Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,586,871 |
G→T |
100% |
intergenic (‑172/+51) |
hipB ← / ← yneO |
antitoxin of HipAB toxin‑antitoxin system/pseudogene, AidA homolog |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,586,871 | 0 | G | T | 99.3%
| 975.6
/ ‑2.5
| 295 | intergenic (‑172/+51) | hipB/yneO | antitoxin of HipAB toxin‑antitoxin system/pseudogene, AidA homolog |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/1); new base T (151/141); total (153/142) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 297 total aligned reads displayed.
CGCTTAAGGGGATATTATAAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACATTCCCCCACAGGCTAAGGTTGTT > CP009273/1586725‑1587017
|
cTTAAGGGGATATTATAAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTc > 1:2065847/1‑150 (MQ=255)
cTTAAGGGGATATTATAAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTc > 1:3551635/1‑150 (MQ=255)
cTTAAGGGGATATTATAAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTc > 1:3626248/1‑150 (MQ=255)
gtgaGGGGATATTATAAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCg > 2:22904/4‑150 (MQ=255)
tAAGGGGATATTATAAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCgg > 1:4895322/1‑150 (MQ=255)
ggggATATTATAAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCaa > 1:2893682/1‑150 (MQ=255)
ggATATTATAAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAata > 1:1845923/1‑150 (MQ=255)
ggATATTATAAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAata < 2:2017836/150‑1 (MQ=255)
gATATTATAAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAatat > 1:862510/1‑150 (MQ=255)
atatTATAAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATAtt > 1:4650355/1‑150 (MQ=255)
atatTATAAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATAtt < 2:3626248/150‑1 (MQ=255)
attatAAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTCTCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTaa < 2:1012837/150‑1 (MQ=255)
ttattaGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAg < 2:1419247/150‑1 (MQ=255)
ataAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGcc < 1:1479446/150‑1 (MQ=255)
ataAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGcc < 1:936066/150‑1 (MQ=255)
taAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCg > 2:3110200/1‑150 (MQ=255)
tttATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGc > 2:112992/1‑150 (MQ=255)
ttATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGcc < 1:4510781/150‑1 (MQ=255)
ttATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGcc < 2:1565541/150‑1 (MQ=255)
aTCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCAt > 2:2744746/1‑150 (MQ=255)
aTCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCAt > 2:661018/1‑150 (MQ=255)
tCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCAtc < 1:1320715/150‑1 (MQ=255)
tCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAATCGGCAATATTAAGCCGCATGCCAtc < 1:2648758/150‑1 (MQ=255)
tttAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATCAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTCAGCCGCATGCCATCTCg > 2:2635941/1‑150 (MQ=255)
tttAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCg < 2:311605/150‑1 (MQ=255)
aGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACa < 2:3617057/150‑1 (MQ=255)
gTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACAt < 2:4186463/150‑1 (MQ=255)
gTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACAt > 1:2550037/1‑150 (MQ=255)
gAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGc > 1:2236137/1‑150 (MQ=255)
gAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGc > 2:1914374/1‑150 (MQ=255)
aGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCg < 2:2137825/150‑1 (MQ=255)
tAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAATTCGGCAATATTAAGCCGCAAGCCATCTCGACATGCGGCtt > 1:3451114/1‑150 (MQ=255)
tAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCtt < 2:3288696/150‑1 (MQ=255)
aaGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTta < 2:2223637/150‑1 (MQ=255)
aaGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTta < 1:3053067/150‑1 (MQ=255)
tCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATAc < 1:1930024/150‑1 (MQ=255)
cAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTGTTAAGTCGGCCATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACg > 2:3237437/1‑150 (MQ=255)
aaTCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACgg < 1:1636201/150‑1 (MQ=255)
aaTCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACgg > 2:3942627/1‑150 (MQ=255)
cTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGttt > 1:4362918/1‑150 (MQ=255)
ggAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAGTAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTAc < 1:4988899/150‑1 (MQ=255)
gAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTAcc < 1:789376/150‑1 (MQ=255)
aaaCACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCa < 2:1882846/150‑1 (MQ=255)
acaTCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCta > 1:5162385/1‑150 (MQ=255)
aTCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCtata < 1:2615101/150‑1 (MQ=255)
ttATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATAttt < 1:1791887/150‑1 (MQ=255)
aTCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCa < 2:1662794/150‑1 (MQ=255)
tCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCAc < 1:159348/150‑1 (MQ=255)
cGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTc > 1:3530277/1‑150 (MQ=255)
gCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTcc > 1:1768037/1‑150 (MQ=255)
gCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTcc < 1:1242028/150‑1 (MQ=255)
ctctACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGACGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTccc < 2:5087842/150‑1 (MQ=255)
ctctACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATGTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTccc < 2:44097/150‑1 (MQ=255)
ctACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAg < 1:5029825/150‑1 (MQ=255)
atACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAg < 1:1074271/149‑1 (MQ=255)
tACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGc > 2:3429533/1‑150 (MQ=255)
cGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCAt < 1:4097096/150‑1 (MQ=255)
aaaCGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTg > 1:4882265/1‑150 (MQ=255)
aaCGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa > 2:1729404/1‑150 (MQ=255)
aaCGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa > 2:3824644/1‑150 (MQ=255)
aaCGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGa > 2:233020/1‑150 (MQ=255)
cGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGt > 1:4038704/1‑150 (MQ=255)
cGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGt > 2:2801006/1‑150 (MQ=255)
tGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATc < 2:4744815/150‑1 (MQ=255)
cGATCTCCGCGATCGCGGATAAAACGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCGATCTCGACTTGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGc < 2:2905527/150‑1 (MQ=255)
gATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCt > 2:916016/1‑150 (MQ=255)
gATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCAACTCGAAATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCt > 1:3983953/1‑150 (MQ=255)
atCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCtata < 2:2990348/150‑1 (MQ=255)
ccGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGc < 1:4585676/150‑1 (MQ=255)
cgGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCAc > 2:1541373/1‑150 (MQ=255)
ggATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCAcc < 1:1196256/150‑1 (MQ=255)
gATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCt > 2:1055965/1‑150 (MQ=255)
aTAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTa > 1:3292541/1‑150 (MQ=255)
aaaaaGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGt < 1:2819004/150‑1 (MQ=255)
aaaaGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACTGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGtt > 2:3471321/1‑150 (MQ=255)
aaGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGc > 2:1809977/1‑150 (MQ=255)
aaGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGc > 2:4268987/1‑150 (MQ=255)
aaGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGc < 2:4127931/150‑1 (MQ=255)
aggaggATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGca < 2:4342614/150‑1 (MQ=255)
aggaggATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGca > 2:1167513/1‑150 (MQ=255)
gaggaTTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCACTATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGcaca < 1:102461/150‑1 (MQ=255)
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aggaTTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATAAGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCacac > 1:1017083/1‑150 (MQ=255)
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ACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATCAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTA > SRR19973063.2616604/1‑150 (MQ=60)
ACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTA > SRR19973063.5178993/1‑150 (MQ=60)
ATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATA < SRR19973063.2044688/150‑1 (MQ=60)
ATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATA < SRR19973063.2623425/150‑1 (MQ=60)
ATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATA < SRR19973063.1606901/150‑1 (MQ=60)
CTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATT > SRR19973063.5063805/1‑150 (MQ=60)
TTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTT < SRR19973063.1797580/150‑1 (MQ=60)
TTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTT < SRR19973063.1797432/150‑1 (MQ=60)
TTATCCGCTCTACGGGATAAACGCAGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTT < SRR19973063.1797385/150‑1 (MQ=60)
ATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCA < SRR19973063.824804/150‑1 (MQ=60)
ATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCA < SRR19973063.3417027/150‑1 (MQ=60)
TCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCAC < SRR19973063.159843/150‑1 (MQ=60)
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GCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCC < SRR19973063.1245732/150‑1 (MQ=60)
GCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCC > SRR19973063.1213656/1‑150 (MQ=60)
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CTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAG > SRR19973063.1793448/1‑150 (MQ=60)
CTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAG < SRR19973063.5046045/150‑1 (MQ=60)
ATACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAG < SRR19973063.1077531/150‑1 (MQ=60)
CGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCAT < SRR19973063.4110224/150‑1 (MQ=60)
ATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCC > SRR19973063.2160605/1‑150 (MQ=60)
TAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCCTGCCCTG > SRR19973063.1672404/1‑150 (MQ=60)
AAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTG > SRR19973063.4898011/1‑150 (MQ=60)
AAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTG > SRR19973063.4898037/1‑150 (MQ=60)
AACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGA > SRR19973063.4925097/1‑150 (MQ=60)
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CCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGC < SRR19973063.4600256/150‑1 (MQ=60)
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GCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCT > SRR19973063.1032050/1‑150 (MQ=60)
GATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTT > SRR19973063.190971/1‑150 (MQ=60)
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AAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGT < SRR19973063.2828065/150‑1 (MQ=60)
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GCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACATTCCCCCACAGGCTAAG < SRR19973063.1577062/150‑1 (MQ=60)
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GTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACATT‑CCCCACAGGCTAAGGTTGTT > SRR19973063.1120153/1‑150 (MQ=60)
TTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACATTCCCCCACAGGCTAAGGTTGTT < SRR19973063.2601966/150‑1 (MQ=60)
TAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACATTCCCCCACAGGCTAAGGTTGTTATT < SRR19973063.3510922/150‑1 (MQ=60)
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ATCCGCTTAAGGGGATATTATAAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACATTCCCCCACAGGCTAAGGTTGTTATT > CP009273/1586722‑1587020
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |