Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
RA |
CP009273 |
2,303,070 |
T→G |
100% |
Q272P (CAG→CCG) |
ada ← |
fused DNA‑binding transcriptional dual regulator/O6‑methylguanine‑DNA methyltransferase |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | CP009273 | 2,303,070 | 0 | T | G | 99.7%
| 1173.8
/ ‑5.0
| 294 | Q272P (CAG→CCG) | ada | fused DNA‑binding transcriptional dual regulator/O6‑methylguanine‑DNA methyltransferase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base G (115/178); minor base A (1/0); total (116/178) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.95e-01 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 296 total aligned reads displayed.
AGGGTATTATGATAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCTGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCTGCAACTCGCTGATT > CP009273/2302924‑2303219
|
tgggTATTATGATAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGaa > 1:4310736/2‑150 (MQ=255)
aGGGTATTATGATAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGaa < 2:707399/150‑1 (MQ=255)
gggTATTATGATAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGaaa < 1:2217222/150‑1 (MQ=255)
ggTATTATGATAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGaaaa < 2:2606510/150‑1 (MQ=255)
ggTATTATGATAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGaaaa < 2:16518/150‑1 (MQ=255)
attatGATAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCa < 1:2039674/150‑1 (MQ=255)
attatGATAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCa < 1:2394454/150‑1 (MQ=255)
tatGATAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGt > 1:2902708/1‑150 (MQ=255)
atGATAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTg < 1:1114502/150‑1 (MQ=255)
gATAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGcc < 1:3865687/150‑1 (MQ=255)
aTAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCcg < 1:4171118/150‑1 (MQ=255)
aGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCcgcg > 2:2941777/1‑150 (MQ=255)
cAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAAt > 2:5030820/1‑150 (MQ=255)
cAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAAt < 1:2418607/150‑1 (MQ=255)
gCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGt < 1:2641858/150‑1 (MQ=255)
gCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGt < 2:2095577/150‑1 (MQ=255)
cTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTc < 2:2187615/150‑1 (MQ=255)
ttgttgGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTcc > 1:408316/1‑150 (MQ=255)
ttgttgGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTcc < 1:1899567/150‑1 (MQ=255)
tgttgGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCa > 1:1787863/1‑150 (MQ=255)
gttgGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAg > 1:646131/1‑150 (MQ=255)
tgGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCg > 2:4126330/1‑150 (MQ=255)
tgGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCg > 2:1967034/1‑150 (MQ=255)
gcggcACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGt < 2:4814438/150‑1 (MQ=255)
cacaGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACg > 2:3321099/1‑150 (MQ=255)
acaGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGt > 1:3169687/1‑150 (MQ=255)
caGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTc < 1:690454/150‑1 (MQ=255)
aGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCa < 1:4028493/150‑1 (MQ=255)
aGGCGCTGGCAACGGCCCGGACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCa < 2:3016543/150‑1 (MQ=255)
gcTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAgcgg < 2:4770242/150‑1 (MQ=255)
gcTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAgcgg < 2:4770346/150‑1 (MQ=255)
cTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAgcggc < 1:3615064/150‑1 (MQ=255)
cTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAgcggc < 1:2563486/150‑1 (MQ=255)
ggCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGt < 1:4941671/150‑1 (MQ=255)
gCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTa < 1:284714/150‑1 (MQ=255)
aaCGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATc > 1:3344382/1‑150 (MQ=255)
aCGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATcg > 2:1299476/1‑150 (MQ=255)
aCGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATcg < 2:1161320/150‑1 (MQ=255)
cGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATcgc > 2:2539199/1‑150 (MQ=255)
gCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGt > 2:3554994/1‑150 (MQ=255)
gCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGt > 1:5226051/1‑150 (MQ=255)
ccttACCGCTTTCGGTTTGCAGATTGCGTTAGCCATTTGCTGTTAAATGACTGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTTCCAGAATTGTTGCGGTAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGttg < 1:3401708/147‑1 (MQ=255)
ccGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGttg < 2:3286719/150‑1 (MQ=255)
ccGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGttg > 2:2659404/1‑150 (MQ=255)
tgTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGttga > 1:3041775/2‑150 (MQ=255)
gTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGttgat > 1:4702027/1‑150 (MQ=255)
gTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGttgat > 1:2799/1‑150 (MQ=255)
aCCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGttgattg < 2:2690435/150‑1 (MQ=255)
aCCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGAGttgattg < 1:325223/150‑1 (MQ=255)
ccGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGttgattga < 1:1076383/150‑1 (MQ=255)
ccGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGttgattga > 1:321768/1‑150 (MQ=255)
cGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAg < 1:2102703/150‑1 (MQ=255)
cGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAg < 2:4891528/150‑1 (MQ=255)
gCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAgg < 2:573900/150‑1 (MQ=255)
cTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGc > 1:219070/1‑150 (MQ=255)
ttGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATc < 1:5167261/150‑1 (MQ=255)
gCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCAc > 2:4410929/1‑150 (MQ=255)
cGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACtt < 1:3821821/150‑1 (MQ=255)
gATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTc > 2:496141/1‑150 (MQ=255)
aTGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCa < 2:3041775/150‑1 (MQ=255)
tGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCAc > 2:3908800/1‑150 (MQ=255)
ggCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACg < 2:694161/150‑1 (MQ=255)
tAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACAt > 2:1027378/1‑150 (MQ=255)
ccAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGtt < 1:1530697/150‑1 (MQ=255)
tGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGa < 2:16022/150‑1 (MQ=255)
cTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGaaa > 1:4511171/1‑150 (MQ=255)
aTAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACAt > 2:1738700/1‑150 (MQ=255)
tAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCAGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATc > 2:4372264/1‑150 (MQ=255)
ggTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGc < 1:566314/150‑1 (MQ=255)
ggTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGc < 1:2702886/150‑1 (MQ=255)
ggTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGc < 2:4283066/150‑1 (MQ=255)
tttCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAg < 2:3461904/150‑1 (MQ=255)
tCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGgc > 2:5328834/1‑150 (MQ=255)
aCCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGgcgc < 2:4159774/150‑1 (MQ=255)
cAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTg > 2:2425590/1‑150 (MQ=255)
aaGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGt > 2:5218173/1‑150 (MQ=255)
aaGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGt > 2:4624339/1‑150 (MQ=255)
aGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTc < 1:4711625/150‑1 (MQ=255)
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GTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGAT > SRR19973062.922000/1‑150 (MQ=60)
GTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGAT > SRR19973062.2815/1‑150 (MQ=60)
GTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGAT > SRR19973062.4726582/1‑150 (MQ=60)
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TACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATT < SRR19973062.284584/150‑1 (MQ=60)
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CGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTT < SRR19973062.3841372/150‑1 (MQ=60)
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CCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTT < SRR19973062.5132424/150‑1 (MQ=60)
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CTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAA > SRR19973062.4534572/1‑150 (MQ=60)
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TGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAAC > SRR19973062.1812732/1‑150 (MQ=60)
ATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACAT > SRR19973062.4152689/1‑150 (MQ=60)
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TAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATC < SRR19973062.2722991/150‑1 (MQ=60)
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GCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGG < SRR19973062.4947092/150‑1 (MQ=60)
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TGCCTGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACAT < SRR19973062.3511265/150‑1 (MQ=60)
TGCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGACACAGCTGC > SRR19973062.5119641/1‑150 (MQ=60)
GCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCT < SRR19973062.1602243/150‑1 (MQ=60)
GCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCT < SRR19973062.1294930/150‑1 (MQ=60)
GCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCT < SRR19973062.5243685/150‑1 (MQ=60)
GCCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCT < SRR19973062.1732430/150‑1 (MQ=60)
CCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCTG > SRR19973062.4199861/1‑150 (MQ=60)
CCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCTG > SRR19973062.3098323/1‑150 (MQ=60)
CCAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCTG > SRR19973062.1687338/1‑150 (MQ=60)
CAGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCTGC > SRR19973062.796330/1‑150 (MQ=60)
AGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCTGCA > SRR19973062.5172660/1‑150 (MQ=60)
AGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCTGCA > SRR19973062.232353/1‑150 (MQ=60)
AGACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCTGCA > SRR19973062.232329/1‑150 (MQ=60)
GACTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCTGCAA < SRR19973062.623979/150‑1 (MQ=60)
CTTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCTGCAACT < SRR19973062.1422239/150‑1 (MQ=60)
TTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCTGCAACTC < SRR19973062.2164145/150‑1 (MQ=60)
TTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCTGCAACTC < SRR19973062.809677/150‑1 (MQ=60)
TTGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCTGCAACTC < SRR19973062.3572933/150‑1 (MQ=60)
TGTTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCTGCAACTCG < SRR19973062.4147687/150‑1 (MQ=60)
TTGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCTGCAACTCGCT < SRR19973062.2957249/150‑1 (MQ=60)
TGCGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCTGCAACTCGCTG < SRR19973062.1732410/150‑1 (MQ=60)
CGGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCTGCAACTCGCTGAT > SRR19973062.580395/1‑150 (MQ=60)
GGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCTGCAACTCGCTGATT < SRR19973062.4767207/150‑1 (MQ=60)
GGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCTGCAACTCGCTGATT < SRR19973062.1365660/150‑1 (MQ=60)
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GACAGGGTATTATGATAGCCAGCTTGTTGGCGGCACAGGCGCTGGCAACGGCCCGTACCGCTTTCGGTTTGCCGATGGCGTTAGCCAGTTGCTGATAACTGACGGTTTCACCGCAAGGTATCGTGCGCAGTGCCTGCCAGACTTGTTGCTGAAAAGCAGTGCCGCGAATGTCCAGCGGTAACGTCAGCGGCGTATCGCGTTGATTGAGGCTGGCGATCACTTCACGCACATGTTGCTGAAACATCAGATCGGCAGGCGCGTTGTCGGCAGCGGGAAACATCTGCTGCAACTCGCTGATT > CP009273/2302921‑2303219
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |