Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,755,723 |
G→T |
100% |
E61* (GAA→TAA) |
rhsA → |
Rhs family protein, putative polymorphic toxin; putative polysaccharide synthesis/export protein; putative neighboring cell growth inhibitor |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,755,723 | 0 | G | T | 95.7%
| 208.3
/ 4.1
| 92 | E61* (GAA→TAA) | rhsA | Rhs family protein, putative polymorphic toxin; putative polysaccharide synthesis/export protein; putative neighboring cell growth inhibitor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/2); new base T (53/35); total (55/37) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.84e-01 |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
TGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCAC > CP009273/3755577‑3755772
|
tGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTaaa > 2:1722700/1‑150 (MQ=21)
tGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTaaa > 1:1553616/1‑150 (MQ=21)
tGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTaaa > 1:1553745/1‑150 (MQ=21)
gACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAGAGGTCCTTCCCGGTTAAAc > 2:3256385/1‑150 (MQ=21)
gACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAAc < 2:429571/150‑1 (MQ=21)
aCGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAAcc < 2:837521/150‑1 (MQ=21)
aCGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAAcc < 2:2885757/150‑1 (MQ=21)
aCGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAAcc < 2:310410/150‑1 (MQ=21)
cGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCg > 1:4273298/1‑150 (MQ=21)
cGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCg > 1:4269729/1‑150 (MQ=21)
cGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCg > 2:2905035/1‑150 (MQ=21)
gCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGa > 2:4688300/1‑150 (MQ=21)
gCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGa > 2:2119766/1‑150 (MQ=21)
gCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGa > 2:2119701/1‑150 (MQ=21)
gCAGAATGGAGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCACACCTGCGTGTCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTCACGTCCGGCCAACCGGTCAATCACCTCCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGa > 2:4945249/1‑150 (MQ=11)
cAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGAc > 2:3393608/1‑150 (MQ=21)
cAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGAc < 2:4674775/150‑1 (MQ=21)
aGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACa > 2:3182930/1‑150 (MQ=21)
aGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACa > 2:807922/1‑150 (MQ=21)
gTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACAt > 1:351453/1‑150 (MQ=21)
gTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACAt < 1:4470235/150‑1 (MQ=21)
tATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATc < 1:4442202/150‑1 (MQ=21)
tATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATc < 1:12141/150‑1 (MQ=21)
tATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATc < 1:3415767/150‑1 (MQ=21)
agggCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCg < 2:1876712/148‑1 (MQ=21)
aTGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCg > 2:1713316/1‑150 (MQ=21)
aTGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCg < 2:1876740/150‑1 (MQ=21)
tGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGc > 2:1824383/1‑150 (MQ=21)
tGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGc > 2:1424365/1‑150 (MQ=21)
tGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCACCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGc > 2:1824420/1‑150 (MQ=21)
tGGCGGTAGCATTGGTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCAGCCGGTCCATCCCCTGCGCGGTGCAAAGGTCACTCCCGGGTAAACCGACATCGc > 1:3025995/1‑150 (MQ=11)
ggCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGcc < 1:1719665/150‑1 (MQ=21)
ggCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGcc > 2:4201469/1‑150 (MQ=21)
gCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGccc > 2:1338400/1‑150 (MQ=21)
cGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCt > 1:326559/1‑150 (MQ=21)
cGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCt > 1:326555/1‑150 (MQ=21)
cGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCt < 2:3351928/150‑1 (MQ=21)
cGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCt > 2:4786750/1‑150 (MQ=21)
ggTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTg < 1:2624810/150‑1 (MQ=21)
gTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTgc < 1:746269/150‑1 (MQ=21)
tAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTgcc > 2:3111773/1‑150 (MQ=21)
aGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTgccc > 1:2848921/1‑150 (MQ=21)
aGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTgccc > 1:3324234/1‑150 (MQ=34)
cATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTgcccgg > 2:4789026/1‑150 (MQ=21)
cATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTgcccgg > 2:4788724/1‑150 (MQ=21)
cATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTgcccgg < 1:4262396/150‑1 (MQ=21)
aTTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTgcccggc > 1:4304702/1‑150 (MQ=21)
aTTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTgcccggc > 2:3535154/1‑150 (MQ=21)
aTTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTgcccggc > 1:784807/1‑150 (MQ=21)
ttGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTgcccggcc > 1:867409/1‑150 (MQ=21)
ttGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTgcccggcc > 1:599197/1‑150 (MQ=21)
tGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTgcccggccc > 2:1525308/1‑150 (MQ=21)
tGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTgcccggccc < 2:1912889/150‑1 (MQ=34)
gTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTgcccggcccg > 1:1153671/1‑150 (MQ=21)
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gTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGGTAAACCGACATCGCCCTgcccggcccg > 1:283746/1‑150 (MQ=21)
tCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCt < 2:2578647/150‑1 (MQ=21)
tCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCt < 2:3540206/150‑1 (MQ=21)
cAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTg < 2:2326983/150‑1 (MQ=21)
cAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTg < 2:429576/150‑1 (MQ=21)
aGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGc < 2:2574622/150‑1 (MQ=21)
aGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGc > 2:1500732/1‑150 (MQ=21)
aGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGc > 1:556921/1‑150 (MQ=21)
ggTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCg < 1:2024033/150‑1 (MQ=21)
ggTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGAGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCg < 2:4317330/150‑1 (MQ=21)
gTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGGTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCACGGTGCAAATGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGt > 1:3000849/1‑150 (MQ=255)
ttCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGtt < 2:4453656/150‑1 (MQ=21)
tCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTc < 1:98894/150‑1 (MQ=21)
tCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTc > 2:2648672/1‑150 (MQ=21)
tCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTc > 2:2648671/1‑150 (MQ=21)
tCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTc > 2:1596446/1‑150 (MQ=21)
tCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTc > 1:2167066/1‑150 (MQ=21)
cAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCa > 2:2112223/1‑150 (MQ=21)
cAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCa > 1:4549733/1‑150 (MQ=21)
cAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCa > 2:2112247/1‑150 (MQ=21)
aGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCAt > 1:2061538/1‑150 (MQ=21)
cGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACCTCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCct < 2:793143/150‑1 (MQ=21)
ggggTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCctc > 2:1002383/1‑150 (MQ=21)
ggggTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCctc < 2:5143797/150‑1 (MQ=21)
ggggTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCctc < 1:2814212/150‑1 (MQ=34)
gggTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCctct < 2:913621/150‑1 (MQ=21)
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TTAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACAC > SRR19973063.1678685/1‑150 (MQ=0)
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ACATGACGCAGTATGGCGGTAGCATTGTTCAGGGTTCAGCCGGGGTGCGCATTGGTGCCCCCACCGGCGTGGCCTGTTCGGTGTGCCCCGGCGGAGTGACGTCCGGCCATCCGGTCAATCCCCTGCTCGGTGCAAAGGTCCTTCCCGGTGAAACCGACATCGCCCTGCCCGGCCCGCTGCCGTTCATCCTCTCCCGCACCTACAGCAGTTACCGGACAAAAACGCCCGCGCCGGTGGGGAGCCTCGGCCCCGGCTGGAAAATGCCTGCGGATATCCGCTTACAGCTGCGCGATAACAC > CP009273/3755574‑3755871
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
