Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F394 I0 R1
|
1342 |
215.0 |
7134094 |
96.2% |
6862998 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
291,348 |
G→A |
100% |
intergenic (‑58/+59) |
yagN ← / ← intF |
CP4‑6 prophage; uncharacterized protein/CP4‑6 prophage; putative phage integrase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 291,348 | 0 | G | A | 98.2%
| 719.0
/ 1.8
| 221 | intergenic (‑58/+59) | yagN/intF | CP4‑6 prophage; uncharacterized protein/CP4‑6 prophage; putative phage integrase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/2); new base A (103/114); total (105/116) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
ATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATGAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATACCTGCTTCATTTAAGATCCATGTCTCAATTTTCTCGTGCCATTTTCGTAACA > CP009273/291203‑291492
|
aTTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATaaa > 2:2383300/1‑148 (MQ=255)
ttGAGTTGTTTTACTTGATTTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATaaaa < 2:2478187/148‑1 (MQ=255)
ttGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATaaaa < 1:327557/148‑1 (MQ=255)
gAGTTGTTGTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAat < 1:552246/148‑1 (MQ=255)
aGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTTTAGTTGCTGTATCATTTACTAAACTGTTTATTAAGATAAATAAAAata > 1:3089140/1‑147 (MQ=255)
gttgttTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAatct < 2:229792/148‑1 (MQ=255)
gttTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAatctatc < 1:2735581/148‑1 (MQ=255)
ttttACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAatctatct > 2:3290141/1‑148 (MQ=255)
cTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATc > 1:3457917/1‑148 (MQ=255)
cTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATc > 2:260134/1‑148 (MQ=255)
cTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATc > 2:2061106/1‑148 (MQ=255)
ttGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCa < 2:1865828/148‑1 (MQ=255)
aaTTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATa > 2:1415353/1‑148 (MQ=255)
aaTTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATa > 2:366271/1‑148 (MQ=255)
aaTTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATa > 2:3188890/1‑148 (MQ=255)
aaTTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATa < 1:1289379/148‑1 (MQ=255)
aTACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTtga < 1:1663145/148‑1 (MQ=255)
aTACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTtga < 2:2420075/148‑1 (MQ=255)
acCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTgatgat < 2:475338/148‑1 (MQ=255)
acCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTgatgat < 1:3087388/148‑1 (MQ=255)
ccAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGata < 1:2449259/148‑1 (MQ=255)
ccAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGata < 2:2109813/148‑1 (MQ=255)
ccAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAAATGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGata > 1:2985741/1‑148 (MQ=255)
cAGCGAGCTCTGAGAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGatat < 1:2501041/148‑1 (MQ=255)
aGCGAGCTCGGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCAGTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATAtt < 1:3177862/148‑1 (MQ=255)
gCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATAttt < 2:1030858/148‑1 (MQ=255)
aGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGt > 2:3228176/1‑148 (MQ=255)
gCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTa < 1:2193851/148‑1 (MQ=255)
gCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTa < 1:1985793/148‑1 (MQ=255)
tctGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAat < 1:2429194/148‑1 (MQ=255)
tctGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAat < 2:1504478/148‑1 (MQ=255)
ctGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAata > 1:2192341/1‑148 (MQ=255)
ctGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAata < 1:2622225/148‑1 (MQ=255)
gATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATg > 1:2049311/1‑148 (MQ=255)
aTAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGt > 1:2386294/1‑148 (MQ=255)
aGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTg < 2:2087313/148‑1 (MQ=255)
gCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGa > 1:2292632/1‑148 (MQ=255)
ccAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGAtttt < 1:2109942/148‑1 (MQ=255)
gagTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTaa > 2:1677790/1‑148 (MQ=255)
gTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACTATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATg < 2:1987289/148‑1 (MQ=255)
tGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATgg < 2:3079484/148‑1 (MQ=255)
ggTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGaa > 1:2936294/1‑148 (MQ=255)
gTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAAt > 2:2859294/1‑148 (MQ=255)
tCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCa < 2:2795464/148‑1 (MQ=255)
tCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCa > 1:2041157/1‑148 (MQ=255)
aTGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACg > 1:796369/1‑148 (MQ=255)
gATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCat > 1:3156443/1‑148 (MQ=255)
tACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCatat < 2:3306736/148‑1 (MQ=255)
tACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCatat < 2:207103/148‑1 (MQ=255)
tACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCatat < 2:2624909/148‑1 (MQ=255)
cAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATGAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCa > 2:1620469/1‑148 (MQ=255)
cAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCa > 2:690048/1‑148 (MQ=255)
aGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCaa < 2:2645624/148‑1 (MQ=255)
gTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTTATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCAAATCAAc > 1:1068101/1‑148 (MQ=255)
tGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACgt > 2:2832653/1‑148 (MQ=255)
gCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATGAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACgtt < 1:2737501/148‑1 (MQ=255)
cTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACgttg > 2:2765490/1‑148 (MQ=255)
gTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGttttt < 1:1329168/148‑1 (MQ=255)
ttGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGtttttt < 2:1143141/148‑1 (MQ=255)
tGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTa < 2:126137/148‑1 (MQ=255)
tGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTa < 1:2399874/148‑1 (MQ=255)
cATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATgg < 2:1052698/148‑1 (MQ=255)
cATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATgg < 2:1052636/148‑1 (MQ=255)
ttGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTa > 1:2671252/1‑148 (MQ=255)
gCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATa > 2:1422623/1‑148 (MQ=255)
gCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATa > 1:1834324/1‑148 (MQ=255)
tctcCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACTATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATACCTGc > 1:3305317/1‑148 (MQ=255)
tctcCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATACCTGc < 2:3404831/148‑1 (MQ=255)
tgtgTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATACCTGCTTCAt > 1:2825730/1‑148 (MQ=255)
gtgtAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATACCTGCTTCAtt > 1:1147258/1‑148 (MQ=255)
gTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATACCTGCTTCATTTAAGa > 2:3045858/1‑148 (MQ=255)
ttGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATACCTGCTTCATTTAAGAt < 1:860730/148‑1 (MQ=255)
ttGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATACCTGCTTCATTTAAGAt > 1:3249615/1‑148 (MQ=255)
tGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATACCTGCTTCATTTAAGATc > 1:1821262/1‑148 (MQ=255)
cTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATACCTGCTTCATTTAAGATCCa > 2:1928897/1‑148 (MQ=255)
tGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATACCTGCTTCATTTAAGATCCAt > 2:2503076/1‑148 (MQ=255)
gTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATACCTGCTTCATTTAAGATCCATg > 2:1156303/1‑148 (MQ=255)
tCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATACCTGCTTCATTTAAGATCCATGtct > 2:26995/1‑148 (MQ=255)
tCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATACCTGCTTCATTTAAGATCCATGtct < 1:1425898/148‑1 (MQ=255)
cATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATACCTGCTTCATTTAATATCCATGtcta > 2:554972/1‑147 (MQ=255)
cATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATACCTGCTTCATTTAAGATCCATGtctc > 1:1368131/1‑148 (MQ=255)
aTTGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATACCTGCTTCATTTAAGATCCATGTCTCa > 1:2532329/1‑148 (MQ=255)
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tGACTAAACTGTGTATTACGATACATAAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATACCTGCTTCATTTAAGATCCATGTCTCAAt < 2:2217864/148‑1 (MQ=255)
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|
AGGATTGAGTTGTTTTACTTGAATTAATACACCAGCGAGCTCTGATAGCTGCCAGAGTGGGTTCTATGGATACAGTTGCTGGGGTTGCCATTGGCTTATCTCCTGTGTAGTTGCTGTATCATTGACTAAACTGTGTATTACGATACATGAAAATCTATCTTGATCAATAGTTGATGATATTTTGTAATATGTTGATTTTTAATGGAATCAACGCATATCAACGTTGTTTTTTATGGTAATACCTGCTTCATTTAAGATCCATGTCTCAATTTTCTCGTGCCATTTTCGTAACAGATCT > CP009273/291200‑291497
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
