Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F394 I0 R1
|
1342 |
215.0 |
7134094 |
96.2% |
6862998 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,318,829 |
G→T |
40.3% |
E159* (GAA→TAA) |
yciO → |
putative RNA binding protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,318,829 | 0 | G | T | 40.3%
| 262.6
/ 239.7
| 233 | E159* (GAA→TAA) | yciO | putative RNA binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (57/82); new base T (43/51); total (100/133) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.02e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
TCTGTTGCAGGAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAGGCGTAGGTGATGTGAAGCCTTTCTTATAAC > CP009273/1318684‑1318976
|
tCTGTTGCAGGAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGgaataa > 1:1435940/1‑148 (MQ=255)
tCTGTTGCAGGAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGgaataa > 2:2340020/1‑148 (MQ=255)
tCTGTTGCAGGAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGgaagaa < 2:2635691/148‑1 (MQ=255)
cTGTTGCAGGAAAAACGTAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGaaa > 2:2382619/1‑148 (MQ=255)
tGTTGCAGGAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAAt < 1:341814/148‑1 (MQ=255)
gTTGCAGGAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAAtt > 1:2213196/1‑148 (MQ=255)
ggAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGAt < 1:1549238/148‑1 (MQ=255)
ggAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGAt < 1:2345673/148‑1 (MQ=255)
ggAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGAt < 2:2055527/148‑1 (MQ=255)
gAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATc > 2:2977624/1‑148 (MQ=255)
aaaaaCGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCg > 1:1720546/1‑148 (MQ=255)
aaaaaCGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCg > 2:2553836/1‑148 (MQ=255)
aaaaaCGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCg < 2:1043879/148‑1 (MQ=255)
aaaaCGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGt > 2:811092/1‑148 (MQ=255)
aaaaCGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGt < 1:2911012/148‑1 (MQ=255)
aaaCGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGTGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTc < 2:1514559/148‑1 (MQ=255)
aaaCGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTc > 1:2022183/1‑148 (MQ=255)
aaaCGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTc < 2:3095860/148‑1 (MQ=255)
cGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTgg < 2:3239924/148‑1 (MQ=255)
cAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGaa > 2:1635224/1‑148 (MQ=255)
cAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGaa > 2:829978/1‑148 (MQ=255)
aCCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGACTAAATTAAAGATCGTCTGGaacaac > 2:1813822/1‑148 (MQ=255)
aCCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGATTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAAc > 1:2306292/1‑148 (MQ=255)
ccATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACa < 1:2619382/148‑1 (MQ=255)
tATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGAt < 1:3286972/148‑1 (MQ=255)
aTGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGAtt < 2:2000431/148‑1 (MQ=255)
cGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGa < 1:1450257/148‑1 (MQ=255)
cGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGa < 1:2789842/148‑1 (MQ=255)
gtgtGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGat < 1:427489/148‑1 (MQ=255)
gtgtGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGat < 2:1338485/148‑1 (MQ=255)
tgtgCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGatt > 2:2815341/1‑148 (MQ=255)
gtgCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGatta > 1:2415196/1‑148 (MQ=255)
gCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGattatt < 1:862901/148‑1 (MQ=255)
ccTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTc < 2:2509413/148‑1 (MQ=255)
ccTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTc < 2:1894027/148‑1 (MQ=255)
ccTTCTAACCCGATTGCGCAAGCGTTGCTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGGTTTTGGTGGGGGGCTGGGGGGGTTGGGTATCCGATCCGGAAGAACTTAAAGACCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGtttattg > 2:3397362/1‑147 (MQ=255)
cTTCTAACCCTATCGCTCTGGCGTTACTGTAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCTGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGATAAACAGGTAGATTTGATTATTCa < 1:1149867/148‑1 (MQ=255)
cTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCa < 2:1671422/148‑1 (MQ=255)
ttCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCAc > 2:1865473/1‑148 (MQ=255)
aaCCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTTGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCAcggcg < 2:2787057/148‑1 (MQ=255)
ccTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCt < 2:2995708/148‑1 (MQ=255)
cTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTa > 1:2818890/1‑148 (MQ=255)
cTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTa > 1:213056/1‑148 (MQ=255)
tATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTAt > 2:934432/1‑148 (MQ=255)
tCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTAtct < 1:1687163/148‑1 (MQ=255)
tCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTAtct < 1:2070415/148‑1 (MQ=255)
tCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTAtct > 1:781801/1‑148 (MQ=255)
cGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTAtctc > 1:2776095/1‑148 (MQ=255)
cTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGa > 1:3266106/1‑148 (MQ=255)
ttGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGAc > 2:2456924/1‑148 (MQ=255)
aaGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAAc > 2:192820/1‑148 (MQ=255)
aaGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAAc > 2:1283700/1‑148 (MQ=255)
aGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACg > 1:2683222/1‑148 (MQ=255)
aTTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGtt > 2:6839/1‑148 (MQ=255)
ttGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTa < 1:2980880/148‑1 (MQ=255)
tGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATCAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTAt < 2:1506680/148‑1 (MQ=255)
gCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGa < 1:1880590/148‑1 (MQ=255)
aaCCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCt < 2:2781343/148‑1 (MQ=255)
aCCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCtt > 1:1591654/1‑148 (MQ=255)
cGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTCTCTCGGGCAGAAAACGACAACGGATATTGATCTTAc > 2:1963404/1‑148 (MQ=255)
cGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTAc < 1:1813060/148‑1 (MQ=255)
aTGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCg > 1:375514/1‑148 (MQ=255)
gCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCgat > 1:2090539/1‑148 (MQ=255)
gCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCgat < 1:2181734/148‑1 (MQ=255)
cTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCTACAACGGTTATTGATCTTACCgatg < 1:3202146/148‑1 (MQ=255)
cTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCgatg < 1:1134473/148‑1 (MQ=255)
ttCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCgatgat < 1:718082/148‑1 (MQ=255)
tCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATa > 2:2417804/1‑148 (MQ=255)
tCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATa < 2:395765/148‑1 (MQ=255)
tCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATa > 1:761241/1‑148 (MQ=255)
cTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGcc > 1:25663/1‑148 (MQ=255)
cGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGt > 1:53565/1‑148 (MQ=255)
tAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCgt > 1:3367951/1‑148 (MQ=255)
tAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCgt > 1:580049/1‑148 (MQ=255)
aTGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCgtgg > 2:2712196/1‑148 (MQ=255)
tgctgcCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCgtggt > 1:1761627/1‑148 (MQ=255)
gctgcCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTCAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCgtggtg > 1:1826450/1‑148 (MQ=255)
gcCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGt < 1:1258356/148‑1 (MQ=255)
gcCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGt < 2:3192052/148‑1 (MQ=255)
aGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGaa < 1:309183/148‑1 (MQ=255)
ggCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAg > 2:3333363/1‑148 (MQ=255)
aGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAGGCg < 1:1635224/148‑1 (MQ=255)
aGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAGGCg < 1:1971762/148‑1 (MQ=255)
aGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAGGCg < 1:829978/148‑1 (MQ=255)
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ggAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTAAAGGCGTAGGTGATGTGAAGCCTTTCTta > 2:212623/1‑148 (MQ=255)
agaaATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAGGCGTAGGTGATGTGAAGCCTTTCTTATaa > 2:2238705/1‑148 (MQ=255)
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TCTGTTGCAGGAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAGGCGTAGGTGATGTGAAGCCTTTCTTATAAC > CP009273/1318684‑1318976
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
