Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F534 I1 R1
|
1235 |
230.2 |
7611948 |
95.1% |
7238962 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
4,249,117 |
G→T |
intergenic (+68/‑48) |
dinF → / → yjbJ |
oxidative stress resistance protein; putative MATE family efflux pump; UV and mitomycin C inducible protein/stress‑induced protein, UPF0337 family |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 4,249,117 | 0 | G | T | 100.0%
| 590.0
/ NA
| 175 | intergenic (+68/‑48) | dinF/yjbJ | oxidative stress resistance protein; putative MATE family efflux pump; UV and mitomycin C inducible protein/stress‑induced protein, UPF0337 family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (92/83); total (92/83) |
Only 100 of 177 total aligned reads displayed.
TTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGATCATTGAA > CP009273/4248970‑4249263
|
ggCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGt > 2:2750243/1‑150 (MQ=255)
ggCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGt < 2:1275867/150‑1 (MQ=255)
ggCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGt < 1:944321/150‑1 (MQ=255)
gCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTg < 2:972285/150‑1 (MQ=255)
ttGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAAc > 2:1974994/1‑150 (MQ=255)
cgcgGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTa > 1:617165/1‑150 (MQ=255)
gcgGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTAc > 1:469443/1‑150 (MQ=255)
gcgGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTAc < 2:2188874/150‑1 (MQ=255)
cgGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTAct < 2:1368836/150‑1 (MQ=255)
tttCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCAt > 1:1783686/1‑150 (MQ=255)
tttCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCAt > 2:1335096/1‑150 (MQ=255)
tctGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTcac < 1:788761/150‑1 (MQ=255)
ctGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTcaca > 2:916681/1‑150 (MQ=255)
tGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACaa > 1:3556554/1‑150 (MQ=255)
ggcggcTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAAc < 1:2081846/150‑1 (MQ=255)
cggcTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAAATCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCt > 2:1266499/1‑150 (MQ=255)
ggcTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTa < 2:483008/150‑1 (MQ=255)
cTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAAc < 2:1995305/150‑1 (MQ=255)
cTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAAc > 2:3667753/1‑150 (MQ=255)
cTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGGACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATg < 2:1851943/150‑1 (MQ=255)
ggcggcGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAg > 2:122799/1‑150 (MQ=255)
gcggcgTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAgg < 2:3506131/150‑1 (MQ=255)
cgTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCtt < 1:2170678/150‑1 (MQ=255)
tCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGa < 1:2482218/150‑1 (MQ=255)
tCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGa > 1:1755921/1‑150 (MQ=255)
aCTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGAtt < 2:2850552/150‑1 (MQ=255)
cTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTa > 1:2384970/1‑150 (MQ=255)
cTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTa < 1:2934178/150‑1 (MQ=255)
ggCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATg > 1:1274932/1‑150 (MQ=255)
aaTGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATaa > 1:2362854/1‑150 (MQ=255)
aaTGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATaa > 1:3382213/1‑150 (MQ=255)
tGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAg > 2:3047995/1‑150 (MQ=255)
gTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGAt < 2:1348289/150‑1 (MQ=255)
gTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGAt < 1:3301524/150‑1 (MQ=255)
tACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATg > 2:3202761/1‑150 (MQ=255)
aCCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGa < 1:1296651/150‑1 (MQ=255)
cTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAg < 2:2892047/150‑1 (MQ=255)
tGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGc > 1:2436822/1‑150 (MQ=255)
tGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGc > 1:2052671/1‑150 (MQ=255)
tGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGc > 1:3704703/1‑150 (MQ=255)
tGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGc < 1:2599375/150‑1 (MQ=255)
gTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCcg > 1:3380323/1‑150 (MQ=255)
tGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCcggcg > 2:2892556/1‑150 (MQ=255)
ccGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGt < 1:2406120/150‑1 (MQ=255)
cGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTa < 2:3148587/150‑1 (MQ=255)
cAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAAc > 2:3404489/1‑150 (MQ=255)
aCGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTg < 1:2750307/150‑1 (MQ=255)
ggTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAg > 2:2585748/1‑150 (MQ=255)
gTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGt > 1:785192/1‑150 (MQ=255)
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tAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGttt < 1:273619/150‑1 (MQ=255)
aaaaaTTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTa > 1:3370725/1‑150 (MQ=255)
aaaaaTTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTa > 1:1369985/1‑150 (MQ=255)
aaaaTTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTaa > 1:2278202/1‑150 (MQ=255)
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taaataaTCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGa < 1:2859249/150‑1 (MQ=255)
taaataaTCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGa > 1:3400449/1‑150 (MQ=255)
taaataaTCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGa > 1:1869470/1‑150 (MQ=255)
aaataaTCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGaa > 1:3081531/1‑150 (MQ=255)
aaataaTCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCCAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGaa > 1:1710276/1‑150 (MQ=255)
aataatCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGaaa > 2:291642/1‑150 (MQ=255)
aataatCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGaaa > 2:1118861/1‑150 (MQ=255)
taatCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAaga > 1:1310659/1‑150 (MQ=255)
taatCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAaga < 2:3556601/150‑1 (MQ=255)
aatCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAagag < 2:47674/150‑1 (MQ=255)
aatCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAagag > 2:2425827/1‑150 (MQ=255)
aatCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAagag > 1:1972739/1‑150 (MQ=255)
atCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGc < 1:1517754/150‑1 (MQ=255)
atCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGc > 2:2641153/1‑150 (MQ=255)
cTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAAt < 1:2022367/150‑1 (MQ=255)
ccAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGc > 2:1579706/1‑150 (MQ=255)
ccAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGc < 1:311966/150‑1 (MQ=255)
ccAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGc > 2:767798/1‑150 (MQ=255)
ccAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGc > 2:768490/1‑150 (MQ=255)
aaaTTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCaa > 2:672061/1‑150 (MQ=255)
tGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGATGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTg < 2:2439433/150‑1 (MQ=255)
tGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGAcc < 2:351861/150‑1 (MQ=255)
aCTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCga > 2:1155808/1‑150 (MQ=255)
cTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCgat < 1:852197/150‑1 (MQ=255)
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TAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGA > SRR19973061.1313866/1‑150 (MQ=60)
TAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGA > SRR19973061.1313940/1‑150 (MQ=60)
AATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAG > SRR19973061.1977676/1‑150 (MQ=60)
ATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGC > SRR19973061.995452/1‑150 (MQ=60)
ATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGC < SRR19973061.1521549/150‑1 (MQ=60)
CTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAAT < SRR19973061.2027445/150‑1 (MQ=60)
CCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGC < SRR19973061.312784/150‑1 (MQ=60)
CAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCA > SRR19973061.3313926/1‑150 (MQ=60)
CAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCA > SRR19973061.308221/1‑150 (MQ=60)
AAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAA > SRR19973061.2588457/1‑150 (MQ=60)
CTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGAT < SRR19973061.425579/150‑1 (MQ=60)
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CTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGAT > SRR19973061.3666169/1‑150 (MQ=60)
TACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATG > SRR19973061.3338033/1‑150 (MQ=60)
ACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATG < SRR19973061.2880007/150‑1 (MQ=60)
TAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATA > SRR19973061.2113863/1‑150 (MQ=60)
TAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATA > SRR19973061.1446566/1‑150 (MQ=60)
TCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGA > SRR19973061.2005823/1‑150 (MQ=60)
CTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGAC < SRR19973061.3126647/150‑1 (MQ=60)
ACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGAT > SRR19973061.820595/1‑150 (MQ=60)
TTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGATCAT < SRR19973061.3597581/150‑1 (MQ=60)
TTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGATCAT < SRR19973061.35361/150‑1 (MQ=60)
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TTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGATCAT < SRR19973061.2384900/150‑1 (MQ=60)
GAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGATCATTGAA < SRR19973061.3677129/150‑1 (MQ=60)
AATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGATCATTGAAG < SRR19973061.919031/150‑1 (MQ=60)
AATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGATCATTGAAG < SRR19973061.919313/150‑1 (MQ=60)
ATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGATCATTGAAGG > SRR19973061.439038/1‑150 (MQ=60)
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TTCTGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGATCATTGAAGG > CP009273/4248970‑4249265
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |