Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,469,880 |
A→T |
100% |
I160I (ATA→ATT) |
ydbD → |
PF10971 family putative periplasmic methylglyoxal resistance protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,469,880 | 0 | A | T | 77.3%
| 555.7
/ 173.7
| 269 | I160I (ATA→ATT) | ydbD | PF10971 family putative periplasmic methylglyoxal resistance protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/30); new base T (114/94); total (145/124) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.62e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.29e-01 |
| Rejected as polymorphism: Polymorphic base substitution creates a homopolymer stretch. |
Only 100 of 272 total aligned reads displayed.
TATTCTCGGTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATTATTGGGGGCTAATTA > CP009273/1469733‑1470025
|
tATTCTCGGTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGAtttt > 2:1686746/1‑150 (MQ=255)
aTTCTCGGTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATAttt < 2:3649490/150‑1 (MQ=255)
ttCTCGGTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTa < 2:1462684/150‑1 (MQ=255)
tctcGGTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTAt < 1:818029/150‑1 (MQ=255)
gTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGAAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACTATTAAGGGGAGTATTAATGAGCGTGGGATTTTTATAAATg > 1:4168869/1‑150 (MQ=255)
tAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGa > 1:2060933/1‑150 (MQ=255)
aaCGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGAc > 1:4318637/1‑150 (MQ=255)
cGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACAt < 2:1959042/150‑1 (MQ=255)
ggCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGc > 2:4498595/1‑150 (MQ=255)
gCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCa < 2:347350/150‑1 (MQ=255)
gCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCa > 2:309737/1‑150 (MQ=255)
cAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCAc < 2:2616708/150‑1 (MQ=255)
aaCGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCAcc > 1:1602691/1‑150 (MQ=255)
aaCGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCAcc < 1:2401338/150‑1 (MQ=255)
aaCGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCAcc < 1:1426082/150‑1 (MQ=255)
aCGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCt > 1:4036156/1‑150 (MQ=255)
cGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCtg < 2:3301689/150‑1 (MQ=255)
gAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCtgt > 2:3907425/1‑150 (MQ=255)
atatAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCtgttg < 2:2378618/150‑1 (MQ=255)
tataGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCtgttgt > 1:347345/1‑150 (MQ=255)
tataGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCtgttgt > 1:2314348/1‑150 (MQ=255)
ataGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTgttgtt < 2:96143/150‑1 (MQ=255)
taGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTATGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAAGGACATAATTGCACGGGttgttg > 2:5133171/1‑150 (MQ=255)
taGTTGCGGATTCACCACTGTTAATGACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGttgttg < 1:3187505/150‑1 (MQ=255)
ggtGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCg < 1:4338922/148‑1 (MQ=255)
cGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCtt > 1:4770863/1‑150 (MQ=255)
ggATTCACCACTGGTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTc < 2:2634785/150‑1 (MQ=255)
aTTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGa < 1:4460776/150‑1 (MQ=255)
cTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGt < 2:224571/150‑1 (MQ=255)
tAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAAt < 2:3351608/150‑1 (MQ=255)
aTTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTc > 2:488905/1‑150 (MQ=255)
ttACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCa > 2:3740812/1‑150 (MQ=255)
tACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCAt > 1:4354745/1‑150 (MQ=255)
aCCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATg > 1:3441473/1‑150 (MQ=255)
aCCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATg > 1:2027755/1‑150 (MQ=255)
cGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGt > 2:3552533/1‑150 (MQ=255)
cGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGt < 2:1602550/150‑1 (MQ=255)
cGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGt > 2:4288969/1‑150 (MQ=255)
ggTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTc < 2:4065906/150‑1 (MQ=255)
ggTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTc > 2:2880084/1‑150 (MQ=255)
ttCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCg < 1:2606604/150‑1 (MQ=255)
cGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTg > 2:1394831/1‑150 (MQ=255)
aTAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCg > 1:4724277/1‑150 (MQ=255)
tAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGa > 2:3070972/1‑150 (MQ=255)
aaTGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGt < 2:1102892/150‑1 (MQ=255)
tGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGa > 1:3564271/1‑150 (MQ=255)
tGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGa < 1:270688/150‑1 (MQ=255)
tGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGa < 1:1304264/150‑1 (MQ=255)
gCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGAc > 1:1373814/1‑150 (MQ=255)
cAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACa > 2:2648633/1‑150 (MQ=255)
cAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACa < 2:739355/150‑1 (MQ=255)
aaGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACaa > 2:4005150/1‑150 (MQ=255)
aaGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACaa > 2:1426811/1‑150 (MQ=255)
aGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACaaa > 1:3036693/1‑150 (MQ=255)
gTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAAc < 2:2096337/150‑1 (MQ=255)
gTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAAc > 1:3777054/1‑150 (MQ=255)
gTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAAc > 2:3376235/1‑150 (MQ=255)
ggACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACAt < 1:1675382/150‑1 (MQ=255)
gACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATg < 1:4422675/150‑1 (MQ=255)
gACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATg < 2:2022960/150‑1 (MQ=255)
cTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGac > 1:2500046/1‑150 (MQ=255)
gTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACt < 2:4502478/150‑1 (MQ=255)
aTCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAAt > 1:40290/1‑150 (MQ=255)
cGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGt < 2:1645828/150‑1 (MQ=255)
gACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTc > 2:889160/1‑150 (MQ=255)
aCTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCa < 1:1222594/150‑1 (MQ=255)
aCTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCa > 2:31376/1‑150 (MQ=255)
cTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCaa > 1:4477715/1‑150 (MQ=255)
cTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCaa > 2:4739308/1‑150 (MQ=255)
cATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCaaaa > 1:1794070/1‑150 (MQ=255)
atTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAg > 2:4208626/1‑150 (MQ=255)
tACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAgcg < 1:1569015/150‑1 (MQ=255)
tACGATAATCCGTATACGATTAAGGGGATTATTAATGCTCGTGGGATTTTTATCAATTACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAtcg > 2:1292085/1‑150 (MQ=255)
aCGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAgcgc > 2:3203870/1‑150 (MQ=255)
tAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCtgat < 2:2692017/150‑1 (MQ=255)
tAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCtgat > 1:1769238/1‑150 (MQ=255)
aaTCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCtgatg < 2:376835/150‑1 (MQ=255)
aTCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCtgatga < 2:2346693/150‑1 (MQ=255)
tCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATATATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGAGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTgatgat > 1:1156887/1‑150 (MQ=255)
cGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGataa < 2:1970944/150‑1 (MQ=255)
gTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGataat > 2:1600556/1‑150 (MQ=255)
cTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGAtaataa > 1:2182692/1‑150 (MQ=255)
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GTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAAC > SRR19973063.3789119/1‑150 (MQ=60)
GGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACAT > SRR19973063.2046647/1‑150 (MQ=60)
GGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACAT < SRR19973063.1680463/150‑1 (MQ=60)
GGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACAT < SRR19973063.1680486/150‑1 (MQ=60)
GACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATG < SRR19973063.4436871/150‑1 (MQ=60)
GACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATG < SRR19973063.4436874/150‑1 (MQ=60)
CTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGAC > SRR19973063.2508019/1‑150 (MQ=60)
ATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAAT > SRR19973063.40445/1‑150 (MQ=60)
GACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTC < SRR19973063.729325/150‑1 (MQ=60)
ACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCA < SRR19973063.1226253/150‑1 (MQ=60)
CTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAA > SRR19973063.4492073/1‑150 (MQ=60)
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CTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAA > SRR19973063.4492062/1‑150 (MQ=60)
CATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAA > SRR19973063.1799623/1‑150 (MQ=60)
CATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAA > SRR19973063.2191116/1‑150 (MQ=60)
ATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACCAAAAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGAGACAAACATGACACAGAAAATGTCAAAAA > SRR19973063.2024574/1‑150 (MQ=60)
ATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAA < SRR19973063.4004485/150‑1 (MQ=60)
ATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAA < SRR19973063.1568237/150‑1 (MQ=60)
ATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAG < SRR19973063.4211361/150‑1 (MQ=60)
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CGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCT > SRR19973063.1316243/1‑150 (MQ=60)
ATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGA < SRR19973063.1517813/150‑1 (MQ=60)
TAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGAT > SRR19973063.1774685/1‑150 (MQ=60)
AATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATG < SRR19973063.3848554/150‑1 (MQ=60)
AATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATG < SRR19973063.2467705/150‑1 (MQ=60)
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TAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGA > SRR19973063.1542309/1‑150 (MQ=60)
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GGGATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATTATTGGGGGCTAATT > SRR19973063.1781667/1‑150 (MQ=60)
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ATTTTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATTATTGGGGGCTAATTAAT > SRR19973063.71842/1‑150 (MQ=60)
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TTATTCTCGGTAACGTGACGGCAACGAATATAGTTGCGGATTCACCACTGTTAATTACCGGTTCGATAAATGCAAGTGGACTGGTATTTATCGACTCATATTACGATAATCCGTCTACGATTAAGGGGAGTATTAATGCGCGTGGGATATTTATCAATGACATAATTGCACCTGTTGTTGCGTCTTCGACAAATAGTGAATTCATGGTCCGTGCGAGTGACAAACATGACACTGAAAATGTCAAAAAAGCGCTGATGATAATAAATCCTGATGCATATTATTGGGGGCTAATTAAT > CP009273/1469732‑1470027
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |