Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F121 I0 R1
|
856 |
273.6 |
9081716 |
94.1% |
8545894 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,454,724 |
G→T |
71.7% |
G472C (GGT→TGT) |
paaH → |
3‑hydroxyadipyl‑CoA dehydrogenase, NAD+‑dependent |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,454,724 | 0 | G | T | 71.7%
| 358.8
/ 253.9
| 272 | G472C (GGT→TGT) | paaH | 3‑hydroxyadipyl‑CoA dehydrogenase, NAD+‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (41/36); new base T (81/114); total (122/150) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.04e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.15e-01 |
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
GGTGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGTCAT > CP009273/1454576‑1454871
|
tGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGtt < 1:4128498/150‑1 (MQ=255)
tGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGtt > 2:1039749/1‑150 (MQ=255)
tGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGtt < 2:3866225/150‑1 (MQ=255)
aaTTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTAt < 2:2135409/150‑1 (MQ=255)
aTTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATg < 1:3431101/150‑1 (MQ=255)
tCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTc < 2:2565026/150‑1 (MQ=255)
ccATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCa < 1:825526/150‑1 (MQ=255)
atGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAg < 1:2562165/150‑1 (MQ=255)
atGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAg > 2:2898075/1‑150 (MQ=255)
gCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGcc < 2:3441912/150‑1 (MQ=255)
gCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGcc < 2:3462192/150‑1 (MQ=255)
ccACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTg > 1:3927234/1‑150 (MQ=255)
ccACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTg < 2:2787863/150‑1 (MQ=255)
cACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTgg > 1:1604908/1‑150 (MQ=255)
tGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCaaa > 1:4339120/1‑150 (MQ=255)
cTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATg < 2:1489278/150‑1 (MQ=255)
ggggAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGcc > 2:4167589/1‑150 (MQ=255)
ggggAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGcc > 2:2465820/1‑150 (MQ=255)
ggggAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGcc < 2:2000129/150‑1 (MQ=255)
aGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATg < 1:102933/150‑1 (MQ=255)
aGCGCAACCTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATg < 2:1098846/150‑1 (MQ=255)
cAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGAGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAATGCCTGGCAAAATGCCCATGCAAt > 2:1704554/1‑150 (MQ=255)
aaCTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATg > 1:2127401/1‑150 (MQ=255)
aCTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGt < 1:1395214/150‑1 (MQ=255)
ttGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTAt < 1:932964/150‑1 (MQ=255)
gctggcAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATgag < 1:3351516/150‑1 (MQ=255)
ggcAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAAc < 2:2689242/150‑1 (MQ=255)
aGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGAt < 1:2455267/150‑1 (MQ=255)
gCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATg < 1:3855496/150‑1 (MQ=255)
gAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGcc > 1:3763656/1‑150 (MQ=255)
aaTATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCt < 1:854621/150‑1 (MQ=255)
aaTATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCt < 2:3864867/150‑1 (MQ=255)
aaTATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCt > 1:2027461/1‑150 (MQ=255)
aaTATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCt > 1:4326052/1‑150 (MQ=255)
atatTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTg > 1:1126304/1‑150 (MQ=255)
tatTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTgc > 1:1535993/1‑150 (MQ=255)
tAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGcc < 1:367901/150‑1 (MQ=255)
tAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCGGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGcc > 1:1710415/1‑150 (MQ=255)
aaGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATTCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCa > 1:3613837/1‑150 (MQ=255)
aaGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCa > 1:1373026/1‑150 (MQ=255)
aaGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCa > 2:2348941/1‑150 (MQ=255)
aaGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCa > 1:2077960/1‑150 (MQ=255)
aaGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCa < 2:3823727/150‑1 (MQ=255)
aGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCaa < 2:2089747/150‑1 (MQ=255)
aGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCaa < 1:2503394/150‑1 (MQ=255)
ggCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCaaa > 2:3164534/1‑150 (MQ=255)
ggCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCaaa > 2:671676/1‑150 (MQ=255)
cTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAgc < 2:3342236/150‑1 (MQ=255)
ccTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAgcgc > 2:1675483/1‑150 (MQ=255)
cTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCt > 2:1429256/1‑150 (MQ=255)
ttGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCtt < 1:80384/150‑1 (MQ=255)
ttGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCtt < 1:700237/150‑1 (MQ=255)
ttGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCtt < 1:1310415/150‑1 (MQ=255)
ttGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCtt < 2:314726/150‑1 (MQ=255)
aacaTCGACAGCATCACTATGGCGCAGAACGCTATCGCCCATGTTCAGTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGc < 2:2543645/147‑1 (MQ=255)
aTCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCCAAGTATGAGAAAGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATc > 1:2415363/1‑150 (MQ=255)
tCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCg < 2:1587518/150‑1 (MQ=255)
cTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGa < 1:3586173/150‑1 (MQ=255)
tACAGCCTCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGAc < 2:3911105/150‑1 (MQ=255)
tACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGAc < 2:881545/150‑1 (MQ=255)
aGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACAtt > 2:4474249/1‑150 (MQ=255)
tCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTAtct > 1:651403/1‑150 (MQ=255)
tCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTAtct > 2:3625732/1‑150 (MQ=255)
tCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTAtct > 2:1340957/1‑150 (MQ=255)
tATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAAt > 1:1951727/1‑150 (MQ=255)
tATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAAt > 1:2242701/1‑150 (MQ=255)
aTGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATg < 1:2247801/150‑1 (MQ=255)
aTGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATg < 1:4522144/150‑1 (MQ=255)
tGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATgg < 2:1202227/150‑1 (MQ=255)
cGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATg < 2:1912588/150‑1 (MQ=255)
cGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATg < 2:37047/150‑1 (MQ=255)
gaagaaCGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGa > 2:4035720/1‑150 (MQ=255)
aagaaCGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCCTCGACATTATCTCAATTGATGaa > 1:3069527/1‑150 (MQ=255)
aagaaCGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGaa > 2:3200102/1‑150 (MQ=255)
gaaCGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATTCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAgg > 1:3146302/1‑150 (MQ=255)
aaCGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTTCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATTGATGAAGGc > 2:479262/1‑150 (MQ=255)
aaCGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCCAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGc > 1:1652506/1‑150 (MQ=255)
cTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATTCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTg > 1:608922/1‑150 (MQ=255)
cTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTg < 1:585990/150‑1 (MQ=255)
cTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTg < 1:3660251/150‑1 (MQ=255)
cTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCGTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAATGCCTGGCAAAATGCCCAATCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACAATATATCAATTGATGAAGGCTTTg > 1:17971/1‑150 (MQ=255)
aTCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCt < 1:3908850/150‑1 (MQ=255)
tCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTg > 1:4295488/1‑150 (MQ=255)
cGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGt < 1:3184766/150‑1 (MQ=255)
gCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTa > 2:174542/1‑150 (MQ=255)
cATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATg > 2:579190/1‑150 (MQ=255)
tgctgcGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGAcc < 2:3723498/150‑1 (MQ=255)
tgctgcGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGAcc < 2:3951571/150‑1 (MQ=255)
tgctgcGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTAATAAGGCCTGGCAAAAAGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTTCTGTAGTGACCATGAcc > 1:528876/1‑150 (MQ=255)
ccAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATTAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTg > 1:3269595/1‑150 (MQ=255)
aaCGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGca > 2:1370898/1‑150 (MQ=255)
ggCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACaaa > 2:2323449/1‑150 (MQ=255)
gcgcTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAAt < 2:100175/150‑1 (MQ=255)
cgcTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATg > 2:3578878/1‑150 (MQ=255)
gcTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGc < 1:2919675/150‑1 (MQ=255)
cTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTaa < 2:3457726/150‑1 (MQ=255)
ggAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACg < 2:2865932/150‑1 (MQ=255)
gagaGCTGTTATGAGTCATACGGCCTGGCAAACTGCCCATGCAATGTATGAGACCGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACgg < 1:718849/150‑1 (MQ=255)
agCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGtca < 2:787437/150‑1 (MQ=255)
gCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTGACGGtcat < 2:224554/150‑1 (MQ=255)
|
GGTGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGTCAT > CP009273/1454576‑1454871
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGTGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGTCATCA > CP009273/1454576‑1454873
|
GGTGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGG > SRR19973080.454610/1‑150 (MQ=60)
TGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTT < SRR19973080.4150870/150‑1 (MQ=60)
TGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTT < SRR19973080.3642926/150‑1 (MQ=60)
GAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTA > SRR19973080.1493053/1‑150 (MQ=60)
ATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATG < SRR19973080.1149949/150‑1 (MQ=60)
ATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATG < SRR19973080.3449794/150‑1 (MQ=60)
TATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAG > SRR19973080.39515/1‑150 (MQ=60)
TATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAG > SRR19973080.39484/1‑150 (MQ=60)
CCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCA > SRR19973080.2493243/1‑150 (MQ=60)
CCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCA < SRR19973080.830471/150‑1 (MQ=60)
CCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCA < SRR19973080.830447/150‑1 (MQ=60)
CCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCA < SRR19973080.1414502/150‑1 (MQ=60)
CATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCAT > SRR19973080.3746926/1‑150 (MQ=60)
CATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCAT < SRR19973080.603710/150‑1 (MQ=60)
CATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCAT < SRR19973080.1351820/150‑1 (MQ=60)
ATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATA < SRR19973080.561887/150‑1 (MQ=60)
ATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAG < SRR19973080.1067664/150‑1 (MQ=60)
ATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAG < SRR19973080.2576173/150‑1 (MQ=60)
CCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCT > SRR19973080.3782738/1‑150 (MQ=60)
CCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTG > SRR19973080.3948915/1‑150 (MQ=60)
CACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGG > SRR19973080.1614299/1‑150 (MQ=60)
CACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGG > SRR19973080.486835/1‑150 (MQ=60)
CACGTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGG < SRR19973080.2234781/150‑1 (MQ=60)
CTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCA < SRR19973080.1692613/150‑1 (MQ=60)
TGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAA > SRR19973080.4362816/1‑150 (MQ=60)
GCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCAGGAGAGAGGTTATGAGTCATAATGCCTGGCAAAA > SRR19973080.299892/1‑150 (MQ=60)
TGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCGTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGC > SRR19973080.4357871/1‑150 (MQ=60)
AGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATG < SRR19973080.103861/150‑1 (MQ=60)
GCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGC < SRR19973080.3633709/150‑1 (MQ=60)
CGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCA < SRR19973080.2396075/150‑1 (MQ=60)
AACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATG > SRR19973080.2139382/1‑150 (MQ=60)
ACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGT < SRR19973080.1403500/150‑1 (MQ=60)
CTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTA < SRR19973080.4066405/150‑1 (MQ=60)
CTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTA > SRR19973080.2774223/1‑150 (MQ=60)
CTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTA > SRR19973080.498003/1‑150 (MQ=60)
CTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCGTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTA > SRR19973080.3446153/1‑150 (MQ=60)
TTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTAT < SRR19973080.938666/150‑1 (MQ=60)
GCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAG < SRR19973080.3369737/150‑1 (MQ=60)
TGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAA < SRR19973080.2496162/150‑1 (MQ=60)
TGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAA < SRR19973080.832308/150‑1 (MQ=60)
AGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGAT < SRR19973080.2468867/150‑1 (MQ=60)
GCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATG < SRR19973080.3876708/150‑1 (MQ=60)
GCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATG < SRR19973080.2112908/150‑1 (MQ=60)
GAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCC > SRR19973080.3784158/1‑150 (MQ=60)
GAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCC > SRR19973080.3254160/1‑150 (MQ=60)
GAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCC > SRR19973080.3253602/1‑150 (MQ=60)
AATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATTCCT > SRR19973080.2033803/1‑150 (MQ=60)
AATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCT > SRR19973080.2038982/1‑150 (MQ=60)
AATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCT < SRR19973080.4322804/150‑1 (MQ=60)
AATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCT < SRR19973080.859798/150‑1 (MQ=60)
AATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCT < SRR19973080.860318/150‑1 (MQ=60)
AATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCT > SRR19973080.4349683/1‑150 (MQ=60)
AATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCT > SRR19973080.4349498/1‑150 (MQ=60)
ATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAAAGTATGAGAACGATGCCTG > SRR19973080.1132814/1‑150 (MQ=60)
ATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTG < SRR19973080.1618556/150‑1 (MQ=60)
TATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGC > SRR19973080.1544856/1‑150 (MQ=60)
TAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCC < SRR19973080.370006/150‑1 (MQ=60)
TAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCC < SRR19973080.369537/150‑1 (MQ=60)
TAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCGGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCC > SRR19973080.1720346/1‑150 (MQ=60)
AAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATTCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCA > SRR19973080.3633809/1‑150 (MQ=60)
AAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCC > SRR19973080.3633820/1‑150 (MQ=60)
AAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCA > SRR19973080.1381196/1‑150 (MQ=60)
AAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCA > SRR19973080.2089726/1‑150 (MQ=60)
AAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCA > SRR19973080.1381307/1‑150 (MQ=60)
AAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCA > SRR19973080.1381233/1‑150 (MQ=60)
AGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAA < SRR19973080.2517276/150‑1 (MQ=60)
AGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAA < SRR19973080.2517208/150‑1 (MQ=60)
GCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAG < SRR19973080.4372987/150‑1 (MQ=60)
GCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAG > SRR19973080.657450/1‑150 (MQ=60)
CTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGC < SRR19973080.1819849/150‑1 (MQ=60)
CTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGC < SRR19973080.1820067/150‑1 (MQ=60)
TTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTT < SRR19973080.1318331/150‑1 (MQ=60)
TTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTT < SRR19973080.81154/150‑1 (MQ=60)
TTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTT < SRR19973080.704885/150‑1 (MQ=60)
TTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTT < SRR19973080.704333/150‑1 (MQ=60)
TTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTT < SRR19973080.82528/150‑1 (MQ=60)
TTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTT < SRR19973080.1792129/150‑1 (MQ=60)
AAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGC < SRR19973080.3555482/150‑1 (MQ=60)
AAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCA < SRR19973080.233701/150‑1 (MQ=60)
ATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCCAAGTATGAGAAAGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATC > SRR19973080.2428770/1‑150 (MQ=60)
ATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCGTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATC > SRR19973080.2428798/1‑150 (MQ=60)
TCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCG < SRR19973080.1554912/150‑1 (MQ=60)
CTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGA < SRR19973080.3605999/150‑1 (MQ=60)
CTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGA < SRR19973080.3607725/150‑1 (MQ=60)
TCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCT > SRR19973080.655334/1‑150 (MQ=60)
TATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAAT > SRR19973080.2255001/1‑150 (MQ=60)
TATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAAT > SRR19973080.2255282/1‑150 (MQ=60)
TATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAAT > SRR19973080.1963379/1‑150 (MQ=60)
TATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAAT > SRR19973080.1962795/1‑150 (MQ=60)
ATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATG < SRR19973080.2260116/150‑1 (MQ=60)
ATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATG < SRR19973080.4546517/150‑1 (MQ=60)
GAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGA > SRR19973080.1246288/1‑150 (MQ=60)
GAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCGTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTaaaaggagga > SRR19973080.3815022/1‑140 (MQ=60)
AAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATTCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACAATATCTCAATGGATGAA > SRR19973080.3088645/1‑150 (MQ=60)
AAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCCTCGACATTATCTCAATTGATGAA > SRR19973080.3086245/1‑150 (MQ=60)
AAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAA > SRR19973080.941793/1‑150 (MQ=60)
GAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATTAGTAATAATGCCTGGCAAAATGCCCAATCAAAGTATGATAACGATTCCATCGCCAAAGCGCGTGGCATCGACAaaatatcaatggattaatg > SRR19973080.3164270/1‑131 (MQ=60)
GAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATTCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAACCGCTTGGCATCGACATTATATAAATGGATGAAGG > SRR19973080.3163630/1‑150 (MQ=60)
GAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGG > SRR19973080.82515/1‑150 (MQ=60)
GAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTATGGAGAGCTGTTATGAGTCATAATGCCTGGCAAAATTACCAAGCAATGTATTATAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATagaaaatatctaaaatgattaatt > SRR19973080.3163714/1‑126 (MQ=60)
AACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCCAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGC > SRR19973080.1662165/1‑150 (MQ=60)
CGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTT > SRR19973080.749297/1‑150 (MQ=60)
CGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTT > SRR19973080.749748/1‑150 (MQ=60)
CGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTT > SRR19973080.3921822/1‑150 (MQ=60)
GCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTT < SRR19973080.621200/150‑1 (MQ=60)
GCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCAGGAGACCAGGTATGATAAAAAACGCCAGGCAAAATGCCCAAGCAAAGTATGAGAAAGATTCCAGAGCCAAAGCGCTAGGCATCGACAATATCACAAAGGATGAAGGCTTT > SRR19973080.780474/1‑150 (MQ=38)
GATATCGCCCATGTTCTTTGCTGCGCCATCGGGCGATTCTTGAGAGCGTTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCAAATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTT < SRR19973080.2127343/150‑1 (MQ=60)
CTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATTAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATTAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTG > SRR19973080.612995/1‑150 (MQ=60)
CTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATTCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTG > SRR19973080.612685/1‑150 (MQ=60)
CTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTG < SRR19973080.3680435/150‑1 (MQ=60)
CTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTG < SRR19973080.589641/150‑1 (MQ=60)
CTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTG < SRR19973080.589645/150‑1 (MQ=60)
CTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCGTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAATGCCTGGCAAAATGCCCAATCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACAATATATCAATTGATGAAGGCTTTG > SRR19973080.18184/1‑150 (MQ=60)
TATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGC > SRR19973080.345743/1‑150 (MQ=60)
ATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCT < SRR19973080.3930419/150‑1 (MQ=60)
TCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTG > SRR19973080.4318961/1‑150 (MQ=60)
TCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTG < SRR19973080.2444815/150‑1 (MQ=60)
CGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGT < SRR19973080.3336617/150‑1 (MQ=60)
CGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGT < SRR19973080.3336694/150‑1 (MQ=60)
CGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGT < SRR19973080.3202348/150‑1 (MQ=60)
GCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTA < SRR19973080.3838508/150‑1 (MQ=60)
TGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGAC < SRR19973080.3970257/150‑1 (MQ=60)
gctcttccgatctCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACC < SRR19973080.951312/137‑1 (MQ=60)
TTGCTGCGCCAATGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGAC > SRR19973080.4261261/1‑150 (MQ=60)
TTGCTGCGCCAATGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGAC > SRR19973080.3068559/1‑150 (MQ=60)
TGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACC < SRR19973080.2161982/150‑1 (MQ=60)
TGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTAATAAGGCCTGGCAAAAAGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTTCTGTAGTGACCATGACC > SRR19973080.532243/1‑150 (MQ=60)
CGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCAC > SRR19973080.1758637/1‑150 (MQ=60)
CCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATTAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTG > SRR19973080.3287568/1‑150 (MQ=60)
CAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCAAGCAATGTATGAGAACGATGCCAGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGC > SRR19973080.1567152/1‑150 (MQ=60)
CGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGAGGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACA < SRR19973080.1621649/150‑1 (MQ=60)
GGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAA > SRR19973080.2704592/1‑150 (MQ=60)
GGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAA > SRR19973080.4171451/1‑150 (MQ=60)
GCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGC < SRR19973080.2935575/150‑1 (MQ=60)
GCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGC < SRR19973080.662308/150‑1 (MQ=60)
TGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAACTGCCCATGCAATGTATGAGACCGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAAC < SRR19973080.3111921/150‑1 (MQ=60)
GAGAGCTGTTATGAGTCATACGGCCTGGCAAACTGCCCATGCAATGTATGAGACCGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGG < SRR19973080.722991/150‑1 (MQ=60)
AGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGT > SRR19973080.2072777/1‑150 (MQ=60)
GCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGTCAT < SRR19973080.3866672/150‑1 (MQ=60)
TGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGTCATCA > SRR19973080.3808930/1‑150 (MQ=60)
TGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGTCATCA < SRR19973080.3063503/150‑1 (MQ=60)
TGTTATGAGTCATAAGGCCTGGAAAAATGCCCATGCAATGTATGTGAACGTTTCCTGCGCCAAAGCTCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGTCATCA < SRR19973080.3064299/150‑1 (MQ=60)
|
GGTGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGTCATCA > CP009273/1454576‑1454873
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |