Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F202 I0 R1
|
1397 |
275.7 |
9089454 |
95.2% |
8653160 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
176,783 |
G→T |
63.4% |
D354Y (GAT→TAT) |
dgt → |
deoxyguanosine triphosphate triphosphohydrolase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 176,783 | 0 | G | T | 63.4%
| 181.6
/ inf
| 270 | D354Y (GAT→TAT) | dgt | deoxyguanosine triphosphate triphosphohydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (56/43); new base T (83/88); total (139/131) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.10e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 276 total aligned reads displayed.
GGTTCGCTCTTTTCGCTGGTGGTTGAAAATGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAG > CP009273/176636‑176929
|
ggTTCGCTCTTTTCGCTGGTGGTTGAAAATGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTAGGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGAt < 2:4130708/150‑1 (MQ=255)
ctTTTCGCTGGTGGTTGAAAATGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATctgcc < 1:209704/150‑1 (MQ=255)
ttttCGCTGGTGGTTGAAAATGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATctgcct > 1:2424495/1‑150 (MQ=255)
ggtggtTGAAAATGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGAtttt > 1:1071640/1‑150 (MQ=255)
ggtggtTGAAAATGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGAtttt < 1:1611994/150‑1 (MQ=255)
gtggtTGAAAATGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTTCCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTc < 1:1020522/150‑1 (MQ=255)
gtggtTGAAAATGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTc < 2:4186508/150‑1 (MQ=255)
tggtTGAAAATGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCg < 2:3739326/150‑1 (MQ=255)
aaaaTGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGaa > 2:2656627/1‑150 (MQ=255)
aaTGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACg < 2:3293002/150‑1 (MQ=255)
ccTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTa < 2:4340844/150‑1 (MQ=255)
tGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAAt > 2:191987/1‑150 (MQ=255)
ggAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCa < 2:4508904/150‑1 (MQ=255)
ggAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCa < 2:2270308/150‑1 (MQ=255)
aaaTCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCa > 2:1748678/1‑150 (MQ=255)
aaaTCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCa > 1:4020625/1‑150 (MQ=255)
cACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCattat > 2:1297612/1‑150 (MQ=255)
cGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTg < 2:2419946/150‑1 (MQ=255)
gCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTgg > 1:2815402/1‑150 (MQ=255)
gCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTgg < 2:1317645/150‑1 (MQ=255)
gCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTgg > 1:2904326/1‑150 (MQ=255)
gCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTgg > 1:2904569/1‑150 (MQ=255)
atCAAATAGTTTATGCCGCAGTACGGAATATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAAAACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCTCAACGTTTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGa < 1:2579625/149‑1 (MQ=255)
aaTAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGAt > 1:3666198/1‑150 (MQ=255)
aaTAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGAt < 1:2786884/150‑1 (MQ=255)
aTAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATg > 1:340719/1‑150 (MQ=255)
aTAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATg > 2:4295825/1‑150 (MQ=255)
aTAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATg > 1:733011/1‑150 (MQ=255)
tAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGc > 1:2200264/1‑150 (MQ=255)
tttAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTCACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAg < 1:4370369/150‑1 (MQ=255)
aaGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGa > 2:765461/1‑150 (MQ=255)
aaGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGa < 1:620424/150‑1 (MQ=255)
aGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGaa > 1:3792642/1‑150 (MQ=255)
gCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAAt < 2:3343186/150‑1 (MQ=255)
gCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAAt < 2:1003177/150‑1 (MQ=255)
gCCGCAGTACGGAAGATCAGTTGTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAAt > 2:1794878/1‑150 (MQ=255)
cAGTACTGAAGATCAGTTTTTTTTGTATTTACGGGTAAACACACTAAATAAACTGGTACCCTACGGGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAg < 1:915093/150‑1 (MQ=255)
aGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGc < 1:3272836/150‑1 (MQ=255)
gTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCg > 2:396731/1‑150 (MQ=255)
gTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCg < 2:2128784/150‑1 (MQ=255)
tACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGa > 1:1512616/1‑150 (MQ=255)
tACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGa < 2:4492393/150‑1 (MQ=255)
aCGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGAt > 2:1868917/1‑150 (MQ=255)
aCGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGAt > 1:4050524/1‑150 (MQ=255)
aCGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCATAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACTACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGAt < 2:1602737/150‑1 (MQ=255)
cgcaaGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGAtc > 2:3660841/4‑150 (MQ=255)
ggAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGAtct > 2:2406915/1‑150 (MQ=255)
aaGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGAAGCGAtcttc > 2:164773/1‑150 (MQ=255)
aGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGAtcttct < 1:2292816/150‑1 (MQ=255)
gATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATcttctt < 1:133492/150‑1 (MQ=255)
aTCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTa < 1:2531135/150‑1 (MQ=255)
tCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGAGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTaa > 2:2855547/1‑150 (MQ=255)
aGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGc > 1:3276325/1‑150 (MQ=255)
gTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCt > 1:1415631/1‑150 (MQ=255)
gTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCt < 1:3570586/150‑1 (MQ=255)
tttATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCtatat > 1:3627606/1‑150 (MQ=255)
tttATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCtatat < 2:1524472/150‑1 (MQ=255)
tttATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCtatat < 2:3459645/150‑1 (MQ=255)
tATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATaa < 1:677995/150‑1 (MQ=255)
tATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAAt > 2:4270480/1‑150 (MQ=255)
tATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAAt > 2:2236061/1‑150 (MQ=255)
tttACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGt < 2:3179542/150‑1 (MQ=255)
ttACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTc < 2:4051931/150‑1 (MQ=255)
ttACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTc < 1:3728204/150‑1 (MQ=255)
ttACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGTTATATAAAAATGTc > 2:1575610/1‑150 (MQ=255)
ttACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATGTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTc > 1:3723009/1‑150 (MQ=255)
tACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCg < 2:3798306/150‑1 (MQ=255)
gggTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTg > 2:3102920/1‑150 (MQ=255)
ggTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGt > 1:1110686/1‑150 (MQ=255)
ggTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGt > 2:4080072/1‑150 (MQ=255)
gTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTa > 2:3396579/1‑150 (MQ=255)
aaaCACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGTTATATAAAAATGTCGCTGTaaa > 2:2248403/1‑150 (MQ=255)
acacCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAAc > 2:3071800/1‑150 (MQ=255)
ccTAAATAAACTGGTACCCTACGCTGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACAtgt < 2:1720335/150‑1 (MQ=255)
cTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACAtgtg < 2:1708716/150‑1 (MQ=255)
aaataaaCTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGtt > 1:2229200/1‑150 (MQ=255)
ataaaCTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTa < 2:1071640/150‑1 (MQ=255)
taaaCTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAg > 2:1251600/1‑150 (MQ=255)
aaaCTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGc > 2:663450/1‑150 (MQ=255)
cTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCAt < 1:4310967/150‑1 (MQ=255)
tGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATc < 2:3273330/150‑1 (MQ=255)
tGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATc < 2:164154/150‑1 (MQ=255)
gTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCa < 1:3561671/150‑1 (MQ=255)
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GATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTT < SRR19973076.133886/150‑1 (MQ=60)
GATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTT < SRR19973076.133723/150‑1 (MQ=60)
GATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCAGTATTGGAAGATGCCATCGAATGCAGCGATCTTCTT > SRR19973076.1073966/1‑150 (MQ=60)
ATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTA < SRR19973076.2534817/150‑1 (MQ=60)
TCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAA > SRR19973076.2515522/1‑150 (MQ=60)
AGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGC < SRR19973076.2090411/150‑1 (MQ=60)
AGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGC > SRR19973076.3281083/1‑150 (MQ=60)
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TTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATAT > SRR19973076.2896226/1‑150 (MQ=60)
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TATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAA < SRR19973076.679010/150‑1 (MQ=60)
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TATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAA > SRR19973076.2973307/1‑150 (MQ=60)
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ATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATG < SRR19973076.2832136/150‑1 (MQ=60)
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TTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTC < SRR19973076.91320/150‑1 (MQ=60)
TTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATGTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTC > SRR19973076.3728464/1‑150 (MQ=60)
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GGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGT > SRR19973076.1112329/1‑150 (MQ=60)
GGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGT > SRR19973076.4267326/1‑150 (MQ=60)
TAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAA < SRR19973076.329287/150‑1 (MQ=60)
CTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTG < SRR19973076.3203329/150‑1 (MQ=60)
AAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTT > SRR19973076.2232406/1‑150 (MQ=60)
AAATAAACTGGTACCCTACGCGGCAAAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTT > SRR19973076.4441191/1‑150 (MQ=60)
AACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCC > SRR19973076.3586633/1‑150 (MQ=60)
CTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCAT < SRR19973076.4317332/150‑1 (MQ=60)
GTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCA < SRR19973076.3566846/150‑1 (MQ=60)
GTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCA < SRR19973076.3566953/150‑1 (MQ=60)
TACCCTACGCGGCGCAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAG < SRR19973076.445346/150‑1 (MQ=60)
TACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAG < SRR19973076.445338/150‑1 (MQ=60)
TACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAG < SRR19973076.445939/150‑1 (MQ=60)
CCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATG > SRR19973076.410501/1‑150 (MQ=60)
CTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGT < SRR19973076.3500961/150‑1 (MQ=60)
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GGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCG < SRR19973076.3475777/150‑1 (MQ=60)
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ATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTATTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAG > SRR19973076.4036645/1‑150 (MQ=60)
TTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAAATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGG > SRR19973076.1127958/1‑150 (MQ=60)
TTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAAATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGG > SRR19973076.1127917/1‑150 (MQ=60)
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CTCTTTTCGCTGGTGGTTGAAAATGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGG > CP009273/176642‑176930
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
