Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F361 I0 R1
|
1353 |
250.7 |
8230166 |
96.0% |
7900959 |
148.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
4,249,117 |
G→T |
100% |
intergenic (+68/‑48) |
dinF → / → yjbJ |
oxidative stress resistance protein; putative MATE family efflux pump; UV and mitomycin C inducible protein/stress‑induced protein, UPF0337 family |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 4,249,117 | 0 | G | T | 99.6%
| 776.1
/ ‑4.2
| 235 | intergenic (+68/‑48) | dinF/yjbJ | oxidative stress resistance protein; putative MATE family efflux pump; UV and mitomycin C inducible protein/stress‑induced protein, UPF0337 family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base T (119/115); total (119/116) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.94e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 235 total aligned reads displayed.
TGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGATCAT > CP009273/4248973‑4249259
|
tGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATaaaa < 2:1711212/149‑1 (MQ=255)
cGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTg < 1:570488/149‑1 (MQ=255)
gTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGa < 1:1541836/149‑1 (MQ=255)
gTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGa < 1:1541029/149‑1 (MQ=255)
ttGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGaa < 2:3387061/149‑1 (MQ=255)
tGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAAc < 2:2989608/149‑1 (MQ=255)
tGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAAc > 1:1245748/1‑149 (MQ=255)
tGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAAc < 1:3078678/149‑1 (MQ=255)
gcgGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTa < 2:124718/149‑1 (MQ=255)
gcgGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTa < 1:690537/149‑1 (MQ=255)
gcgGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTa < 2:2197413/149‑1 (MQ=255)
ggCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTActc < 1:2023454/149‑1 (MQ=255)
ggCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTActc > 2:2241193/1‑149 (MQ=255)
tctGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTca > 1:1075377/1‑149 (MQ=255)
gcggcTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGACTAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAAc > 1:778228/1‑149 (MQ=255)
cggcTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAAcc < 1:168847/149‑1 (MQ=255)
cggcTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAAcc < 1:3742731/149‑1 (MQ=255)
gcTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTa > 2:1362044/1‑149 (MQ=255)
cTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTaa < 1:3467307/149‑1 (MQ=255)
tCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCAAAACCTAACGa < 2:245777/149‑1 (MQ=255)
cgTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCt < 1:2665668/149‑1 (MQ=255)
tCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTg < 1:1010438/149‑1 (MQ=255)
aCTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGAt > 1:90125/1‑149 (MQ=255)
gcgcAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATg > 1:1821006/1‑149 (MQ=255)
gcgcAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATg < 1:1763839/149‑1 (MQ=255)
gcAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGaa < 1:4086527/149‑1 (MQ=255)
aaTGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATa > 1:1388869/1‑149 (MQ=255)
ggTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAg > 1:1086530/1‑149 (MQ=255)
ggTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAg > 1:1118801/1‑149 (MQ=255)
gTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGa > 2:1487495/1‑149 (MQ=255)
tACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTTAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCCCGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGAt < 1:2304857/149‑1 (MQ=255)
cTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGaa > 1:3942468/1‑149 (MQ=255)
tGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAg > 1:2859436/1‑149 (MQ=255)
ggTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGc > 1:140482/1‑149 (MQ=255)
gCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCcggcg > 2:1890734/1‑149 (MQ=255)
gCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTa < 2:9125/149‑1 (MQ=255)
aCGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACt > 2:2784603/1‑149 (MQ=255)
aCGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACt > 2:3654311/1‑149 (MQ=255)
tGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGa > 1:3369318/1‑149 (MQ=255)
tGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGa > 1:1190935/1‑149 (MQ=255)
tGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGa > 1:464514/1‑149 (MQ=255)
gACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGaa < 1:2111707/149‑1 (MQ=255)
gACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGaa > 2:500723/1‑149 (MQ=255)
aCGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGaaa < 2:110493/149‑1 (MQ=255)
cGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAAc < 1:1362044/149‑1 (MQ=255)
ggTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACa > 2:1717825/1‑149 (MQ=255)
ggTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACa > 1:1834069/1‑149 (MQ=255)
gTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAg < 1:2913398/149‑1 (MQ=255)
gTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAg > 1:3661827/1‑149 (MQ=255)
aaaaTTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTa < 2:1509967/149‑1 (MQ=255)
aaaaTTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTa > 2:962416/1‑149 (MQ=255)
aaaTTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTaa < 1:986838/149‑1 (MQ=255)
aaaTTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTaa < 1:1968729/149‑1 (MQ=255)
aaTTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTaaa < 1:799582/149‑1 (MQ=255)
aaTTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTaaa > 1:2548110/1‑149 (MQ=255)
aaTTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCAAGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAAACTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGACGACGGCGGTAACTGGAAACAGTTTaaa > 2:2651687/1‑149 (MQ=255)
aTTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAg > 1:1325740/1‑149 (MQ=255)
aTTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAg < 2:2071010/149‑1 (MQ=255)
tCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGt < 2:1125769/149‑1 (MQ=255)
cTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTa < 2:3942468/149‑1 (MQ=255)
gAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTaaa > 1:2802926/1‑149 (MQ=255)
aataaataATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAg < 2:445835/149‑1 (MQ=255)
ataaataaTCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGt > 2:3485842/1‑149 (MQ=255)
taaataaTCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGGGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTg > 1:1414514/1‑149 (MQ=255)
taaataaTCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTg > 2:2357109/1‑149 (MQ=255)
aataatCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGaa > 2:3658711/1‑149 (MQ=255)
ataatCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGaaa > 1:1170689/1‑149 (MQ=255)
taatCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAag > 1:511973/1‑149 (MQ=255)
taatCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAag < 2:3794354/149‑1 (MQ=255)
atCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAagag < 2:2733341/149‑1 (MQ=255)
tCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGc < 2:69516/149‑1 (MQ=255)
tCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGc < 2:3079308/149‑1 (MQ=255)
cTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATTAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCaa < 2:3300894/149‑1 (MQ=255)
cTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATTAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCaa < 2:1300455/149‑1 (MQ=255)
cTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCac > 2:647173/1‑148 (MQ=255)
cTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCaa > 2:2493797/1‑149 (MQ=255)
cTAAGCCAAAGTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTACAGGTAAAGTGAAAGAGCaa > 2:1992121/1‑149 (MQ=255)
tAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAAt > 1:3256184/1‑149 (MQ=255)
aaGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATg > 1:2957246/1‑149 (MQ=255)
ccAAATTGCTGACTACAATTAATCTCACTTTCATAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATgggg < 1:905423/149‑1 (MQ=255)
ccAAAGTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTAATCTCATTCACAACCTATCGATGAGGTCTTTATTATTAATATAGATGAAGCAGGCGGTTTCTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATgggg < 1:2279050/149‑1 (MQ=255)
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GTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGA > SRR19973068.3389898/1‑150 (MQ=60)
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CGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACA > SRR19973068.1846165/1‑150 (MQ=60)
CGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTAAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACA > SRR19973068.1845999/1‑150 (MQ=60)
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TTAAAAATTATGAATAAATAATCCTAAGCAAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACATAACGATGAGGTCTTGATTATGATTAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTT < SRR19973068.2002787/150‑1 (MQ=60)
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TGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAA > SRR19973068.2820345/1‑150 (MQ=60)
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CCAAAGTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAATAAAAGTGAACGTAATCTCATTCACAACCTATCGATGAGGTCTTTATTATTAATATAGATGAAGCAGGCGGTTTCTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGC < SRR19973068.2293825/150‑1 (MQ=60)
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TAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGATCATTGAAGGT > SRR19973068.1002037/1‑150 (MQ=60)
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TGGCGTTGCGCGGGCTTTCTCTGGCGGCTATCTGGCGGCGTCACTGGCGCAATGGTACCTGGTTTGCCGCAACGTGACGGTTAAAAATTCTGAATAAATAATCCTAAGCCAAATTGCTGACTACACTTAATCTCACGTTCAGAAGAAAAGTGAACGTACTCTCATTCACAACCTAACGATGAGGTCTTGATTATGAATAAAGATGAAGCCGGCGGTAACTGGAAACAGTTTAAAGGTAAAGTGAAAGAGCAATGGGGCAAACTGACCGATGATGATATGACGATCATTGAAGGT > CP009273/4248973‑4249266
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
