Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F181 I0 R1
|
1262 |
323.1 |
10297870 |
97.5% |
10040423 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,586,871 |
G→T |
24.8% |
intergenic (‑172/+51) |
hipB ← / ← yneO |
antitoxin of HipAB toxin‑antitoxin system/pseudogene, AidA homolog |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,586,871 | 0 | G | T | 24.8%
| 681.8
/ 169.8
| 278 | intergenic (‑172/+51) | hipB/yneO | antitoxin of HipAB toxin‑antitoxin system/pseudogene, AidA homolog |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (103/105); new base T (38/32); total (141/137) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.81e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 280 total aligned reads displayed.
TCCGCTTAAGGGGATATTATAAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACATTCCCCCACAGGCTAAGGTTGTTATT > CP009273/1586723‑1587020
|
tCCGCTTAAGGGGATATTTTATGTTTTATCCTTTAGTGAGGATATGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGTAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGa < 2:2086363/150‑1 (MQ=255)
ggATATTATAAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAata > 2:187397/1‑150 (MQ=255)
ataAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGcc > 2:4579194/1‑150 (MQ=255)
ataAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGcc < 2:4005104/150‑1 (MQ=255)
ataAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGcc < 1:2217458/150‑1 (MQ=255)
ataAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGcc < 1:2540913/150‑1 (MQ=255)
taAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCg < 1:828605/150‑1 (MQ=255)
gTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCAt > 1:1836631/1‑150 (MQ=255)
tttATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGc > 1:563493/1‑150 (MQ=255)
tttATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGc < 1:2395531/150‑1 (MQ=255)
ctCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCAt < 2:2805607/149‑1 (MQ=255)
aTCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCAt > 1:1523391/1‑150 (MQ=255)
aTCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCAt < 2:1878763/150‑1 (MQ=255)
ccTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACAAATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCAtct > 2:4728005/1‑150 (MQ=255)
tttAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCg > 1:3293259/1‑150 (MQ=255)
tAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGAc < 1:2174156/150‑1 (MQ=255)
gTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACAt > 1:3924538/1‑150 (MQ=255)
gAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGc > 2:484016/1‑150 (MQ=255)
gAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGc < 2:1323897/150‑1 (MQ=255)
gAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGc > 2:3346047/1‑150 (MQ=255)
gAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGc < 2:859500/150‑1 (MQ=255)
aGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCg < 1:4253601/150‑1 (MQ=255)
aGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCAACGGGAAAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATAAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCg > 2:3121458/1‑150 (MQ=255)
ggATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCgg < 1:153105/150‑1 (MQ=255)
gATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGc > 1:1200574/1‑150 (MQ=255)
aTAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCt > 2:1389431/1‑150 (MQ=255)
tAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCtt < 2:3966082/150‑1 (MQ=255)
tAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCtt > 2:3553469/1‑150 (MQ=255)
aGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAACTAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTtat < 2:3972182/150‑1 (MQ=255)
tCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATAc < 2:2927386/150‑1 (MQ=255)
tCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATAc < 1:3798447/150‑1 (MQ=255)
cAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACg > 1:2294025/1‑150 (MQ=255)
cAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACg > 1:3457512/1‑150 (MQ=255)
aTCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAACGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGt > 2:3609141/1‑150 (MQ=255)
cTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGttt < 2:3030799/150‑1 (MQ=255)
tGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTa < 1:3695644/150‑1 (MQ=255)
gAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCACTATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTAcc > 1:491435/1‑150 (MQ=255)
aaCACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAg > 2:2260285/1‑150 (MQ=255)
aaCACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAg < 2:2488040/150‑1 (MQ=255)
acaTCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCta > 1:1967161/1‑150 (MQ=255)
caTCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCtat < 1:4471449/150‑1 (MQ=255)
aTCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCtata > 2:2495184/1‑150 (MQ=255)
cTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATAtt < 2:4245740/150‑1 (MQ=255)
cTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATAtt > 1:934038/1‑150 (MQ=255)
tATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTc > 2:701547/1‑150 (MQ=255)
tATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTc < 2:3617555/150‑1 (MQ=255)
gaTCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTc < 2:1145725/149‑1 (MQ=255)
gCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTcc < 1:3841813/150‑1 (MQ=255)
tctACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCa > 1:4935253/1‑150 (MQ=255)
tACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGc > 1:499026/1‑150 (MQ=255)
cGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCAt < 2:5089984/150‑1 (MQ=255)
cGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCAt < 2:3863635/150‑1 (MQ=255)
aTAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTATGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGccc > 2:3417342/1‑150 (MQ=255)
aTAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGccc < 1:1483542/150‑1 (MQ=255)
cTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTAt < 1:413348/150‑1 (MQ=255)
tGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATc < 1:5137037/150‑1 (MQ=255)
gCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTAtag < 2:3450890/150‑3 (MQ=255)
gATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCt < 1:2081715/150‑1 (MQ=255)
atCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCtata > 1:4835761/1‑150 (MQ=255)
cgcgATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGcc > 1:3235775/1‑150 (MQ=255)
gcgATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCCTGCCCTGAGTATCGCTATAGCCt > 2:239466/1‑150 (MQ=255)
gcgATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCt < 1:4059946/150‑1 (MQ=255)
cgATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCtt > 1:455475/1‑150 (MQ=255)
gATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCttt > 1:2848461/1‑150 (MQ=255)
gATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCttt < 1:347183/150‑1 (MQ=255)
aTCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTa > 2:1593859/1‑150 (MQ=255)
tCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTAt < 1:2048819/150‑1 (MQ=255)
cgcgGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATc > 1:2325329/1‑150 (MQ=255)
gcgGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCa < 1:2428732/150‑1 (MQ=255)
tAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAg > 1:4578141/1‑150 (MQ=255)
aaaaGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGtt > 1:1085553/1‑150 (MQ=255)
aaaGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTg > 1:5038317/1‑150 (MQ=255)
aaGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGc < 2:4988077/150‑1 (MQ=255)
ggaggaTTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGcac > 1:1364544/1‑150 (MQ=255)
ggaggaTTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGcac < 1:4195113/150‑1 (MQ=255)
aggaTTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCacac > 1:4609808/1‑150 (MQ=255)
gaTTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCg < 1:3213733/150‑1 (MQ=255)
aTTTAAATAAGGCGTTGATGCTCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGa < 2:4480236/150‑1 (MQ=255)
tttAAATCAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGAc < 2:4458955/150‑1 (MQ=255)
aaaTAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACAtt > 2:324406/1‑150 (MQ=255)
aaaTAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACAtt < 2:1238598/150‑1 (MQ=255)
aaTAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTGCCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACATTc > 1:1026183/1‑150 (MQ=255)
aaTAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACATTc > 2:2003369/1‑150 (MQ=255)
aTAAGGCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCTCATGACATCAATACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGATATATTTCACTCCCATCATGCCCTGAGTATCTCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCAAACCGACATTcc > 2:5069248/1‑150 (MQ=255)
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aaGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACATTcccc < 2:620988/150‑1 (MQ=255)
ggCGTTGATGCGCCGTTTTAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACATTCCCCca < 1:2982556/150‑1 (MQ=255)
gCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACATTCCCCcac < 2:1187947/150‑1 (MQ=255)
cGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACATTCCCCcaca < 1:5023945/150‑1 (MQ=255)
cGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACATTCCCCcaca > 2:2708726/1‑150 (MQ=255)
gATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACATTCCCCCACAGGCt < 2:3818874/150‑1 (MQ=255)
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gTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACATTCCCCCACAGGCTAAGgttgt > 1:3404299/1‑150 (MQ=255)
tttGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACATTCCCCCACAGGCTAAGgttgtt > 1:4790936/1‑150 (MQ=255)
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ttGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACATTCCCCCACAGGCTAAGGTTGTTa > 1:4347506/1‑150 (MQ=255)
ttGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACATTCCCCCACAGGCTAAGGTTGTTa < 1:3521034/150‑1 (MQ=255)
ttGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACATTCCCCCACAGGCTAAGGTTGTTa < 1:866907/150‑1 (MQ=255)
ttGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACATTCCCCCACAGGCTAAGGTTGTTa > 2:3728520/1‑150 (MQ=255)
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TCCGCTTAAGGGGATATTATAAGTTTTATCCTTTAGTGAGGATAAGTCAATCTGGAAACACATCTTATCCGCTCTACGGGATAAACGCTGCGATATCCGCGATCGCGGATAAAAAGGAGGATTTAAATAAGGCGTTGATGCGCCGTTTGAAGTCGGCAATATTAAGCCGCATGCCATCTCGACATGCGGCTTATACGGTTTACCAGCTATATTTCACTCCCAGCATGCCCTGAGTATCGCTATAGCCTTTATCACCTAGTTGCACACCGACATTCCCCCACAGGCTAAGGTTGTTATT > CP009273/1586723‑1587020
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
