Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,461,872 |
G→T |
80.5% |
pseudogene (2224/2513 nt) |
ydbA → |
pseudogene, autotransporter homolog; interrupted by IS2 and IS30 |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,461,872 | 0 | G | T | 80.5%
| 516.9
/ 150.1
| 269 | pseudogene (2224/2513 nt) | ydbA | pseudogene, autotransporter homolog; interrupted by IS2 and IS30 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (24/29); new base T (110/106); total (134/135) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.40e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 |
Only 100 of 269 total aligned reads displayed.
TCCGTGGGTATCAACGTTTACGGCAGTGATAATAACGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCGATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAGGATATAGTTATACCAGCGTTATTGTCGTTAGTGGTGAGTCGTCGGTATATCT > CP009273/1461725‑1462017
|
tccGTGGGTATCAACGTTTACGGCAGTGATAATAACGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTAt < 1:5031077/150‑1 (MQ=255)
tccGTGGGTATCAACGTTTACGGCAGTGATAATAACGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTAt < 1:3723509/150‑1 (MQ=255)
tccGTGGGTATCAACGTTTACGGCAGTGATAATAACGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTAt < 1:2295485/150‑1 (MQ=255)
ccGTGGGTATCAACGTTTACGGCAGTGATAATAACGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATg > 2:881486/1‑150 (MQ=255)
ccGTGGGTATCAACGTTTACGGCAGTGATAATAACGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCGATg < 1:3243141/150‑1 (MQ=255)
gTGGGTATAAACGTTTACGGCAGTGATAATAACGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGc > 2:791479/1‑150 (MQ=255)
gTATCAACGTTTACGGCAGTGATAATAACGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCGATGGCAATa > 2:1227821/1‑150 (MQ=255)
tATCAACGTTTACGGCAGTGATAATAACGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATAc > 2:2062361/1‑150 (MQ=255)
aTCAACGTTTACGGCAGTGATAATAACGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATAcc < 2:2600909/150‑1 (MQ=255)
aTCAACGTTTACGGCAGTGATAATAACGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATAcc > 1:3906026/1‑150 (MQ=255)
aaCGTTTACGGCAGTGATAATAACGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGGGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGtt > 2:4180984/1‑150 (MQ=255)
aaCGTTTACGGCAGTGATAATAACGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGtt < 1:1436568/150‑1 (MQ=255)
aCGTTTACGGCAGTGATAATAACGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTa < 1:1747464/150‑1 (MQ=255)
aCGTTTACGGCAGTGATAATAACGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTa < 2:4388764/150‑1 (MQ=255)
ttACGGCAGTGATAATAACGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAatat < 2:1744885/150‑1 (MQ=255)
tACGGCAGTGATAATAACGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATg > 1:267954/1‑150 (MQ=255)
aCGGCAGTGATAATAACGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGa > 1:4056596/1‑150 (MQ=255)
gCAGTGATAATAACGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAAtg < 1:557970/150‑1 (MQ=255)
tGATAATAACGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAAtggtgg > 1:1778239/1‑150 (MQ=255)
tGATAAAAACGTGACGCAGGAAGGAAAGTAAAATGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTACTCGTCAGAGTAATTTATTTTATGTAAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGACGATTGCAATACCCTTAAAATGAAtggttt > 2:4930526/1‑148 (MQ=255)
taaCGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGa < 1:3058744/150‑1 (MQ=255)
aCGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCGATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAAc < 1:3690826/150‑1 (MQ=255)
cGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACt > 1:4872193/1‑150 (MQ=255)
tGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGa > 2:1301935/1‑150 (MQ=255)
tGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGa > 1:2873918/1‑150 (MQ=255)
tGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGa < 1:3104862/150‑1 (MQ=255)
ggatggaAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGgaga > 1:3639207/1‑150 (MQ=255)
ggatggaAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGgaga < 2:2480645/150‑1 (MQ=255)
ggatggaAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCGATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGgaga > 2:2396245/1‑150 (MQ=255)
gatggaAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGgagag > 2:1305879/1‑150 (MQ=255)
gatggaAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGgagag < 1:1973448/150‑1 (MQ=255)
atggaAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGTGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGgagaga < 2:384519/150‑1 (MQ=255)
atggaAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGgagaga > 1:18084/1‑150 (MQ=255)
atggaAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGgagaga > 1:1165159/1‑150 (MQ=255)
aaaGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGaaaaa < 1:4225751/150‑1 (MQ=255)
aaaGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCGATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGaaaaa > 1:3601224/1‑150 (MQ=255)
aaGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAAc < 2:2735108/150‑1 (MQ=255)
aaGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAAc > 2:1946751/1‑150 (MQ=255)
aGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAAcg > 2:4023528/1‑150 (MQ=255)
aaCTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCt > 2:3715203/1‑150 (MQ=255)
cTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCGATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAGAACGCGCTTg < 2:3981216/150‑1 (MQ=255)
gttgtATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCGATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCa < 2:3785076/150‑1 (MQ=255)
ttgtATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAg < 1:5159592/150‑1 (MQ=255)
ttgtATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCGATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAg < 2:3755613/150‑1 (MQ=255)
gtATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCGATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGAt < 2:212748/150‑1 (MQ=255)
tATCAGACAGTGAGGTAACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATg < 1:2586095/150‑1 (MQ=255)
aTCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATgg < 1:2333594/150‑1 (MQ=255)
tCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCGATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATggg < 2:4060065/150‑1 (MQ=255)
cAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGt > 1:4071089/1‑150 (MQ=255)
aGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAg < 1:2729871/150‑1 (MQ=255)
tGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCGATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGt < 1:1012204/150‑1 (MQ=255)
tGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCGATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGt > 2:167455/1‑150 (MQ=255)
aGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTa > 1:3463936/1‑150 (MQ=255)
aGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTa < 2:4956749/150‑1 (MQ=255)
aGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTa < 1:3235310/150‑1 (MQ=255)
ggTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCGATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTAc < 2:1633217/150‑1 (MQ=255)
gTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACt < 1:4680821/150‑1 (MQ=255)
aCTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTcc < 2:4054510/150‑1 (MQ=255)
aCTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTcc > 1:4717743/1‑150 (MQ=255)
cGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTgcgc > 2:1179159/1‑150 (MQ=255)
cGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTgcgc > 2:1274515/1‑150 (MQ=255)
cGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTgcgc > 1:3196163/1‑150 (MQ=255)
cAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGcaca < 1:83429/150‑1 (MQ=255)
cAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCGATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGcaca > 1:4863528/1‑150 (MQ=255)
agagTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAg > 1:2434756/1‑150 (MQ=255)
agagTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCGATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAg < 2:2262067/150‑1 (MQ=255)
tAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGTTATGGTTGTGTTTGGCGATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAGGata < 1:4234994/150‑1 (MQ=255)
tAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAGGata < 2:3179864/150‑1 (MQ=255)
tAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAGGata < 2:4404401/150‑1 (MQ=255)
tatttGATGGCAGCGCAGAGTAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCGATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAGGATATAGtt < 1:786631/150‑1 (MQ=255)
tatttGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAGGATATAGtt < 2:4986632/150‑1 (MQ=255)
tGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAGGATATAGTTATAc > 1:4421246/1‑150 (MQ=255)
aTGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAGGATATAGTTATACCa > 2:2959078/1‑150 (MQ=255)
aGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAGGATATAGTTATACCAGCGtt > 1:906567/1‑150 (MQ=255)
aGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCGATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAGGATATAGTTATACCAGCGtt > 1:2753375/1‑150 (MQ=255)
aGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCGATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAGGATATAGTTATACCAGCGtt > 2:561635/1‑150 (MQ=255)
aGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCGATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAGGATATAGTTATACCAGCGtt > 1:4273053/1‑150 (MQ=255)
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cgcAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCTATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAGGATATAGTTATACCAGCGTTAt < 2:3664051/150‑1 (MQ=255)
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TGGCTATTGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACCCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAGGATATAGTTATAACAGCGTTATTGTCGTTAGTTGAGAGTCGTCGGTATATCT > SRR19973063.62006/1‑150 (MQ=60)
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TCCGTGGGTATCAACGTTTACGGCAGTGATAATAACGTGACGCTGGATGGAAAGTTAACTGTTGTATCAGACAGTGAGGTTACTTCTCGTCAGAGTAATTTATTTGATGGCAGCGCAGAGAAAACGTCAGGTCTGGTTGTGATTGGCGATGGCAATACCGTTAATATGAATGGTGGACTTGAACTGATTGGAGAGAAAAACGCGCTTGCAGATGGGTCGCAGGTTACTTCCTTGCGCACAGGATATAGTTATACCAGCGTTATTGTCGTTAGTGGTGAGTCGTCGGTATATCT > CP009273/1461725‑1462017
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |