Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F368 I0 R1
|
1472 |
214.4 |
7116750 |
95.9% |
6824963 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
732,494 |
G→T |
100% |
pseudogene (214/1137 nt) |
ybfL → |
pseudogene, DDE domain transposase family;putative factor; Not classified; putative receptor protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 732,494 | 0 | G | T | 96.2%
| 769.2
/ 17.1
| 252 | pseudogene (214/1137 nt) | ybfL | pseudogene, DDE domain transposase family;putative factor; Not classified; putative receptor protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (5/5); new base T (128/114); total (133/119) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
GCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGA > CP009273/732349‑732638
|
gCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTAt < 1:2163620/148‑1 (MQ=255)
gCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTAt < 1:2299710/148‑1 (MQ=255)
gCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTAt < 2:437330/148‑1 (MQ=255)
cATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACtata < 2:2193986/148‑1 (MQ=255)
aaaTTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTa < 1:1176015/148‑1 (MQ=255)
aaTTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCactatactat > 2:2004296/1‑148 (MQ=255)
aTTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTAtt > 1:1149958/1‑148 (MQ=255)
ttGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTg > 1:2016509/1‑148 (MQ=255)
gTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGcc < 2:818752/148‑1 (MQ=255)
gTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGcc < 2:1221848/148‑1 (MQ=255)
cATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGtt > 1:2169040/1‑148 (MQ=255)
tCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGt < 1:1398190/148‑1 (MQ=255)
tactaTTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATc > 1:2498692/1‑148 (MQ=255)
taTTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCTGAGTTGTTTCCTg > 1:3271095/1‑148 (MQ=255)
ttGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTa > 1:3327484/1‑148 (MQ=255)
tGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTAt < 2:2355839/148‑1 (MQ=255)
cTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAg > 2:3205867/1‑148 (MQ=255)
tttttGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTcc > 2:1139350/1‑148 (MQ=255)
tttttGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTcc > 2:30424/1‑148 (MQ=255)
tttttGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTcc > 2:3410017/1‑148 (MQ=255)
ttttGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCt < 2:3163914/148‑1 (MQ=255)
gCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCaa > 1:647211/1‑148 (MQ=255)
gTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAAt < 2:2790999/148‑1 (MQ=255)
tATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAAttt > 2:2828709/1‑148 (MQ=255)
tATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAAttt < 2:238157/148‑1 (MQ=39)
aTTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTc > 1:2241212/1‑148 (MQ=255)
aTTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTc < 2:704316/148‑1 (MQ=255)
ttCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCAc > 1:1530626/1‑148 (MQ=255)
gTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTg < 1:2142619/148‑1 (MQ=255)
gCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCt < 1:1021258/148‑1 (MQ=255)
gTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTaa > 1:2627969/1‑148 (MQ=37)
aaGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGAt < 1:3091547/148‑1 (MQ=37)
aaGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGAt > 2:187690/1‑148 (MQ=37)
gATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGc > 2:1825071/1‑148 (MQ=37)
ataGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTg < 2:1258826/148‑1 (MQ=37)
gagGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGAtt < 2:2053613/148‑1 (MQ=38)
gagGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGAtt > 1:423805/1‑148 (MQ=38)
agGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTg < 2:1186594/148‑1 (MQ=255)
ggATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGc < 1:3505453/148‑1 (MQ=255)
aTTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCa < 2:2439876/148‑1 (MQ=255)
tttCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCAt < 2:3423359/148‑1 (MQ=255)
ttCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCAtt < 2:768093/148‑1 (MQ=255)
cGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATtca > 1:3526360/1‑148 (MQ=38)
cGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATtca > 1:1767763/1‑148 (MQ=38)
gggAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATtcatc > 1:629234/1‑148 (MQ=255)
ggAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATtcatca > 1:88763/1‑148 (MQ=39)
gAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCaa < 2:585380/148‑1 (MQ=255)
gAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCaa < 1:737882/148‑1 (MQ=255)
aaaCACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCaaa > 2:2571470/1‑148 (MQ=255)
aaaCACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCaaa < 1:1578593/148‑1 (MQ=40)
acacATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATg > 1:2239761/1‑148 (MQ=255)
acacATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCAATATACTATTGCCAGAGTTGTATCATTTATCAGTCCTGCAAAATTTCAATAGTGCTTTATTAACTGGATGCTTGATTGACATTCATCAAAtt > 1:1623458/1‑147 (MQ=14)
acaTCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGAt > 2:1072906/1‑148 (MQ=255)
acaTCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGAt > 1:1241218/1‑148 (MQ=255)
acaTCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGAt > 1:2903024/1‑148 (MQ=255)
ctcGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAg < 2:2535697/148‑1 (MQ=255)
ctcGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATCGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAg > 1:1448947/1‑148 (MQ=255)
tcGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGa < 1:499822/148‑1 (MQ=255)
tcGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGa > 2:2099773/1‑148 (MQ=255)
cGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGAc > 2:169470/1‑148 (MQ=255)
cGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGAc > 2:1934069/1‑148 (MQ=255)
aTTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGt < 1:3337109/148‑1 (MQ=255)
aTTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGt > 1:780362/1‑148 (MQ=255)
tttCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTc > 1:3395822/1‑148 (MQ=255)
ttCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCa < 2:3220235/148‑1 (MQ=255)
ttCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTAATCAAATGATAAAGACGTCa > 2:1317650/1‑148 (MQ=255)
tCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCAt > 2:774505/1‑148 (MQ=255)
tCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCAt < 1:558324/148‑1 (MQ=255)
tGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGc > 1:3020928/1‑148 (MQ=255)
aaGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCaa > 2:2101893/1‑148 (MQ=255)
aaTATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGa > 2:1608626/1‑148 (MQ=255)
aaTATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGa < 2:260796/148‑1 (MQ=255)
atatGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTACTGCAAAATTTAACTAGTTCTTTATAAAGTGTATGCGTTATTGCGATTCATAAAAAGATAAAGACTTAATTGAAATTgtt > 2:398498/1‑146 (MQ=14)
tatGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATg < 1:1139350/148‑1 (MQ=255)
tatGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATg < 1:3410017/148‑1 (MQ=255)
tatGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATg > 1:1718505/1‑148 (MQ=255)
atGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATgg > 2:2458616/1‑148 (MQ=255)
atGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATgg > 1:509303/1‑148 (MQ=255)
ggTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGaa > 1:547342/1‑148 (MQ=255)
gTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGaaa < 2:2516212/148‑1 (MQ=255)
tGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGaaaa > 1:2601840/1‑148 (MQ=255)
tGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGaaaa > 1:2723679/1‑148 (MQ=39)
gATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGTGTTTTATCCTGCATCAGTCCTGCATAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCAGTGCAATTGATGGaaaaa < 2:1530091/148‑1 (MQ=14)
gATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGaaaaa > 2:3319456/1‑148 (MQ=255)
tttGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGc > 2:1920711/1‑148 (MQ=255)
tttGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGc > 2:521549/1‑148 (MQ=255)
gAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTcc < 2:18425/148‑1 (MQ=255)
gAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTcc < 2:1149958/148‑1 (MQ=255)
tGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCAc > 2:2843272/1‑148 (MQ=255)
tGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCAc > 2:642028/1‑148 (MQ=255)
tATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCActct > 2:2484571/1‑148 (MQ=255)
aTTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCtt > 2:45090/1‑148 (MQ=255)
tCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTAt > 2:1032610/1‑148 (MQ=255)
ccTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTAtt > 2:2080599/1‑147 (MQ=255)
gTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACa < 1:187681/148‑1 (MQ=255)
gTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACa > 1:1282146/1‑148 (MQ=255)
ttCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACaa < 1:2033085/148‑1 (MQ=255)
ttCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACaa < 1:237795/148‑1 (MQ=255)
ttCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACaa > 1:869475/1‑148 (MQ=39)
tCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAag > 1:2774703/1‑148 (MQ=255)
|
GCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGA > CP009273/732349‑732638
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TAGAGCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGC > CP009273/732345‑732643
|
TAGAGCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACT < SRR19973067.1735187/150‑1 (MQ=60)
TAGAGCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACT > SRR19973067.2505578/1‑150 (MQ=60)
GAGCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTAT < SRR19973067.2882137/150‑1 (MQ=60)
GAGCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGCATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTAT < SRR19973067.2531263/150‑1 (MQ=60)
GCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATAC < SRR19973067.1633214/150‑1 (MQ=60)
GCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATAC < SRR19973067.2178085/150‑1 (MQ=60)
GCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATAC < SRR19973067.2314876/150‑1 (MQ=60)
AAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATT > SRR19973067.1157656/1‑150 (MQ=60)
AAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATT < SRR19973067.891292/150‑1 (MQ=60)
AAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATT < SRR19973067.1183796/150‑1 (MQ=60)
AATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTG > SRR19973067.2030063/1‑150 (MQ=60)
ATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGC > SRR19973067.2254196/1‑150 (MQ=60)
ATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGC > SRR19973067.2254977/1‑150 (MQ=60)
TGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCA < SRR19973067.1467275/150‑1 (MQ=60)
TCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGA > SRR19973067.52231/1‑150 (MQ=60)
CAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAG < SRR19973067.454674/150‑1 (MQ=60)
GGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTT > SRR19973067.2183543/1‑150 (MQ=60)
GCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTG < SRR19973067.3307507/150‑1 (MQ=60)
ATCCTACTATTGACTGTTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTA > SRR19973067.262573/1‑150 (MQ=57)
TCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTAT < SRR19973067.1407680/150‑1 (MQ=57)
CCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATC > SRR19973067.2515095/1‑150 (MQ=55)
CTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCC > SRR19973067.2438328/1‑150 (MQ=53)
ACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCTGAGTTGTTTCCTG > SRR19973067.3291534/1‑150 (MQ=50)
TATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTA > SRR19973067.3348533/1‑150 (MQ=55)
ATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTAT < SRR19973067.2247905/150‑1 (MQ=55)
TTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATC < SRR19973067.713454/150‑1 (MQ=55)
GACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAG < SRR19973067.575273/150‑1 (MQ=59)
CTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTC > SRR19973067.3548459/1‑150 (MQ=60)
TATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCC < SRR19973067.1033620/150‑1 (MQ=53)
TTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAA > SRR19973067.651601/1‑150 (MQ=60)
TTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAA > SRR19973067.651314/1‑150 (MQ=60)
GCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAA < SRR19973067.2160938/150‑1 (MQ=60)
CGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATT > SRR19973067.982996/1‑150 (MQ=42)
TTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTC > SRR19973067.2256113/1‑150 (MQ=42)
TTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTC > SRR19973067.2256314/1‑150 (MQ=42)
ATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCAC > SRR19973067.1540957/1‑150 (MQ=42)
ATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCAC < SRR19973067.1670930/150‑1 (MQ=60)
ATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATATCGGTGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCAATATACTATTGCCAGAGTTGTATCATGCATCAGTCCAGCAAAATTTCAC > SRR19973067.1540412/1‑150 (MQ=36)
CTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGT > SRR19973067.2170057/1‑150 (MQ=42)
TGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTG < SRR19973067.2372045/150‑1 (MQ=42)
GTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCT > SRR19973067.2826737/1‑150 (MQ=42)
GTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCT < SRR19973067.2156940/150‑1 (MQ=42)
TGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTT < SRR19973067.1582020/150‑1 (MQ=42)
TGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTT < SRR19973067.2125007/150‑1 (MQ=42)
TGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTT > SRR19973067.72868/1‑150 (MQ=42)
GCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTT < SRR19973067.1028274/150‑1 (MQ=42)
CAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTA > SRR19973067.1177077/1‑150 (MQ=42)
AAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTA > SRR19973067.792861/1‑150 (MQ=38)
AAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAA > SRR19973067.2644998/1‑150 (MQ=36)
GGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGAT > SRR19973067.3100336/1‑150 (MQ=32)
GAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATG > SRR19973067.1286737/1‑150 (MQ=32)
AAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGC < SRR19973067.3111213/150‑1 (MQ=32)
TATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGA < SRR19973067.173352/150‑1 (MQ=32)
ATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGAT > SRR19973067.3410115/1‑150 (MQ=34)
ATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGAT < SRR19973067.3065798/150‑1 (MQ=34)
ATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGAT > SRR19973067.3410173/1‑150 (MQ=34)
TAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATT < SRR19973067.2805021/150‑1 (MQ=36)
TAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATT > SRR19973067.426751/1‑150 (MQ=36)
TAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATT > SRR19973067.426261/1‑150 (MQ=36)
AGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTG < SRR19973067.3437412/150‑1 (MQ=38)
GGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCA < SRR19973067.3527663/150‑1 (MQ=42)
TTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTC < SRR19973067.1300518/150‑1 (MQ=40)
TTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCA > SRR19973067.3548664/1‑150 (MQ=40)
TTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCA > SRR19973067.1779771/1‑150 (MQ=40)
CGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATC > SRR19973067.633430/1‑150 (MQ=40)
CGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATC > SRR19973067.1423765/1‑150 (MQ=40)
GGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCA > SRR19973067.89715/1‑150 (MQ=41)
GGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAA > SRR19973067.2180754/1‑150 (MQ=44)
GAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAAT < SRR19973067.743003/150‑1 (MQ=46)
GAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAAT > SRR19973067.2042296/1‑150 (MQ=46)
GAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCATGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAAT > SRR19973067.2042201/1‑150 (MQ=45)
AAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATG > SRR19973067.2254659/1‑150 (MQ=48)
AAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATG < SRR19973067.1589400/150‑1 (MQ=50)
AAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATG < SRR19973067.1589415/150‑1 (MQ=50)
AAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCAATATACTATTGCCAGAGTTGTATCATTTATCAGTCCTGCAAAATTTCAATAGTGCTTTATTAACTGGATGCTTGATTGACATTCATCAAATT > SRR19973067.1634596/1‑150 (MQ=34)
AACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGA > SRR19973067.3427321/1‑150 (MQ=50)
ACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGAT > SRR19973067.1249570/1‑150 (MQ=53)
ACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGAT > SRR19973067.2921533/1‑150 (MQ=53)
ACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGAT > SRR19973067.3031557/1‑150 (MQ=53)
CACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATA < SRR19973067.2653324/150‑1 (MQ=53)
ATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAG > SRR19973067.1225733/1‑150 (MQ=53)
ATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATCGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAG > SRR19973067.1458659/1‑150 (MQ=51)
TCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACG < SRR19973067.503256/150‑1 (MQ=53)
TCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACG < SRR19973067.2505975/150‑1 (MQ=53)
CGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGTATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGAAGT > SRR19973067.2579658/1‑150 (MQ=50)
CGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGT > SRR19973067.785762/1‑150 (MQ=53)
GATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTC > SRR19973067.3417427/1‑150 (MQ=53)
ATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCA < SRR19973067.3358220/150‑1 (MQ=53)
ATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCA < SRR19973067.3358237/150‑1 (MQ=53)
TCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTG < SRR19973067.545918/150‑1 (MQ=46)
TCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTG < SRR19973067.561982/150‑1 (MQ=46)
TCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTG < SRR19973067.562130/150‑1 (MQ=46)
CTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGC > SRR19973067.3040162/1‑150 (MQ=44)
TGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGTCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAA > SRR19973067.2745737/1‑150 (MQ=41)
TGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAA > SRR19973067.3201469/1‑150 (MQ=42)
GAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAAT > SRR19973067.1190742/1‑150 (MQ=43)
CAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCNAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATCGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGAT < SRR19973067.1813900/150‑1 (MQ=40)
CAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCNAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATCGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGAT < SRR19973067.1813903/150‑1 (MQ=40)
AATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATG > SRR19973067.1730366/1‑150 (MQ=42)
AATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATG > SRR19973067.1730281/1‑150 (MQ=42)
ATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGG > SRR19973067.512774/1‑150 (MQ=42)
ATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGG < SRR19973067.1386458/150‑1 (MQ=42)
TATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGA < SRR19973067.1147020/150‑1 (MQ=42)
TATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGA < SRR19973067.1147045/150‑1 (MQ=42)
TATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGA < SRR19973067.1147013/150‑1 (MQ=42)
TATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGA < SRR19973067.3431726/150‑1 (MQ=42)
ATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAA > SRR19973067.550959/1‑150 (MQ=42)
ATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAA > SRR19973067.551589/1‑150 (MQ=42)
TGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTAAACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGAGTGATTGACATTCATCAAATGATAAATACGTCATATCAAATGATGGAAA > SRR19973067.292132/1‑150 (MQ=35)
GGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAA > SRR19973067.826613/1‑150 (MQ=42)
GGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAA > SRR19973067.2618759/1‑150 (MQ=42)
GGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAA > SRR19973067.2741250/1‑150 (MQ=43)
GTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAA < SRR19973067.2696197/150‑1 (MQ=42)
GATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACG < SRR19973067.486289/150‑1 (MQ=42)
GATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACG < SRR19973067.508783/150‑1 (MQ=42)
TTGAAAATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCC < SRR19973067.2304098/150‑1 (MQ=42)
AATGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCAC > SRR19973067.764937/1‑150 (MQ=42)
TGGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTC > SRR19973067.3293106/1‑150 (MQ=42)
GGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCT < SRR19973067.986202/150‑1 (MQ=42)
GGTATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCT > SRR19973067.2642066/1‑150 (MQ=42)
ATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTAT > SRR19973067.421298/1‑150 (MQ=42)
ATTCCTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTAT < SRR19973067.3522365/150‑1 (MQ=42)
CTGTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACA > SRR19973067.1290880/1‑150 (MQ=42)
TGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAA > SRR19973067.875287/1‑150 (MQ=43)
GTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAG > SRR19973067.2792627/1‑150 (MQ=42)
GTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAG < SRR19973067.189157/150‑1 (MQ=42)
GTTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAG < SRR19973067.189148/150‑1 (MQ=42)
TTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGA < SRR19973067.239466/150‑1 (MQ=42)
TTCACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGA < SRR19973067.2046707/150‑1 (MQ=42)
CACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGT > SRR19973067.3094572/1‑150 (MQ=42)
ACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTC < SRR19973067.1254974/150‑1 (MQ=42)
ACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTC > SRR19973067.1752011/1‑150 (MQ=42)
ACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTC > SRR19973067.1752059/1‑150 (MQ=42)
ACTATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTC < SRR19973067.1255027/150‑1 (MQ=42)
CGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCG > SRR19973067.3312195/1‑150 (MQ=43)
CGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCG > SRR19973067.3312205/1‑150 (MQ=43)
TATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGC > SRR19973067.2986245/1‑150 (MQ=43)
|
TAGAGCATAAATTGTCAGGCATCCTACTATTGACTATTTTTGCCGTTATTTCTGGTGCAGAAAGTTGGGAAGATATAGAGGATTTCGGGGAAACACATCTCGATTTCTTGAAGCAATATGGTGATTTTGAAAATGGTATTCCTGTTCACGATACTATTGCCAGAGTTGTATCCTGTATCAGTCCTGCAAAATTTCACGAGTGCTTTATTAACTGGATGCGTGATTGCCATTCATCAAATGATAAAGACGTCATTGCAATTGATGGAAAAACGCTCCGGCACTCTTATGACAAGAGTCGC > CP009273/732345‑732643
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |