Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
10478538 |
96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
3,230,201 |
C→T |
A23V (GCC→GTC) |
RPPX_14410 → |
cell division protein FtsQ |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 3,230,201 | 0 | C | T | 97.9%
| 844.8
/ ‑5.5
| 236 | A23V (GCC→GTC) | RPPX_14410 | cell division protein FtsQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base T (140/89); minor base G (2/3); total (142/94) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.84e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 237 total aligned reads displayed.
GGCCCGCGCGGCTGGCCTGGACTTCCAGCAACTGGTGCTGGCAATCCTGGCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGCCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGCTGGTGGCGGCCGGCTTTGGTGCCTACGAGGGCGCCATTCGCCTGATGCCGTACGCCGA > CP009974/3230053‑3230348
|
ggcCCGCGCGGCTGGCCTGGACTTCCAGCAACTGGTGCTGGCAATCCTGGCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCa < 1:4008032/151‑1 (MQ=255)
ggcCCGCGCGGCTGGCCTGGACTTCCAGCAACTGGTGCTGGCAATCCTGGCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCa > 2:3081371/1‑151 (MQ=255)
ggcCCGCGCGGCTGGCCTGGACTTCCAGCAAATGGTGCTGGCAATCCTGGCCGAAAGGGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGAAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCa < 1:2052802/151‑1 (MQ=255)
gcCCGCGCGGCTGGCCTGGACTTCCAGCAACTGGTGCTGGCAATCCTGGCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAg > 1:1333140/1‑151 (MQ=255)
ccGCGCGGCTGGCCTGGACTTCCAGCAACTGGTGCTGGCAATCCTGGCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGcc > 1:1515215/1‑151 (MQ=255)
ggcgcgGCTGGCCTGGACTTCCAGCAACTGGTGCTGGCAATCCTGGCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCg < 2:2106101/150‑1 (MQ=255)
ggCTGGCCTGGACTTCCAGCAACTGGTGCTGGCAATCCTGGCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCCAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCtgg > 2:3174446/1‑151 (MQ=255)
ggCTGGCCTGGACTTCCAGCAACTGGTGCTGGCAATCCTGGCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCtgg > 2:3711174/1‑151 (MQ=255)
cTGGCCTGGACTTCCAGCAACTGGTGCTGGCAATCCTGGCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCtggtg < 2:1464109/151‑1 (MQ=255)
tGGCCTGGACTTCCAGCAACTGGTGCTGGCAATCCTGGCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCtggtgg < 1:2801250/151‑1 (MQ=255)
tGGCCTGGACTTCCAGCAACTGGTGCTGGCAATCCTGGCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCtggtgg > 2:3888883/1‑151 (MQ=255)
ggCCTGGACTTCCAGCAACTGGTGCTGGCAATCCTGGCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGc > 1:2171673/1‑151 (MQ=255)
cTGGACTTCCAGCAACTGGTGCTGGCAATCCTGGCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCcga > 2:1079532/1‑151 (MQ=255)
cTGGACTTCCAGCAACTGGTGCTGGCAATCCTGGCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCcga > 1:4809707/1‑151 (MQ=255)
gACTTCCAGCAACTGGTGCTGGCAATCCTGGCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCcgacga < 2:4228331/151‑1 (MQ=255)
cTTCCAGCAACTGGTGCTGGCAATCCTGGCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGc > 1:5083258/1‑151 (MQ=255)
ttCCAGCAACTGGTGCTGGCAATCCTGGCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGcc > 1:4402505/1‑151 (MQ=255)
tCCAGCAACTGGTGCTGGCAATCCTGGCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCGACCCGTTACCGGCCATAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGccc > 2:5017144/1‑151 (MQ=255)
aaCTGGTGCTGGCAATCCTGGCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCg > 1:1061299/1‑151 (MQ=255)
tggCTGGCAATCCTGGCCGAAAGCGAGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGgcgcg < 1:1652348/149‑1 (MQ=255)
gTGCTGGCAATCCTGGCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGgcgcg > 1:1879981/1‑151 (MQ=255)
tGGCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCa > 2:859582/1‑151 (MQ=255)
gCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAg < 2:2769211/151‑1 (MQ=255)
cGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGcc > 2:217980/1‑151 (MQ=255)
cGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGcc > 1:3641637/1‑151 (MQ=255)
gAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGccc > 2:3942154/1‑150 (MQ=255)
gAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCt > 1:1917140/1‑151 (MQ=255)
gAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCt > 1:730975/1‑151 (MQ=255)
aaaGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTg > 2:1423101/1‑151 (MQ=255)
gTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGggcgg > 1:4156055/1‑151 (MQ=255)
ggCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAACCCTGGGCGGcc > 2:5213772/1‑151 (MQ=255)
gCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCt < 2:2080960/151‑1 (MQ=255)
cGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTc > 2:298774/1‑151 (MQ=255)
gACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCa > 1:3655987/1‑151 (MQ=255)
cgcgAGGTTAATGACCATGGCAGGGGGGATGATACGTCGGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAg < 2:3291853/151‑1 (MQ=255)
cgcgAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAg > 1:3379391/1‑151 (MQ=255)
gcgAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAgc > 1:3183638/1‑151 (MQ=255)
gcgAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGCCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAgc > 1:2614558/1‑151 (MQ=255)
gcgAGGTTAATAACCAGGCACGGCGCGATGATACGTCAGCAGCACCCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAgc < 1:5022288/151‑1 (MQ=255)
aGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTAGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCt > 2:3098400/1‑151 (MQ=255)
ggTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCtt < 2:2478749/151‑1 (MQ=255)
gTTAATAGCCATGCAAGAGGGGATGAGACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGGGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTg < 2:1730247/151‑1 (MQ=255)
gTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTg > 2:2764151/1‑151 (MQ=255)
gTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTg > 1:2904654/1‑151 (MQ=255)
ttAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCAAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGc > 1:4598038/1‑151 (MQ=255)
taaCCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCtgtg < 1:2219613/151‑1 (MQ=255)
taaCCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCtgtg > 1:369207/1‑151 (MQ=255)
aCCATGCAAGGCGCGATGATACGGCAGCAGCAACCCGTGACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGc < 2:2287223/151‑1 (MQ=255)
aCCAGGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGc < 2:2622656/151‑1 (MQ=255)
tGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGgt < 1:3206658/151‑1 (MQ=255)
tGCAAGGCGCGATGATACGTCAGAAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCggg > 2:205592/1‑150 (MQ=255)
cAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCCAGCCTGGGCGGCCGCACGCGCCTGCTCTGGCCGctgt > 2:5152150/1‑151 (MQ=255)
cAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGgtgt > 2:2906568/1‑151 (MQ=255)
cAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGgtgt < 1:5044567/151‑1 (MQ=255)
ggCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGc > 1:3161835/1‑151 (MQ=255)
ggCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGc > 1:4772775/1‑151 (MQ=255)
gcgcGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGCt < 1:442221/151‑1 (MQ=255)
cgcgATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTGCCGGCCGTCGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGCtg < 1:1708561/151‑1 (MQ=255)
gcgATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGCGTTGCtgg > 2:2560456/1‑151 (MQ=255)
cgATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGCtggt > 2:1124617/1‑151 (MQ=255)
gatgatACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGCtggtg > 2:2327311/1‑151 (MQ=255)
gatgatACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGCtggtg > 2:3808538/1‑151 (MQ=255)
gatgatACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGCtggtg > 2:2425298/1‑151 (MQ=255)
gatgatACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGCCCGGTGTTGCtgggg > 2:875522/1‑149 (MQ=255)
atgatACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGCtggtgg > 1:3950310/1‑151 (MQ=255)
atACGGCAGCAGCAACCCGTTTCCGGCCGCAGCGAGCCGGTGCCTCGTCGTGTCAGCCGGCTGGTGGGCGACGAGCCCGTCTCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGCTGGTggcgg < 2:4006519/151‑1 (MQ=255)
tACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGCTGGTggcggc > 2:3751535/1‑151 (MQ=255)
aggTCAGCGGCAACCCGTTCCCGGCCGTAGCACGCCGGGGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCCGGGGGCTGACGGGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGCTGGTGGcggcc < 2:4984930/149‑1 (MQ=255)
aCGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGCTGGTGGcggcc > 1:3868872/1‑151 (MQ=255)
tCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGCTGGTGGcggccggc > 1:2316104/1‑151 (MQ=255)
agcagcAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGCTGGTGGCGGCCGGCtt > 1:560778/1‑151 (MQ=255)
agcaACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGCTGGTGGCGGCCGGCTGTgg > 2:4478734/1‑151 (MQ=255)
aaCCCGTTACGGGCCGAAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGGCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGCTGGTGGCGGCCGGCTTTGGTGc < 1:2532893/151‑1 (MQ=255)
aaCCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGCTGGTGGcggcc > 2:1978959/1‑140 (MQ=255)
aaCCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGCTGGTGGcggcc < 1:1978959/140‑1 (MQ=255)
aCCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGCTGGTGGCGGCCGGCTTTGGTGcc > 2:128998/1‑151 (MQ=255)
aCCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGTCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGCTGGTGGCGGCCGGCTTTGGTGcc < 2:69173/151‑1 (MQ=255)
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CGGCCCGCGCGGCTGGCCTGGACTTCCAGCAACTGGTGCTGGCAATCCTGGCCGAAAGCGTGGCGACGCGAGGTTAATAACCATGCAAGGCGCGATGATACGTCAGCAGCAACCCGTTACCGGCCGTAGCAAGCCGGTGCCGCGTGGTGCCAGCCGGCTGGTGGCCGACGAGCCCGTATCGGCGCGCCTGCCCCGGCCAAGCCTGGGCGGCCTCAAGCGCTTGCTGTGGCCGGTGTTGCTGGTGGCGGCCGGCTTTGGTGCCTACGAGGGCGCCATTCGCCTGATGCCGTACGCCGACCG > CP009974/3230052‑3230351
|
| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |