Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F78 I0 R1
|
626 |
241.3 |
10389380 |
77.7% |
8072548 |
149.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
230,579 |
C→T |
100% |
E231K (GAA→AAA) |
gloB ← |
hydroxyacylglutathione hydrolase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 230,579 | 0 | C | T | 96.0%
| 680.3
/ 10.3
| 201 | E231K (GAA→AAA) | gloB | hydroxyacylglutathione hydrolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (5/3); new base T (100/91); total (107/94) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.24e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.21e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Polymorphic base substitution creates a homopolymer stretch. |
Only 100 of 204 total aligned reads displayed.
TTGCCTTCATGTGTGTGTCAATAGTTGCTTAAAAGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGATAATAATCATTTATGGACAAAT > CP009273/230433‑230725
|
cTTCATGTGTGTGTCAATAGTTGCTTAAAAGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTcatta < 2:3162017/150‑1 (MQ=255)
tCATGTGTGTGTCAATAGTTGCTTAAAAGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTcattaat < 2:3336365/150‑1 (MQ=255)
cATGTGTGTGTCAATAGTTGCTTAAAAGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTcattaatt < 1:4270961/150‑1 (MQ=255)
cATGTGTGTGTCAATAGTTGCTTAAAAGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTcattaatt < 1:3015097/150‑1 (MQ=255)
aTGTGTGTGTCAATAGTTGCTTAAAAGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTcattaatta > 1:1160006/1‑150 (MQ=255)
tgtgtgtgTCAATAGTTGCTTAAAAGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTcattaattac > 1:4999520/1‑150 (MQ=255)
tgtgtgtgTCAATAGTTGCTTAAAAGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTcattaattac < 2:4883107/150‑1 (MQ=255)
tgtgtgtCAATAGTTGCATAAAAGACGACCGAACATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAACCGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTcattaattacat > 2:3070252/1‑150 (MQ=255)
tgtgtCAATAGTTGCTTAAAAGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTcattaattacatta < 1:946796/150‑1 (MQ=255)
tgtCAATAGTTGCTTAAAAGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTcattaattacattaat > 1:5034735/1‑150 (MQ=255)
gtCAATAGTTGCTTAAAAGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTAAATTcattaattacattaatt > 1:3394040/1‑150 (MQ=255)
aaTAGTTGCTTAAAAGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTaaa > 1:697121/1‑150 (MQ=255)
aTAGTTGCTTAAAAGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAAt > 2:229049/1‑150 (MQ=255)
aTAGTTGCTTAAAAGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAAt > 2:3607050/1‑150 (MQ=255)
aGTTGCTTAAAAGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCa > 2:2732267/1‑150 (MQ=255)
ttGCTTAAAAGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCCATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAat < 1:4773024/150‑1 (MQ=255)
tGCTTAAAAGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAata < 1:268144/150‑1 (MQ=255)
cTTAAAAGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATc > 2:682239/1‑150 (MQ=255)
aaaaGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTc < 2:2892018/150‑1 (MQ=255)
aaaaGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTc < 1:1647966/150‑1 (MQ=255)
aaaGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTcc < 2:4424661/150‑1 (MQ=255)
aGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGt > 1:2212781/1‑150 (MQ=255)
aGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGt < 1:462031/150‑1 (MQ=255)
gacgacCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGtt < 1:1334923/150‑1 (MQ=255)
gacgacCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGtt < 1:4576357/150‑1 (MQ=255)
cgacCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCt < 1:1295825/150‑1 (MQ=255)
gacCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCtt > 1:321590/1‑150 (MQ=255)
gacCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCtt > 2:4477670/1‑150 (MQ=255)
cGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTaaa > 1:1923061/1‑150 (MQ=255)
cGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTaaa < 2:4210895/150‑1 (MQ=255)
gATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTaaaa > 2:3017249/1‑150 (MQ=255)
aTAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAAc < 2:379202/150‑1 (MQ=255)
aTAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAAc > 2:2843640/1‑150 (MQ=255)
aCGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACAtt < 2:2463115/150‑1 (MQ=255)
cGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTa > 1:446737/1‑150 (MQ=255)
cGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTa > 1:3404874/1‑150 (MQ=255)
cGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTa > 1:811245/1‑150 (MQ=255)
ggCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTTATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTaa < 1:3912006/150‑1 (MQ=255)
cGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAAtt < 1:1255845/150‑1 (MQ=255)
aaCGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCATAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTg < 1:3036778/150‑1 (MQ=255)
aCGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGc > 2:4096895/1‑150 (MQ=255)
aCGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGc > 2:496700/1‑150 (MQ=255)
aCGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGc < 2:3563014/150‑1 (MQ=255)
cGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGcc > 1:4593756/1‑150 (MQ=255)
gAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGc > 1:5114807/1‑150 (MQ=255)
gCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTc > 2:1390610/1‑150 (MQ=255)
ccGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCa < 2:2348108/150‑1 (MQ=255)
aTGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCATTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCAttt < 2:4346369/150‑1 (MQ=255)
gACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCAttttt > 1:35220/1‑150 (MQ=255)
cAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACAGTAATTTGCCGCTCATTTTTCa > 2:222193/1‑150 (MQ=255)
cAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCAATAATTACATTAATTAAATCAATATTTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCa < 1:2039111/150‑1 (MQ=255)
aaGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAg > 2:554885/1‑150 (MQ=255)
aaGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAg > 1:396136/1‑150 (MQ=255)
ttATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACggg > 1:4262199/1‑150 (MQ=255)
tATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGt > 1:2933428/1‑150 (MQ=255)
tATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGt < 2:4317228/150‑1 (MQ=255)
tCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTACCCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAg < 2:3465024/150‑1 (MQ=255)
tCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGATTATTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCAGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAg > 1:644205/1‑150 (MQ=255)
aGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAgtg < 1:1002285/150‑1 (MQ=255)
gAACCTATATTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATAACGGGTAgtgt > 1:1221269/1‑150 (MQ=255)
aCCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACTGGTAGTGTTa > 2:3490354/1‑150 (MQ=255)
aTCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTg > 2:2437862/1‑150 (MQ=255)
ctttctttGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGAt > 2:1581944/1‑150 (MQ=255)
tttctttGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGAtt > 1:2722449/1‑150 (MQ=255)
ctttGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGAttttt < 2:4999520/150‑1 (MQ=255)
ctttGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGAttttt < 2:4919300/150‑1 (MQ=255)
tttGACCTTAACCATGCAAGACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGAtttttt < 2:136322/150‑1 (MQ=255)
cTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGt > 1:285032/1‑150 (MQ=255)
aaCCCTGCAAAACGCTCTTCAGGTTGGTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAAc < 2:3404487/150‑1 (MQ=255)
cATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTcc > 1:2396724/1‑150 (MQ=255)
aTGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCt > 2:3779303/1‑150 (MQ=255)
aTGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCt > 2:4701849/1‑150 (MQ=255)
aTGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTGTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCt < 2:2631001/150‑1 (MQ=255)
aTGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTCAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCt < 2:323696/150‑1 (MQ=255)
tGCACAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCtt > 1:91827/1‑150 (MQ=255)
tGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCtt < 2:402693/150‑1 (MQ=255)
aaaaCGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAAc > 1:4547673/1‑150 (MQ=255)
aaaCGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACt > 1:2633046/1‑150 (MQ=255)
cGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTa < 2:4593756/150‑1 (MQ=255)
ctTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGACTTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGat > 2:2642368/1‑150 (MQ=255)
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GAACCTATATTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATAACGGGTAGTGT > SRR19973083.1227277/1‑150 (MQ=60)
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TATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTT > SRR19973083.80252/1‑150 (MQ=60)
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TATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTT < SRR19973083.28202/150‑1 (MQ=60)
TTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATT > SRR19973083.2736056/1‑150 (MQ=60)
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TGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGC < SRR19973083.1477046/150‑1 (MQ=60)
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TTTTTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGATAATAATCATTTATGGACAAAT > SRR19973083.2959323/1‑150 (MQ=60)
TTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGATAATAATCATTTATGGACAAATCGT < SRR19973083.477828/150‑1 (MQ=60)
TTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGATAATAATCATTTATGGACAAATCGT < SRR19973083.478402/150‑1 (MQ=60)
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TTGCCTTCATGTGTGTGTCAATAGTTGCTTAAAAGACGACCGATCATAACGGCGAACGGAGCCGATGACAAGAAAGTTTTATCAGAACCTATCTTTCTTTGACCTTAACCATGCAAAACGCTCTTCAGGTTGTTGCAATAATGTTTCTTCATTAATTACATTAATTAAATCAATATCTTCCGTTCTTAAAAAAACATTAATTTGCCGCTCATTTTTCAGAATTACGGGTAGTGTTATTTGATTTTTTGCCCGTAACTCCTTAACTTTACGATAATAATCATTTATGGACAAATCGT > CP009273/230433‑230728
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
