Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F142 I0 R1
|
859 |
274.6 |
8723680 |
96.4% |
8409627 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
RA |
CP009273 |
2,264,143 |
G→A |
90.5% |
intergenic (+119/‑62) |
mepS → / → rtn |
murein DD‑endopeptidase, space‑maker hydrolase, mutational suppressor of prc thermosensitivity, outer membrane lipoprotein/resistance protein for phages lambda and N4, putative membrane‑anchored cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | CP009273 | 2,264,143 | 0 | G | A | 90.5%
| 737.9
/ 53.9
| 232 | intergenic (+119/‑62) | mepS/rtn | murein DD‑endopeptidase, space‑maker hydrolase, mutational suppressor of prc thermosensitivity, outer membrane lipoprotein/resistance protein for phages lambda and N4, putative membrane‑anchored cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (10/12); new base A (102/108); total (112/120) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.26e-01 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
AAGCACGCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGTGAGTTGCC > CP009273/2263996‑2264292
|
aaGCACGCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACt < 2:1024169/150‑1 (MQ=255)
aGCACGCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACta > 1:1888446/1‑150 (MQ=255)
gCACGCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACtat < 1:799170/150‑1 (MQ=255)
gCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTc < 1:3171745/150‑1 (MQ=255)
gCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTc < 2:914513/150‑1 (MQ=255)
gggTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCgg > 1:1852983/1‑150 (MQ=255)
ttCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCa > 1:2685337/1‑150 (MQ=255)
ctcAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCAtt < 2:773331/150‑1 (MQ=255)
tcAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTg < 2:2589883/150‑1 (MQ=255)
gCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTa < 2:1179421/150‑1 (MQ=255)
ccGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTAt < 2:921117/150‑1 (MQ=255)
gCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCt < 1:2268029/150‑1 (MQ=255)
cAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCtt < 1:2556812/150‑1 (MQ=255)
cTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTa > 1:67595/1‑150 (MQ=255)
taataaACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTaa > 1:3767144/1‑150 (MQ=255)
aataaACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTaaa < 2:193231/150‑1 (MQ=255)
ataaACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAAt < 2:305224/150‑1 (MQ=255)
ataaACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAAt < 1:3282528/150‑1 (MQ=255)
taaACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAAtg < 2:1141846/150‑1 (MQ=255)
taaACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAAtg < 1:3096859/150‑1 (MQ=255)
taaACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGATAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCAAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAAtg > 2:2543725/1‑150 (MQ=255)
cGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAAtgttgtg > 2:3386554/1‑149 (MQ=255)
tttGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGt < 1:244721/150‑1 (MQ=255)
tGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTaa > 1:2768884/1‑150 (MQ=255)
gCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCa < 1:556225/150‑1 (MQ=255)
aaTCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAgg > 1:486376/1‑150 (MQ=255)
aaTCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAgg > 1:1259400/1‑150 (MQ=255)
cTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAAtt > 1:4252048/1‑150 (MQ=255)
gCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACg > 2:1640416/1‑150 (MQ=255)
gCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACg > 1:437883/1‑150 (MQ=255)
cTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAActg > 2:1281650/1‑148 (MQ=255)
cTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACgg < 1:3719520/150‑1 (MQ=255)
tATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGa > 2:1845835/1‑150 (MQ=255)
tATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGa > 2:861763/1‑150 (MQ=255)
tATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGa < 2:3812061/150‑1 (MQ=255)
tATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGa > 2:863596/1‑150 (MQ=255)
tATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTGTCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTCCGGTCAGTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGa > 2:3602610/1‑150 (MQ=255)
ccTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATc > 2:2348240/1‑150 (MQ=255)
aCGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGt < 2:2663994/150‑1 (MQ=255)
cGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGtt < 1:1821964/150‑1 (MQ=255)
cGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGtt > 2:4081877/1‑150 (MQ=255)
cGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATATTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGtt < 1:1820175/150‑1 (MQ=255)
aGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATACAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCa < 2:3340343/150‑1 (MQ=255)
ttAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATa > 1:2993718/1‑150 (MQ=255)
aaCTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATAcg < 2:19705/150‑1 (MQ=255)
cTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATAcgcg > 1:2978510/1‑150 (MQ=255)
tGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGACTCATGTTCATACgcgc > 1:3418560/1‑150 (MQ=255)
gAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCt > 2:629460/1‑150 (MQ=255)
aaGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTcc < 2:2540586/150‑1 (MQ=255)
gCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGACAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCa < 1:1021445/150‑1 (MQ=255)
cACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGATTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATTTTGTCGTAATTACAGGAAATTAAAGGAATCATGTTAATACGCGCTCCCaa > 2:152584/1‑150 (MQ=255)
tGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAAttt > 2:2054372/1‑150 (MQ=255)
gCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAAtttt > 2:3723883/1‑150 (MQ=255)
ttAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTgg > 1:137568/1‑150 (MQ=255)
aGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGAc < 1:4056721/150‑1 (MQ=255)
ggCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACg > 2:3659712/1‑150 (MQ=255)
cAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTa > 1:813814/1‑150 (MQ=255)
aGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTaa < 1:1779654/150‑1 (MQ=255)
gTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAg < 1:3138954/150‑1 (MQ=255)
tGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGc > 2:314052/1‑150 (MQ=255)
tttttGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCt < 2:3972999/150‑1 (MQ=255)
tttttGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCt < 2:3514623/150‑1 (MQ=255)
tttGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGc > 2:2801005/1‑150 (MQ=255)
tttGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGc > 2:226064/1‑150 (MQ=255)
ttGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCt < 1:3960996/150‑1 (MQ=255)
tGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCtt > 2:2620712/1‑150 (MQ=255)
tGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCtt > 2:446112/1‑150 (MQ=255)
gTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTa > 1:3008923/1‑150 (MQ=255)
gTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTa > 1:2092677/1‑150 (MQ=255)
ttttCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTAc < 1:1341588/150‑1 (MQ=255)
ttttCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTAc < 2:3169372/150‑1 (MQ=255)
ttcatCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCAt < 2:723362/150‑1 (MQ=255)
tcatcaGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCAtt > 1:667124/1‑150 (MQ=255)
caGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCAttgttg > 2:2109099/1‑150 (MQ=255)
gagaAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCa > 1:75524/1‑150 (MQ=255)
agaAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAg > 1:3791044/1‑150 (MQ=255)
aaaaTGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGc > 1:248500/1‑150 (MQ=255)
aaaTGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCATTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCg < 1:1481675/150‑1 (MQ=255)
gatgTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAAt > 2:2115093/1‑150 (MQ=255)
tgTTTCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGa < 2:933379/150‑1 (MQ=255)
tgTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGa > 1:1557131/1‑150 (MQ=255)
tgTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGa > 1:1556790/1‑150 (MQ=255)
ttCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTg < 2:1096774/150‑1 (MQ=255)
tCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCGCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGc < 2:2337209/150‑1 (MQ=255)
cgcgTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGa < 1:244391/150‑1 (MQ=255)
cgTCTTGATCCGGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATa < 1:2784/150‑1 (MQ=255)
cgTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATa < 1:160437/150‑1 (MQ=255)
gTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATAc > 1:2175591/1‑150 (MQ=255)
tCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACt > 2:3404331/1‑150 (MQ=255)
cTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTg > 1:3368369/1‑150 (MQ=255)
ttGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTgg < 1:2624119/150‑1 (MQ=255)
tGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGt > 1:4158349/1‑150 (MQ=255)
aTCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCTGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGTGa > 1:2876715/1‑150 (MQ=255)
aTCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGTGa < 2:455965/150‑1 (MQ=255)
aTCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGTGa < 1:870942/150‑1 (MQ=255)
tCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGTGAg < 2:4239335/150‑1 (MQ=255)
tCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGTGAg > 2:4262909/1‑150 (MQ=255)
tCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGTGAg > 2:4321393/1‑150 (MQ=255)
tCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGTGAg > 2:4322016/1‑150 (MQ=255)
ccAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGTGAGt < 2:2302590/150‑1 (MQ=255)
|
AAGCACGCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGTGAGTTGCC > CP009273/2263996‑2264292
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CGAAGCACGCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGTGAGTTGCC > CP009273/2263994‑2264292
|
CGAAGCACGCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGA < SRR19973079.3208701/150‑1 (MQ=60)
CGAAGCACGCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGA > SRR19973079.758595/1‑150 (MQ=60)
AGCACGCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTA > SRR19973079.1898504/1‑150 (MQ=60)
GCACGCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTAT < SRR19973079.803720/150‑1 (MQ=60)
CGCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGT < SRR19973079.4216040/150‑1 (MQ=60)
GCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTC < SRR19973079.29754/150‑1 (MQ=60)
GCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTC < SRR19973079.3187985/150‑1 (MQ=60)
GGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTCCGG < SRR19973079.2041365/150‑1 (MQ=60)
GGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGG > SRR19973079.1862786/1‑150 (MQ=60)
TTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCA > SRR19973079.2699246/1‑150 (MQ=60)
CAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGT < SRR19973079.1543719/150‑1 (MQ=60)
AGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGGAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTT < SRR19973079.140937/150‑1 (MQ=60)
AGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTT > SRR19973079.4260789/1‑150 (MQ=60)
AGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTT < SRR19973079.301121/150‑1 (MQ=60)
GCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCT < SRR19973079.2279803/150‑1 (MQ=60)
CAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTT < SRR19973079.2569793/150‑1 (MQ=60)
CAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTT < SRR19973079.2569790/150‑1 (MQ=60)
CAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTT > SRR19973079.3504513/1‑150 (MQ=60)
CTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTA < SRR19973079.159972/150‑1 (MQ=60)
CTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTA > SRR19973079.68248/1‑150 (MQ=60)
TAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAA > SRR19973079.3786449/1‑150 (MQ=60)
TAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAA > SRR19973079.3786355/1‑150 (MQ=60)
ATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAAT < SRR19973079.3299187/150‑1 (MQ=60)
TAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATG < SRR19973079.3112857/150‑1 (MQ=60)
AAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGT < SRR19973079.1946198/150‑1 (MQ=60)
AAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGT < SRR19973079.32286/150‑1 (MQ=60)
AAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGT < SRR19973079.32811/150‑1 (MQ=60)
AACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTT > SRR19973079.1830173/1‑150 (MQ=60)
AACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTT > SRR19973079.1830126/1‑150 (MQ=60)
CCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGT > SRR19973079.723383/1‑150 (MQ=60)
CGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTC > SRR19973079.458708/1‑150 (MQ=60)
GTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCG > SRR19973079.1405720/1‑150 (MQ=60)
GTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCG < SRR19973079.847414/150‑1 (MQ=60)
TTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGT < SRR19973079.246340/150‑1 (MQ=60)
TGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAA > SRR19973079.2783125/1‑150 (MQ=60)
TGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAA > SRR19973079.2783219/1‑150 (MQ=60)
TGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAA > SRR19973079.2783118/1‑150 (MQ=60)
GCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCA < SRR19973079.559545/150‑1 (MQ=60)
GCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCA < SRR19973079.4287601/150‑1 (MQ=60)
AATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGG > SRR19973079.1266611/1‑150 (MQ=60)
AATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGG > SRR19973079.489333/1‑150 (MQ=60)
AATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGG < SRR19973079.2633746/150‑1 (MQ=60)
ATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGA < SRR19973079.3590379/150‑1 (MQ=60)
CCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAA < SRR19973079.1608260/150‑1 (MQ=60)
CTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATT > SRR19973079.4273560/1‑150 (MQ=60)
GCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACG > SRR19973079.440506/1‑150 (MQ=60)
CTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGG < SRR19973079.3738559/150‑1 (MQ=60)
TGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCAT < SRR19973079.616263/150‑1 (MQ=60)
CGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTT < SRR19973079.1831490/150‑1 (MQ=60)
CGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTT < SRR19973079.4171937/150‑1 (MQ=60)
CGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTT < SRR19973079.225097/150‑1 (MQ=60)
CGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTT > SRR19973079.903670/1‑150 (MQ=60)
CGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATATTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTT < SRR19973079.1829687/150‑1 (MQ=60)
TTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATA > SRR19973079.3009170/1‑150 (MQ=60)
TAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATAC > SRR19973079.2103611/1‑150 (MQ=60)
CTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCG > SRR19973079.2993836/1‑150 (MQ=60)
TGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGACTCATGTTCATACGCGC > SRR19973079.3436212/1‑150 (MQ=60)
AGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCC > SRR19973079.760047/1‑150 (MQ=60)
GCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGACAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCA < SRR19973079.1027154/150‑1 (MQ=60)
CACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACTGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAA > SRR19973079.4039330/1‑150 (MQ=60)
TGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTT < SRR19973079.3013108/150‑1 (MQ=60)
TTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGG > SRR19973079.138663/1‑150 (MQ=60)
AGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGAC < SRR19973079.2401409/150‑1 (MQ=60)
AGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGAC < SRR19973079.2401399/150‑1 (MQ=60)
AGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGAC < SRR19973079.4077259/150‑1 (MQ=60)
CAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTA > SRR19973079.818485/1‑150 (MQ=60)
CAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTA > SRR19973079.1316967/1‑150 (MQ=60)
CAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTA > SRR19973079.818473/1‑150 (MQ=60)
AGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAA < SRR19973079.1789680/150‑1 (MQ=60)
AGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAA < SRR19973079.1788973/150‑1 (MQ=60)
AGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAA > SRR19973079.539085/1‑150 (MQ=60)
AGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAA > SRR19973079.539088/1‑150 (MQ=60)
GTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAG < SRR19973079.3155100/150‑1 (MQ=60)
GTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAG < SRR19973079.3155099/150‑1 (MQ=60)
GTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAG < SRR19973079.3154923/150‑1 (MQ=60)
TTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTG > SRR19973079.3299568/1‑150 (MQ=60)
TTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCT > SRR19973079.2927826/1‑150 (MQ=60)
TTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCT < SRR19973079.3980937/150‑1 (MQ=60)
TTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCT > SRR19973079.2564922/1‑150 (MQ=60)
GTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTA > SRR19973079.3024483/1‑150 (MQ=60)
GTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTA > SRR19973079.2103572/1‑150 (MQ=60)
GTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTA > SRR19973079.3024463/1‑150 (MQ=60)
TTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTAC < SRR19973079.1349108/150‑1 (MQ=60)
TTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTAC < SRR19973079.1349456/150‑1 (MQ=60)
TTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACTCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGATCCTGCTTACCT > SRR19973079.3423913/1‑150 (MQ=60)
TTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCT < SRR19973079.1882316/150‑1 (MQ=60)
TTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCT > SRR19973079.1218695/1‑150 (MQ=60)
TCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCAGAGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGATGTCGTAATTTAAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATAAGCTCTCCCAATTTTGGACGTAAGATCCTGCTTACCAG > SRR19973079.2776630/1‑150 (MQ=60)
TCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATT > SRR19973079.671824/1‑150 (MQ=60)
TCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATT > SRR19973079.670840/1‑150 (MQ=60)
GAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCA > SRR19973079.846833/1‑150 (MQ=60)
GAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCA > SRR19973079.76235/1‑150 (MQ=60)
AGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAG > SRR19973079.3810454/1‑150 (MQ=60)
AGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAG > SRR19973079.3810426/1‑150 (MQ=60)
AAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGC > SRR19973079.250129/1‑150 (MQ=60)
AAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCATTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCG < SRR19973079.1489778/150‑1 (MQ=60)
AATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGT < SRR19973079.754249/150‑1 (MQ=60)
TGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGA > SRR19973079.1565728/1‑150 (MQ=60)
TGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGA > SRR19973079.1565385/1‑150 (MQ=60)
TGTTTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGA > SRR19973079.1565405/1‑150 (MQ=60)
TTCCGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTG < SRR19973079.3040805/150‑1 (MQ=60)
CGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGA < SRR19973079.246014/150‑1 (MQ=60)
CGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGA < SRR19973079.246010/150‑1 (MQ=60)
CGCGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGA < SRR19973079.247586/150‑1 (MQ=60)
CGTCTTGATCCGGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATA < SRR19973079.2823/150‑1 (MQ=60)
CGTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATA < SRR19973079.161673/150‑1 (MQ=60)
GTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATAC > SRR19973079.1752453/1‑150 (MQ=60)
GTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATAC > SRR19973079.3950817/1‑150 (MQ=60)
GTCTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATAC > SRR19973079.2186696/1‑150 (MQ=60)
CTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTG > SRR19973079.395111/1‑150 (MQ=60)
CTTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTG > SRR19973079.3385707/1‑150 (MQ=60)
TTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGG < SRR19973079.2637687/150‑1 (MQ=60)
TTGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGG < SRR19973079.2637674/150‑1 (MQ=60)
TGATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGT > SRR19973079.4179459/1‑150 (MQ=60)
ATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCTGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGTGA > SRR19973079.2891282/1‑150 (MQ=60)
ATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGTGA > SRR19973079.2890233/1‑150 (MQ=60)
ATCCAGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGTGA < SRR19973079.875982/150‑1 (MQ=60)
AGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGTGAGTTG < SRR19973079.2301987/150‑1 (MQ=60)
AGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGTGAGTTG < SRR19973079.2301928/150‑1 (MQ=60)
AGACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGTGAGTTG < SRR19973079.3776473/150‑1 (MQ=60)
GCTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGTGAGTTGCC < SRR19973079.1855722/150‑1 (MQ=60)
ACTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGTGAGTTGCC < SRR19973079.4370716/150‑1 (MQ=60)
|
CGAAGCACGCCGGGTTCTCAGCCGCAGCTAATAAACCGTTTGGATGCAATCCCTTGGCTATCCTGACGAGTTAACTGAAAGCACTGCTTAGGCAGTGCTTTTTTGTTTTCATTCATCAGAGAAAATGATGTTTCCGCGTCTTGATCCAGGCTATAGTCCGGTCATTGTTATCTTTTAAATGTTGTCGTAATTTCAGGAAATTAACGGAATCATGTTCATACGCGCTCCCAATTTTGGACGTAAGCTCCTGCTTACCTGCATTGTTGCAGGCGTAATGATTGCGATACTGGTGAGTTGCC > CP009273/2263994‑2264292
|
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |