Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
747,973 |
C→A |
P93P (CCG→CCT) |
ybgD ← |
putative fimbrial‑like adhesin protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 747,973 | 0 | C | A | 100.0%
| 726.4
/ NA
| 217 | P93P (CCG→CCT) | ybgD | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (107/110); total (107/110) |
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
TGAACCTAATACGATGTTACCGTCATTTTTGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACCGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATG > CP009273/747829‑748119
|
tGAACCTAATACGATGTTACCGTCATTTTTGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCAt < 2:812564/150‑1 (MQ=255)
gAACCTAATACGATGTTACCGTCATTTTTGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCAtt < 2:360108/150‑1 (MQ=255)
gAACCTAATACGATGTTACCGTCATTTTTGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCAtt < 2:485809/150‑1 (MQ=255)
tAATACGATGTTACCGTCATTTTTGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCt < 2:2430003/150‑1 (MQ=255)
aaTACGATGTTACCGTCATTTTTGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTa > 2:452615/1‑150 (MQ=255)
tACGATGTTACCGTCATTTTTGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTAcc > 1:3441183/1‑150 (MQ=255)
cGATGTTACCGTCATTTTTGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGt > 2:2762789/1‑150 (MQ=255)
tGTTACCGTCATTTTTGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGt < 1:2564012/150‑1 (MQ=255)
tGTTACCGTCATTTTTGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGt < 1:656887/150‑1 (MQ=255)
gTTACCGTCATTTTTGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTc > 2:2508909/1‑150 (MQ=255)
tACCGTCATTTTTGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAg > 2:2941348/1‑150 (MQ=255)
aCCGTCATTTTTGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGa > 1:1958094/1‑150 (MQ=255)
cGTCATTTTTGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAg < 2:3634471/150‑1 (MQ=255)
cGTCATTTTTGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAg > 2:3294623/1‑150 (MQ=255)
cGTCATTTTTGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAg < 1:401449/150‑1 (MQ=255)
cGTCATTTTTGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAg > 2:3473640/1‑150 (MQ=255)
gTCATTTTTGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAgc > 2:3237922/1‑150 (MQ=255)
cATTTTTGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAgcag < 2:303887/150‑1 (MQ=255)
aTTTTTGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAgcagg < 2:2004533/150‑1 (MQ=255)
tttttGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAgcaggc < 1:2318706/150‑1 (MQ=255)
tGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGAt > 1:2022494/1‑150 (MQ=255)
gTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATc < 2:845868/150‑1 (MQ=255)
tCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATca > 1:617400/1‑150 (MQ=255)
tCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATca > 1:3258997/1‑150 (MQ=255)
ccATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATcac > 1:1672497/1‑150 (MQ=255)
cATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATcaca > 1:817897/1‑150 (MQ=255)
aTCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAg > 2:530796/1‑150 (MQ=255)
cAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGtt < 2:1912630/150‑1 (MQ=255)
aGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTg > 1:1429828/1‑150 (MQ=255)
gTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGa < 1:1392813/150‑1 (MQ=255)
gTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGa < 1:2762789/150‑1 (MQ=255)
gTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGa < 2:186130/150‑1 (MQ=255)
cGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATc < 1:1723658/150‑1 (MQ=255)
cGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATc > 1:3053588/1‑150 (MQ=255)
gTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCa < 2:1309371/150‑1 (MQ=255)
gTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCa < 1:3637703/150‑1 (MQ=255)
acacCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAg > 2:2390765/1‑150 (MQ=255)
cacCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGc < 1:1167801/150‑1 (MQ=255)
acCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCg < 2:1648764/150‑1 (MQ=255)
acCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCg > 1:2076554/1‑150 (MQ=255)
ccGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGa > 2:3261107/1‑150 (MQ=255)
gACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAAt < 2:1811251/150‑1 (MQ=255)
gACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAAt > 2:3700671/1‑150 (MQ=255)
gACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAAt < 2:2888189/150‑1 (MQ=255)
aCCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATg < 1:3318427/150‑1 (MQ=255)
ccccAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGt > 1:2237004/1‑150 (MQ=255)
cccAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGACTGTc > 2:1020327/1‑150 (MQ=255)
ccAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCg < 1:897071/150‑1 (MQ=255)
ccAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCg > 2:2630580/1‑150 (MQ=255)
ccAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCg > 1:2026346/1‑150 (MQ=255)
ccAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCg < 1:741813/150‑1 (MQ=255)
ccAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCg < 1:2647362/150‑1 (MQ=255)
ttGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACgg < 2:467361/150‑1 (MQ=255)
gCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGcc < 2:2070928/150‑1 (MQ=255)
gCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGcc < 2:2282867/150‑1 (MQ=255)
gCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGcc > 1:2275479/1‑150 (MQ=255)
gCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGcc < 2:2283421/150‑1 (MQ=255)
tCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACt > 1:2752440/1‑150 (MQ=255)
gCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACttt < 2:3153640/150‑1 (MQ=255)
ccTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTa > 1:2152392/1‑150 (MQ=255)
ccTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTa > 1:3533683/1‑150 (MQ=255)
cTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTAt > 1:2991958/1‑150 (MQ=255)
cTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTAt > 2:771181/1‑150 (MQ=255)
tGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCTGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTAtt < 2:3498132/150‑1 (MQ=255)
cTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTa > 1:2601414/1‑150 (MQ=255)
cTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTa > 1:2464004/1‑150 (MQ=255)
cTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTa < 2:1203334/150‑1 (MQ=255)
ggTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTatg > 1:2399540/1‑150 (MQ=255)
ttGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGc > 1:3477973/1‑150 (MQ=255)
gCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTc > 1:3185670/1‑150 (MQ=255)
ttaaGTCGGAGCTCTAGTTGTCTTAGGCGTGCTATTGTAGGTTTCGCCATCTTTGGTTACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGATGCAGGCAGATGACAGTTGATCTAGCGTTTGTCGAGGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGtt < 1:1224536/148‑1 (MQ=255)
aaaGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGttt < 1:1311366/150‑1 (MQ=255)
aGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTtat < 1:209781/150‑1 (MQ=255)
tAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATggg > 2:657217/1‑150 (MQ=255)
gCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGtt > 2:950566/1‑150 (MQ=255)
cACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTGTATTGCTATGATGCTCCCGGTGTATATGGGTTg > 2:3757604/1‑150 (MQ=255)
aCCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGt > 2:1542636/1‑150 (MQ=255)
aGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGt > 1:1921295/1‑150 (MQ=255)
gTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACt < 1:2937445/150‑1 (MQ=255)
ttAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGt < 1:1865663/150‑1 (MQ=255)
aGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTcc < 2:1577961/150‑1 (MQ=255)
tGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGAt < 1:3700671/150‑1 (MQ=255)
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cTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCt < 1:866429/150‑1 (MQ=255)
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CTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTAT > SRR19973061.2999682/1‑150 (MQ=60)
CTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTAT > SRR19973061.2999316/1‑150 (MQ=60)
TGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATT < SRR19973061.879048/150‑1 (MQ=60)
CTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTA > SRR19973061.2608096/1‑150 (MQ=60)
CTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTA > SRR19973061.2470278/1‑150 (MQ=60)
GGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATG > SRR19973061.1509264/1‑150 (MQ=60)
GGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATG > SRR19973061.2405657/1‑150 (MQ=60)
GGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATG > SRR19973061.2405662/1‑150 (MQ=60)
GTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATG < SRR19973061.3246248/150‑1 (MQ=60)
GTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTAGACGGCCACTTTATTGCTATGATG > SRR19973061.1988273/1‑150 (MQ=60)
TTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGC > SRR19973061.3486872/1‑150 (MQ=60)
GCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTC > SRR19973061.3193844/1‑150 (MQ=60)
CTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCC > SRR19973061.53869/1‑150 (MQ=60)
ttaagtcggagctctAGTTGTCTTAGGCGTGCTATTGTAGGTTTCGCCATCTTTGGTTACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGATGCAGGCAGATGACAGTTGATCTAGCGTTTGTCGAGGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTT < SRR19973061.1227587/135‑1 (MQ=60)
AAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTT < SRR19973061.1314652/150‑1 (MQ=60)
AGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTAT < SRR19973061.210408/150‑1 (MQ=60)
CGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTctagg > SRR19973061.1427283/1‑145 (MQ=60)
CACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTG > SRR19973061.1194319/1‑150 (MQ=60)
AGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGT > SRR19973061.2901257/1‑150 (MQ=60)
AGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGT > SRR19973061.1926062/1‑150 (MQ=60)
TGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGAC > SRR19973061.2553961/1‑150 (MQ=60)
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CTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTG > SRR19973061.2069694/1‑150 (MQ=60)
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TAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTC > SRR19973061.1724186/1‑150 (MQ=60)
GCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCA < SRR19973061.600419/150‑1 (MQ=60)
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TGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGAT < SRR19973061.3710127/150‑1 (MQ=60)
CTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCT < SRR19973061.2397952/150‑1 (MQ=60)
CTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCT < SRR19973061.868673/150‑1 (MQ=60)
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AGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTT < SRR19973061.532205/150‑1 (MQ=60)
AGGTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTT > SRR19973061.1294618/1‑150 (MQ=60)
GTTACGCCAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTA < SRR19973061.527840/150‑1 (MQ=60)
CAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATAT < SRR19973061.3303106/150‑1 (MQ=60)
CAACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATAT < SRR19973061.3482532/150‑1 (MQ=60)
AACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATC < SRR19973061.1847449/150‑1 (MQ=60)
AACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATC < SRR19973061.1434381/150‑1 (MQ=60)
ACTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCT < SRR19973061.288671/150‑1 (MQ=60)
CTTTGGATACAGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTT < SRR19973061.1809527/150‑1 (MQ=60)
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AGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAAT < SRR19973061.826486/150‑1 (MQ=60)
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TGAACCTAATACGATGTTACCGTCATTTTTGTCCATCAGTCGTACACCGACCCCAGTTGCTTCGCCTGCACTGGTGTTGCTCAACAAAGGCGTAGCACCAGTTGTCTTAGCCGTGCTATCGAAGGTTACGCCAACTTTGGATACCGGCATTCCGCTACCGTTGTCAGAAGCAGGCAGATCACAGTTGATCAAGCGAATGTCGACGGCCACTTTATTGCTATGATGCTCCCGGTTTATATGGGTTGTCGTGACTTGTCCAAGATCTATGTTTTTATCAATATCTTCTGGATGAAT > CP009273/747829‑748122
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |