Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,284,857 |
G→T |
100% |
D53Y (GAT→TAT) |
rssA → |
putative patatin‑like family phospholipase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,284,857 | 0 | G | T | 98.6%
| 657.5
/ ‑0.8
| 209 | D53Y (GAT→TAT) | rssA | putative patatin‑like family phospholipase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/3); new base T (113/93); total (113/96) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.53e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
AAAATAGGGCTGGCGCTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCGATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTTCAATCAATACCGCGAAATAATGCCGGAAACAG > CP009273/1284713‑1285001
|
aaaTAGGGCTGGCGCTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGctatcg < 1:372155/148‑1 (MQ=255)
aaaTAGGGCTGGCGCTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGctatcg < 1:1368840/148‑1 (MQ=255)
aTAGGGCTGGCGCTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGctatcgat > 2:1683516/1‑148 (MQ=255)
gggCTGGCGCTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTAt < 2:1786340/148‑1 (MQ=255)
ggCTGGCGCTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATc < 2:1853541/148‑1 (MQ=255)
ggCTGGCGCTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATc > 2:362896/1‑148 (MQ=255)
gCTGGCGCTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCt > 2:2341386/1‑148 (MQ=255)
cTGGCGCTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTg < 2:2407937/148‑1 (MQ=255)
ggCGCTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTgcg < 1:405075/148‑1 (MQ=255)
gcgcTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTgcgc > 1:1667899/1‑148 (MQ=255)
cgAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACctc > 1:2861386/1‑148 (MQ=255)
cgAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACctc < 1:1805086/148‑1 (MQ=255)
gagaGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACctct < 1:3318579/148‑1 (MQ=255)
gagaGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGAGATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACctct < 2:840333/148‑1 (MQ=255)
gagGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCttt > 1:2243882/1‑148 (MQ=255)
agGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTc > 1:489168/1‑148 (MQ=255)
ggTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCa < 2:3009515/148‑1 (MQ=255)
tGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGtt > 2:935178/1‑148 (MQ=255)
tGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGtt < 2:1580380/148‑1 (MQ=255)
tGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGtt > 1:3508893/1‑148 (MQ=255)
ggTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTa < 1:2594130/148‑1 (MQ=255)
ggTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTa < 2:2265150/148‑1 (MQ=255)
tCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTAtt > 2:316825/1‑148 (MQ=255)
cGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTg < 1:2440122/148‑1 (MQ=255)
tatTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGAt > 2:169634/1‑148 (MQ=255)
tatTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGAt > 2:798893/1‑148 (MQ=255)
ttGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGt > 1:558274/1‑148 (MQ=255)
ttGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGt < 1:692622/148‑1 (MQ=255)
tGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTTCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGAATATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTAAGTTATTGGGATGtt > 1:2435682/1‑148 (MQ=255)
tGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTTGGATGtt > 2:1622541/1‑148 (MQ=255)
tGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGtt < 1:2737833/148‑1 (MQ=255)
cGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTa < 1:2913080/148‑1 (MQ=255)
gTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTAc > 2:1450968/1‑148 (MQ=255)
attaATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGcc > 2:2949048/1‑148 (MQ=255)
ttaATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCt < 2:2751115/148‑1 (MQ=255)
ttaATGAGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGGTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCt < 2:2131171/148‑1 (MQ=255)
taATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTg > 1:706550/1‑148 (MQ=255)
taATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTg < 2:1760480/148‑1 (MQ=255)
taATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTg > 2:2769538/1‑148 (MQ=255)
taATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTg > 1:1036322/1‑148 (MQ=255)
taATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTg > 1:1081921/1‑148 (MQ=255)
aaTGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGa < 1:2137293/148‑1 (MQ=255)
aaTGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGa < 1:321009/148‑1 (MQ=255)
aTGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGAt > 1:2207489/1‑148 (MQ=255)
aTGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGAt > 1:118610/1‑148 (MQ=255)
aTGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGAt < 1:2990281/148‑1 (MQ=255)
aTGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGAt > 1:1170890/1‑148 (MQ=255)
gcgcTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATgg < 1:1450484/148‑1 (MQ=255)
cgcTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGa < 2:543241/148‑1 (MQ=255)
aaaaaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGAtctc > 2:2202071/1‑148 (MQ=255)
aaaaaaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGAtctc > 2:434951/1‑148 (MQ=255)
aaaGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCt < 1:2823239/148‑1 (MQ=255)
tgtgTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCa > 1:3368138/4‑148 (MQ=255)
tGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCa > 1:1426438/1‑148 (MQ=255)
tGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTAAGCCTGATGGATCTCTCCTGGCa > 1:465679/1‑148 (MQ=255)
gggTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAg > 1:2229303/1‑148 (MQ=255)
ggTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAgc > 2:1310564/1‑148 (MQ=255)
ggTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAgc > 1:3246650/1‑148 (MQ=255)
aaaTTGATATCGGTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTgg < 1:816166/148‑1 (MQ=255)
aaTTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTggg > 1:2117061/1‑148 (MQ=255)
ttGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGtt > 2:696587/1‑148 (MQ=255)
ttGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGtt > 2:1065009/1‑148 (MQ=255)
tGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTa < 1:1310564/148‑1 (MQ=255)
gATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTAc > 1:2765890/1‑148 (MQ=255)
gATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTAc < 2:487732/148‑1 (MQ=255)
gATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTAc > 1:2934094/1‑148 (MQ=255)
atCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTgc > 1:2693849/1‑148 (MQ=255)
atCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTgc > 1:3153881/1‑148 (MQ=255)
atCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTgc > 2:1379042/1‑148 (MQ=255)
cGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTgcgc > 1:1162597/1‑148 (MQ=255)
cGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTgcgc > 1:3485290/1‑148 (MQ=255)
ttGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCgcgg > 2:518578/1‑148 (MQ=255)
cAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGa > 2:2657774/1‑148 (MQ=255)
ggATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGc > 2:3026065/1‑148 (MQ=255)
aTGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCgt > 2:3484833/1‑148 (MQ=255)
gTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCgtgt < 2:1852381/148‑1 (MQ=255)
gTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCgtgt > 2:3226897/1‑148 (MQ=255)
ttCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTc < 1:698316/148‑1 (MQ=255)
aTTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtca > 1:2425360/1‑148 (MQ=255)
aTTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtca > 1:2425566/1‑148 (MQ=255)
ttGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACTCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaa > 2:191253/1‑148 (MQ=255)
gTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTtcaatca < 2:2826779/148‑1 (MQ=255)
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cGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTTCAATCAATa < 2:1488295/148‑1 (MQ=255)
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CGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATC > SRR19973065.173914/1‑150 (MQ=60)
AAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTC > SRR19973065.1325980/1‑150 (MQ=60)
AAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCC < SRR19973065.2358179/150‑1 (MQ=60)
AAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCC > SRR19973065.2524282/1‑150 (MQ=60)
AAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCT < SRR19973065.2852948/150‑1 (MQ=60)
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GAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGG > SRR19973065.2130685/1‑150 (MQ=60)
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TTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTAC > SRR19973065.2951890/1‑150 (MQ=60)
TGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCTATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACT < SRR19973065.1319215/150‑1 (MQ=60)
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GATAAAAATAGGGCTGGCGCTGGGATCTGGCGCGGCGAGAGGTTGGTCGCATATTGGCGTTATTAATGCGCTAAAAAAAGTGGGTATTGAAATTGATATCGTTGCAGGATGTTCAATTGGTTCGCTGGTGGGCGCTGCCTATGCATGCGATCGATTATCTGCGCTGGAAGATTGGGTGACCTCTTTCAGTTATTGGGATGTTTTACGCCTGATGGATCTCTCCTGGCAGCGCGGTGGGTTACTGCGCGGCGAGCGTGTCTTCAATCAATACCGCGAAATAATGCCGGAAACAGAGATC > CP009273/1284709‑1285006
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |