCTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTCGCAGCAGCGGACTCACATCCTCCAACCGCCGCGCAATC < SRR10918232.4141992/151‑1 (MQ=60)
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CTGCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTGCAGCAGCGGACTCACATCCTCCAACCGCCGCGCAATCAGGTGCC < SRR10918232.100038/151‑1 (MQ=60)
GCAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTCCGTACCTCCAGCCCTTGCAGCAGCGCACTCACATCCTCCAACCGCCCCCCAATCACCTGCCGC > SRR10918232.6024670/1‑151 (MQ=60)
CAATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTGCAGCAGCGGACTCACATCCTCCAACCGCCGCGCAATCAGGTGCCGCC > SRR10918232.219600/1‑151 (MQ=60)
AATGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTGCAGCAGCGGACTCACATCCTCCAACCGCCGCGCAATCAGGTGCCGCAC > SRR10918232.4295904/1‑151 (MQ=60)
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GGGGGGGCTCAGGCCTAGTGGCAAACGTGGCTGTCGACCAAGGTATAACGCACCGTGGCCGATGAATGGTTGGGGCAGGCTCAAGGCTGCAGGCGGTCAATGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAACACCGGCAAGGCCGGTGCCCTGCAACGCGGTGGCTGCTTCGCGGGCTCGCCCGCTCCCACAGGGAACCGCGCAAGTTCCGAGCGTTGGGGTCAGTGGAAATCCCGGCTGCGTACATCCAGCCCTTGCAGCAGCGGACTCACATCCTCCAACCGCCGCGCAATCAGGTGCCGCAC > CP009974/5157203‑5157500
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |