Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F224 I0 R1
|
1457 |
284.0 |
9290224 |
95.7% |
8890744 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,299,742 |
C→A |
60.4% |
A244A (GCC→GCA) |
oppD → |
oligopeptide transporter subunit |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,299,742 | 0 | C | A | 60.4%
| 98.0
/ inf
| 288 | A244A (GCC→GCA) | oppD | oligopeptide transporter subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (59/55); new base A (94/80); total (153/135) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.19e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 291 total aligned reads displayed.
CCAACAACTGCGCTGGACGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCCGCCAAACCTGCT > CP009273/1299593‑1299888
|
ccAACAACTGCGCTGGACGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGcc < 2:3158063/150‑1 (MQ=255)
caacaaCTGCGCTGGACGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCg < 2:3693495/150‑1 (MQ=255)
aacTGCGCTGGACGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGgcg < 1:2945817/150‑1 (MQ=255)
cTGCGCTGGACGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCa > 1:3762784/1‑150 (MQ=255)
gcgcTGGACGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACg > 2:613090/1‑150 (MQ=255)
tGGACGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCATGATgg > 1:2178583/1‑150 (MQ=255)
tGGACGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATgg > 1:1729930/1‑150 (MQ=255)
tGGACGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATgg > 1:1974186/1‑150 (MQ=255)
ggACGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGa > 2:4576871/1‑150 (MQ=255)
aCGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAat < 1:2807469/150‑1 (MQ=255)
aCGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAat < 1:4543291/150‑1 (MQ=255)
aCGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAat < 1:3656857/150‑1 (MQ=255)
gTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAatat > 1:769408/1‑150 (MQ=255)
gTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAatat > 1:1793898/1‑150 (MQ=255)
cACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATgg < 1:3032951/150‑1 (MQ=255)
aCCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGc < 1:4179607/150‑1 (MQ=255)
ccGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCa < 1:3883257/150‑1 (MQ=255)
aCAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAAcgc < 1:4596890/150‑1 (MQ=255)
aGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAAcgcgc > 1:4627784/1‑150 (MQ=255)
ggCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCCCGATGGAATATGGCAAcgcgcg > 2:2042826/1‑150 (MQ=255)
aGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATg > 2:743649/1‑150 (MQ=255)
aGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATg > 2:2332137/1‑150 (MQ=255)
aGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATg > 1:571293/1‑150 (MQ=255)
cATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCtt > 2:2699316/1‑150 (MQ=255)
cATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCtt > 2:1052852/1‑150 (MQ=255)
cATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCtt > 2:1839104/1‑150 (MQ=255)
cATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCtt > 2:1550486/1‑150 (MQ=255)
aTGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCttt > 1:1827706/1‑150 (MQ=255)
aTGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCttt < 2:1651958/150‑1 (MQ=255)
gACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTa < 1:1088920/150‑1 (MQ=255)
tcGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGTATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTAt < 1:1027539/149‑1 (MQ=255)
aCGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTAt > 1:2581602/1‑150 (MQ=255)
aCGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTAt < 1:441047/150‑1 (MQ=255)
cGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATc < 1:159327/150‑1 (MQ=255)
cGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATc < 2:2964907/150‑1 (MQ=255)
gCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCa > 1:1660923/1‑150 (MQ=255)
tATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCACCGCGCGCGAGGTCTTTTATCAAc > 2:3892798/1‑150 (MQ=255)
tATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAAc > 2:359260/1‑150 (MQ=255)
tATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAAc > 1:1062241/1‑150 (MQ=255)
tATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAAc > 2:4032595/1‑150 (MQ=255)
aTTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAAcc > 1:2502942/1‑150 (MQ=255)
aaaTGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGt > 1:253864/1‑150 (MQ=255)
gAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCAt < 1:933816/150‑1 (MQ=255)
tGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCtt < 2:162832/150‑1 (MQ=255)
cGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCt > 1:1754731/1‑150 (MQ=255)
gAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCACCGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATc > 2:2395150/1‑150 (MQ=255)
gAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATc < 1:2385451/150‑1 (MQ=255)
tactACCGCCTTCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGTTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGTATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCATCACGTTCTTCCTTTTTCTTTCGGttt < 2:2292115/147‑1 (MQ=255)
tAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGttt < 1:885781/150‑1 (MQ=255)
aaTACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTg > 1:4535143/1‑150 (MQ=255)
aaTACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTg < 1:3630021/150‑1 (MQ=255)
aaTACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAAAGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTg > 1:1324592/1‑150 (MQ=255)
aaTACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATATGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTg < 2:3363723/150‑1 (MQ=255)
aTACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGc > 2:1779835/1‑150 (MQ=255)
aCCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTc > 2:2812731/1‑150 (MQ=255)
aCCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTc > 1:4027027/1‑150 (MQ=255)
gCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAAc > 2:3320652/1‑150 (MQ=255)
gCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAAc > 2:1183562/1‑150 (MQ=255)
gCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAAc < 1:3412733/150‑1 (MQ=255)
atcatTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAAcgcg < 2:3979026/150‑1 (MQ=255)
atTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTg < 2:835488/150‑1 (MQ=255)
atTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTg > 1:2914884/1‑150 (MQ=255)
tttGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGcc < 1:712832/148‑1 (MQ=255)
tATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGcc > 1:3613212/1‑150 (MQ=255)
aTGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCcg > 1:34729/1‑150 (MQ=255)
gATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCACCGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCcgcg > 2:1917289/1‑150 (MQ=255)
gATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCcgcg < 2:2236927/150‑1 (MQ=255)
aTCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGt > 1:2681928/1‑150 (MQ=255)
aTCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGt < 2:2443937/150‑1 (MQ=255)
cACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGtct < 2:682563/150‑1 (MQ=255)
aCCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGACTATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGtctc > 1:4094533/1‑150 (MQ=255)
aCCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGtctc > 1:2972895/1‑150 (MQ=255)
aCCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGtctc < 2:4384000/150‑1 (MQ=255)
cccACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCg < 2:254068/150‑1 (MQ=255)
ccACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGa > 1:2294808/1‑150 (MQ=255)
ccACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGa > 2:4184789/1‑150 (MQ=255)
cACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGAt < 1:2800943/150‑1 (MQ=255)
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cACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGAt < 2:1107485/150‑1 (MQ=255)
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ACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTAT < SRR19973072.498060/150‑1 (MQ=60)
ACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTAT < SRR19973072.4515538/150‑1 (MQ=60)
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ATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACC > SRR19973072.3788254/1‑150 (MQ=60)
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TAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCG < SRR19973072.2736466/150‑1 (MQ=60)
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GATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGAC > SRR19973072.2056954/1‑150 (MQ=60)
CTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTTCGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCAT < SRR19973072.4366233/150‑1 (MQ=60)
CTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCAT > SRR19973072.4432801/1‑150 (MQ=60)
TGCGACAAAGGGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATC > SRR19973072.3598183/1‑150 (MQ=60)
GACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCG > SRR19973072.2461870/1‑150 (MQ=60)
GACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCG > SRR19973072.4142285/1‑150 (MQ=60)
GACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCG > SRR19973072.4142330/1‑150 (MQ=60)
GACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCG > SRR19973072.2629588/1‑150 (MQ=60)
GACAAAGTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCG > SRR19973072.306568/1‑150 (MQ=60)
CAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGG < SRR19973072.396022/150‑1 (MQ=60)
CAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGG < SRR19973072.389001/150‑1 (MQ=60)
GTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAAT < SRR19973072.4630296/150‑1 (MQ=60)
GTGCTGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAAT < SRR19973072.4630782/150‑1 (MQ=60)
TGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATC < SRR19973072.4075339/150‑1 (MQ=60)
GCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCC > SRR19973072.3758898/1‑150 (MQ=60)
GCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCC < SRR19973072.789963/150‑1 (MQ=60)
TGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCCGC > SRR19973072.2057964/1‑150 (MQ=60)
TGGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCCGC > SRR19973072.1405723/1‑150 (MQ=60)
GGTAATGTACGCAGGGCGCACGATGGACTATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCCGCC > SRR19973072.300372/1‑150 (MQ=60)
TAATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCCGCCAA < SRR19973072.1881491/150‑1 (MQ=60)
ATGTACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCCGCCAAAC < SRR19973072.2877982/150‑1 (MQ=60)
TACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCCGCCAAACCTG < SRR19973072.78549/150‑1 (MQ=60)
ACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCCGCCAAACCTGC > SRR19973072.2974609/1‑150 (MQ=60)
ACGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCCGCCAAACCTGC > SRR19973072.3801382/1‑150 (MQ=60)
CGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCCGCCAAACCTGCT < SRR19973072.1642423/150‑1 (MQ=60)
CGCAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCCGCCAAACCTGCT > SRR19973072.2195479/1‑150 (MQ=60)
CAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCCGCCAAACCTGCTGC < SRR19973072.3003092/150‑1 (MQ=60)
CAGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCCGCCAAACCTGCTGC < SRR19973072.3003087/150‑1 (MQ=60)
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CCAACAACTGCGCTGGACGTCACCGTACAGGCGCAGATCATGACGCTATTAAATGAACTGAAGCGGGAATTTAATACCGCCATCATTATGATCACCCACGATCTTGTCGTGGTGGCGGGGATCTGCGACAAAGTGCTGGTAATGTACGCCGGGCGCACGATGGAATATGGCAACGCGCGCGATGTCTTTTATCAACCCGTTCATCCTTATTCTATCGGTTTGCTCAACGCGGTGCCGCGTCTCGATGCGGAAGGTGAAACAATGTTGACCATCCCGGGTAATCCGCCAAACCTGCTGC > CP009273/1299593‑1299890
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |