Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
700,407 |
C→A |
66.0% |
N336K (AAC→AAA) |
nagE → |
fused N‑acetyl glucosamine specific PTS enzyme: IIC, IIB, and IIA components |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 700,407 | 0 | C | A | 66.0%
| 154.3
/ 251.0
| 236 | N336K (AAC→AAA) | nagE | fused N‑acetyl glucosamine specific PTS enzyme: IIC, IIB, and IIA components |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/47); new base A (66/87); total (99/137) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.89e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.62e-01 |
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
CTTGCTCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACT > CP009273/700258‑700554
|
cTTGCTCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAc < 1:3259367/150‑1 (MQ=255)
tGCTCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAACCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGt < 2:4920461/150‑1 (MQ=255)
cTCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCt < 2:5209272/150‑1 (MQ=255)
tCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTg > 2:3486196/1‑150 (MQ=255)
tCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTg > 2:3521783/1‑150 (MQ=255)
tCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTg > 2:3781747/1‑150 (MQ=255)
cGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGa > 1:377701/1‑150 (MQ=255)
ctgctgTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGAtg > 2:4023621/1‑150 (MQ=255)
tgctgTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGAtgc > 2:1625670/1‑150 (MQ=255)
ctgTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGAtgctg < 1:5039608/150‑1 (MQ=255)
ctgTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGAtgctg > 1:3163123/1‑150 (MQ=255)
gTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATgctgct < 1:720863/150‑1 (MQ=255)
ctGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATg < 1:4325721/150‑1 (MQ=255)
tGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATgg < 2:4438630/150‑1 (MQ=255)
tGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATgg > 1:4764688/1‑150 (MQ=255)
gcacgcacTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATggg < 1:2935973/150‑1 (MQ=255)
gcacgcacTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATggg < 2:3221658/150‑1 (MQ=255)
gcacgcacTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATggg > 1:3181666/1‑150 (MQ=255)
acgcacTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCg > 2:4886154/1‑150 (MQ=255)
cacTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTa > 1:3014614/1‑150 (MQ=255)
cacTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTa < 2:3622583/150‑1 (MQ=255)
ctgctgACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTAtc > 1:1635859/1‑150 (MQ=255)
gctgACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTAtctt < 1:4176823/150‑1 (MQ=255)
gctgACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTAtctt < 2:2802186/150‑1 (MQ=255)
gctgACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTAtctt < 1:1758153/150‑1 (MQ=255)
tgACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTAtcttct < 1:969980/150‑1 (MQ=255)
tgACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTAtcttct > 2:2527633/1‑150 (MQ=255)
tgACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTAtcttct < 1:262582/150‑1 (MQ=255)
gACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATcttctt < 1:330627/150‑1 (MQ=255)
aCCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCttcttc < 2:338672/150‑1 (MQ=255)
ccGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCg < 1:480240/150‑1 (MQ=255)
ggTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCt > 1:548025/1‑150 (MQ=255)
aTCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATc > 2:2746200/1‑150 (MQ=255)
aTCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTGTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATc < 2:1569781/150‑1 (MQ=255)
ccTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACtt < 2:136399/150‑1 (MQ=255)
tGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCg > 2:2211567/1‑150 (MQ=255)
tgtgGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATATTCTTCGCTATCTACTTCgtggt < 1:3999079/150‑1 (MQ=255)
tgGCAACGCTGCTGGGTATCTACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGTTGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGgtgt < 1:3389751/150‑1 (MQ=255)
tgGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGgtgt > 1:3830905/1‑150 (MQ=255)
ggCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGtt < 1:3059151/150‑1 (MQ=255)
ggCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCCGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGtt > 1:3230809/1‑150 (MQ=255)
cAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCa < 1:5283164/150‑1 (MQ=255)
cAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCa < 1:1033105/150‑1 (MQ=255)
aaCGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAg > 2:2733928/1‑150 (MQ=255)
aaCGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAg < 2:4500145/150‑1 (MQ=255)
aaCGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAg > 1:1094651/1‑150 (MQ=255)
aCGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCGTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGt < 2:1924672/150‑1 (MQ=255)
gctgctGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTc < 2:3865813/150‑1 (MQ=255)
ctgctgGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCg < 1:3672234/150‑1 (MQ=255)
tgctgGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCgg > 2:1944057/1‑150 (MQ=255)
gctgGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGt < 1:5005559/150‑1 (MQ=255)
ctgGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGtt > 1:2231493/1‑150 (MQ=255)
aTCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGc > 2:333013/1‑150 (MQ=255)
aTCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGc > 1:360183/1‑150 (MQ=255)
ccACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCAt < 2:230134/150‑1 (MQ=255)
aCGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGt < 2:3983578/150‑1 (MQ=255)
cgcgGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGtt > 2:2028255/1‑150 (MQ=255)
cgcgGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGtt < 2:1112065/150‑1 (MQ=255)
gcgGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCGTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTc < 2:3756857/150‑1 (MQ=255)
gcgGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTc < 1:1600305/150‑1 (MQ=255)
cgGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCa > 2:4755547/1‑150 (MQ=255)
cgtctctttctctGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCt < 1:4846726/148‑1 (MQ=255)
cTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCt < 1:5097556/150‑1 (MQ=255)
cTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCt < 2:4952872/150‑1 (MQ=255)
cTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCt < 1:1764545/150‑1 (MQ=255)
cTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCt > 1:2706333/1‑150 (MQ=255)
tctctttctctGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGa < 1:1019245/150‑1 (MQ=255)
tctctttctctGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGa < 2:291270/150‑1 (MQ=255)
ctctttctctGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGaa > 2:5275416/1‑150 (MQ=255)
ctttctctGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGaaaa > 2:2095086/1‑150 (MQ=255)
tttctctGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAAc < 2:3116246/150‑1 (MQ=255)
tctGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCg > 2:2652401/1‑150 (MQ=255)
cGGGGGCTATCTACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGTTGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTc < 2:741699/150‑1 (MQ=255)
tATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGa > 1:2663720/1‑150 (MQ=255)
tATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGa > 2:3693905/1‑150 (MQ=255)
tCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGTTGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATa < 1:2184749/150‑1 (MQ=255)
ctaCTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCCGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGAATGTACAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATaa < 1:2446247/148‑1 (MQ=255)
cGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATaa > 2:1683415/1‑150 (MQ=255)
gACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATaaa > 1:5079069/1‑150 (MQ=255)
gACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATaaa > 1:4439380/1‑150 (MQ=255)
ccgcgTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAATGTCTGGATGCTGCTGGTGTTGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAaagaag < 1:4266334/149‑1 (MQ=255)
aCGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAaagaag < 1:3419937/150‑1 (MQ=255)
aCGCGTTGATGTATAACCTGCCGACCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAaagaag < 2:1515812/150‑1 (MQ=255)
gcgTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGATATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTACAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGAc < 1:2122827/150‑1 (MQ=255)
cgTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACg < 2:4292815/150‑1 (MQ=255)
ttGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTACAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACgag < 1:1305866/150‑1 (MQ=255)
tGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACgaga > 2:5312304/1‑150 (MQ=255)
gATTTATACCCTGCCGGCCGCCCGCATGAACTTGTGTTTGCTGCTGGTTTTGGGCTTTATCTTCTTCGCTATCTACTTGGTGTTTTTCTGTTCGGTTATCCGAATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGAt < 1:2527642/150‑1 (MQ=255)
gATGTATACCCTGCCGGCCGCCAGCAATAACGTCTGGTGGCTGGTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATATACTTCGTGGTGTTCAGTTGGGTTATCCGCATGTACAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGAt < 1:3421579/150‑1 (MQ=255)
aTGTATACCCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCGGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCCGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATc < 2:2992829/150‑1 (MQ=255)
aaCCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACt < 2:1279180/150‑1 (MQ=255)
aCCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGTTGGGCTTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGTTTACCCGATTGTACAACCTTAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTg < 1:486805/150‑1 (MQ=255)
cggccgCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGaagaag < 2:4873498/150‑1 (MQ=255)
ggccgCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGc > 2:3200611/1‑150 (MQ=255)
ccagccagAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACa < 2:4827381/150‑1 (MQ=255)
ccagAAAGTCTGGTTGCTGCTGGTGTTGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCTGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCaa < 1:3781915/150‑1 (MQ=255)
ccagAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATACGCATGTTCAACCGGAAAACGCCGGGTCGGGATGTTAAAGAAGACGATATAGTTACTGAAGAATCCAAAAGCaa > 1:5051829/1‑150 (MQ=255)
cagAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAac > 2:2586151/1‑150 (MQ=255)
cagAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAac > 2:4149394/1‑150 (MQ=255)
gAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAacac > 2:5178466/1‑150 (MQ=255)
|
CTTGCTCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACT > CP009273/700258‑700554
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
CTTGCTCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGA > CP009273/700258‑700556
|
CTTGCTCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAC > SRR19973062.4804749/1‑150 (MQ=60)
CTTGCTCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAC < SRR19973062.3276277/150‑1 (MQ=60)
TCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTG < SRR19973062.3979264/150‑1 (MQ=60)
CGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGA > SRR19973062.379390/1‑150 (MQ=60)
CGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGA > SRR19973062.4852349/1‑150 (MQ=60)
GCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGAT < SRR19973062.5123379/150‑1 (MQ=60)
CTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATG < SRR19973062.1767967/150‑1 (MQ=60)
CTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTG < SRR19973062.5066315/150‑1 (MQ=60)
CTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTG > SRR19973062.3179499/1‑150 (MQ=60)
CTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTG > SRR19973062.3179538/1‑150 (MQ=60)
GTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCT < SRR19973062.724167/150‑1 (MQ=60)
CTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTG < SRR19973062.1699215/150‑1 (MQ=60)
CTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATG < SRR19973062.4348005/150‑1 (MQ=60)
TGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGG > SRR19973062.4789457/1‑150 (MQ=60)
TGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGG > SRR19973062.4350317/1‑150 (MQ=60)
GCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGG < SRR19973062.2951424/150‑1 (MQ=60)
GCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGG > SRR19973062.3198164/1‑150 (MQ=60)
GCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGG > SRR19973062.506840/1‑150 (MQ=60)
GCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGG > SRR19973062.2216182/1‑150 (MQ=60)
ACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCG < SRR19973062.3761511/150‑1 (MQ=60)
GCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTT < SRR19973062.2722956/150‑1 (MQ=60)
GCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTT > SRR19973062.3287256/1‑150 (MQ=60)
CACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTA < SRR19973062.3376409/150‑1 (MQ=60)
CACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTA > SRR19973062.214977/1‑150 (MQ=60)
CACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTA > SRR19973062.3030363/1‑150 (MQ=60)
ACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTAT > SRR19973062.3610272/1‑150 (MQ=60)
ACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTAT > SRR19973062.3610953/1‑150 (MQ=60)
CTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATC > SRR19973062.1643928/1‑150 (MQ=60)
GCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTT < SRR19973062.4198493/150‑1 (MQ=60)
GCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTT < SRR19973062.1766680/150‑1 (MQ=60)
TGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCT < SRR19973062.974450/150‑1 (MQ=60)
TGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCT < SRR19973062.263899/150‑1 (MQ=60)
TGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCT < SRR19973062.263860/150‑1 (MQ=60)
TGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCT < SRR19973062.264087/150‑1 (MQ=60)
TGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCT < SRR19973062.264083/150‑1 (MQ=60)
GACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTT < SRR19973062.332162/150‑1 (MQ=60)
ACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTC < SRR19973062.1045374/150‑1 (MQ=60)
CCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCG < SRR19973062.482431/150‑1 (MQ=60)
GGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCT > SRR19973062.550612/1‑150 (MQ=60)
ATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATC > SRR19973062.2393382/1‑150 (MQ=60)
ATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATC > SRR19973062.5073048/1‑150 (MQ=60)
TCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCT < SRR19973062.2824169/150‑1 (MQ=60)
GCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACT > SRR19973062.2098633/1‑150 (MQ=60)
CTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTC > SRR19973062.581269/1‑150 (MQ=60)
TGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGT < SRR19973062.5083494/150‑1 (MQ=60)
TGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATATTCTTCGCTATCTACTTCGTGGT < SRR19973062.4019281/150‑1 (MQ=60)
GTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGttactgcgttcctgaccggtgtgactgagccgctggaat < SRR19973062.1127974/150‑40 (MQ=60)
TGGCAACGCTGCTGGGTATCTACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGTTGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGT < SRR19973062.3407157/150‑1 (MQ=60)
TGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGT > SRR19973062.3850507/1‑150 (MQ=60)
GGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTT < SRR19973062.3075030/150‑1 (MQ=60)
GGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCCGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTT > SRR19973062.3247574/1‑150 (MQ=60)
CAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCA < SRR19973062.2696443/150‑1 (MQ=60)
CAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCA < SRR19973062.1037940/150‑1 (MQ=60)
CAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCA < SRR19973062.5310940/150‑1 (MQ=60)
AACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAG > SRR19973062.1099804/1‑150 (MQ=60)
AACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAG > SRR19973062.4877120/1‑150 (MQ=60)
CGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTT < SRR19973062.5228105/150‑1 (MQ=60)
CGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTT < SRR19973062.4906135/150‑1 (MQ=60)
CTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCG < SRR19973062.3691056/150‑1 (MQ=60)
GCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGT < SRR19973062.5032037/150‑1 (MQ=60)
GCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGT < SRR19973062.3973991/150‑1 (MQ=60)
CTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTT > SRR19973062.2242657/1‑150 (MQ=60)
TGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTATTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTA > SRR19973062.2281301/1‑150 (MQ=60)
GGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTGCAGTTCGGTGATC > SRR19973062.1712842/1‑150 (MQ=60)
TATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCG < SRR19973062.504268/150‑1 (MQ=60)
ATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGC < SRR19973062.2996025/150‑1 (MQ=60)
ATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGC > SRR19973062.361808/1‑150 (MQ=60)
ATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGC < SRR19973062.3832980/150‑1 (MQ=60)
GCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTC < SRR19973062.1608327/150‑1 (MQ=60)
GCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTC < SRR19973062.1608238/150‑1 (MQ=60)
GGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAA > SRR19973062.3416412/1‑150 (MQ=60)
CTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCT < SRR19973062.5124542/150‑1 (MQ=60)
CTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCT < SRR19973062.1773106/150‑1 (MQ=60)
CTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCT > SRR19973062.2720549/1‑150 (MQ=60)
CTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCT < SRR19973062.4046599/150‑1 (MQ=60)
CTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCT > SRR19973062.316460/1‑150 (MQ=60)
CTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCT > SRR19973062.4289810/1‑150 (MQ=60)
CGTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCT < SRR19973062.4871757/150‑1 (MQ=60)
TTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGAAGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTG > SRR19973062.4271978/1‑150 (MQ=60)
TCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGA < SRR19973062.1365316/150‑1 (MQ=60)
TCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGA < SRR19973062.1024022/150‑1 (MQ=60)
CTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAA > SRR19973062.111774/1‑150 (MQ=60)
TTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAAC < SRR19973062.1941569/150‑1 (MQ=60)
TTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAAC < SRR19973062.3214355/150‑1 (MQ=60)
CTATCGACTACGCGTTGTTGTATACCCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGTTGGGCGTTATATTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCTGTTGGTTTATCCGATTGTACAACCTTAAAACGCCGGGTCGTGAAG < SRR19973062.1025062/150‑1 (MQ=60)
TATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGA > SRR19973062.2677698/1‑150 (MQ=60)
ATCGACTACGCGTTTATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCATAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATATTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTTTTCTGTTCGGTTATCCGAATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGAT < SRR19973062.4786448/150‑1 (MQ=60)
TCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGTTGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATA < SRR19973062.2195736/150‑1 (MQ=60)
CTACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCCGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGAATGTACAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAA < SRR19973062.2459375/150‑1 (MQ=60)
GACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAA > SRR19973062.4462024/1‑150 (MQ=60)
GACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAA > SRR19973062.5105968/1‑150 (MQ=60)
TACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATAATCTTCGCTATCAACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAA > SRR19973062.729430/1‑150 (MQ=60)
CCGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCATAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAG < SRR19973062.4288670/150‑1 (MQ=60)
CCGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAATGTCTGGATGCTGCTGGTGTTGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAG < SRR19973062.4288418/150‑1 (MQ=60)
ACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAG < SRR19973062.3437439/150‑1 (MQ=60)
ACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAG < SRR19973062.3437476/150‑1 (MQ=60)
GCTTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGATATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTACAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGAC < SRR19973062.2133619/150‑1 (MQ=60)
TTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTACAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAG < SRR19973062.1311837/150‑1 (MQ=60)
GTTGTATACCCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCTTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCTGTTCGTTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGAT < SRR19973062.3271264/150‑1 (MQ=60)
GTTGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCTGAACGTCTGGATGCTGGTGGTGTTGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGTTTATCCGCTTGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGAT < SRR19973062.2541129/150‑1 (MQ=60)
GATGTATACCCTGCCGGCCGCCAGCAATAACGTCTGGTGGCTGGTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATATACTTCGTGGTGTTCAGTTGGGTTATCCGCATGTACAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGAT < SRR19973062.3439084/150‑1 (MQ=60)
GATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCATCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAAACTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAATAAGACGAGAT > SRR19973062.3659810/1‑150 (MQ=60)
TATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTT > SRR19973062.4550184/1‑150 (MQ=60)
ACCCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACT < SRR19973062.376587/150‑1 (MQ=60)
ACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGTTGGGCTTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGTTTACCCGATTGTACAACCTTAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTG < SRR19973062.489046/150‑1 (MQ=60)
ACCTGCCGGCCGCCAGCAATAACGTCTGTTTGCTGCTGGTTTTGGGCGTTATCTTCTTCGATATCTACTTCGTGGTGTTCTGTTGGGTTATCCGATTGTTCAACCTTAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTG < SRR19973062.489007/150‑1 (MQ=60)
GGCCGGCCGCCAGCAATAATGTCTGGATGCTGCTGGTGTTGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGTTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAG < SRR19973062.5120204/150‑1 (MQ=60)
CCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCA < SRR19973062.3093404/150‑1 (MQ=60)
CGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAA < SRR19973062.3249604/150‑1 (MQ=60)
AGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGC > SRR19973062.3352672/1‑150 (MQ=60)
AGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGC < SRR19973062.1278880/150‑1 (MQ=60)
CCAGAATGTCTGGATGCTGCTGGTGTTGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTGGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAA < SRR19973062.3801121/150‑1 (MQ=60)
CCAGAAAGTCTGGTTGCTGCTGGTGTTGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCTGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAA < SRR19973062.3801289/150‑1 (MQ=60)
CCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATACGCATGTTCAACCGGAAAACGCCGGGTCGGGATGTTAAAGAAGACGATATAGTTACTGAAGAATCCAAAAGCAA > SRR19973062.5078612/1‑150 (MQ=60)
CATAACGTCTGGTTGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCTTTTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAAC < SRR19973062.558027/150‑1 (MQ=60)
AGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACA < SRR19973062.3060080/150‑1 (MQ=60)
AATGTCTGGTTGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTACAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACT < SRR19973062.154924/150‑1 (MQ=60)
AACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACT > SRR19973062.5312375/1‑150 (MQ=60)
AAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACT > SRR19973062.438029/1‑150 (MQ=60)
AGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATATTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGA > SRR19973062.1913409/1‑150 (MQ=60)
|
CTTGCTCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACTGA > CP009273/700258‑700556
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |