Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
10478538 |
96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
3,514,540 |
(G)6→7 |
coding (316/2754 nt) |
RPPX_15700 ← |
chemotaxis protein CheY |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 3,514,534 | 1 | . | G | 96.8%
| 885.3
/ 19.4
| 253 | coding (322/2754 nt) | RPPX_15700 | chemotaxis protein CheY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (6/2); new base G (122/123); total (128/125) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.81e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 275 total aligned reads displayed.
CAGCTCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CT‑‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGC > CP009974/3514385‑3514678
|
cAGCTCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CT‑‑g > 2:604027/1‑151 (MQ=255)
aGCTCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CT‑‑g‑g < 1:3127086/151‑1 (MQ=255)
cgcGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CT‑‑g‑ggg < 1:1931571/149‑1 (MQ=255)
cTCGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CT‑‑g‑ggg > 1:1643621/1‑151 (MQ=255)
gATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CT‑‑g‑gggggg > 2:2352055/1‑150 (MQ=255)
aTCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGAGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CT‑‑g‑ggggggc < 2:2404191/151‑3 (MQ=255)
tctcTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CT‑‑g‑ggggggca > 2:269744/1‑148 (MQ=255)
tctcTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CT‑‑g‑ggggggca < 1:3414580/151‑4 (MQ=255)
tctcTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CT‑‑G‑GGGGGCAg < 1:1218637/151‑1 (MQ=255)
ctctACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CT‑‑g‑ggggggcag > 1:390309/1‑147 (MQ=255)
tctACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CT‑‑g‑ggggggcagg < 2:3683927/151‑6 (MQ=255)
gtACCCGGCGCAGCAGGGGCTCGGCGGCGGCGGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGt < 2:5207121/150‑1 (MQ=255)
ctACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGt > 2:4887184/1‑151 (MQ=255)
tACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGGCGTTGCCACTGCGCTGCAGGGGCTGGGTGCCGGGCCCGCCC‑CT‑‑g‑ggggggccggtt > 2:4167394/1‑144 (MQ=255)
cccagcccagCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGa < 2:1448616/151‑1 (MQ=255)
cccagcccagCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGa < 2:2165956/151‑1 (MQ=255)
cccagcccagCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGa < 1:4400452/151‑1 (MQ=255)
cagcccagcAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGc < 2:1540046/151‑1 (MQ=255)
ggcgaggagGCGCGCGGCTTGGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCGGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCAt < 1:1320867/144‑1 (MQ=255)
gcccagcAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCag < 2:2862827/151‑2 (MQ=255)
agcagGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCtt > 1:5154297/1‑151 (MQ=255)
gcagGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGCTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTg > 2:4492436/1‑151 (MQ=255)
agGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCCG‑‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTggg > 2:1945415/1‑151 (MQ=255)
ggCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGc < 1:4243083/151‑1 (MQ=255)
gcgcTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGcc < 2:1327466/151‑1 (MQ=255)
cgcTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCg < 1:889666/151‑1 (MQ=255)
gcTCCGCTTCGGCTGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCgg < 2:1997549/151‑1 (MQ=255)
cTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGc > 2:3967234/1‑151 (MQ=255)
cTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGc < 2:1274692/151‑1 (MQ=255)
ggCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTg > 1:3063995/1‑151 (MQ=255)
ggCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTACCGGGTGGCGTCGTTGCCACTTCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGCTACCGCCG‑CT‑‑GAGGGGGCAGGCTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTg > 2:1371046/1‑151 (MQ=255)
gCTTCGGCCGGCACGGCGGCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGGGCATGCTTGGGCCGGCGTgg < 2:550133/151‑1 (MQ=255)
gCTGCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTgg < 2:4046594/151‑1 (MQ=255)
gcggccggcACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGcc < 1:1129296/150‑1 (MQ=255)
ccggcACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGgc < 1:2998933/151‑1 (MQ=255)
cggcACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGgcg > 1:4049557/1‑151 (MQ=255)
cggcACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGgcg > 2:4552045/1‑151 (MQ=255)
aCGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTg > 2:2184142/1‑151 (MQ=255)
cGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGc < 1:3364464/151‑1 (MQ=255)
gTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCTTGCGGTc > 1:2613745/1‑151 (MQ=255)
gTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTGGG‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCgg > 1:539116/1‑151 (MQ=255)
gTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCggg > 1:4456036/1‑151 (MQ=255)
ggCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAg > 2:87409/1‑133 (MQ=255)
cAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAg < 1:3538718/151‑1 (MQ=255)
aGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGa > 2:2740323/1‑151 (MQ=255)
aGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCCTGGCCAGa > 2:3226204/1‑151 (MQ=255)
ggTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGaa > 2:2277943/1‑151 (MQ=255)
gTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGaaa < 1:4918058/151‑1 (MQ=255)
tCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAAc < 1:4534582/151‑1 (MQ=255)
cgcgGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACg > 2:508362/1‑151 (MQ=255)
cgGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGcc < 2:3703803/151‑1 (MQ=255)
cgGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGcc < 2:1082991/151‑1 (MQ=255)
cgGTGGTGGCCGAACACGGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGcc < 2:3449778/151‑1 (MQ=255)
gtggtgGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGCACTGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGCTGAGCCTGCTTGCTCCGGCGTGTGTCAGACCTGTGCGGTCCGGTGCCAGATATGCCAc > 2:2491085/1‑151 (MQ=255)
tggtggCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACt < 1:817388/151‑1 (MQ=255)
tggtggCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACt > 1:1612283/1‑151 (MQ=255)
ggtggCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTg < 2:1155551/151‑1 (MQ=255)
ggtggCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTg > 1:2400285/1‑151 (MQ=255)
ggtggCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTg > 1:4061074/1‑151 (MQ=255)
gtggCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCGCTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTgc < 2:2091246/151‑1 (MQ=255)
gtggCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTgc < 1:5105268/151‑1 (MQ=255)
gtggCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTgc > 1:108600/1‑151 (MQ=255)
tggCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTgcg < 1:4340398/151‑1 (MQ=255)
tGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGc < 1:2867056/151‑1 (MQ=255)
ggCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGcc < 2:1735692/151‑1 (MQ=255)
gcagcaGGTAGCGGGGGGCGTCGTCGCCCCTGGGCTCCAGGAGTGGGGTGCCGGCACCGCCGCCG‑‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCt < 2:4778155/151‑1 (MQ=255)
cATGAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTGGGGTGCCGGTACGGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTg < 2:3032518/151‑1 (MQ=255)
aGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGCCCGGGGCCACACGCGCCACTGCGCGCACCTCGGCCTGcccc > 2:2246444/1‑151 (MQ=255)
ggTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCa < 1:1764979/151‑1 (MQ=255)
gCGGCTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGAGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGt < 1:4199142/151‑1 (MQ=255)
cGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGtt > 1:2807848/1‑151 (MQ=255)
ggTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTtg < 2:4228789/151‑1 (MQ=255)
gTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGTCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTtgt > 1:442349/1‑151 (MQ=255)
gTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTtgt < 2:1243717/151‑1 (MQ=255)
gTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTtgt > 1:452089/1‑151 (MQ=255)
gCGTCGTTGCCGCTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCg < 2:3834937/151‑1 (MQ=255)
gtcgtTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGc > 1:2119291/1‑151 (MQ=255)
tcgtTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCa > 1:947308/1‑151 (MQ=255)
gtTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCG‑CTG‑G‑GGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTGTGTGCGGCAAt > 1:3859203/1‑151 (MQ=255)
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tgGGGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTG < SRR10918231.1712582/149‑1 (MQ=60)
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tgGGGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTG > SRR10918231.2910520/3‑151 (MQ=60)
GGGGGGCAGTTTGAGCATGCTGGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGAAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCG < SRR10918231.2376581/151‑1 (MQ=60)
GGGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCG < SRR10918231.3669347/151‑1 (MQ=60)
GGGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCG < SRR10918231.1697569/151‑1 (MQ=60)
GGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGC > SRR10918231.2462767/1‑151 (MQ=60)
GGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCA < SRR10918231.606259/151‑1 (MQ=60)
GCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAG < SRR10918231.1693232/151‑1 (MQ=60)
GCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAG < SRR10918231.2774705/151‑1 (MQ=60)
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CGATCTCTACCCAGCCCAGCAGGCGCTCGGCTTCGGCCGGCACGGCGTCGGTGGCCAGGTCGCGGTGGTGGCCGAACACTGGCATCAGGTAGCGGGTGGCGTCGTTGCCACTGCGCTGCAGGAGTTGGGTGCCGGTACCGCCGCT‑‑GGGGGGCAGGTTGAGCATGCTTGGGCCGGCGTGGGCCAGGCGCGTGCGGTCCGGGGCCAGAAACGCCACTGCGCGCACATCGGCCTGCTCCAGGGTTTGTGCGGCAATTCTCTCCAGTTGCGCAGGCGCGAGCCGGGCCATGGCGGGTGCGGCCAG > CP009974/3514390‑3514690
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |