Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,318,829 |
G→T |
100% |
E159* (GAA→TAA) |
yciO → |
putative RNA binding protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,318,829 | 0 | G | T | 96.8%
| 715.2
/ 11.3
| 234 | E159* (GAA→TAA) | yciO | putative RNA binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/5); new base T (112/114); total (115/119) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.22e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
TCTGTTGCAGGAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAGGCGTAGGTGATGTGAAGCCTTTCTTAT > CP009273/1318684‑1318973
|
tCTGTTGCAGGAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGgaataa < 1:2995670/148‑1 (MQ=255)
tCTGTTGCAGGAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGgaagaa > 1:116129/1‑148 (MQ=255)
tCTGTTGCAGGAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGATGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGgaataa > 2:2979751/1‑148 (MQ=255)
cTGTTGCAGGAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATaaa > 1:2216151/1‑148 (MQ=255)
cTGTTGCAGGAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATaaa < 2:277841/148‑1 (MQ=255)
cTGTTGCAGGAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATaaa < 1:909553/148‑1 (MQ=255)
cTGTTGCAGGAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATaaa < 2:79154/148‑1 (MQ=255)
cAGGAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAg < 2:1789934/148‑1 (MQ=255)
ggAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGAt < 1:2615041/148‑1 (MQ=255)
ggAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGAt > 2:2497870/1‑148 (MQ=255)
gAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATc > 2:206293/1‑148 (MQ=255)
aaaaCGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGt < 2:3086090/148‑1 (MQ=255)
aaaCGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTc > 1:2928484/1‑148 (MQ=255)
aaCGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCt > 2:829015/1‑148 (MQ=255)
aaCGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCt < 2:1474175/148‑1 (MQ=255)
aCGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTg > 1:3252856/1‑148 (MQ=255)
aaCCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGaaaaa > 1:320022/1‑148 (MQ=255)
ccATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGACTAAATTAAAGATCGTCTGGAacaaca > 2:2090371/1‑148 (MQ=255)
ccATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAAACCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACa < 1:2066869/148‑1 (MQ=255)
aTCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGaaaaa < 2:2086462/144‑1 (MQ=255)
aTCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGaaaaa > 1:2086764/1‑144 (MQ=255)
aTCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGAACGTCTGGAAAAACAgg > 2:178486/1‑148 (MQ=255)
gTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGa > 1:3480361/1‑148 (MQ=255)
gTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGa > 1:1491953/1‑148 (MQ=255)
tATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGAt > 2:2766248/1‑148 (MQ=255)
tGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGAttt > 1:2243609/1‑148 (MQ=255)
tGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGAttt < 1:1746533/148‑1 (MQ=255)
gCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTg > 2:2752020/1‑148 (MQ=255)
gCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTg > 1:1440752/1‑148 (MQ=255)
cGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGa < 1:2766248/148‑1 (MQ=255)
tgCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGattat < 2:2050895/148‑1 (MQ=255)
gCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGattatt < 2:1569922/148‑1 (MQ=255)
cTTCTAACCCTATATCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCAGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCa < 2:1374085/148‑1 (MQ=255)
ttCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCAc > 1:3210162/1‑148 (MQ=255)
tCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCAcg > 2:3301588/1‑148 (MQ=255)
cTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCAcgg < 2:2274779/148‑1 (MQ=255)
cTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCAcgg < 2:513882/148‑1 (MQ=255)
aCCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCAcggcgg < 2:1645105/148‑1 (MQ=255)
aCCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCAcggcgg < 1:1154073/148‑1 (MQ=255)
aCCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCAcggcgg < 1:311670/148‑1 (MQ=255)
tATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTAt > 2:3193730/1‑148 (MQ=255)
tATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTAt < 2:822208/148‑1 (MQ=255)
aTCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTAtc < 1:2350512/148‑1 (MQ=255)
cGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTAtctc > 1:2472404/1‑148 (MQ=255)
tCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCggg < 1:1339059/148‑1 (MQ=255)
cAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGc < 2:2141294/148‑1 (MQ=255)
cAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGc < 1:708233/148‑1 (MQ=255)
aGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCa > 2:663295/1‑148 (MQ=255)
gCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGa > 1:2220215/1‑148 (MQ=255)
ttACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAAc > 2:1936617/1‑148 (MQ=255)
ttGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGAc < 1:1359513/148‑1 (MQ=255)
cATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGt > 1:577673/1‑148 (MQ=255)
gAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATc < 2:3322901/148‑1 (MQ=255)
aCCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCtt < 1:350274/148‑1 (MQ=255)
ccGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTa > 2:564304/1‑148 (MQ=255)
ccGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTa > 1:2854267/1‑148 (MQ=255)
ccGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTa > 1:2012135/1‑148 (MQ=255)
gATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTAcc > 2:353983/1‑148 (MQ=255)
tttCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCgatga > 2:1073449/1‑148 (MQ=255)
tttCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCgatga > 1:121302/1‑148 (MQ=255)
tttCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCgatga > 1:121191/1‑148 (MQ=255)
tCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGATTAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGTGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATa < 2:2730174/148‑1 (MQ=255)
cACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGGTATTGATCTTACCGATGATACg > 1:2140217/1‑148 (MQ=255)
aCTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGc < 1:537586/148‑1 (MQ=255)
ttCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCg > 2:705077/1‑148 (MQ=255)
ttCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCg > 1:1032086/1‑148 (MQ=255)
cGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGt < 1:1419810/148‑1 (MQ=255)
cTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCg > 1:2700837/1‑148 (MQ=255)
tAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCgt < 2:2339626/148‑1 (MQ=255)
aaTGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCgtg < 2:785192/148‑1 (MQ=255)
gctgcCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCgtggtg > 1:988811/1‑148 (MQ=255)
gctgcCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCgtggtg < 2:1199864/148‑1 (MQ=255)
gctgcCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCgtggtg > 1:1573686/1‑148 (MQ=255)
gctgcCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCCATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCgtggtg > 1:1573425/1‑148 (MQ=255)
gcCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGt > 2:232220/1‑148 (MQ=255)
gcCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGt > 2:1413795/1‑148 (MQ=255)
cAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGa < 2:714387/148‑1 (MQ=255)
aGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGaa > 1:2749395/1‑148 (MQ=255)
ggCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAg < 2:2366622/148‑1 (MQ=255)
ggCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAg > 2:3226656/1‑148 (MQ=255)
gCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAgg > 2:3301781/1‑148 (MQ=255)
cGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTAGTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAGGGCGTa > 1:1861259/1‑148 (MQ=255)
aaTTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAGGCGTAgg < 1:612385/148‑1 (MQ=255)
aTTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAGGCGTAGGt > 2:1706123/1‑148 (MQ=255)
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AACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTA > SRR19973065.2025112/1‑150 (MQ=60)
AACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTA > SRR19973065.2871811/1‑150 (MQ=60)
ACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTAC < SRR19973065.352726/150‑1 (MQ=60)
GATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGA > SRR19973065.1946265/1‑150 (MQ=60)
ATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGAT < SRR19973065.2350498/150‑1 (MQ=60)
ATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGAT > SRR19973065.1202924/1‑150 (MQ=60)
ATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGAT < SRR19973065.2041097/150‑1 (MQ=60)
GCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGA > SRR19973065.122251/1‑150 (MQ=60)
GCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGA > SRR19973065.122298/1‑150 (MQ=60)
GCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGA > SRR19973065.122362/1‑150 (MQ=60)
TCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGGTATTGATCTTACCGATGATACG > SRR19973065.2153978/1‑150 (MQ=60)
ACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCG > SRR19973065.1038918/1‑150 (MQ=60)
ACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCG < SRR19973065.541085/150‑1 (MQ=60)
ACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCG > SRR19973065.2610137/1‑150 (MQ=60)
CTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGG > SRR19973065.1471976/1‑150 (MQ=60)
CGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCG < SRR19973065.1429096/150‑1 (MQ=60)
CGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCG < SRR19973065.1429077/150‑1 (MQ=60)
CGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCG > SRR19973065.2717617/1‑150 (MQ=60)
CGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCG < SRR19973065.3185161/150‑1 (MQ=60)
CGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCG > SRR19973065.1083208/1‑150 (MQ=60)
GCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGT > SRR19973065.9048/1‑150 (MQ=60)
ATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTG > SRR19973065.995379/1‑150 (MQ=60)
ATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTG < SRR19973065.3220336/150‑1 (MQ=60)
ATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTG > SRR19973065.1584136/1‑150 (MQ=60)
ATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTG > SRR19973065.1584162/1‑150 (MQ=60)
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GCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCG < SRR19973065.2497274/150‑1 (MQ=60)
GCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGA < SRR19973065.2782795/150‑1 (MQ=60)
GCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGA < SRR19973065.2485721/150‑1 (MQ=60)
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CCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAA > SRR19973065.2766506/1‑150 (MQ=60)
AGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAGG < SRR19973065.2964163/150‑1 (MQ=60)
CAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAGGCGT > SRR19973065.1638680/1‑150 (MQ=60)
CAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGAACGTCTGGAAATACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAAACGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAGGCGT > SRR19973065.332183/1‑150 (MQ=60)
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GAATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAGGCGTAGGT > SRR19973065.1444278/1‑150 (MQ=60)
AATTTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAGGCGTAGGTG < SRR19973065.616294/150‑1 (MQ=60)
TTACCGAATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAGGCGTAGGTGATG > SRR19973065.2747526/1‑150 (MQ=60)
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AATCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAGGCGTAGGTGATGTGAAGC > SRR19973065.811369/1‑150 (MQ=60)
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TCGGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAGGCGTAGGTGATGTGAAGCCT < SRR19973065.3321696/150‑1 (MQ=60)
GGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAGGCGTAGGTGATGTGAAGCCTTT < SRR19973065.2600163/150‑1 (MQ=60)
GGACCCGGAATAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAGGCGTAGGTGATGTGAAGCCTTT < SRR19973065.2599874/150‑1 (MQ=60)
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GCCGTCTGTTGCAGGAAAAACGCAAAACCATCGGTATGCGTGTGCCTTCTAACCCTATCGCTCAGGCGTTACTTGAAGCATTGGGCGAACCGATGCTTTCCACTTCGCTAATGCTGCCAGGCAGCGAATTTACCGAATCGGACCCGGAAGAAATTAAAGATCGTCTGGAAAAACAGGTAGATTTGATTATTCACGGCGGCTATCTCGGGCAGAAACCGACAACGGTTATTGATCTTACCGATGATACGCCGGTCGTGGTGCGTGAAGGCGTAGGTGATGTGAAGCCTTT > CP009273/1318680‑1318968
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |