Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F1 I1 R1
|
404 |
265.1 |
10478538 |
96.8% |
10143224 |
150.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009974 |
3,971,951 |
G→T |
S9S (TCC→TCA) |
RPPX_17675 ← |
hemolysin D |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009974 | 3,971,951 | 0 | G | T | 98.5%
| 896.2
/ NA
| 262 | S9S (TCC→TCA) | RPPX_17675 | hemolysin D |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (125/132); minor base C (4/0); total (130/132) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.83e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
GTAGGCATCGTCGGTGGTTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGGGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCGATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGA > CP009974/3971801‑3972098
|
gTAGGCATCGTCGGTGGTTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCgggg > 1:412201/1‑151 (MQ=255)
tAGGCATCGTCGGTGGTTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCggggg > 2:3198351/1‑151 (MQ=255)
ggCATCGTCGGTGGTGTCCAGGTAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTCCAGTTTCGGCGGGTGAg < 2:494405/151‑1 (MQ=255)
cgtcgGTGGTTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGttt > 2:71600/1‑151 (MQ=255)
cgtcgGTGGTTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGttt < 1:3990835/151‑1 (MQ=255)
tcgGTGGTTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGt > 2:5079911/1‑151 (MQ=255)
ggtggtTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCt < 1:1478871/151‑1 (MQ=255)
tggtTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTAc < 2:5138471/151‑1 (MQ=255)
tggtTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTCTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTAc > 2:2063603/1‑151 (MQ=255)
tttCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGc < 1:2389184/151‑1 (MQ=255)
tggtAGAGGGCGTTGCTGAACCAGTAGCGGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACAt < 2:4762526/148‑1 (MQ=255)
aGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACAt > 1:1035564/1‑151 (MQ=255)
aGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACAt > 1:3805416/1‑151 (MQ=255)
gATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACAtt < 1:1661513/151‑1 (MQ=255)
gATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACAtt < 1:5025541/151‑1 (MQ=255)
aTAGCGGGCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTc < 2:2339939/151‑1 (MQ=255)
tAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCa < 1:2582929/151‑1 (MQ=255)
aGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCAt > 1:1730666/1‑151 (MQ=255)
aGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCAt < 1:1169950/151‑1 (MQ=255)
aGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGAGGATTGCCAGGCGGCGCCGGGTTTTGGCGCGCGGCCGCTGTTCAGGTTCGGCGGGTGACGGTTTGTCTACGGCAACATTcct > 2:2938211/1‑149 (MQ=255)
ggCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCAtggt < 1:2242827/151‑1 (MQ=255)
gCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACCTTCAtggtt > 1:2458742/1‑151 (MQ=255)
cGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCAtggttgg < 1:5000287/151‑1 (MQ=255)
cGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCAtggttgg > 2:3709749/1‑151 (MQ=255)
cTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTcc < 1:12162/151‑1 (MQ=255)
tGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCa < 2:3613340/151‑1 (MQ=255)
gAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAt < 2:4201623/151‑1 (MQ=255)
gAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCAt > 2:583450/1‑151 (MQ=255)
cccAGGAGCGGGTGAAGGCCGGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATtc < 2:741940/150‑1 (MQ=255)
cAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATtctc < 2:4272768/151‑1 (MQ=255)
cAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATtctc > 1:470122/1‑151 (MQ=255)
cAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATtctc < 2:2169888/151‑1 (MQ=255)
ggTAGCTGGTGGAGGCCAGCGGGGTGAGTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCg < 2:4651463/150‑1 (MQ=255)
gTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCCGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCGCGGCCGCTGTTGCGTTTCGGCGGGCGCGGGTTTGTCTACGGCAACATGCATGGGTGGTTTCCATTCTCgc > 2:4703453/1‑150 (MQ=255)
gTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGa < 1:1421321/151‑1 (MQ=255)
cTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGGATTg > 1:858082/1‑151 (MQ=255)
gTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGc < 2:2744415/151‑1 (MQ=255)
gTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGc > 1:1103247/1‑151 (MQ=255)
tGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGCGAGGGTTTGTCTACGGCAACCTTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGcc > 2:4832800/1‑151 (MQ=255)
gAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCct < 2:2461665/151‑1 (MQ=255)
aaGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCctg > 2:3809041/1‑151 (MQ=255)
aGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCctgc < 1:2434556/151‑1 (MQ=255)
aGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCctgc > 2:3742072/1‑151 (MQ=255)
ggCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCctgct > 1:3448843/1‑151 (MQ=255)
gCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCctgctg > 1:2923293/1‑151 (MQ=255)
cagcagGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTgctggc > 2:4342500/1‑151 (MQ=255)
agcagGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTgctggct < 1:4356813/151‑1 (MQ=255)
agGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTc < 1:64017/151‑1 (MQ=255)
agGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTc < 2:893072/151‑1 (MQ=255)
agGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTc > 1:3146121/1‑151 (MQ=255)
gggTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCg < 1:361112/151‑1 (MQ=255)
gggTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGCTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCg > 1:4164123/1‑151 (MQ=255)
tGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGtt < 1:592690/151‑1 (MQ=255)
acggCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAGTTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTtgt < 2:2419806/148‑1 (MQ=255)
cGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGa < 1:5125648/151‑1 (MQ=255)
cGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGa > 2:138496/1‑151 (MQ=255)
gCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGc < 1:197978/151‑1 (MQ=255)
gCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGc > 1:2723373/1‑151 (MQ=255)
ccAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGTCGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCCTTCTCGACTTGGGCCTGCTGGCTGTCGTCTGTGGGAGcc > 2:2393239/1‑151 (MQ=255)
cAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCa < 2:792559/151‑1 (MQ=255)
aGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCAc > 2:3417617/1‑151 (MQ=255)
ggCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGCGGGGTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACt > 1:3153008/1‑151 (MQ=255)
cTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGt > 1:4533397/1‑151 (MQ=255)
tGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTc > 1:4561789/1‑151 (MQ=255)
gCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCt > 1:4848521/1‑151 (MQ=255)
ccGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCtt < 1:284692/151‑1 (MQ=255)
ccGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCtt > 2:1139008/1‑151 (MQ=255)
cTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGcc > 2:509712/1‑150 (MQ=255)
tGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACTGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTc > 1:1087055/1‑151 (MQ=255)
tGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTc > 2:4730981/1‑151 (MQ=255)
atgatTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCGAttt < 1:393978/151‑1 (MQ=255)
tgatTGCCGGGCGGCGACGGGTTTTCGCGCTCGGCCTCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCGATTTc < 2:3088048/151‑1 (MQ=255)
tGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCGATTTCTaaa > 2:4305179/1‑151 (MQ=255)
tGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCGATTTCTaaa > 1:2886357/1‑151 (MQ=255)
gggcggcGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCGATTTCTAAAAGCt < 2:3480571/150‑1 (MQ=255)
ggcgACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCGATTTCTAAAAGCTGgcg < 1:446048/151‑1 (MQ=255)
gcgACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCGATTTCTAAAAGCTGgcgc < 1:2036963/151‑1 (MQ=255)
gggTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGAGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCGGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCGATTTCTAAAAGCTGGCGCGATcc > 1:2746093/1‑151 (MQ=255)
ttttAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCGATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCgtg > 1:1279821/1‑151 (MQ=255)
ttttAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCGATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCgtg > 2:4519455/1‑151 (MQ=255)
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CGGCGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCGATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGG > SRR10918231.2369885/1‑151 (MQ=60)
GCGGGTGAGGGTTTGTCCACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCGATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGC < SRR10918231.1510852/151‑1 (MQ=60)
CGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCGATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCG < SRR10918231.4388613/151‑1 (MQ=60)
CGGGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCGATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCG > SRR10918231.1287984/1‑151 (MQ=60)
GGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCGATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAA < SRR10918231.5226758/151‑1 (MQ=60)
GGTGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCGATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAA < SRR10918231.4314097/151‑1 (MQ=60)
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GTAGGCATCGTCGGTGGTTTCCAGATAGCGGCCGGTGCTGAACCAGTAGCTGGTGAAGGCCAGCAGGGTGATTGCGGCCAGGCTGCCGCTGGCGATGATTGCCAGGCGGCGACGGGTTTTAGCGCTCGGCCGCTGTTCAGTTTCGGCGGGGGAGGGTTTGTCTACGGCAACATTCATGGTTGGTTTCCATTCTCGAATTGGGCCTGCTGGCTGTCGGTTGTGGGAGCCACTGTCTTGCTCGATTTCTAAAAGCTGGCGCGATCCGTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAACACGGGCGAA > CP009974/3971801‑3972099
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |