Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
N/A
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
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|
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ATTCTCGGTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGACTACGATTAAGGTGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTT > SRR19973062.1875332/1‑150 (MQ=60)
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GTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATG < SRR19973062.65145/150‑1 (MQ=60)
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AACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGAC < SRR19973062.958172/150‑1 (MQ=60)
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GACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAAT < SRR19973062.2722309/150‑1 (MQ=60)
GACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAAT < SRR19973062.1633182/150‑1 (MQ=60)
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CGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTG < SRR19973062.2063648/150‑1 (MQ=60)
GCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCA > SRR19973062.4681674/1‑150 (MQ=60)
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CAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCAC > SRR19973062.1187193/1‑150 (MQ=60)
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CGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTG > SRR19973062.3459901/1‑150 (MQ=60)
GAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGT > SRR19973062.4332721/1‑150 (MQ=60)
GAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGT > SRR19973062.1659212/1‑150 (MQ=60)
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AATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTT > SRR19973062.321848/1‑150 (MQ=60)
AATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTT < SRR19973062.2178969/150‑1 (MQ=60)
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AGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGC > SRR19973062.30639/1‑150 (MQ=60)
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CGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTT < SRR19973062.5147436/150‑1 (MQ=60)
CGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTT < SRR19973062.3152807/150‑1 (MQ=60)
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GGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTC > SRR19973062.378597/1‑150 (MQ=60)
GGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTC < SRR19973062.3553857/150‑1 (MQ=60)
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CACCACTGTTAATTCCCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGAATAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAA > SRR19973062.3795168/1‑150 (MQ=60)
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CCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAAT > SRR19973062.35907/1‑150 (MQ=60)
CACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATA < SRR19973062.4531472/150‑1 (MQ=60)
CACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATAGACTCATAATACGATAATCAGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGATGTTGCTTCTTCGAAAAATA > SRR19973062.3639832/1‑150 (MQ=60)
ACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCTCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCTACAAATAG > SRR19973062.5212241/1‑150 (MQ=60)
ACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAG > SRR19973062.4776715/1‑150 (MQ=60)
ACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAG < SRR19973062.2400376/150‑1 (MQ=60)
CTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGT > SRR19973062.1116380/1‑150 (MQ=60)
GTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGA > SRR19973062.772386/1‑150 (MQ=60)
TAATTACCGTTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAAT < SRR19973062.3968166/150‑1 (MQ=60)
TAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTTCGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAAT < SRR19973062.3863307/150‑1 (MQ=60)
AATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATT > SRR19973062.2118854/1‑150 (MQ=60)
TTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCA > SRR19973062.1765476/1‑150 (MQ=60)
TACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCAT < SRR19973062.4309532/150‑1 (MQ=60)
TACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCAT < SRR19973062.192314/150‑1 (MQ=60)
CCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGG < SRR19973062.2380390/150‑1 (MQ=60)
GTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCC > SRR19973062.2706166/1‑150 (MQ=60)
GTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCC > SRR19973062.1971212/1‑150 (MQ=60)
GTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCC > SRR19973062.1971245/1‑150 (MQ=60)
CGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTG < SRR19973062.882945/150‑1 (MQ=60)
CGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTG < SRR19973062.4026928/150‑1 (MQ=60)
CGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTG > SRR19973062.3987860/1‑150 (MQ=60)
CGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTG < SRR19973062.2318616/150‑1 (MQ=60)
CGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTG > SRR19973062.5071112/1‑150 (MQ=60)
GATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGC < SRR19973062.2046925/150‑1 (MQ=60)
GATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGC < SRR19973062.2046920/150‑1 (MQ=60)
GATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGC < SRR19973062.1142188/150‑1 (MQ=60)
TAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGA > SRR19973062.2952348/1‑150 (MQ=60)
TAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGA < SRR19973062.3137724/150‑1 (MQ=60)
TAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGA < SRR19973062.2597681/150‑1 (MQ=60)
TAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGA < SRR19973062.330028/150‑1 (MQ=60)
TAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGA > SRR19973062.1930598/1‑150 (MQ=60)
AAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAG > SRR19973062.2342221/1‑150 (MQ=60)
AAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAG > SRR19973062.2341943/1‑150 (MQ=60)
AATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGT > SRR19973062.2628006/1‑150 (MQ=60)
AATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGT > SRR19973062.2811098/1‑150 (MQ=60)
ATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTG > SRR19973062.4407133/1‑150 (MQ=60)
CAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACA > SRR19973062.2473076/1‑150 (MQ=60)
AGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAA > SRR19973062.4986764/1‑150 (MQ=60)
AGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAA < SRR19973062.2198953/150‑1 (MQ=60)
GGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACAT < SRR19973062.190178/150‑1 (MQ=60)
