Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
800,488 |
G→T |
100% |
V510V (GTG→GTT) |
ybhJ → |
putative hydratase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 800,488 | 0 | G | T | 100.0%
| 604.7
/ NA
| 185 | V510V (GTG→GTT) | ybhJ | putative hydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (98/87); total (98/87) |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
CGTTGATGGACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTGAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGACCACCACCGACGAACTGATTCCTTCC > CP009273/800343‑800632
|
ttGATGGACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAg < 1:1288038/148‑1 (MQ=255)
aTGGACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAgggg > 2:936194/1‑148 (MQ=255)
ggACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCa > 2:1137432/1‑148 (MQ=255)
gACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCaa < 2:3405963/148‑1 (MQ=255)
gACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCaa < 2:2635267/148‑1 (MQ=255)
cGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAATGGGGCAACt > 2:641865/1‑148 (MQ=255)
gCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTc > 1:2273853/1‑148 (MQ=255)
tCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAg > 2:674551/1‑148 (MQ=255)
tCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAg > 2:135665/1‑148 (MQ=255)
aTCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGc > 1:3327041/1‑148 (MQ=255)
tCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCt < 1:1052478/148‑1 (MQ=255)
cGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTg < 1:1820010/148‑1 (MQ=255)
cGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTg < 1:2754311/148‑1 (MQ=255)
gCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGAttt < 1:1303094/148‑1 (MQ=255)
cGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCCGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTa > 1:467930/1‑148 (MQ=255)
tGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACggg < 2:2112764/148‑1 (MQ=255)
gCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGc < 1:1563705/148‑1 (MQ=255)
gCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGc < 1:3420641/148‑1 (MQ=255)
gCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGa > 2:334763/1‑148 (MQ=255)
aaCGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACa < 2:3206713/148‑1 (MQ=255)
aaCGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACa < 2:1831279/148‑1 (MQ=255)
aCGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACAt > 1:1036551/1‑148 (MQ=255)
cGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACAtt > 1:842596/1‑148 (MQ=255)
gTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTaa > 2:200185/1‑148 (MQ=255)
gTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTaa < 1:1218148/148‑1 (MQ=255)
tGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTaaa > 2:1162344/1‑148 (MQ=255)
tGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTaaa < 2:1024036/148‑1 (MQ=255)
gCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGa > 2:2662417/1‑148 (MQ=255)
gCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGa > 2:679630/1‑148 (MQ=255)
tATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACt > 1:2320114/1‑148 (MQ=255)
tATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACt > 1:3300853/1‑148 (MQ=255)
aCCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCgg > 1:2196483/1‑148 (MQ=255)
ccTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGa > 1:2019039/1‑148 (MQ=255)
tctGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAAt > 1:1577663/1‑148 (MQ=255)
tctGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAAt > 1:531527/1‑148 (MQ=255)
tctGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAAt < 1:2371944/148‑1 (MQ=255)
tGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTg > 1:1189538/1‑148 (MQ=255)
tGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTg > 1:1912257/1‑148 (MQ=255)
gCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTgg < 2:2959131/148‑1 (MQ=255)
ccAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTggg < 2:3131999/148‑1 (MQ=255)
ccAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTggg < 1:495403/148‑1 (MQ=255)
ccAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTggg > 2:2244594/1‑148 (MQ=255)
cGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTgcg < 2:3461330/148‑1 (MQ=255)
aaCTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGct > 2:3444900/1‑148 (MQ=255)
aCTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTgcg < 2:2345156/145‑1 (MQ=255)
aCTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTgcg > 1:2345156/1‑145 (MQ=255)
cTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCATTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGctga < 1:984204/148‑1 (MQ=255)
ttGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGctgac < 1:2907499/148‑1 (MQ=255)
ttGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGctgac < 1:1157230/148‑1 (MQ=255)
ttGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGctgac < 2:2851912/148‑1 (MQ=255)
tGCTGGGACACCGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACa < 2:3414920/148‑1 (MQ=255)
tGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACa < 2:1677381/148‑1 (MQ=255)
cTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAat < 1:639935/148‑1 (MQ=255)
cTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAat < 2:780716/148‑1 (MQ=255)
cTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAat < 1:936194/148‑1 (MQ=255)
cTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAat < 2:2540194/148‑1 (MQ=255)
gACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCg < 2:2915685/148‑1 (MQ=255)
gACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCg < 2:1166363/148‑1 (MQ=255)
cAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTc < 2:1564041/148‑1 (MQ=255)
aCGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCt > 1:1299791/1‑148 (MQ=255)
cGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTg > 1:2772015/1‑148 (MQ=255)
aGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGtgtg < 1:693616/148‑1 (MQ=255)
aGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGtgtg < 1:1795841/148‑1 (MQ=255)
gTACGCCTTCGATGTAACGCAGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGATTTGTTAAAGGGGCAACTGAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGc < 1:135665/148‑1 (MQ=255)
tACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCt > 1:2303353/1‑148 (MQ=255)
tACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCt > 1:2303571/1‑148 (MQ=255)
cGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATc < 1:2249405/148‑1 (MQ=255)
cGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATc < 1:892789/148‑1 (MQ=255)
gATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATcc < 1:2433538/148‑1 (MQ=255)
tGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTc > 2:3387736/1‑148 (MQ=255)
gTAACGCCGTATAAAAACCTTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGAAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTATAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTcg < 2:1523907/148‑1 (MQ=255)
gTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGa > 2:2075893/1‑139 (MQ=255)
gTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGa > 2:1692500/1‑139 (MQ=255)
gTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGa < 1:1692500/139‑1 (MQ=255)
aaCGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTcgac > 1:785471/1‑148 (MQ=255)
aaCGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTcgac > 1:1989437/1‑148 (MQ=255)
cGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTcgacga > 2:2593808/1‑148 (MQ=255)
cGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTcgacga > 2:2594653/1‑148 (MQ=255)
gCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTACAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGaa < 2:3486786/148‑1 (MQ=255)
gCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGaa > 2:689429/1‑148 (MQ=255)
cGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGt > 1:1515205/1‑148 (MQ=255)
tataAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGa > 1:2826313/1‑148 (MQ=255)
aaaCCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGaccacc > 1:2222358/1‑148 (MQ=255)
aaaCCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGaccacc > 1:2256815/1‑148 (MQ=255)
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aaCCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGaccacca > 2:786176/1‑148 (MQ=255)
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TAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGACCACCACCGACGAACTGATTCCTTCCGGTGA > SRR19973065.288575/1‑150 (MQ=60)
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GTGGCGTTGATGGACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTGAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGACCACCACCGACGAACTGATTCCTTCCGGTGA > CP009273/800339‑800637
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |