Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
800,488 |
G→T |
100% |
V510V (GTG→GTT) |
ybhJ → |
putative hydratase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 800,488 | 0 | G | T | 100.0%
| 506.7
/ NA
| 152 | V510V (GTG→GTT) | ybhJ | putative hydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (80/72); total (80/72) |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
CGTTGATGGACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTGAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGACCACCACCGACGAACTGATTCCTT > CP009273/800343‑800630
|
cGTTGATGGACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTaa < 2:1945970/148‑1 (MQ=255)
ttGATGGACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAg > 1:2120121/1‑148 (MQ=255)
tGATGGACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAgg > 1:275530/1‑148 (MQ=255)
tGATGGACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAgg < 2:2546628/148‑1 (MQ=255)
tGATGGACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAgg < 2:1319402/148‑1 (MQ=255)
tGATGGACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAgg < 1:1174020/148‑1 (MQ=255)
tGATGGACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAgg < 1:1563238/148‑1 (MQ=255)
gACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGGGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCaa > 2:1787890/1‑148 (MQ=255)
cGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACt < 2:1880000/148‑1 (MQ=255)
cGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACt < 2:2509701/148‑1 (MQ=255)
cGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACt < 2:2509698/148‑1 (MQ=255)
cGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGc > 2:1526925/1‑148 (MQ=255)
cGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGc < 2:2169936/148‑1 (MQ=255)
tCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAAc > 2:1213059/1‑148 (MQ=255)
tCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAAc > 2:1213100/1‑148 (MQ=255)
cGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTg > 1:1511394/1‑148 (MQ=255)
cTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGAt > 2:2920191/1‑148 (MQ=255)
gCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGAttt < 1:2120256/148‑1 (MQ=255)
gCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGAttt > 1:1045384/1‑148 (MQ=255)
gCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGAttt > 1:1045364/1‑148 (MQ=255)
cTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACgg > 1:996499/1‑148 (MQ=255)
cTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACgg < 2:3177670/148‑1 (MQ=255)
cTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACgg > 1:2650834/1‑148 (MQ=255)
tGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACggg > 1:2347229/1‑148 (MQ=255)
cGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGcc < 2:1013748/148‑1 (MQ=255)
cGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGcc < 1:754793/148‑1 (MQ=255)
cGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGcc < 2:2667904/148‑1 (MQ=255)
cAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGaa < 2:1882487/148‑1 (MQ=255)
cAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGaa < 2:2590056/148‑1 (MQ=255)
aaCGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACa < 2:644728/148‑1 (MQ=255)
aaCGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACa > 2:146969/1‑148 (MQ=255)
gTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTaa > 1:89897/1‑148 (MQ=255)
gCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGa > 2:2967139/1‑148 (MQ=255)
gCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGa < 2:2942533/148‑1 (MQ=255)
gCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGa > 2:1048395/1‑148 (MQ=255)
cTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGAc > 1:2428557/1‑148 (MQ=255)
aTTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTg < 2:263573/148‑1 (MQ=255)
tttAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTgg > 2:1576568/1‑148 (MQ=255)
ttAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGc > 1:2654015/1‑148 (MQ=255)
ttAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGc < 2:2994265/148‑1 (MQ=255)
ttAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGc > 2:2283595/1‑148 (MQ=255)
ttAACCTCTGCCAGAGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCGTCGATGAAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTATGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTgtc > 2:1739676/1‑146 (MQ=255)
aCCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCgg > 2:2598549/1‑148 (MQ=255)
ccTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGa > 2:1330771/1‑148 (MQ=255)
tctGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAAt > 1:3062031/1‑148 (MQ=255)
gCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTgg < 1:2690657/148‑1 (MQ=255)
gCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTgg > 2:1253209/1‑148 (MQ=255)
cGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTgcg < 1:2047364/148‑1 (MQ=255)
aCTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGctg > 1:2554295/1‑148 (MQ=255)
aCTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGctg < 1:187807/148‑1 (MQ=255)
aCTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGctg < 2:1068137/148‑1 (MQ=255)
aCTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGctg < 1:187722/148‑1 (MQ=255)
aCTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGctg < 1:699671/148‑1 (MQ=255)
cTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGACTTGGGTGCGctga > 2:2716312/1‑148 (MQ=255)
cTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGctga > 1:3212085/1‑148 (MQ=255)
tGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACa < 2:1094582/148‑1 (MQ=255)
tGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACa > 2:1746337/1‑148 (MQ=255)
gggACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAatat < 2:3131941/148‑1 (MQ=255)
ggACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATc < 1:2015405/148‑1 (MQ=255)
ggACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATc < 1:737477/148‑1 (MQ=255)
gACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCg > 1:3247421/1‑148 (MQ=255)
aaCGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTcc < 2:2428557/148‑1 (MQ=255)
aaCGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTcc < 1:804847/148‑1 (MQ=255)
aCGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCt > 2:2585420/1‑148 (MQ=255)
cGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACAGACAATATCGTCCTg > 2:800718/1‑148 (MQ=255)
tGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGaa < 1:690348/148‑1 (MQ=255)
gCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGaaa > 1:1448820/1‑148 (MQ=255)
ccGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAg < 2:420123/148‑1 (MQ=255)
cGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCg > 1:2984853/1‑148 (MQ=255)
cGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCg > 1:2984715/1‑148 (MQ=255)
ccTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGaa > 2:1707467/1‑148 (MQ=255)
ttCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGa > 1:2916511/1‑148 (MQ=255)
tAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTcga > 2:1485397/1‑148 (MQ=255)
tAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTcga < 1:1535665/148‑1 (MQ=255)
aaCGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTcgac > 2:1248860/1‑148 (MQ=255)
aaCGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTcgac > 2:1156935/1‑148 (MQ=255)
gCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGaa < 2:2591052/148‑1 (MQ=255)
ccGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAg > 1:1015728/1‑148 (MQ=255)
ccGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAg > 1:1015741/1‑148 (MQ=255)
tataAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGa < 1:1085082/148‑1 (MQ=255)
tataAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGa < 1:1085127/148‑1 (MQ=255)
ataAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGac > 1:2410000/1‑148 (MQ=255)
ataAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGac > 2:1180679/1‑148 (MQ=255)
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ataAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGac > 1:1433326/1‑148 (MQ=255)
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CCGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGACCACCACCGA > SRR19973070.2156851/1‑150 (MQ=60)
CGTGTTTATCAGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGACCACCACCGAC > SRR19973070.2408425/1‑150 (MQ=60)
AGGGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGACCACCACCGACGAACTGATTC > SRR19973070.3127516/1‑150 (MQ=60)
GGCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGACCACCACCGACGAACTGATTCCT < SRR19973070.1287648/150‑1 (MQ=60)
GCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGACCACCACCGACGAACTGATTCCTT > SRR19973070.707611/1‑150 (MQ=60)
GCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGACCACCACCGACGAACTGATTCCTT < SRR19973070.2615522/150‑1 (MQ=60)
GCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGACCACCACCGACGAACTGATTCCTT > SRR19973070.2380864/1‑150 (MQ=60)
GCTTTGTTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGACCACCACCGACGAACTGATTCCTT < SRR19973070.2615520/150‑1 (MQ=60)
TTAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGACCACCACCGACGAACTGATTCCTTCCGGTG > SRR19973070.1098547/1‑150 (MQ=60)
TAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGACCACCACCGACGAACTGATTCCTTCCGGTGA < SRR19973070.2602314/150‑1 (MQ=60)
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TGGCGTTGATGGACGCTCGTTCTATCGCTGCGACTGCGGCAAACGGTGGCTATTTAACCTCTGCCAGCGAACTTGATTGCTGGGACAACGTGCCGGAGTACGCCTTCGATGTAACGCCGTATAAAAACCGTGTTTATCAGGGCTTTGTGAAAGGGGCAACTCAGCAACCGCTGATTTACGGGCCGAACATTAAAGACTGGCCGGAATTGGGTGCGCTGACTGACAATATCGTCCTGAAAGTGTGCTCGAAGATCCTCGACGAAGTGACCACCACCGACGAACTGATTCCTTCCGGTGA > CP009273/800340‑800637
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