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GGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACAT > SRR19973062.2409715/1‑150 (MQ=60)
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CTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGAC < SRR19973062.3835979/150‑1 (MQ=60)
TGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACA > SRR19973062.4414904/1‑150 (MQ=60)
GGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACAC < SRR19973062.2098630/150‑1 (MQ=60)
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GGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACAC > SRR19973062.4870447/1‑150 (MQ=60)
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TTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACT < SRR19973062.4281095/150‑1 (MQ=60)
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TATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTG > SRR19973062.1884402/1‑150 (MQ=60)
ATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGA > SRR19973062.1701376/1‑150 (MQ=60)
TTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAA > SRR19973062.5337498/1‑150 (MQ=60)
ATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAAT < SRR19973062.5057544/150‑1 (MQ=60)
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ACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCA > SRR19973062.3576007/1‑150 (MQ=60)
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TTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGC > SRR19973062.4579258/1‑150 (MQ=60)
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GATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTG > SRR19973062.847203/1‑150 (MQ=60)
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AATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATG > SRR19973062.3109162/1‑150 (MQ=60)
TCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGAT < SRR19973062.22004/150‑1 (MQ=60)
TCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGAT > SRR19973062.3209631/1‑150 (MQ=60)
CCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATA < SRR19973062.4867224/150‑1 (MQ=60)
GTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGGCAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAAT > SRR19973062.3729932/1‑150 (MQ=60)
GTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAAT < SRR19973062.1281097/150‑1 (MQ=60)
CTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAA < SRR19973062.4700327/150‑1 (MQ=60)
TACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAA > SRR19973062.4591629/1‑150 (MQ=60)
ACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAAT < SRR19973062.711185/150‑1 (MQ=60)
ACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAAT < SRR19973062.1546835/150‑1 (MQ=60)
ACGATTAAGGGGAGTAATAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAAT < SRR19973062.4898031/150‑1 (MQ=60)
GATTAATGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCTACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGATGATGATAATAAATCC > SRR19973062.5107024/1‑150 (MQ=60)
GATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGACTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCC > SRR19973062.38352/1‑150 (MQ=60)
ATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCT < SRR19973062.4148388/150‑1 (MQ=60)
ATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCAT > SRR19973062.1937155/1‑150 (MQ=60)
TTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTG < SRR19973062.4016586/150‑1 (MQ=60)
AAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGAT > SRR19973062.4081004/1‑150 (MQ=60)
AAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGAT < SRR19973062.5261188/150‑1 (MQ=60)
AAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGAT > SRR19973062.3883342/1‑150 (MQ=60)
AGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATG < SRR19973062.2020845/150‑1 (MQ=60)
GGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCTCTGATGATAATAAATCCTGATGCAT > SRR19973062.4986903/1‑150 (MQ=60)
GAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATA < SRR19973062.4955984/150‑1 (MQ=60)
GAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATA > SRR19973062.2346223/1‑150 (MQ=60)
GAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATA > SRR19973062.962721/1‑150 (MQ=60)
AGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATAT < SRR19973062.4641874/150‑1 (MQ=60)
GTATTATTGCGCGTGGGATTTTTATCAATTACATAATTGCAACTTTTGTTGCTTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCAGTTCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATTTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGTTGCATATT < SRR19973062.4444637/150‑1 (MQ=60)
GTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCTTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATT < SRR19973062.4017672/150‑1 (MQ=60)
GTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCTTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATT < SRR19973062.4017662/150‑1 (MQ=60)
GTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATT < SRR19973062.3054016/150‑1 (MQ=60)
TATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATTA < SRR19973062.1351793/150‑1 (MQ=60)
TATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATTA < SRR19973062.40151/150‑1 (MQ=60)
ATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATTAT > SRR19973062.61128/1‑150 (MQ=60)
TTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATTATT > SRR19973062.3404959/1‑150 (MQ=60)
ATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATTATTGGG < SRR19973062.3469662/150‑1 (MQ=60)
ATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATTATTGGG < SRR19973062.1143262/150‑1 (MQ=60)
ATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATTATTGGG < SRR19973062.4396927/150‑1 (MQ=60)
GCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATTATTGGGGG < SRR19973062.4320910/150‑1 (MQ=60)
GCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATTATTGGGGGCT < SRR19973062.4422738/150‑1 (MQ=60)
GCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATTATTGGGGGCT < SRR19973062.1098266/150‑1 (MQ=60)
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ATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATTATTGGGGGCTAATTAAT < SRR19973062.3203618/150‑1 (MQ=60)
ATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATTATTGGGGGCTAATTAAT > SRR19973062.3780870/1‑150 (MQ=60)
TTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATTATTGGGGGCTAATTAATG < SRR19973062.3362362/150‑1 (MQ=60)
TATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATTATTGGGGGCTAATTAATG > SRR19973062.3093322/1‑150 (MQ=60)
ATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATTATTGGGGGCTAATTAATGA > SRR19973062.1509533/1‑150 (MQ=60)
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GTTATTCTCGGTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATTATTGGGGGCTAATTAATGA > CP009273/1469731‑1470029
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
