Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,469,880 |
A→T |
100% |
I160I (ATA→ATT) |
ydbD → |
PF10971 family putative periplasmic methylglyoxal resistance protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,469,880 | 0 | A | T | 92.2%
| 747.7
/ 39.9
| 242 | I160I (ATA→ATT) | ydbD | PF10971 family putative periplasmic methylglyoxal resistance protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (11/8); new base T (104/119); total (115/127) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.74e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
| Rejected as polymorphism: Polymorphic base substitution creates a homopolymer stretch. |
Only 100 of 249 total aligned reads displayed.
TTCTCGGTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATTATTGGGGGCTAATT > CP009273/1469735‑1470024
|
tctcGGTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATtttt < 1:171163/148‑1 (MQ=255)
tcGGTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTAt < 1:2942040/148‑1 (MQ=255)
cGGTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATc > 2:1184893/1‑148 (MQ=255)
cGGTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATc > 2:3425820/1‑148 (MQ=255)
cGGTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATc > 1:2847612/1‑148 (MQ=255)
gTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCaa > 1:575387/1‑148 (MQ=255)
aaCGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATg < 2:2351247/148‑1 (MQ=255)
gACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATa < 2:438401/148‑1 (MQ=255)
cGGCAACGAATTTTGTTGCGGAGTCACCACTTTTAATTACCGGTTCGATATATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTATACGATTAAGGGGGTTTTTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAAt < 2:655005/148‑1 (MQ=255)
gCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTg > 2:1273902/1‑148 (MQ=255)
gCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTg < 1:2637120/148‑1 (MQ=255)
gCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTg > 1:2236958/1‑148 (MQ=255)
cGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCAcc > 1:1627144/1‑148 (MQ=255)
cGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCAcc < 2:3089237/148‑1 (MQ=255)
cGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCAcc > 1:445961/1‑148 (MQ=255)
atatAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCtgt < 2:2269340/148‑1 (MQ=255)
ataGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCtgttg < 2:2111762/148‑1 (MQ=255)
ataGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCtgttg > 2:2165653/1‑148 (MQ=255)
aGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTgttgtt > 2:1355289/1‑148 (MQ=255)
gCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGt < 2:1480623/148‑1 (MQ=255)
gATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCtt > 1:487408/1‑148 (MQ=255)
aTTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTc < 1:2985721/148‑1 (MQ=255)
ttCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCg < 2:1988955/148‑1 (MQ=255)
accacTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACa > 2:214121/1‑148 (MQ=255)
accacTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACa > 2:1283702/1‑148 (MQ=255)
cacTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACaaa < 1:1120185/148‑1 (MQ=255)
cTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATa < 2:458435/148‑1 (MQ=255)
cTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATa > 1:2748449/1‑148 (MQ=255)
cTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATa < 2:2598880/148‑1 (MQ=255)
gTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGt > 2:1558673/1‑148 (MQ=255)
tAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGa < 2:2344333/148‑1 (MQ=255)
aTTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAAt > 2:1646163/1‑148 (MQ=255)
ttACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAAtt < 2:1114575/148‑1 (MQ=255)
tACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTc < 1:1845960/148‑1 (MQ=255)
ccGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCAt > 1:61679/1‑148 (MQ=255)
cGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATg < 1:714691/148‑1 (MQ=255)
cGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATg < 1:2476530/148‑1 (MQ=255)
gTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGt > 1:3069976/1‑148 (MQ=255)
gTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGt > 1:2586406/1‑148 (MQ=255)
cGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCg > 2:2710711/1‑148 (MQ=255)
tAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGc > 1:1012903/1‑148 (MQ=255)
aaaTGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCg > 1:2272101/1‑148 (MQ=255)
aaaTGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCg < 1:849309/148‑1 (MQ=255)
tGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGt > 1:2821344/1‑148 (MQ=255)
gCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTg > 1:2526403/1‑148 (MQ=255)
gCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTg < 2:555018/148‑1 (MQ=255)
gCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTg > 1:2894096/1‑148 (MQ=255)
gCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTg > 1:3109419/1‑148 (MQ=255)
cAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGa > 1:3461255/1‑148 (MQ=255)
aGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTg > 1:2033835/1‑145 (MQ=255)
aGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACa > 1:3027517/1‑148 (MQ=255)
gTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACaa < 2:2835966/148‑1 (MQ=255)
ggACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAAc < 2:1305727/148‑1 (MQ=255)
gACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACa < 1:1490881/148‑1 (MQ=255)
gACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACa < 2:614212/148‑1 (MQ=255)
cTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATg < 2:268306/148‑1 (MQ=255)
cTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATg > 2:3497203/1‑148 (MQ=255)
tGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGa < 1:1894172/148‑1 (MQ=255)
tGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGa < 2:179300/148‑1 (MQ=255)
ggTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGac > 2:1056581/1‑148 (MQ=255)
ggTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGac > 2:1496698/1‑148 (MQ=255)
gTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGaca < 1:1273902/148‑1 (MQ=255)
aTTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACt > 2:3271417/1‑148 (MQ=255)
ttATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGa > 2:890851/1‑148 (MQ=255)
tCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGaaaa < 2:782935/148‑1 (MQ=255)
aCTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGt > 1:333203/1‑148 (MQ=255)
cTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTc > 1:3198698/1‑148 (MQ=255)
atatTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCaaa < 1:957915/148‑1 (MQ=255)
tACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAg < 2:326310/148‑1 (MQ=255)
cGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAgcg < 2:1601619/148‑1 (MQ=255)
gATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAgcgc < 1:3737/148‑1 (MQ=255)
aTAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCt > 1:2159925/1‑148 (MQ=255)
tAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCtg > 1:2327373/1‑148 (MQ=255)
aaTCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCtga > 2:1960526/1‑148 (MQ=255)
atgcttatACTATTAAGGGGAGTATTAATGCGCTTGTGATATTTATAAATGAAATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATATTGAATTCATGGTCGGTGCGAGTGAAAAACATTACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCtgat < 1:3296066/141‑1 (MQ=255)
aTCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCtgat > 1:879533/1‑148 (MQ=255)
aTCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCtgat > 1:3439183/1‑148 (MQ=255)
ccGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCtgatga < 2:2945372/148‑1 (MQ=255)
cGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTgatgat < 2:2786082/148‑1 (MQ=255)
cGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTgatgat < 1:1160605/148‑1 (MQ=255)
tCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGataa < 1:1389643/148‑1 (MQ=255)
tCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGataa < 1:2695687/148‑1 (MQ=255)
cTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCaaaa > 1:339747/1‑132 (MQ=255)
cTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCaaaa < 2:601253/132‑1 (MQ=255)
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CAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACA > SRR19973065.3046068/1‑150 (MQ=60)
CAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGAGTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACA > SRR19973065.2046902/1‑150 (MQ=60)
GACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATG < SRR19973065.1500441/150‑1 (MQ=60)
CTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGAC < SRR19973065.1990398/150‑1 (MQ=60)
CTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAAAAGGACCTGTTGTTGCCTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGAC < SRR19973065.3469185/150‑1 (MQ=60)
TGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACA < SRR19973065.1906618/150‑1 (MQ=60)
TGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACA < SRR19973065.3123943/150‑1 (MQ=60)
GGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACAC < SRR19973065.3042375/150‑1 (MQ=60)
GTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACT < SRR19973065.1282301/150‑1 (MQ=60)
ATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAAT > SRR19973065.2843924/1‑150 (MQ=60)
ATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAAT < SRR19973065.2912226/150‑1 (MQ=60)
TCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATG < SRR19973065.1514106/150‑1 (MQ=60)
CGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGT > SRR19973065.335532/1‑150 (MQ=60)
GACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTC > SRR19973065.3217966/1‑150 (MQ=60)
ATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAA < SRR19973065.964259/150‑1 (MQ=60)
ATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAA > SRR19973065.2230179/1‑150 (MQ=60)
ATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAA < SRR19973065.358805/150‑1 (MQ=60)
ATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAA < SRR19973065.2584300/150‑1 (MQ=60)
CGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCT > SRR19973065.2173812/1‑150 (MQ=60)
GATAATCCGTCTACTATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTG > SRR19973065.570512/1‑150 (MQ=60)
GATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTG < SRR19973065.3780/150‑1 (MQ=60)
GATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTG > SRR19973065.2341934/1‑150 (MQ=60)
TAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGAT > SRR19973065.885136/1‑150 (MQ=60)
TAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGAT > SRR19973065.3460161/1‑150 (MQ=60)
AATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATG > SRR19973065.1700339/1‑150 (MQ=60)
atgcttatactATTAAGGGGAGTATTAATGCGCTTGTGATATTTATAAATGAAATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATATTGAATTCATGGTCGGTGCGAGTGAAAAACATTACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGA < SRR19973065.3316140/139‑1 (MQ=60)
ATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGA < SRR19973065.2248462/150‑1 (MQ=60)
ATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGA < SRR19973065.3324816/150‑1 (MQ=60)
ATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGA < SRR19973065.3316195/150‑1 (MQ=60)
CGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAA < SRR19973065.1168242/150‑1 (MQ=60)
CGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAA < SRR19973065.1168034/150‑1 (MQ=60)
CGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAA > SRR19973065.3101790/1‑150 (MQ=60)
GTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAagatcggaagagca > SRR19973065.342118/1‑136 (MQ=60)
GTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGAACCTGTTGTTGAGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAatatcggaagagca > SRR19973065.605023/1‑136 (MQ=60)
TCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATA < SRR19973065.2712427/150‑1 (MQ=60)
TCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATA < SRR19973065.1398770/150‑1 (MQ=60)
CTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAA > SRR19973065.1786044/1‑150 (MQ=60)
GATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCC > SRR19973065.306690/1‑150 (MQ=60)
GATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCC > SRR19973065.2088266/1‑150 (MQ=60)
GATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCC > SRR19973065.306779/1‑150 (MQ=60)
ATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCT < SRR19973065.2909438/150‑1 (MQ=60)
TTAAGGGGATTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTG < SRR19973065.1364270/150‑1 (MQ=60)
TTAAGGGGAGTATTAATGGGCGTGGTTTTTTTATCAATGACATAATTGCACGTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGAAACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTG < SRR19973065.2749502/150‑1 (MQ=60)
AAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGAT > SRR19973065.3444697/1‑150 (MQ=60)
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AGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATG > SRR19973065.91721/1‑150 (MQ=60)
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GGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCA > SRR19973065.2546244/1‑150 (MQ=60)
GGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCA < SRR19973065.3178402/150‑1 (MQ=60)
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TTCTCGGTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATTATTGGGGGCTAATTAAT > CP009273/1469735‑1470027
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |