Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F224 I0 R1
|
1457 |
284.0 |
9290224 |
95.7% |
8890744 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
800,488 |
G→T |
94.6% |
V510V (GTG→GTT) |
ybhJ → |
putative hydratase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 800,488 | 0 | G | T | 94.6%
| 747.2
/ 32.9
| 240 | V510V (GTG→GTT) | ybhJ | putative hydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (5/8); new base T (104/123); total (109/131) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.76e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.53e-01 |
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
GCGTTGATGGACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTGAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGACCACCACCGACGAACTGATTCCTTCCGGTG > CP009273/800342‑800636
|
gCGTTGATGGACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTaaa < 1:270611/150‑1 (MQ=255)
gTTGATGGACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAgg > 2:1619592/1‑150 (MQ=255)
gTTGATGGACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAgg > 1:857076/1‑150 (MQ=255)
ttGATGGACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAggg < 1:3894439/150‑1 (MQ=255)
tGATGGACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAgggg < 2:1662016/150‑1 (MQ=255)
tCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCa < 2:1456223/150‑1 (MQ=255)
cGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCaa < 2:2224852/150‑1 (MQ=255)
cGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCaa < 2:2689337/150‑1 (MQ=255)
tCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCg < 2:545349/150‑1 (MQ=255)
tCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCg > 1:3082493/1‑150 (MQ=255)
gCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCTGGGCTTTGTGAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGAtt < 2:4583733/150‑1 (MQ=255)
cTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGAttt < 1:1360255/150‑1 (MQ=255)
cTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTGAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGAttt > 1:1520096/1‑150 (MQ=255)
tGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTa > 1:3321226/1‑150 (MQ=255)
gCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTAc < 1:3823418/150‑1 (MQ=255)
gCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTAc < 1:415000/150‑1 (MQ=255)
gACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACgg > 2:2242479/1‑150 (MQ=255)
cGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGa < 2:874311/150‑1 (MQ=255)
ggCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGaa > 1:2167536/1‑150 (MQ=255)
ggCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGaa < 1:4584960/150‑1 (MQ=255)
gCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAAc < 1:13394/150‑1 (MQ=255)
aaaCGGTGGCTATTTAACCTCTGCGAGAGTACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAAAAGTTTTTATCATGGCTTTGTTAAAGGGTCAACTCAGCAACCGCTGATTTTCGGGCCGAACAt < 1:3926719/150‑1 (MQ=255)
aaCGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACAtt < 2:1475890/150‑1 (MQ=255)
ggTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTaaa < 2:118726/150‑1 (MQ=255)
ggTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTaaa < 2:3481624/150‑1 (MQ=255)
gTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAg > 1:412690/1‑150 (MQ=255)
tGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGa < 1:1022795/150‑1 (MQ=255)
tATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTgg > 1:4448392/1‑150 (MQ=255)
tATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTgg > 2:2335162/1‑150 (MQ=255)
tttAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTTTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGcc < 1:3181748/150‑1 (MQ=255)
aaCCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGa > 2:1281170/1‑150 (MQ=255)
aaCCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGa < 1:2508934/150‑1 (MQ=255)
ccTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAAt < 2:4434824/150‑1 (MQ=255)
ctctGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAAtt > 1:942987/1‑150 (MQ=255)
tGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTggg > 2:4032101/1‑150 (MQ=255)
tGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTggg < 2:2809327/150‑1 (MQ=255)
ccAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTg < 2:844510/150‑1 (MQ=255)
ccAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTg < 2:2115813/150‑1 (MQ=255)
catcGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTgc > 2:1945927/4‑150 (MQ=255)
cGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGct < 2:554688/150‑1 (MQ=255)
gAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCCACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGctg < 2:3022517/150‑1 (MQ=255)
gAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTGAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGctg > 2:74416/1‑150 (MQ=255)
aCTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGctgac > 2:2816219/1‑150 (MQ=255)
aCTTGATTGCTCGGACAACGTGCCGGAGTACGCCATCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGCGCAACTCAGCAACCGCTGATATACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGACTTGGGTGCGctgac > 2:3257606/1‑150 (MQ=255)
cTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGctgact < 1:2387923/150‑1 (MQ=255)
cTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGctgact < 2:2921398/150‑1 (MQ=255)
ttGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATTTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGctgactg > 2:2130069/1‑150 (MQ=255)
ttGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGctgactg < 2:3468865/150‑1 (MQ=255)
tGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGTGCAACTCAGCAACCGCTGATTGACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGctgactga > 1:1857087/1‑150 (MQ=255)
tGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGctgactga > 1:2187534/1‑150 (MQ=255)
gATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCtgactgac < 1:3397544/150‑1 (MQ=255)
gATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCtgactgac > 1:1974138/1‑150 (MQ=255)
gATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCtgactgac > 1:3731060/1‑150 (MQ=255)
tGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATc < 2:4306462/150‑1 (MQ=255)
tGGGACAACGTGCAGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGTGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATc < 1:3351101/150‑1 (MQ=255)
gggACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCg > 1:258387/1‑150 (MQ=255)
gggACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCg < 2:4089099/150‑1 (MQ=255)
gggACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCg > 2:3264239/1‑150 (MQ=255)
ggACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGt < 1:3033136/150‑1 (MQ=255)
ggACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGt > 1:4398576/1‑150 (MQ=255)
cGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAgtgt > 1:1337955/1‑150 (MQ=255)
cGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAgtgt > 1:2006065/1‑150 (MQ=255)
cGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAgtgt < 1:2365397/150‑1 (MQ=255)
gTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTc < 1:4259696/150‑1 (MQ=255)
aCGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGa > 2:1369838/1‑150 (MQ=255)
cGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGaa > 2:2620991/1‑150 (MQ=255)
ccTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGa > 1:3448776/1‑150 (MQ=255)
ccTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGa > 1:2941199/1‑150 (MQ=255)
cGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAGCTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCt < 1:2743096/150‑1 (MQ=255)
cGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCt > 1:4040905/1‑150 (MQ=255)
cGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCt > 2:2737736/1‑150 (MQ=255)
gATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTGAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTc < 2:3819770/150‑1 (MQ=255)
aTGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTcg < 1:2669199/150‑1 (MQ=255)
gTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTcgac < 1:3103348/150‑1 (MQ=255)
tAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCATGGCTTTGTTAAAGGGGAAACTCAGCAACCGCTGATTTACTGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTcgacg < 1:3947336/150‑1 (MQ=255)
tAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTcgacg > 1:2002116/1‑150 (MQ=255)
aCGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTCAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGAGTTACGGGACGAACATAAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGAATGACAATATCTTCATGAAAGTGAGCTCGAAGATCATCTACGaa > 1:4341881/1‑150 (MQ=255)
gCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGt > 2:4249044/1‑150 (MQ=255)
ccGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTg < 1:2242479/150‑1 (MQ=255)
cGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGa < 1:559508/150‑1 (MQ=255)
cGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGa > 1:2189306/1‑150 (MQ=255)
cGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGa > 1:4134596/1‑150 (MQ=255)
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aaaaCCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGaccacca < 2:1141810/150‑1 (MQ=255)
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GTGGCGTTGATGGACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTGAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGACCACCACCGACGAACTGATTCCTTCCGGTGA > CP009273/800339‑800637
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
