Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
10478538 |
96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
1,657,996 |
G→A |
A200A (GCC→GCT) |
RPPX_07420 ← |
acyl‑CoA dehydrogenase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 1,657,996 | 0 | G | A | 99.2%
| 1005.8
/ ‑5.3
| 268 | A200A (GCC→GCT) | RPPX_07420 | acyl‑CoA dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base A (138/128); total (139/129) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
TCACGCCGTTGCGCTCGCCCACACCGCCTTCGGCGTTGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCGGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTTCAGTCAGGCACATGGTGCCGGTCCACTCGCCGGACACCAGCTTGGTC > CP009974/1657848‑1658143
|
tCACGCCGTTGCGCTCGCCCACACCGCCTTCGGCGTTGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGc < 1:2793624/151‑1 (MQ=255)
cACGCCGTTGCGCTCGCCCACACCGCCTTCGGCGTTGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGcc > 1:712542/1‑151 (MQ=255)
gCCGTTGCGCTCGCCCACACCGCCTTCGGCGTTGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGaa < 1:2614655/151‑1 (MQ=255)
cGTTGCGCTCGCCCACACCGCCTTCGGCGTTGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAAt < 1:3050602/151‑1 (MQ=255)
gTTGCGCTCGCCCACACCGCCTTCGGCGTTGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATg > 1:1870387/1‑151 (MQ=255)
ttGCGCTCGCCCACACCGCCTTCGGCGTTGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGa > 1:4645280/1‑151 (MQ=255)
cgcTCGCCCACACCGCCTTCGGCGTTGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGa > 2:1246285/1‑151 (MQ=255)
gcTCGCCCACACCGCCTTCGGCGTTGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGAt > 1:248511/1‑151 (MQ=255)
cTCGCCCACACCGCCTTCGGCGTTGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATc < 2:2259572/151‑1 (MQ=255)
ggcacacgCCGCCTTCGGGGTTGGGGAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCtt < 2:2991029/147‑1 (MQ=255)
ccACACCGCCTTCGGCGTTGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGt > 2:3126049/1‑151 (MQ=255)
cacaCCGCCTTCGGCGTTGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTg < 1:3743806/151‑1 (MQ=255)
acacCGCCTTCGGCGTTGGGCAGGAACTGCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGc < 2:4485434/151‑1 (MQ=255)
cGCCTTCGGCGTTGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGa < 1:4752158/151‑1 (MQ=255)
cGCCTTCGGCGTTGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGa > 2:1626094/1‑151 (MQ=255)
gCCTTCGGCGTTGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGac < 2:2143832/151‑1 (MQ=255)
gCCTTCGGCGTTGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGac > 2:4324599/1‑151 (MQ=255)
cTTCGGCGTTGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGacac > 2:1499051/1‑151 (MQ=255)
ttCGGCGTTGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACt < 1:2130936/151‑1 (MQ=255)
ggCGTTGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTg < 1:383487/151‑1 (MQ=255)
gCGTTGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGt > 2:3615361/1‑151 (MQ=255)
ttttggCAGGAACTTCGGCACGATGAGCAGGGAATTACCCTTGGGGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAg < 2:1759728/147‑1 (MQ=255)
gTTGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAg > 2:1136162/1‑151 (MQ=255)
ttGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGc > 1:530856/1‑151 (MQ=255)
tGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCt < 2:1349784/151‑1 (MQ=255)
gCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTAcc > 1:3092344/1‑151 (MQ=255)
gCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTAcc < 1:4088380/151‑1 (MQ=255)
cAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCa < 2:1425664/151‑1 (MQ=255)
cAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCa > 1:88006/1‑151 (MQ=255)
aGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCAt > 1:3476747/1‑151 (MQ=255)
aGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCAt < 1:1546913/151‑1 (MQ=255)
aCTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTATCTACCATCGGc > 2:329589/1‑151 (MQ=255)
cTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGcc < 1:4019768/151‑1 (MQ=255)
ttCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCt < 1:4303844/151‑1 (MQ=255)
ttCGGCACGATAAATACTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCAAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGTCATGTCGTGCTCACCAGCCGACATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCCTCGGCCt < 2:4185567/151‑1 (MQ=255)
gtcggggcGATGAACAGTGAAGTACGCTTGGTGCCGACCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCGAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCt < 2:4596056/144‑1 (MQ=255)
tCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCtg > 1:2233475/1‑151 (MQ=255)
cGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCtgt > 1:610754/1‑151 (MQ=255)
ggCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCtgtg < 2:1705246/151‑1 (MQ=255)
gaaCGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTgg < 2:169793/149‑1 (MQ=255)
gCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTgg > 2:712184/1‑151 (MQ=255)
cACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGc > 2:3170242/1‑151 (MQ=255)
cGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTc < 1:837131/151‑1 (MQ=255)
aGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGCTCTTGGTGCCAGACACCTTGTAGATACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTgg > 2:3999493/1‑151 (MQ=255)
aGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTgg > 1:4881797/1‑151 (MQ=255)
tGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTg > 2:949369/1‑151 (MQ=255)
aTACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCgca < 1:2483968/151‑1 (MQ=255)
ttGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGc > 1:1789412/1‑151 (MQ=255)
ttGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGc < 1:241861/151‑1 (MQ=255)
tGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGACATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTATCATCGGACTGTGGCTCGGCATTGTTGCGCAGCATGcc > 2:2743847/1‑151 (MQ=255)
gTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCa < 2:392658/151‑1 (MQ=255)
gccggccgGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAgg < 1:774140/151‑1 (MQ=255)
ccggccggTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAggt > 1:3582828/1‑151 (MQ=255)
cggccggTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAACCGAAATGAAGCTCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTTCGCAGCATGCCCAggtc > 2:1822552/1‑151 (MQ=255)
ggccggTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAggtcg > 1:4452937/1‑151 (MQ=255)
ccggTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAggtcggt > 1:1587551/1‑151 (MQ=255)
ccggTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAggtcggt < 2:237955/151‑1 (MQ=255)
ggTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTcc > 2:728837/1‑151 (MQ=255)
ggTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTcc < 2:2321286/151‑1 (MQ=255)
ggTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCACGCCCAGGTCGGccc > 2:2125916/1‑151 (MQ=255)
gTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGAAGCATGCCCAGGTCGGTccc < 1:23921/151‑1 (MQ=255)
tGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGTTTCGCAGCATGCCCACGTCGGTCCCg > 1:2187738/1‑151 (MQ=255)
gTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAg > 1:238684/1‑151 (MQ=255)
ccGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTg > 2:4623086/1‑151 (MQ=255)
ggCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCg > 2:2006165/1‑151 (MQ=255)
cAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCCTGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCggg > 2:4063447/1‑150 (MQ=255)
aGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGtt > 1:3994392/1‑151 (MQ=255)
ggCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTtc > 2:373023/1‑151 (MQ=255)
cGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCCGTGCGGTtcag > 1:905825/1‑151 (MQ=255)
gggCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTtcagt > 1:4266905/1‑151 (MQ=255)
ccAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTtcagtcag < 1:3344654/151‑1 (MQ=255)
cAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTTCAGTCAgg < 1:1265409/151‑1 (MQ=255)
aGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTTCAGTCAGGc > 1:3434659/1‑151 (MQ=255)
cGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTTCAGTCAGGCACAt < 1:4128598/151‑1 (MQ=255)
tatGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTTCAGTCAGGCACATGGt < 2:535619/151‑1 (MQ=255)
tGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTTCAGTCAGGCACATGGTGc < 2:4726681/151‑1 (MQ=255)
ggACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTTCAGTCAGGCACATGGTGcc < 1:3170242/151‑1 (MQ=255)
gACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTTCAGTCAGGCACATGGTGCCg < 1:3705096/151‑1 (MQ=255)
aTGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTTCAGTCAGGCACATGGTGCCGGTcc > 1:5175678/1‑151 (MQ=255)
gttgtCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTTCAGTCAGGCACATGGTGCCGGTCCAc < 2:504242/151‑1 (MQ=255)
ttgtCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTTCAGTCAGGCACATGGTGCCGGTCCACt < 2:3241095/151‑1 (MQ=255)
tgtCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTTCAGTCAGGCACATGGTGCCGGTCCACTc < 2:1088791/151‑1 (MQ=255)
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ACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTT > SRR10918231.2459181/1‑151 (MQ=60)
CAGTGTAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAGCGATATGGACGATGTTGACGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTG < SRR10918231.1299024/151‑1 (MQ=60)
CAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTG < SRR10918231.4141988/151‑1 (MQ=60)
AGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGG > SRR10918231.4905314/1‑151 (MQ=60)
AGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGG > SRR10918231.1977097/1‑151 (MQ=60)
AGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGG > SRR10918231.3159408/1‑151 (MQ=60)
TGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTG > SRR10918231.1736430/1‑151 (MQ=60)
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ATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCA < SRR10918231.2495334/151‑1 (MQ=60)
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CTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATG < SRR10918231.811816/151‑1 (MQ=60)
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GCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGG < SRR10918231.777257/151‑1 (MQ=60)
GCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGG < SRR10918231.777256/151‑1 (MQ=60)
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GGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCG < SRR10918231.2669328/151‑1 (MQ=60)
GGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCG > SRR10918231.4474083/1‑151 (MQ=60)
GGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCG < SRR10918231.884312/151‑1 (MQ=60)
CCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGT > SRR10918231.1594903/1‑151 (MQ=60)
CGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTC > SRR10918231.1399588/1‑151 (MQ=60)
GGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTAGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGAACATTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCACGCCCAGGCTGGTCC > SRR10918231.2090191/1‑151 (MQ=60)
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CCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTTCAGTCAG < SRR10918231.3359826/151‑1 (MQ=60)
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ACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTTCAGTCAGGCACATGGTGCCGGTCCACTCGCCGGACACCAGCTTGGTC < SRR10918231.3931572/151‑1 (MQ=60)
ACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTTCAGTCAGGCACATGGTGCCGGTCCACTCGCCGGACACCAGCTTGGTC > SRR10918231.1853587/1‑151 (MQ=60)
ACCAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTTCAGTCAGGCACATGGTGCCGGTCCACTCGCCGGACACCAGCTTGGTC < SRR10918231.659916/151‑1 (MQ=60)
CAGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTTCAGTCAGGCACATGGTGCCGGTCCACTCGCCGGACACCAGCTTGGTCAG < SRR10918231.954093/151‑1 (MQ=60)
AGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTTCAGTCAGGCACATGGTGCCGGTCCACTCGCCGGACACCAGCTTGGTCAGG > SRR10918231.1754356/1‑151 (MQ=60)
AGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTTCAGTCAGGCACATGGTGCCGGTCCACTCGCCGGACACCAGCTTGGTCAGG < SRR10918231.3679359/151‑1 (MQ=60)
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GCTCACGCCGTTGCGCTCGCCCACACCGCCTTCGGCGTTGGGCAGGAACTTCGGCACGATGAACAGTGAAATACCCTTGGTGCCGGCCGGTGCGTCCGGCAGGCGGGCCAGAACGATATGGACGATGTTGTCGGCCATGTCGTGCTCACCGGCCGAAATGAAGATCTTGGTGCCCGACACTTTGTAGCTACCATCGGCCTGTGGCTCGGCCTTGGTGCGCAGCATGCCCAGGTCGGTCCCGCAGTGCGGTTCAGTCAGGCACATGGTGCCGGTCCACTCGCCGGACACCAGCTTGGTCAGG > CP009974/1657846‑1658146
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |