Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F204 I0 R1
|
1155 |
255.8 |
8356456 |
95.7% |
7997128 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,454,724 |
G→T |
100% |
G472C (GGT→TGT) |
paaH → |
3‑hydroxyadipyl‑CoA dehydrogenase, NAD+‑dependent |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,454,724 | 0 | G | T | 97.0%
| 881.4
/ 14.5
| 268 | G472C (GGT→TGT) | paaH | 3‑hydroxyadipyl‑CoA dehydrogenase, NAD+‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (5/3); new base T (121/139); total (126/142) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.81e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.82e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 268 total aligned reads displayed.
TGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGTCA > CP009273/1454578‑1454870
|
tGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGtt < 1:452307/150‑1 (MQ=255)
tGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGtt < 1:2930313/150‑1 (MQ=255)
aaTTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTAt < 1:2900771/150‑1 (MQ=255)
aaTTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTAt < 2:748437/150‑1 (MQ=255)
ttATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGa < 1:2255678/150‑1 (MQ=255)
aTCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGt < 1:3517013/150‑1 (MQ=255)
tatGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATaa > 1:1306133/1‑150 (MQ=255)
tatGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATaa < 2:503910/150‑1 (MQ=255)
tatGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATaa < 1:3248080/150‑1 (MQ=255)
tatGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATaa < 1:1759167/150‑1 (MQ=255)
cccACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCt < 2:302193/150‑1 (MQ=255)
cccACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCt > 1:3080787/1‑150 (MQ=255)
ccACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTg > 2:2068324/1‑150 (MQ=255)
tGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCaaa < 1:3484521/150‑1 (MQ=255)
tGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCaaa > 1:1165693/1‑150 (MQ=255)
ccTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAAt < 1:2591946/150‑1 (MQ=255)
cTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATg > 2:38615/1‑150 (MQ=255)
ggggAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGcc > 1:1974947/1‑150 (MQ=255)
ggAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCa < 2:2383624/150‑1 (MQ=255)
gAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCAt > 1:674460/1‑150 (MQ=255)
gAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCAt < 1:3974713/150‑1 (MQ=255)
cgcAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCa < 2:2838806/150‑1 (MQ=255)
gcAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCaa < 1:2531150/150‑1 (MQ=255)
aaCTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATg < 2:1746348/150‑1 (MQ=255)
ttGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTAt > 2:164940/1‑150 (MQ=255)
ttGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTAt > 2:923372/1‑150 (MQ=255)
tggctggcAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATg > 2:2677888/1‑150 (MQ=255)
ggcAGCGACTATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAAc < 2:853526/150‑1 (MQ=255)
ggcAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAAc < 2:1292171/150‑1 (MQ=255)
ggcAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAAc > 2:704086/1‑150 (MQ=255)
gAATATTAAGTCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGcc < 2:1296364/150‑1 (MQ=255)
gAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAGGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGcc > 2:3044908/1‑150 (MQ=255)
tatTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTgc > 1:1903075/1‑150 (MQ=255)
cTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAgc > 1:489317/1‑150 (MQ=255)
ccTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAgcgc > 2:757683/1‑150 (MQ=255)
ccTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAgcgc > 1:601546/1‑150 (MQ=255)
cTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCt > 2:3753878/1‑150 (MQ=255)
cTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCt > 2:213053/1‑150 (MQ=255)
ttGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCtt < 2:3108592/150‑1 (MQ=255)
ttGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCtt < 2:4176165/150‑1 (MQ=255)
ttGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCtt > 2:1127455/1‑150 (MQ=255)
ttGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCtt < 2:1124137/150‑1 (MQ=255)
ttGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCtt > 2:2970806/1‑150 (MQ=255)
tGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTg > 2:1070560/1‑150 (MQ=255)
gAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTgg < 1:1025821/150‑1 (MQ=255)
aaaaTCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGc < 2:3132930/150‑1 (MQ=255)
aaaaTCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGc < 1:1641994/150‑1 (MQ=255)
aaaTCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCa > 1:572164/1‑150 (MQ=255)
tCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCg > 2:3813365/1‑150 (MQ=255)
tCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCg < 2:970210/150‑1 (MQ=255)
cTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGa > 1:1400886/1‑150 (MQ=255)
tACAGCATCACTAAGGAGAAGAACTCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTTGCATCGAc > 2:565042/1‑150 (MQ=255)
aTCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTAtc > 2:780145/1‑150 (MQ=255)
aTCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTAtc > 2:2954079/1‑150 (MQ=255)
tCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTAtct > 2:2288521/1‑150 (MQ=255)
aCTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCa > 2:3485114/1‑150 (MQ=255)
cTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCaa > 2:2346788/1‑150 (MQ=255)
tATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAAt < 1:3720864/150‑1 (MQ=255)
ggCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGa > 2:1424960/1‑150 (MQ=255)
ggCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGa < 2:2018332/150‑1 (MQ=255)
gCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGAt < 1:1287624/150‑1 (MQ=255)
cGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATg < 1:150365/150‑1 (MQ=255)
cGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATg > 1:2162266/1‑150 (MQ=255)
cGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATg < 2:1004179/150‑1 (MQ=255)
cGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATg > 2:1587117/1‑150 (MQ=255)
cGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATg > 1:1568403/1‑150 (MQ=255)
gaagaaCGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGa > 1:4044003/1‑150 (MQ=255)
cGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCtt > 2:4068046/1‑150 (MQ=255)
gCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCttt < 1:2390086/150‑1 (MQ=255)
gCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCttt < 2:1340928/150‑1 (MQ=255)
ttCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCTTAAGGCCTGGCAAAATGCCCTTGCAATGTTTGAGAACGATGCATGAGCAAAATCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGTTGAAGGCTTTGCt < 2:1485749/149‑1 (MQ=255)
aTCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCt > 1:1104741/1‑150 (MQ=255)
gCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTa < 1:2133968/150‑1 (MQ=255)
gCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGGATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCGTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTa > 2:1176091/1‑150 (MQ=255)
cccATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCTCTTCTTGAGAGATGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCAAAAGCGCTTGGAATAGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAg < 1:800728/150‑1 (MQ=255)
cccATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAg < 1:800696/150‑1 (MQ=255)
ccATGTTCCTTGCTGCGCCACCGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGCACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGt < 1:3557456/150‑1 (MQ=255)
aTGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGa < 1:2235218/150‑1 (MQ=255)
tGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGAc > 1:1895988/1‑150 (MQ=255)
tGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGAc < 1:230411/150‑1 (MQ=255)
gTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGAcc > 1:1627349/1‑150 (MQ=255)
gTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGAcc < 1:3004615/150‑1 (MQ=255)
cATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATg < 1:2502694/150‑1 (MQ=255)
tgctgcGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGAcc > 1:1010058/1‑150 (MQ=255)
tgctgcGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGAcc < 1:1229164/150‑1 (MQ=255)
tgctgcGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCAGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGAcc > 2:1383342/1‑150 (MQ=255)
gggCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACaa > 1:1849431/1‑150 (MQ=255)
cgcTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATg < 2:1978825/150‑1 (MQ=255)
cTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCt < 1:2036171/150‑1 (MQ=255)
cTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCt < 2:220423/150‑1 (MQ=255)
ttCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCtt < 2:3228510/150‑1 (MQ=255)
tCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTa < 2:1904022/150‑1 (MQ=255)
tGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGACGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAAc > 2:3887551/1‑150 (MQ=255)
tGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAAc > 2:946202/1‑150 (MQ=255)
gagaGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACgg < 1:2728237/150‑1 (MQ=255)
gagaGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACgg < 1:3756888/150‑1 (MQ=255)
agagCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGt < 2:3480209/150‑1 (MQ=255)
agagCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGt > 2:2729971/1‑150 (MQ=255)
agagCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGt > 1:3808692/1‑150 (MQ=255)
agCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGtca > 2:602870/1‑150 (MQ=255)
|
TGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGTCA > CP009273/1454578‑1454870
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGGTGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGTCATCA > CP009273/1454575‑1454873
|
GGGTGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCT < SRR19973074.3013073/150‑1 (MQ=60)
GGGTGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCT < SRR19973074.3013065/150‑1 (MQ=60)
GGGTGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATNAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCT < SRR19973074.2980231/150‑1 (MQ=60)
TGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTTGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTT < SRR19973074.453224/150‑1 (MQ=60)
TGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTT < SRR19973074.453189/150‑1 (MQ=60)
TGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTT < SRR19973074.2935761/150‑1 (MQ=60)
TGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTT > SRR19973074.1263413/1‑150 (MQ=60)
TGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCCGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTT > SRR19973074.1263358/1‑150 (MQ=60)
AATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTAT < SRR19973074.2906360/150‑1 (MQ=60)
AATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTAT < SRR19973074.2906158/150‑1 (MQ=60)
TTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGA < SRR19973074.2259905/150‑1 (MQ=60)
TTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGA < SRR19973074.2259911/150‑1 (MQ=60)
ATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGT < SRR19973074.3523505/150‑1 (MQ=60)
ATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGT < SRR19973074.3523475/150‑1 (MQ=60)
CATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCAT > SRR19973074.1512097/1‑150 (MQ=60)
TATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAA > SRR19973074.1308599/1‑150 (MQ=60)
TATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAA < SRR19973074.1762454/150‑1 (MQ=60)
TATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAA < SRR19973074.3254093/150‑1 (MQ=60)
GGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGC > SRR19973074.305761/1‑150 (MQ=60)
CCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCT > SRR19973074.3086453/1‑150 (MQ=60)
CCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTG < SRR19973074.113534/150‑1 (MQ=60)
CCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTG < SRR19973074.113427/150‑1 (MQ=60)
CACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGG < SRR19973074.3470777/150‑1 (MQ=60)
ACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGC > SRR19973074.573890/1‑150 (MQ=60)
TGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAA > SRR19973074.1167908/1‑150 (MQ=60)
TGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAA > SRR19973074.1167933/1‑150 (MQ=60)
TGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAA < SRR19973074.3490916/150‑1 (MQ=60)
CCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAAT < SRR19973074.2596792/150‑1 (MQ=60)
CCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAAT < SRR19973074.1981546/150‑1 (MQ=60)
CCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAAT < SRR19973074.2256205/150‑1 (MQ=60)
CTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATG < SRR19973074.1702742/150‑1 (MQ=60)
GGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCC > SRR19973074.1978709/1‑150 (MQ=60)
GGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCC < SRR19973074.2714462/150‑1 (MQ=60)
GAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCAT < SRR19973074.3982042/150‑1 (MQ=60)
GAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCAT > SRR19973074.675702/1‑150 (MQ=60)
GCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAATTGCCCATGC < SRR19973074.2199183/150‑1 (MQ=60)
GCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAA < SRR19973074.2535866/150‑1 (MQ=60)
CAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAAT < SRR19973074.3644574/150‑1 (MQ=60)
CAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAAT < SRR19973074.3644593/150‑1 (MQ=60)
CAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAAT < SRR19973074.3059157/150‑1 (MQ=60)
TGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATG < SRR19973074.2658414/150‑1 (MQ=60)
GCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAG < SRR19973074.2998158/150‑1 (MQ=60)
GGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAAC < SRR19973074.1355819/150‑1 (MQ=60)
AGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGAT > SRR19973074.1741626/1‑150 (MQ=60)
AGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGAT < SRR19973074.471350/150‑1 (MQ=60)
AGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGAT < SRR19973074.3732817/150‑1 (MQ=60)
TATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGC > SRR19973074.1906721/1‑150 (MQ=60)
TATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGC > SRR19973074.2387030/1‑150 (MQ=60)
AAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCA > SRR19973074.2500059/1‑150 (MQ=60)
CTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGC > SRR19973074.490300/1‑150 (MQ=60)
CTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGC > SRR19973074.490315/1‑150 (MQ=60)
CTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGC > SRR19973074.491369/1‑150 (MQ=60)
CCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGC > SRR19973074.4045688/1‑150 (MQ=60)
CCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGC > SRR19973074.602695/1‑150 (MQ=60)
GAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGG < SRR19973074.1027173/150‑1 (MQ=60)
GAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGG < SRR19973074.1027716/150‑1 (MQ=60)
AAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGC < SRR19973074.1645102/150‑1 (MQ=60)
AAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGC > SRR19973074.3802086/1‑150 (MQ=60)
AAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCA > SRR19973074.573282/1‑150 (MQ=60)
CTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGA > SRR19973074.1403459/1‑150 (MQ=60)
ACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACA > SRR19973074.2773969/1‑150 (MQ=60)
CATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTAT < SRR19973074.759449/150‑1 (MQ=60)
ATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATC > SRR19973074.1644416/1‑150 (MQ=60)
TCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCT < SRR19973074.961455/150‑1 (MQ=60)
TCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCT < SRR19973074.3924461/150‑1 (MQ=60)
TCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCT < SRR19973074.961541/150‑1 (MQ=60)
TATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAAT < SRR19973074.3727728/150‑1 (MQ=60)
ATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATG < SRR19973074.1463241/150‑1 (MQ=60)
ATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATG > SRR19973074.1301144/1‑150 (MQ=60)
GCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGAT < SRR19973074.1290068/150‑1 (MQ=60)
GCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGAT < SRR19973074.1290095/150‑1 (MQ=60)
CGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATG > SRR19973074.2166329/1‑150 (MQ=60)
CGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATG > SRR19973074.2166336/1‑150 (MQ=60)
CGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATG < SRR19973074.150706/150‑1 (MQ=60)
CGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATG > SRR19973074.1571375/1‑150 (MQ=60)
GAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGA > SRR19973074.4051481/1‑150 (MQ=60)
GAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGA > SRR19973074.436530/1‑150 (MQ=60)
AACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGC > SRR19973074.2405472/1‑150 (MQ=60)
GCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTT < SRR19973074.1634018/150‑1 (MQ=60)
GCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTT < SRR19973074.2394519/150‑1 (MQ=60)
GCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTT < SRR19973074.2136865/150‑1 (MQ=60)
CTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTG > SRR19973074.1975772/1‑150 (MQ=60)
TATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGC > SRR19973074.3298273/1‑150 (MQ=60)
ATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCT > SRR19973074.1106817/1‑150 (MQ=60)
GCCCATGTTCATTGCTGCGCCTACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTA < SRR19973074.3001480/150‑1 (MQ=60)
GCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTA < SRR19973074.2137976/150‑1 (MQ=60)
CCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCTCTTCTTGAGAGATGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCAAAAGCGCTTGGAATAGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAG < SRR19973074.802266/150‑1 (MQ=60)
CCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAG < SRR19973074.802234/150‑1 (MQ=60)
CCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAG < SRR19973074.2536946/150‑1 (MQ=60)
CCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAG < SRR19973074.802262/150‑1 (MQ=60)
CCATGTTCCTTGCTGCGCCACCGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGCACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGT < SRR19973074.3564013/150‑1 (MQ=60)
CATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTG > SRR19973074.3996191/1‑150 (MQ=60)
CATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTCATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTGGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTG < SRR19973074.2238008/150‑1 (MQ=60)
ATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGA > SRR19973074.3233515/1‑150 (MQ=60)
ATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGA < SRR19973074.2239419/150‑1 (MQ=60)
TGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATTCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATTAAGGCTTTGCTGTAGTGAC > SRR19973074.1899428/1‑150 (MQ=60)
TGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATTCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGAC < SRR19973074.3504036/150‑1 (MQ=60)
TGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGAC > SRR19973074.1899623/1‑150 (MQ=60)
TGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGAC < SRR19973074.230885/150‑1 (MQ=60)
TGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGAC > SRR19973074.1899424/1‑150 (MQ=60)
TGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGAC < SRR19973074.3504058/150‑1 (MQ=60)
TGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGAC < SRR19973074.230999/150‑1 (MQ=60)
GTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACC > SRR19973074.1630437/1‑150 (MQ=60)
GTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACC < SRR19973074.3010188/150‑1 (MQ=60)
CATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATG < SRR19973074.2507348/150‑1 (MQ=60)
TTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGAC > SRR19973074.1524975/1‑150 (MQ=60)
TTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCCCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGAC < SRR19973074.775561/150‑1 (MQ=60)
TGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACC > SRR19973074.1011934/1‑150 (MQ=60)
TGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACC < SRR19973074.1231514/150‑1 (MQ=60)
TGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACC < SRR19973074.2108581/150‑1 (MQ=60)
TGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTC > SRR19973074.1594148/1‑150 (MQ=60)
CCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTG > SRR19973074.640312/1‑150 (MQ=60)
CCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTG < SRR19973074.2531844/150‑1 (MQ=60)
AACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCA > SRR19973074.2514597/1‑150 (MQ=60)
AACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCA > SRR19973074.1900639/1‑150 (MQ=60)
AACGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCA > SRR19973074.1900638/1‑150 (MQ=60)
CGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACA < SRR19973074.1031647/150‑1 (MQ=60)
CGGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACA < SRR19973074.1031916/150‑1 (MQ=60)
GGGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAA > SRR19973074.1852962/1‑150 (MQ=60)
GGCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAA > SRR19973074.183123/1‑150 (MQ=60)
GCGCTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAAT < SRR19973074.608398/150‑1 (MQ=60)
CTTCTGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCT < SRR19973074.2040011/150‑1 (MQ=60)
TCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTA < SRR19973074.1467664/150‑1 (MQ=60)
TGGAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAAC > SRR19973074.2034984/1‑150 (MQ=60)
GAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGG < SRR19973074.2733275/150‑1 (MQ=60)
GAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGG < SRR19973074.2733276/150‑1 (MQ=60)
GAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGG < SRR19973074.3763786/150‑1 (MQ=60)
GAGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGG < SRR19973074.3763795/150‑1 (MQ=60)
AGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGT > SRR19973074.3815655/1‑150 (MQ=60)
AGAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGT > SRR19973074.3974730/1‑150 (MQ=60)
GAGCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGTC < SRR19973074.2262750/150‑1 (MQ=60)
GCTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGATTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGTCAT < SRR19973074.1667749/150‑1 (MQ=60)
CTGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGTCATC < SRR19973074.3489883/150‑1 (MQ=60)
TGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGTCATCA > SRR19973074.1581727/1‑150 (MQ=60)
|
GGGTGAATTATCCATATGGCCCACTTGCCTGGGGAGCGCAACTTGGCTGGCAGCGAATATTAAGGCTCCTTGAAAATCTACAGCATCACTATGGCGAAGAACGCTATCGCCCATGTTCATTGCTGCGCCAACGGGCGCTTCTGGAGAGCGGTTATGAGTCATAAGGCCTGGCAAAATGCCCATGCAATGTATGAGAACGATGCCTGCGCCAAAGCGCTTGGCATCGACATTATCTCAATGGATGAAGGCTTTGCTGTAGTGACCATGACCGTCACTGCACAAATGCTTAACGGTCATCA > CP009273/1454575‑1454873
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
