Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
700,407 |
C→A |
92.7% |
N336K (AAC→AAA) |
nagE → |
fused N‑acetyl glucosamine specific PTS enzyme: IIC, IIB, and IIA components |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 700,407 | 0 | C | A | 92.7%
| 426.1
/ 25.0
| 161 | N336K (AAC→AAA) | nagE | fused N‑acetyl glucosamine specific PTS enzyme: IIC, IIB, and IIA components |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (6/5); new base A (78/69); total (84/77) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.08e-01 |
Only 100 of 161 total aligned reads displayed.
TCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAAC > CP009273/700263‑700551
|
tCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTc < 2:1513962/148‑1 (MQ=255)
tCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTc < 2:1514063/148‑1 (MQ=255)
tCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTc < 2:3256454/148‑1 (MQ=255)
ccGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCt > 2:1434518/1‑148 (MQ=255)
gctgctGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTgg < 1:3272156/148‑1 (MQ=255)
ctgTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGAtgc > 1:1025288/1‑148 (MQ=255)
ctgTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGAtgc > 1:3132306/1‑148 (MQ=255)
ctgTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGAtgc > 1:3132301/1‑148 (MQ=255)
tgTACCTCCTGCACGCACTGCGGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGAtgct > 1:1481849/1‑148 (MQ=255)
gTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGAtgctg > 2:1803884/1‑148 (MQ=255)
ctGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGa < 1:1741534/148‑1 (MQ=255)
gcacgcacTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGNGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATg < 1:1781821/148‑1 (MQ=255)
gcacgcacTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATg < 2:2127967/148‑1 (MQ=255)
gcacgcacTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATg > 2:2795497/1‑148 (MQ=255)
cacgcacTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATgg > 2:795374/1‑148 (MQ=255)
cacTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGt < 2:1447727/148‑1 (MQ=255)
cacTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGt < 1:1434518/148‑1 (MQ=255)
acTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGtt < 1:3451247/148‑1 (MQ=255)
ctgctgACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTa < 2:234661/148‑1 (MQ=255)
gctgACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTAtc > 1:1218057/1‑148 (MQ=255)
gACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTAtcttc > 2:1788858/1‑148 (MQ=255)
aCCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTAtcttct > 1:2216109/1‑148 (MQ=255)
aCCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTAtcttct < 2:862327/148‑1 (MQ=255)
ggTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCg < 1:2858080/148‑1 (MQ=255)
tATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCt > 2:202339/1‑148 (MQ=255)
tATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCt > 2:202710/1‑148 (MQ=255)
tATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCt > 2:3382143/1‑148 (MQ=255)
tATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCt > 2:1519745/1‑148 (MQ=255)
aTCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTa > 2:3367259/1‑148 (MQ=255)
cAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATc > 2:549341/1‑148 (MQ=255)
cAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATc > 1:2536677/1‑148 (MQ=255)
aGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCt < 1:1281352/148‑1 (MQ=255)
gCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTa < 2:1729531/148‑1 (MQ=255)
ccTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTAc < 1:1875609/148‑1 (MQ=255)
ccTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTAc < 2:1656401/148‑1 (MQ=255)
ccTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCGGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTAc > 2:2643390/1‑148 (MQ=255)
cTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACt < 2:38373/148‑1 (MQ=255)
tGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACtt < 1:797144/148‑1 (MQ=255)
tGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACtt < 1:2634050/148‑1 (MQ=255)
tGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACtt < 1:3059217/148‑1 (MQ=255)
ggCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCgtggtg > 2:371108/1‑148 (MQ=255)
cAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGtt > 1:2574117/1‑148 (MQ=255)
aCGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCa > 2:3454449/1‑148 (MQ=255)
aCGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCa > 2:2193183/1‑148 (MQ=255)
aCGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCa > 2:2511371/1‑148 (MQ=255)
aCGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCa > 2:3454390/1‑148 (MQ=255)
aCGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCa > 2:3316949/1‑148 (MQ=255)
cGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAg < 2:953019/148‑1 (MQ=255)
cGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAg > 2:2454404/1‑148 (MQ=255)
cGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAg > 1:966724/1‑148 (MQ=255)
ctgctgGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGtt < 2:707251/148‑1 (MQ=255)
gggTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGtt > 1:2672384/1‑148 (MQ=255)
ggTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTa > 2:1208418/1‑148 (MQ=255)
tATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATc < 2:172669/148‑1 (MQ=255)
tATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATc > 1:979430/1‑148 (MQ=255)
aCGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCAt > 1:499350/1‑148 (MQ=255)
cgcgGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATg < 1:2023642/148‑1 (MQ=255)
cgGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGtt > 2:1066314/1‑148 (MQ=255)
cgGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGtt > 2:1066217/1‑148 (MQ=255)
ggCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCa > 1:2159581/1‑148 (MQ=255)
gCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCaa > 1:34658/1‑148 (MQ=255)
cTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAAc > 2:1194511/1‑148 (MQ=255)
cTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAAc > 2:1194495/1‑148 (MQ=255)
ttctctttctctGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAAcc < 2:2678141/148‑1 (MQ=255)
ctctGCGGGGTCTATCGACTAACATTTCATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTTCTGGTGATGGGCGTTATATTCTTCGCTATCAACTTCGTGGTGATCAGTTCTGTTATCAGCATTTTCAACCTGAAAAct > 2:2318266/1‑147 (MQ=255)
tctGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGc < 2:2629144/148‑1 (MQ=255)
gCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCgg > 1:2310040/1‑148 (MQ=255)
gCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCgg > 1:2310116/1‑148 (MQ=255)
gCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCgg < 2:2876872/148‑1 (MQ=255)
cTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGGTGCGGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGa < 2:3099667/148‑1 (MQ=255)
tCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGa > 1:2048925/1‑148 (MQ=255)
cGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGAt > 1:2901997/1‑148 (MQ=255)
aCTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATaa > 2:1135972/1‑148 (MQ=255)
cTACGCTTTGATTTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCTTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGAATTTTCAACCTCAAAACGCCGGGTCGTGAAGATaaa < 1:2782163/148‑1 (MQ=255)
tACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAaag > 1:1465615/1‑148 (MQ=255)
aCGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAaaga < 2:2216109/148‑1 (MQ=255)
cggttttaTGTATCACCTGCCGGCCGCCAGCAAGAAAGTCTGTATGCTGGTGGTGTTGGGCGTTATCTTCTTCGATATCTACTTCGTGGTTTTCAGTTCGTTTATCCGATTTTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAaagaa < 1:3392269/141‑1 (MQ=255)
cgcgTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAaagaa > 1:3303300/1‑148 (MQ=255)
gtttGATTTAAAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAGGTCTGGTTGCTGCGGGTGTTGGGCTTTATCTTCTTCGCTATCTACTTGGGGGTGTTCATTTCGGTTAACCGAATTTTAAACCTTAACACGCCGGGTCGTGAAGATAAagaaga < 1:1597072/146‑1 (MQ=255)
cgTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAagaaga > 2:2882270/1‑148 (MQ=255)
ttGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACg > 1:703730/1‑148 (MQ=255)
ataCCCGGCCGGCCGCCCGCCAGAAAGTCTGGTTGCTGGTGGTGAGGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTAGTGCGTGGTTTTCTGTTCGGTTATCCGCATGTTCACCCTGAACACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGt < 1:1001200/148‑1 (MQ=255)
ataACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGt < 2:521900/148‑1 (MQ=255)
taACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGtt > 1:676264/1‑148 (MQ=255)
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gtttgatttaaAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAGGTCTGGTTGCTGCGGGTGTTGGGCTTTATCTTCTTCGCTATCTACTTGGGGGTGTTCATTTCGGTTAACCGAATTTTAAACCTTAACACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACG < SRR19973065.1607740/139‑1 (MQ=60)
CGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACG > SRR19973065.708410/1‑150 (MQ=60)
GTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCACGCCATAACTTTTGTTTGCGGCTGGTTTTGGGGTTTATCTTCTTCGATATATCCTTGGTGGTGTTCTGTTGTTTTATCCGCATTTACAACATCAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGA < SRR19973065.128683/150‑1 (MQ=13)
TATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTT > SRR19973065.3116570/1‑150 (MQ=60)
TATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTT > SRR19973065.680767/1‑150 (MQ=60)
ATACCCGGCCGGCCGCCCGCCAGAAAGTCTGGTTGCTGGTGGTGAGGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTAGTGCGTGGTTTTCTGTTCGGTTATCCGCATGTTCACCCTGAACACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTA < SRR19973065.1007850/150‑1 (MQ=60)
ATACCCGGCCGGCCGCCAGCAAGAAAGTGTGTATGCTGCTGTTGTTGGGCTTTATCTTCTTCGATATCTACTGGGGGGTGTTCAGTGCGGTTATCCGATTGTACAACCTCAACACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTA < SRR19973065.1008661/150‑1 (MQ=50)
ATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATATACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTAAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAATACCAGATCGTTA > SRR19973065.2965369/1‑150 (MQ=60)
tacccgcCCGGCCGCCACCAAGAATGTCGGGATGCTGGTGGTGTGGGCCGTTATCTTCTTCGCAATCTCCTTCGGGGTTTAAAGTTCGGTTACCCGCATGTACACCCTCAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTAC < SRR19973065.618738/143‑1 (MQ=44)
TAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTAC > SRR19973065.1405415/1‑150 (MQ=60)
TAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTAC > SRR19973065.3162783/1‑150 (MQ=60)
AACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACT > SRR19973065.533389/1‑150 (MQ=60)
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CTGCCGGCCGCCCGCCAGAAAGTCTGGTTGCGGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGATATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAA < SRR19973065.3019355/150‑1 (MQ=60)
CGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGGTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTAGTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGAATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAG < SRR19973065.372569/150‑1 (MQ=60)
CCGCAAGCAAGAAAGTCTGGATGCTGGTGGTTTTGGGCTTTATCTTCTTCGCTATATAGTTGGTGGTGTTCTTTTCGGTTATCCGAATTTTCAACCTCAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCA < SRR19973065.2437700/150‑1 (MQ=60)
CCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACA > SRR19973065.2522172/1‑150 (MQ=60)
CAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAAC > SRR19973065.595562/1‑150 (MQ=60)
AGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACA > SRR19973065.1802928/1‑150 (MQ=60)
GAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACAC < SRR19973065.2904123/150‑1 (MQ=60)
GAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGAGGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACAC < SRR19973065.2903900/150‑1 (MQ=60)
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TTGCTCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACAC > CP009273/700259‑700553
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
