Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F218 I0 R1
|
1506 |
278.7 |
9275112 |
94.5% |
8764980 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
176,783 |
G→T |
89.6% |
D354Y (GAT→TAT) |
dgt → |
deoxyguanosine triphosphate triphosphohydrolase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 176,783 | 0 | G | T | 89.6%
| 601.5
/ 64.2
| 219 | D354Y (GAT→TAT) | dgt | deoxyguanosine triphosphate triphosphohydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (12/11); new base T (89/107); total (101/118) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.59e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 231 total aligned reads displayed.
GGTTCGCTCTTTTCGCTGGTGGTTGAAAATGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGC > CP009273/176636‑176932
|
ggTTCGCTCTTTTCGCTGGTGGTTGAAAATGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATttatttat < 1:12388/150‑1 (MQ=255)
ggTTCGCTCTTTTCGCTGGTGGTTGAAAATGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATttatttat < 1:1681672/150‑1 (MQ=255)
tCGCTCTTTTCGCTGGTGGTTGAAAATGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAAt > 1:2726790/1‑150 (MQ=255)
cGCTCTTTTCGCTGGTGGTTGAAAATGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATc > 2:1700381/1‑150 (MQ=255)
cGCTCTTTTCGCTGGTGGTTGAAAATGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATc > 1:2071294/1‑150 (MQ=255)
ttttCGCTGGTGGTTGAAAATGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATctgcct > 1:2284201/1‑150 (MQ=255)
cGCTGGTGGTTGAAAATGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGa > 1:2043998/1‑150 (MQ=255)
tggtggTTGAAAATGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGAttt < 1:4519741/150‑1 (MQ=255)
tggtggTTGAAAATGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGAttt < 1:2359576/150‑1 (MQ=255)
gtggtTGAAAATGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTc < 2:4189612/150‑1 (MQ=255)
aaaTGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAAc > 1:3610801/1‑150 (MQ=255)
aaaTGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAAc < 2:555326/150‑1 (MQ=255)
aTGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGt > 2:3921321/1‑150 (MQ=255)
aTGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGt > 2:3235362/1‑150 (MQ=255)
aTGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGt > 2:842685/1‑150 (MQ=255)
gCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGttt < 1:218775/150‑1 (MQ=255)
gCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGttt > 2:3028552/1‑150 (MQ=255)
gCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGttt > 2:4153832/1‑150 (MQ=255)
gCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGttt < 1:1779124/150‑1 (MQ=255)
gCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGttt < 2:1902615/150‑1 (MQ=255)
ccTGGGAAAAATCACGCTCAAAGAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTa < 2:1638740/150‑1 (MQ=255)
ggAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCa > 1:1427968/1‑150 (MQ=255)
gAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCAt < 2:1589889/150‑1 (MQ=255)
aaaaaTCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATg < 2:424774/150‑1 (MQ=255)
aaaaaTCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATg < 2:469732/150‑1 (MQ=255)
aaaTCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCa > 1:275715/1‑150 (MQ=255)
aaaTCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCa < 1:593968/150‑1 (MQ=255)
tCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCatta < 2:3019511/150‑1 (MQ=255)
cACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCattat < 2:3717992/150‑1 (MQ=255)
gCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTgg < 2:2528834/150‑1 (MQ=255)
gCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTgg > 1:2661515/1‑150 (MQ=255)
cAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTTAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAg < 1:3421955/150‑1 (MQ=255)
aaaTAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGa > 1:3359905/1‑150 (MQ=255)
aaaTAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGa < 2:3817060/150‑1 (MQ=255)
aaTAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGAt < 2:2995829/150‑1 (MQ=255)
aGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGcc < 1:1871851/150‑1 (MQ=255)
aGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGcc > 2:761417/1‑150 (MQ=255)
tttAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAg < 1:3560919/150‑1 (MQ=255)
aaGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGa < 1:1227065/150‑1 (MQ=255)
aGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGaa > 1:1463978/1‑150 (MQ=255)
aGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGAGTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCAGTCTTGGAAGATGCCAGCGac > 2:3517985/1‑149 (MQ=255)
gCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAAt < 2:2231402/150‑1 (MQ=255)
cGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGc > 2:217190/1‑150 (MQ=255)
gCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCa < 1:1012239/150‑1 (MQ=255)
aCGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGNTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGAt > 1:4279551/1‑150 (MQ=255)
aCGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGAt < 2:2760319/150‑1 (MQ=255)
aCGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGAt < 1:3698880/150‑1 (MQ=255)
aaGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGAtcttc < 2:4447680/150‑1 (MQ=255)
gATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATcttctt > 1:4109005/1‑150 (MQ=255)
gATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATATTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATcttctt > 1:2958402/1‑150 (MQ=255)
aTCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTa < 1:2145144/150‑1 (MQ=255)
aTCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTa > 2:2296922/1‑150 (MQ=255)
aTCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTa > 2:3342622/1‑150 (MQ=255)
tCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTaa > 2:734688/1‑150 (MQ=255)
cAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAg > 2:83406/1‑150 (MQ=255)
gTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCt > 2:4018070/1‑150 (MQ=255)
ttttttATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCta < 2:3054138/150‑1 (MQ=255)
ttttttATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGTta > 2:2736258/1‑150 (MQ=255)
tttttATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCtat > 2:1272050/1‑150 (MQ=255)
tttttATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATCATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCtat < 1:2110496/150‑1 (MQ=255)
tttttATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCtat < 2:2810164/150‑1 (MQ=255)
ttttATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCtata < 1:969907/150‑1 (MQ=255)
aTGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGACTGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATaaa > 1:3123787/1‑150 (MQ=255)
aTGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGGTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATaaa > 2:2009569/1‑150 (MQ=255)
gTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATaaaaa > 1:4582885/1‑150 (MQ=255)
gTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATaaaaa > 1:556934/1‑150 (MQ=255)
gTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATaaaaa < 2:323890/150‑1 (MQ=255)
gTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGTTATATaaaaa > 1:2467953/1‑150 (MQ=255)
tATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAAt > 1:3934826/1‑150 (MQ=255)
ttACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTc < 2:1111188/150‑1 (MQ=255)
ttACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTc < 2:486278/150‑1 (MQ=255)
ttACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGTTATATAAAAATGTc > 2:4051559/1‑150 (MQ=255)
cGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAAAGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATATTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCt < 1:2355681/150‑1 (MQ=255)
gggTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTg < 2:2635272/150‑1 (MQ=255)
aaCACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTaaaa < 2:939862/150‑1 (MQ=255)
cacCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACa < 1:4590839/150‑1 (MQ=255)
acCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGACCGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACAt > 2:3593462/1‑150 (MQ=255)
acCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACAt > 1:2858086/1‑150 (MQ=255)
taaataaaCTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATgtgt < 2:286765/150‑1 (MQ=255)
aaaCTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGc > 1:1972806/1‑150 (MQ=255)
aCTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCa < 2:2453023/150‑1 (MQ=255)
tGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATc < 1:4339143/150‑1 (MQ=255)
ggTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATcc > 1:328161/1‑150 (MQ=255)
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GATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATATTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTT > SRR19973073.2964430/1‑150 (MQ=60)
ATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTA < SRR19973073.2149594/150‑1 (MQ=60)
ATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTA < SRR19973073.2149629/150‑1 (MQ=60)
AGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGC > SRR19973073.2749706/1‑150 (MQ=60)
TTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATCATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTAT < SRR19973073.2114913/150‑1 (MQ=60)
TTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATA < SRR19973073.971938/150‑1 (MQ=60)
TTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATA < SRR19973073.2900724/150‑1 (MQ=60)
TTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATA > SRR19973073.2065804/1‑150 (MQ=60)
TTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATA > SRR19973073.2624331/1‑150 (MQ=60)
ATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGACTGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAA > SRR19973073.3130073/1‑150 (MQ=60)
GTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAA > SRR19973073.558136/1‑150 (MQ=60)
GTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAA > SRR19973073.4592045/1‑150 (MQ=60)
GTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGTTATATAAAAA > SRR19973073.2473061/1‑150 (MQ=60)
TATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAAT > SRR19973073.3942663/1‑150 (MQ=60)
TATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTACGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGAGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAAT > SRR19973073.1723403/1‑150 (MQ=60)
ATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTTATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAATAATG < SRR19973073.3953514/150‑1 (MQ=60)
ATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATG > SRR19973073.3664382/1‑150 (MQ=60)
CGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAAAGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATATTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCT < SRR19973073.2360499/150‑1 (MQ=60)
GTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTA > SRR19973073.1979793/1‑150 (MQ=60)
CACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACA < SRR19973073.4599952/150‑1 (MQ=60)
CACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACA < SRR19973073.4600013/150‑1 (MQ=60)
ACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACAT > SRR19973073.2863940/1‑150 (MQ=60)
AAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGC > SRR19973073.2032158/1‑150 (MQ=60)
AAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGC > SRR19973073.1976891/1‑150 (MQ=60)
TGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATC < SRR19973073.4347817/150‑1 (MQ=60)
GGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCC > SRR19973073.328834/1‑150 (MQ=60)
GTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCA < SRR19973073.1860328/150‑1 (MQ=60)
CCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGAT > SRR19973073.2322110/1‑150 (MQ=60)
CCCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGAT > SRR19973073.2322121/1‑150 (MQ=60)
CCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATG < SRR19973073.567864/150‑1 (MQ=60)
CCTACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATG > SRR19973073.2720620/1‑150 (MQ=60)
TACGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTC < SRR19973073.1218405/150‑1 (MQ=60)
CGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGA > SRR19973073.3463392/1‑150 (MQ=60)
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CGCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGA > SRR19973073.1847853/1‑150 (MQ=60)
CGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGA < SRR19973073.4411081/150‑1 (MQ=60)
GCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAG < SRR19973073.4462419/150‑1 (MQ=60)
GCGGCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAG < SRR19973073.2131056/150‑1 (MQ=60)
GCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCATCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTATAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGG < SRR19973073.3026226/150‑1 (MQ=60)
GCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGG < SRR19973073.4160788/150‑1 (MQ=60)
GCACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGG < SRR19973073.4161043/150‑1 (MQ=60)
ACAACGATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCT < SRR19973073.132893/150‑1 (MQ=60)
GATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAAT < SRR19973073.4126161/150‑1 (MQ=60)
ATTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATT < SRR19973073.3981770/150‑1 (MQ=60)
TTTATTTATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTG < SRR19973073.3021776/150‑1 (MQ=60)
GATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGC < SRR19973073.4078126/150‑1 (MQ=60)
GATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGC < SRR19973073.4232382/150‑1 (MQ=60)
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GGTTCGCTCTTTTCGCTGGTGGTTGAAAATGCCTGGGAAAAATCACGCTCAAATAGTTTAAGCCGCAGTACGGAAGATCAGTTTTTTATGTATTTACGGGTAAACACCCTAAATAAACTGGTACCCTACGCGGCACAACGATTTATTGATAATCTGCCTGCGATTTTCGCCGGAACGTTTAATCATGCATTATTGGAAGATGCCAGCGAATGCAGCGATCTTCTTAAGCTATATAAAAATGTCGCTGTAAAACATGTGTTTAGCCATCCAGATGTCGAGCGGCTTGAATTGCAGGGC > CP009273/176636‑176932
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |