Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F247 I0 R1
|
1496 |
299.8 |
9582018 |
97.8% |
9371213 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,403,534 |
C→T |
100% |
intergenic (+224/‑105) |
prmA → / → dusB |
methyltransferase for 50S ribosomal subunit protein L11/tRNA‑dihydrouridine synthase B |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,403,534 | 0 | C | T | 88.1%
| 875.1
/ 96.9
| 302 | intergenic (+224/‑105) | prmA/dusB | methyltransferase for 50S ribosomal subunit protein L11/tRNA‑dihydrouridine synthase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (18/18); new base T (167/99); total (185/117) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.49e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.36e-01 |
| Rejected as polymorphism: Polymorphic base substitution creates a homopolymer stretch. |
Only 100 of 310 total aligned reads displayed.
ACGCAAATTTGCGTGCCAAAATTTTCATTCATAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAATATCAGCTCAGAAATCGCCTGATCGCA > CP009273/3403388‑3403680
|
aCGCAAATTTGCGTGCCAAAATTTTCATTCATAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATtttt < 2:2245351/149‑1 (MQ=255)
aCGCAAATTTGCGTGCCAAAATTTTCATTCATAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATtttt < 1:2353939/149‑1 (MQ=255)
aCGCAAATTTGCGTGCCAAAATTTTCATTCATAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATtttt < 2:3469839/149‑1 (MQ=255)
aCGCAAATTTGCGTGCCAAAATTTTCATTCATAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCtt < 2:1594079/149‑1 (MQ=255)
aaaTTTGCGTGCCAAAATTTTCATTCATAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGAt > 1:3376277/1‑149 (MQ=255)
aaaTTTGCGTGCCAAAATTTTCATTCATAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGAt > 2:1009864/1‑149 (MQ=255)
aaTTTGCGTGCCAAAATTTTCATTCATAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATc > 1:4714225/1‑149 (MQ=255)
aaTTTGCGTGCCAAAATTTTCATTCATAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATc > 1:4107539/1‑149 (MQ=255)
aaTTTGCGTGCCAAAATTTTCATTCATAAAGAAAAAGTGAGAACTTACTCAAATTTCGTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTCTGAGTCATTATCGCACCACGCGCATTTTAAATGCAATTTGTTGATc > 2:87346/1‑149 (MQ=255)
aTTTGCGTGCCAAAATTTTCATTCATAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATcc > 2:213327/1‑149 (MQ=255)
tGCGTGCCAAAATTTTCATTCATAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATCCAtc > 2:2415020/1‑149 (MQ=255)
cGTGCCAAAATTTTCATTCATAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCAtctc < 2:3819424/149‑1 (MQ=255)
gTGCCAAAATTTTCATTCATAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCa < 2:3149391/149‑1 (MQ=255)
gTGCCAAAATTTTCATTCATAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCa < 1:2434235/149‑1 (MQ=255)
gCCAAAATTTTCATTCATAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCaga < 1:3719018/149‑1 (MQ=255)
gCCAAAATTTTCATTCATAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCaga > 1:854543/1‑149 (MQ=255)
aaaaTTTTCATTCATAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGa > 2:3407897/1‑149 (MQ=255)
aaaaTTTTCATTCATAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGa < 2:26602/149‑1 (MQ=255)
ttttCATTCATAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTgg > 1:2827491/1‑149 (MQ=255)
cattcatAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCaa > 2:3715735/1‑149 (MQ=255)
ttcatAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCACTTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAg > 2:4319041/1‑149 (MQ=255)
tAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTg > 1:1826300/1‑149 (MQ=255)
aaaGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTgg < 1:2228341/149‑1 (MQ=255)
aaaGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTgg > 1:3028078/1‑149 (MQ=255)
aGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGcc > 1:729535/1‑149 (MQ=255)
gAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCt > 2:1981100/1‑149 (MQ=255)
gAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCt > 2:1611994/1‑149 (MQ=255)
gAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCt > 1:4439357/1‑149 (MQ=255)
gAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCt < 2:2537751/149‑1 (MQ=255)
aaaaaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCtt > 1:1493242/1‑149 (MQ=255)
aaTTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCa < 2:2058128/149‑1 (MQ=255)
aCTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGc < 1:612431/149‑1 (MQ=255)
cTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCaaaaa > 1:1722261/1‑149 (MQ=255)
cTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCaaaaa > 2:508841/1‑149 (MQ=255)
cTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCaaaaa < 1:3227111/149‑1 (MQ=255)
tCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCaaaaaa > 1:4057837/1‑149 (MQ=255)
aaaTTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATg < 2:1805674/149‑1 (MQ=255)
tttCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGt > 2:3675706/1‑149 (MQ=255)
tCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTaa < 1:3771518/149‑1 (MQ=255)
tCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTaa > 1:3941297/1‑149 (MQ=255)
gagAGGGTAAATTTTAGTCACTCATGCCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAatat < 2:3438772/147‑1 (MQ=255)
gtAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATAcgccg > 2:3987373/1‑149 (MQ=255)
tAAATTTTAGTCACTATTTTCTTATATGATGATTTTTATGAGTAAGTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATAcgccgc < 1:3450814/149‑1 (MQ=255)
aTTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCtt < 1:1429614/149‑1 (MQ=255)
ttAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCa < 1:1227126/149‑1 (MQ=255)
tAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAg > 2:2038204/1‑149 (MQ=255)
gTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTc < 2:3241908/149‑1 (MQ=255)
cACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTcac > 1:1020306/1‑149 (MQ=255)
cACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTcac < 1:2631548/149‑1 (MQ=255)
aCTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTcaca > 1:1253336/1‑149 (MQ=255)
aCTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTcaca < 2:863744/149‑1 (MQ=255)
aCTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTcaca < 2:454635/149‑1 (MQ=255)
aCTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCAATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACTCAGCTTTTCAGTcaca > 1:4668676/1‑149 (MQ=255)
cTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAg > 1:3595457/1‑149 (MQ=255)
tttCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATg > 2:1210019/1‑149 (MQ=255)
ttCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATgg < 2:3588569/149‑1 (MQ=255)
cTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTc < 2:2613906/149‑1 (MQ=255)
tAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCa > 1:841650/1‑149 (MQ=255)
aaTATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCAt > 2:2271239/1‑149 (MQ=255)
atatGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCAtt > 1:1395353/1‑149 (MQ=255)
atatGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCAtt < 2:2814051/149‑1 (MQ=255)
atatGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCAtt > 1:4541667/1‑149 (MQ=255)
tatGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCAttt < 2:4381329/149‑1 (MQ=255)
tatGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCAttt > 1:1133553/1‑149 (MQ=255)
atgatgATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTc > 2:2973257/1‑149 (MQ=255)
tgatgaTTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCCAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCt > 2:3870911/1‑149 (MQ=255)
tgatgaTTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCt > 2:187042/1‑149 (MQ=255)
tgatgaTTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCt > 1:2725246/1‑149 (MQ=255)
tgatgaTTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCt > 1:4161876/1‑149 (MQ=255)
gatgatTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCACCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCtt > 1:4003774/1‑149 (MQ=255)
tgatTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTaa > 2:1235707/1‑149 (MQ=255)
atTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACt > 2:702333/1‑149 (MQ=255)
atTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACt < 2:2595430/149‑1 (MQ=255)
ttttATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCa < 1:213327/149‑1 (MQ=255)
tttATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCAt > 1:3500112/1‑149 (MQ=255)
tATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATgc < 1:164561/149‑1 (MQ=255)
gAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCa > 2:4574380/1‑149 (MQ=255)
aaTTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCgg > 1:2654904/1‑149 (MQ=255)
ttATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGAc > 2:4238965/1‑149 (MQ=255)
tATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACa > 2:2305758/1‑149 (MQ=255)
tCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAat > 1:2918613/1‑149 (MQ=255)
cGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCTGACAata > 2:4742647/1‑149 (MQ=255)
gCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAatat > 1:2536479/1‑149 (MQ=255)
caccacGCTCATTTTAAATGCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAATATc < 1:1693631/149‑1 (MQ=255)
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GCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAATATCAGCTCAGAAATCGCCTGATC < SRR19973071.1535981/150‑1 (MQ=60)
GCAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAATATCAGCTCAGAAATCGCCTGATC > SRR19973071.1246921/1‑150 (MQ=60)
CAATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAATATCAGCTCAGAAATCGCCTGATCG < SRR19973071.3543511/150‑1 (MQ=60)
AATTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAATATCAGCTCAGAAATCGCCTGATCGC > SRR19973071.2560200/1‑150 (MQ=60)
ATTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAATATCAGCTCAGAAATCGCCTGATCGCA < SRR19973071.4476454/150‑1 (MQ=60)
TTTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAATATCAGCTCAGAAATCGCCTGATCGCAG > SRR19973071.2117133/1‑150 (MQ=60)
TTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAATATCAGCTCAGAAATCGCCTGATCGCAG < SRR19973071.3662326/150‑1 (MQ=60)
TTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAATATCAGCTCAGAAATCGCCTGATCGCAGC > SRR19973071.1978842/1‑150 (MQ=60)
TTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAATATCAGCTCAGAAATCGCCTGATCGCAGC > SRR19973071.2047513/1‑150 (MQ=60)
TTTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAATATCAGCTCAGAAATCGCCTGATCGCAGC > SRR19973071.2047565/1‑150 (MQ=60)
TTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAATATCAGCTCAGAAATCGCCTGATCGCAGCG < SRR19973071.3133305/150‑1 (MQ=60)
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TACGCAAATTTGCGTGCCAAAATTTTCATTCATAAAGAAAAATTGAGAACTTACTCAAATTTCTTTGAGTGTAAATTTTAGTCACTATTTTCTAATATGATGATTTTTATGAGTAATTATCGCACCACGCTCATTTTAAATGCAATTCTTTGATCCATCTCAGAGGATTGGTCAAAGTTTGGCCTTTCATCTCGTGCAAAAAATGCGTAATATACGCCGCCTTGCAGTCACAGTATGGTCATTTCTTAACTCATGCGCATCGGACAATATCAGCTCAGAAATCGCCTGATCGCAGCG > CP009273/3403387‑3403683
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
