Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F394 I0 R1
|
1342 |
215.0 |
7134094 |
96.2% |
6862998 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
700,407 |
C→A |
57.7% |
N336K (AAC→AAA) |
nagE → |
fused N‑acetyl glucosamine specific PTS enzyme: IIC, IIB, and IIA components |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 700,407 | 0 | C | A | 57.7%
| 21.2
/ 232.7
| 170 | N336K (AAC→AAA) | nagE | fused N‑acetyl glucosamine specific PTS enzyme: IIC, IIB, and IIA components |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/36); new base A (49/48); total (83/87) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.76e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 173 total aligned reads displayed.
TGCTCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACT > CP009273/700260‑700554
|
tGCTCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAc > 1:3104927/1‑148 (MQ=255)
cTCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGt > 2:2226675/1‑148 (MQ=255)
gctgctGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTgg > 1:790595/1‑148 (MQ=255)
gctgctGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTgg < 2:1744629/148‑1 (MQ=255)
gctgctGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTgg > 2:1870673/1‑148 (MQ=255)
gctgctGGACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTgg < 2:2306533/148‑1 (MQ=255)
gctgTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGAtg < 1:3258420/148‑1 (MQ=255)
ctgTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGAtgc > 2:3330509/1‑148 (MQ=255)
tACCTCCTGCACGAACTGCTGACCGGTATCAGCCTGATTGTGTCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTATCTTTCTCTGCGCGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCAAGAACGTCTGGAtgctgc > 2:2853145/1‑148 (MQ=255)
cctcctGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGctgctg > 2:3546090/1‑148 (MQ=255)
tGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGAt < 1:891562/148‑1 (MQ=255)
gcacgcacTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATg > 1:1163636/1‑148 (MQ=255)
gcacgcacTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATg < 2:1504037/148‑1 (MQ=255)
gcacTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCg < 1:1627659/148‑1 (MQ=255)
cacTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGt > 2:1611968/1‑148 (MQ=255)
tgctgACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTAt < 2:72534/148‑1 (MQ=255)
gACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTAtcttc < 1:2301183/148‑1 (MQ=255)
gACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTAtcttc < 1:2302086/148‑1 (MQ=255)
gACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTAtcttc > 1:3159152/1‑148 (MQ=255)
aCCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTAtcttct > 2:404176/1‑148 (MQ=255)
ccGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATcttctt < 2:3040809/148‑1 (MQ=255)
ccGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATcttctt > 1:3051415/1‑148 (MQ=255)
ccGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATcttctt < 1:2946495/148‑1 (MQ=255)
tATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCt > 1:360748/1‑148 (MQ=255)
tcggCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTAt < 1:2868389/145‑1 (MQ=255)
cAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATc > 2:1173892/1‑148 (MQ=255)
cAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATc < 2:2335199/148‑1 (MQ=255)
gCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTa > 1:2516124/1‑148 (MQ=255)
ccTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTAc > 1:519934/1‑148 (MQ=255)
tGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACtt < 2:172422/148‑1 (MQ=255)
tGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACtt > 1:1682154/1‑148 (MQ=255)
gTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTc > 2:1123646/1‑148 (MQ=255)
gTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTc > 2:1123505/1‑148 (MQ=255)
tttGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCg > 2:2953894/1‑148 (MQ=255)
ggCAACGCTGCTGGGTCTCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCgtggtg < 2:1888986/148‑1 (MQ=255)
ggCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCgtggtg < 2:3276206/148‑1 (MQ=255)
ggCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCgtggtg < 2:3276862/148‑1 (MQ=255)
gCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGgtgt < 1:1522043/148‑1 (MQ=255)
gCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGgtgt < 2:195411/148‑1 (MQ=255)
cAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGtt > 2:800700/1‑148 (MQ=255)
cAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCGGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGtt > 2:800753/1‑148 (MQ=255)
aaCGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTc < 2:875534/148‑1 (MQ=255)
aCGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCa < 1:1157841/148‑1 (MQ=255)
cGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAg < 2:2709616/148‑1 (MQ=255)
gctgGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCg > 1:1494372/1‑148 (MQ=255)
ctgGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCgg < 1:2330136/148‑1 (MQ=255)
gggTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGt < 1:1601232/147‑1 (MQ=255)
gggTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGt > 2:1601232/1‑147 (MQ=255)
ggTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTa < 2:2337735/148‑1 (MQ=255)
ggTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTa < 1:1833189/148‑1 (MQ=255)
tCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCg > 2:2315407/1‑148 (MQ=255)
ccACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGAGGGGGCTATCGACTACGAGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGATCGTCTGGATGCTGTTTGTGTTGGGCGGTTTATTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTGAGTTCGGTTATACGc < 2:93908/148‑1 (MQ=255)
cgcgGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATg < 1:2420945/148‑1 (MQ=255)
ggCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCa > 1:673859/1‑148 (MQ=255)
ggCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCa < 1:2936513/148‑1 (MQ=255)
ggCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCa < 1:3471002/148‑1 (MQ=255)
ggCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGATATCCGCATGTTCa > 1:2039062/1‑148 (MQ=255)
gCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCaa < 2:3562125/148‑1 (MQ=255)
cTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAAc > 1:217689/1‑148 (MQ=255)
tctctttctctGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCt > 1:151227/1‑148 (MQ=255)
ctctttctctGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTg > 1:1139392/1‑148 (MQ=255)
ctctttctctGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTg > 2:2428942/1‑148 (MQ=255)
ctttctctGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGaa > 2:3464965/1‑148 (MQ=255)
ttctctGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGaaaa > 2:2614787/1‑148 (MQ=255)
ttctctGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGaaaa > 2:2614510/1‑148 (MQ=255)
ctctGCGTGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGATGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACg < 2:321518/148‑1 (MQ=255)
ctctGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACg < 2:1251269/148‑1 (MQ=255)
ctctGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACg < 2:1251253/148‑1 (MQ=255)
ggggCTTTCGACTAGGGGTTTATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCTGAAGGTGTGTATGGTGGTGTTGATGGGGTTTTTCTTGTTCGCTATCTAGTGGGTGTTTTTCTGTTCGGTTAGCGGCTTGTTCACCGTGAAAACGCCGGGTc < 2:2397306/148‑1 (MQ=255)
cTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACAACGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCAGGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGa > 1:337627/1‑148 (MQ=255)
tATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGaa > 2:1548219/1‑148 (MQ=255)
tCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGa > 1:956627/1‑148 (MQ=255)
cGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGTTGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGTTTTACAGTTCGGTTAACCGAATTTTCAACATGAAAACGCCGGGTCGTGAAGAt < 1:1430465/148‑1 (MQ=255)
aCTACGCGTTGTTGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGGTGGTGTTGGGGGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATaa < 1:1173892/148‑1 (MQ=255)
tACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAaag < 2:519934/148‑1 (MQ=255)
aCGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAaaga > 1:859102/1‑148 (MQ=255)
aCGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAaaga < 2:217689/148‑1 (MQ=255)
gcgTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAaagaag > 1:2431362/1‑148 (MQ=255)
gcgTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAaagaag > 1:2970099/1‑148 (MQ=255)
cgTTGATTTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAATGTCGGGATGCTGCTGGTGATGGGCTTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCTGTTCGGTTATCCGCTTTTTCAACCTTAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAagaaga < 1:465749/148‑1 (MQ=255)
cgTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAagaaga < 2:1476194/148‑1 (MQ=255)
tGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACga > 1:2392151/1‑148 (MQ=255)
gATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGACCGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACgag < 2:1246973/148‑1 (MQ=255)
aTGTATAAGCTGCCGGCCGCCAGCAAGAAGGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCTTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCTGTTATCCGAATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACgaga < 2:2905778/148‑1 (MQ=255)
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ACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAG > SRR19973066.2447866/1‑150 (MQ=60)
ACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAG > SRR19973066.2989734/1‑150 (MQ=60)
ACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAG > SRR19973066.2989737/1‑150 (MQ=60)
CGTTGATTTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAATGTCGGGATGCTGCTGGTGATGGGCTTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCTGTTCGGTTATCCGCTTTTTCAACCTTAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACG < SRR19973066.469298/150‑1 (MQ=60)
CGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGAATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACG < SRR19973066.2343415/150‑1 (MQ=60)
GTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGA > SRR19973066.2408253/1‑150 (MQ=60)
GATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGAT > SRR19973066.368732/1‑150 (MQ=60)
ATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGATATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATC < SRR19973066.1513690/150‑1 (MQ=60)
TTTATAACCTGCCGGCCGCCAGCATGAAAGTGTGGTTGCTGCTGGTGATGGGGGTTATCTTCTTGGATATCTATTTGGTGGTTTTATGTTGGGTTATCCGATTGTTCAACCTTAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCG < SRR19973066.118347/150‑1 (MQ=57)
GTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGT > SRR19973066.2077751/1‑150 (MQ=60)
TATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTT > SRR19973066.796831/1‑150 (MQ=60)
TATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTT > SRR19973066.796897/1‑150 (MQ=60)
ATACCCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGTTGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGAATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTA < SRR19973066.1748187/150‑1 (MQ=60)
ATACCCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCGGGATGCTGCTGGTGAGGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTA < SRR19973066.3163056/150‑1 (MQ=60)
ATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGTTGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTA < SRR19973066.3163156/150‑1 (MQ=60)
TAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTAC > SRR19973066.1935133/1‑150 (MQ=60)
CGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAG < SRR19973066.2375187/150‑1 (MQ=60)
AGCCAGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGC > SRR19973066.1325363/1‑150 (MQ=60)
gcattAACGTCTGGTTGCTGCTGTTGTTGGGCTTTATCTTCTTCGATATCTATTTGGTGGTGTTATGTTCGTTTATCCGCTTGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCA < SRR19973066.2242062/145‑1 (MQ=60)
AGAAAGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACA > SRR19973066.3102274/1‑150 (MQ=60)
AACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACT > SRR19973066.208244/1‑150 (MQ=60)
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CTTGCTCCGCTGCTGTACCTCCTGCACGCACTGCTGACCGGTATCAGCCTGTTTGTGGCAACGCTGCTGGGTATCCACGCGGGCTTCTCTTTCTCTGCGGGGGCTATCGACTACGCGTTGATGTATAACCTGCCGGCCGCCAGCCAGAACGTCTGGATGCTGCTGGTGATGGGCGTTATCTTCTTCGCTATCTACTTCGTGGTGTTCAGTTCGGTTATCCGCATGTTCAACCTGAAAACGCCGGGTCGTGAAGATAAAGAAGACGAGATCGTTACTGAAGAAGCCAACAGCAACACT > CP009273/700258‑700554
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
